Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM132437
035-os BibID:	(Scopus)105015659007 (WoS)001567521000001
Első szerző:	Benhamza, Ibtissem (Biologist)
Cím:	H2A.Z-nucleosomes are stabilized by the superhelicity-dependent DNA binding of the C-terminal tail of the histone variant / Ibtissem Benhamza, Laszlo Imre, Zutao Yu, Peter Pal ifj. Nanasi, Pialy Sen, Kata Nora Enyedi, Katalin Goda, György Vamosi, Gabor Szabo
Dátum:	2025
ISSN:	1949-1034 1949-1042
Megjegyzések:	Using an in situ nucleosome stability assay based on salt extraction, we identified distinct stability features of H2A.Z-containing nucleosomes linked to alternative interactions of the histone variant's Cterminal tail (Imre et al., Nat. Commun., 2024). In DT40 cells expressing either full-length or Cterminally truncated human H2A.Z1, we show that nucleosome stability is tail-dependent also through the spectacles of intercalator sensitivity, raising the possibility that the tail may bind to DNA in a superhelicity-dependent fashion. Supporting this, fluorescence correlation spectroscopy detected binding of a fluorescent H2A.Z-tail nonapeptide to supercoiled?but not relaxed?plasmid DNA, while a scrambled peptide showed negligible binding. The DNA topology-dependent binding of the unstructured H2A.Z C-terminus, by affecting nucleosome stability, may be of functional significance in various roles of the histone variant, demonstrating the strong interplay between DNA topology and nucleosome stability and exemplifying how it may be exploited by the cell for regulatory purposes.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk H2A.Z nucleosome stability superhelicity C-terminal tail
Megjelenés:	Nucleus. - 16 : 1 (2025), p. 1-14. -
További szerzők:	Imre László (1979-) (biológus) Yu, Zutao Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Sen, Pialy (1996-) Enyedi Kata Nóra (1987-) (vegyész) Goda Katalin (1969-) (biofizikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	K138524 OTKA ANN 135107 OTKA K146028 OTKA ERA-Net NEURON 2024-1.2.2-ERA_NET-2024?00009 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM040294
035-os BibID:	(scopus)33750011602 (wos)000241117100006
Első szerző:	Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:	Chip-on-beads : flow-cytometric evaluation of chromatin immunoprecipitation / Székvölgyi L., Bálint B. L., Imre L., Goda K., Szabó M., Nagy L., Szabó G.
Dátum:	2006
ISSN:	1552-4922
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Cytometry. Part A. - 69A : 10 (2006), p. 1086-1091. -
További szerzők:	Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Imre László (1979-) (biológus) Goda Katalin (1969-) (biofizikus) Szabó Miklós (vegyészmérnök) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM001049
035-os BibID:	(scopus)35448970162 (wos)000249715100018
Első szerző:	Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:	Ribonucleoprotein-masked nicks at 50-kbp intervals in the eukaryotic genomic DNA / Lóránt Székvölgyi, Zsuzsa Rákosy, Bálint L. Bálint, Endre Kókai, László Imre, György Vereb, Zsolt Bacsó, Katalin Goda, Sándor Varga, Margit Balázs, Viktor Dombrádi, László Nagy, Gábor Szabó
Dátum:	2007
Megjegyzések:	By using a microscopic approach, field inversion single-cell gel electrophoresis, we show that preformed single-strand discontinuities are present in the chromatin of resting and proliferating mammalian and yeast cells. These single-strand breaks are primarily nicks positioned at approximately 50-kbp intervals throughout the entire genome that could be efficiently labeled in situ by DNA polymerase I holoenzyme but not by Klenow fragment and terminal transferase unless after ribonucleolytic treatments. The RNA molecules involved appear to comprise R-loops, recognized by the S9.6 RNA/DNA hybrid-specific antibody. By using the breakpoint cluster region of the Mixed Lineage Leukemia (MLL) gene as a model, we have found that the number of manifest nicks detected by FISH performed after field inversion single-cell gel electrophoresis depends on epigenetic context, but the difference between germ-line and translocated MLL alleles is abolished by protease treatment. Our data imply that the double-stranded genomic DNA is composed of contiguous rather than continuous single strands and reveal an aspect of higher-order chromatin organization with ribonucleoprotein-associated persistent nicks defining approximately 50-kbp domains.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Természettudományok Elméleti orvostudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk chromatin loop RNA/DNA hybrid translocation
Megjelenés:	Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 104 : 38 (2007), p. 14964-14969. -
További szerzők:	Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Imre László (1979-) (biológus) Vereb György (1965-) (biofizikus, orvos) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Goda Katalin (1969-) (biofizikus) Varga Sándor (1943-) (biofizikus) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:	elektronikus változat DOI
Borító:
Saját polcon: