CCL

Összesen 2 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM131358
Első szerző:Al-Hamadani, Mokhaled N. A. (informatics)
Cím:Improving Cell Detection and Tracking in Microscopy Images Using YOLO and an Enhanced DeepSORT Algorithm / Mokhaled N. A. Al-Hamadani, Richard Poroszlay, Gabor Szeman-Nagy, Andras Hajdu, Stathis Hadjidemetriou, Luca Ferrarini, Balazs Harangi
Dátum:2025
ISSN:1424-8220
Megjegyzések:Accurate and automated detection and tracking of cells in microscopy images is a persistent challenge in biotechnology and biomedical research. Effective detection and tracking are crucial for understanding biological processes and extracting meaningful data for subsequent simulations. In this study, we present an integrated pipeline that leverages a fine-tuned YOLOv8x model for detecting cells and cell divisions across microscopy image series. While YOLOv8x exhibits strong detection capabilities, it occasionally misses certain cells, leading to gaps in data. To mitigate this, we incorporate the DeepSORT tracking algorithm, which enhances data association and reduces the cells' identity (ID) switches by utilizing a pre-trained convolutional network for robust multi-object tracking. This combination ensures continuous detection and compensates for missed detections, thereby improving overall recall. Our approach achieves a recall of 93.21% with the enhanced DeepSORT algorithm, compared to the 53.47% recall obtained by the original YOLOv8x model. The proposed pipeline effectively extracts detailed information from structured image datasets, providing a reliable approximation of cellular processes in culture environments.
Tárgyszavak:Műszaki tudományok Informatikai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
microscopy images
cell detection
YOLO model
cell tracking
DeepSORT algorithm
UKF
multi-scale ResNet50
Megjelenés:Sensors. - 25 : 14 (2025), p. 1-15. -
További szerzők:Poroszlay Richárd Szemán-Nagy Gábor (1975-) (biológia tanár-molekuláris biológus) Hajdu András (1973-) (matematikus, informatikus) Hadjidemetriou, Stathis Ferrarini, Luca Harangi Balázs (1986-) (programtervező matematikus)
Pályázati támogatás:TKP2021-NKTA-34
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM098704
035-os BibID:(WoS)000723448300001 (Scopus)85118861202
Első szerző:Bankó Csaba (molekuláris biológus)
Cím:Isocyanide Substitution in Acridine Orange Shifts DNA Damage-Mediated Phototoxicity to Permeabilization of the Lysosomal Membrane in Cancer Cells / Bankó Csaba, Nagy Zsolt László, Nagy Miklós, Szemán-Nagy Gábor György, Rebenku István, Imre László, Tiba Attila, Hajdu András, Szöllősi János, Kéki Sándor, Bacso Zsolt
Dátum:2021
ISSN:2072-6694
Megjegyzések:Aside from tissue cell renewal, tumor cells are also produced every day. In ordinary conditions, immunologically controlled cell death mechanisms limit cancer development. There are several cell death processes used for how normal and tumor cells are eliminated at the end of their lifespan. In cancer therapy, cells dying via immunological death are more efficiently eradicated than cells dying by classical apoptosis. Photodynamic treatments with some photosensitizers target lysosomes. Lysosomal death diverts apoptosis to the immunologically more pertinent necrosis-like death pathways. Acridine orange (AO), a well-known photosensitizer, targets lysosomes as well. We have synthesized a new compound abbreviated as DM, a modified AO, and examined details of intracellular processes leading to photodynamic cell death. We have proven that DM targets lysosomes better than AO. Remarkably, with DM, we could visualize an abrupt nuclear DNA release from cells during the photodynamic process. Our work highlights which cellular events may enhance immunological cell death.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Cancers. - 13 : 22 (2021), p. 1-24. -
További szerzők:Nagy Zsolt László (1989-) (gyógyszerész) Nagy Miklós (1976-) (vegyész) Szemán-Nagy Gábor (1975-) (biológia tanár-molekuláris biológus) Rebenku István (1990-) (molekuláris biológus) Imre László (1979-) (biológus) Tiba Attila (1990-) (informatikus, matematikus) Hajdu András (1973-) (matematikus, informatikus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Kéki Sándor (1964-) (polimer kémikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00041
GINOP
GINOP 2.3.4- 15-2020-00008
GINOP
K-132685
Egyéb
FIKP-20428-3/2018/FEKUTSTRAT
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1