Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM118188
035-os BibID:	(Scopus)85183013078
Első szerző:	Feró Orsolya
Cím:	DNA methylome, R-loop and clinical exome profiling of patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis / Orsolya Feró, Dóra Varga, Éva Nagy, Zsolt Karányi, Éva Sipos, József Engelhardt, Nóra Török, István Balogh, Borbála Vető, István Likó, Ábel Fóthi, Zoltán Szabó, Gábor Halmos, László Vécsei, Tamás Arányi, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2024
ISSN:	2052-4463
Megjegyzések:	Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disorder characterized by the death of motor neurons, the aetiology of which is essentially unknown. Here, we present an integrative epigenomic study in blood samples from seven clinically characterised sporadic ALS patients to elucidate molecular factors associated with the disease. We used clinical exome sequencing (CES) to study DNA variants, DNA-RNA hybrid immunoprecipitation sequencing (DRIP-seq) to assess R-loop distribution, and reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) to examine DNA methylation changes. The above datasets were combined to create a comprehensive repository of genetic and epigenetic changes associated with the ALS cases studied. This repository is well-suited to unveil new correlations within individual patients and across the entire patient cohort. The molecular attributes described here are expected to guide further mechanistic studies on ALS, shedding light on the underlying genetic causes and facilitating the development of new epigenetic therapies to combat this life-threatening disease.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk R-loop ALS DNA methylation mutation
Megjelenés:	Scientific Data. - 11 : 1 (2024), p. 1-12. -
További szerzők:	Szabóné Varga Dóra (1994-) (gyógyszerész) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Sipos Éva (1989-) (gyógyszerész) Engelhardt József Török Nóra (Szeged) Balogh István (1972-) (molekuláris biológus, genetikus) Vető Borbála Liko István Fóthi Ábel Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Vécsei László (1954-) (neurológus) Arányi Tamás Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM103523
Első szerző:	Halász László (molekuláris biológus)
Cím:	Corrigendum: RNA-DNA hybrid (R-loop) immunoprecipitation mapping: an analytical workflow to evaluate inherent biases / László Halász, Zsolt Karányi, Beáta Boros-Oláh, Tímea Kuik-Rózsa, Éva Sipos, Éva Nagy, Ágnes Mosolygó-L, Anett Mázló, Éva Rajnavölgyi, Gábor Halmos, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2019
ISSN:	1088-9051
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok hozzászólás folyóiratcikk
Megjelenés:	Genome Research. - 29 : 1 (2019), p. 157-157. -
További szerzők:	Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Kuik-Rózsa Tímea Sipos Éva (1989-) (gyógyszerész) Nagy Éva Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Türk-Mázló Anett (1989-) (molekuláris biológus) Rajnavölgyi Éva (1950-) (immunológus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM068037
Első szerző:	Halász László (molekuláris biológus)
Cím:	RNA-DNA hybrid (R-loop) immunoprecipitation mapping : an analytical workflow to evaluate inherent biases / Halász László, Karányi Zsolt, Boros-Oláh Beáta, Kuik-Rózsa Tímea, Sipos Éva, Nagy Éva, Mosolygó-Lukács Ágnes, Mázló Anett, Rajnavölgyi Éva, Halmos Gábor, Székvölgyi Lóránt
Dátum:	2017
ISSN:	1088-9051
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:	Genome Research. - 27 :6 (2017), p. 1063-1073. -
További szerzők:	Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Kuik-Rózsa Tímea Sipos Éva (1989-) (gyógyszerész) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Türk-Mázló Anett (1989-) (molekuláris biológus) Rajnavölgyi Éva (1950-) (immunológus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	H2020/NKFIH NKFIH GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat DOI
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM136744
Első szerző:	Miskei Márton (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:	Herpes simplex virus type 1 R-loops are targets for APOBEC-mediated mutagenesis / Márton Miskei, Dóra Varga, Lilla Hornyák, Éva Sipos, Éva Nagy, Qiuzhen Li, Zsolt Karányi, Zoltán Szabó, Rachel DeWeerd, Abby Green, Dávid Szüts, Eszter Csoma, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2026
ISSN:	1474-760X
Megjegyzések:	APOBEC3 enzymes are key effectors of antiviral immunity that introduce mutations into viral genomes. We show that viral R-loops serve as preferred substrates for APOBEC3-mediated mutagenesis during herpes simplex virus type 1 (HSV-1) infection. APOBEC3 enzymes are recruited to viral R-loops, generating clustered C-to-T mutations in genes critical for viral assembly. Importantly, R-loops alone are not mutagenic, and APOBEC3 enzymes do not edit HSV-1 without an R-loop; mutagenesis occurs when R-loops and APOBEC3 enzymes interact. These findings identify endogenous R-loops formed during the HSV-1 life cycle as focal vulnerabilities and highlight R-loop?APOBEC3 coupling as a mechanism for antiviral mutagenesis.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk R-loop RNA-DNA hybrid DRIP-seq APOBEC virus HSV-1
Megjelenés:	Genome Biology. - 4 (2026), p. 1-14. -
További szerzők:	Varga Dóra (gyógyszerész) Hornyák Lilla Sipos Éva (1989-) (gyógyszerész) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Li, Qiuzhen Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) DeWeerd, Rachel Green, Abby Szüts Dávid Csoma Eszter (1978-) (molekuláris biológus, mikrobiológus) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	NKFIH K-142137 Egyéb TKP2021-EGA-18 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: