CCL

Összesen 5 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM131622
035-os BibID:(scopus)105011746733
Első szerző:Hajdu Tímea (biomérnök)
Cím:Fluorescence labeling-induced structural rearrangement of a monoclonal IgG revealed by biophysical experiments and simulations / Hajdu Tímea, Rebenku István, Cano Tayde Gabriela Serrano, Mocsár Gábor, Bécsi Bálint, Erdődi Ferenc, Nagy Peter
Dátum:2025
ISSN:0141-8130
Megjegyzések:Although it is known that labeling antibodies with fluorescent dyes impairs their function, the underlying mechanism remains unclear. In this study, we show that multiple antibody functions decline in a strikingly similar way as the degree of labeling increases, suggesting that labeling induces a global structural change affecting the entire IgG molecule. Fluorescence anisotropy decay experiments revealed faster nanosecond-scale dynamics in labeled antibodies. FRET measurements showed that the Fc region moves closer to the hypervariable region upon labeling, further indicating major structural rearrangements. Molecular dynamics simulations confirmed that labeled antibodies adopt a more compact structure, bringing the Fc and Fab regions closer together. During simulations, the dye molecules gradually became less exposed to solvent, implicating the hydrophobic effect as a driver of structural collapse. The reduced antigen-binding affinity caused by labeling was partially restored by glycerol, likely due to its ability to weaken hydrophobic interactions. Together, these findings provide molecular-level insight into how fluorescent labeling disrupts antibody structure and function.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Fluoreszcens jelölés
IgG struktúra és dinamika
hidrofób effektus
Megjelenés:International Journal Of Biological Macromolecules. - 321 (2025), p. 1-45. -
További szerzők:Rebenku István (1990-) (molekuláris biológus) Serrano Cano, Tayde Gabriela (1993-) (molekuláris biológus) Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Bécsi Bálint (1981-) (vegyészmérnök) Erdődi Ferenc (1953-) (biokémikus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:Ann133421
OTKA
K138075
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM065104
035-os BibID:(WoS)000380371400013 (Scopus)84993661764
Első szerző:Mocsár Gábor (biofizikus)
Cím:MHC I expression regulates co-clustering and mobility of interleukin-2 and -15 receptors in T cells / G. Mocsár, J. Volkó, D. Rönnlund, J. Widengren, P. Nagy, J. Szöllősi, K. Tóth, C. K. Goldman, S. Damjanovich, T. A. Waldmann, A. Bodnár, G. Vámosi
Dátum:2016
ISSN:0006-3495
Megjegyzések:MHC glycoproteins form supramolecular clusters with interleukin-2 and -15 receptors in lipid rafts of T cells.The role of highly expressed MHC I in maintaining these clusters is unknown. We knocked down MHC I inFT7.10 human T cells, and studied protein clustering at two hierarchic levels: molecular aggregations andmobility by FRET and fluorescence correlation spectroscopy, and segregation into larger domains orsuperclusters by superresolution STED microscopy. FCS based molecular brightness analysis revealed thatthe studied molecules diffused as tight aggregates of several proteins of a kind. Knockdown reduced thenumber of MHC I containing molecular aggregates and their average MHC I content, and decreased theheteroassociation of MHC I with IL-2R?/IL-15R?. The mobility of not only MHC I but also that of IL-2R?/IL-15R? increased, corroborating the general size decrease of tight aggregates. A multifaceted analysis of STEDimages revealed that the diameter of MHC I superclusters diminished from 400-600 to 200-300 nm, whereasthose of IL-2R?/IL-15R? hardly changed. MHC I and IL-2R?/IL-15R? colocalized with GM1 gangliosiderichlipid rafts, but MHC I clusters retracted to smaller subsets of GM1- and IL-2R?/IL-15R?-rich areas uponknockdown. Our results prove that changes in expression level may significantly alter the organization andmobility of interacting membrane proteins.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Biophysical Journal. - 111 : 1 (2016), p. 100-112. -
További szerzők:Volkó Julianna (1983-) (biotechnológus) Rönnlund, Daniel Widengren, Jerker Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Tóth Katalin (Heidelberg) Goldman, Caroline K. Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus) Waldmann, Thomas A. Dóczy-Bodnár Andrea (1970-) (biofizikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM131499
035-os BibID:(scopus)105009842819 (wos)001532825300001
Első szerző:Nagyné Szabó Ágnes Timea (vegyész)
Cím:Local ligand concentration gradients induced by the plasma membrane / Szabó Ágnes, Tóth Gabriella, Szatmári Tímea, Mocsár Gábor, Rebenku István, Szöllősi János, Nagy Peter
Dátum:2025
ISSN:2589-0042
Megjegyzések:The plasma membrane is a dynamic structure surrounded by the extracellular matrix. Although stimulation of transmembrane proteins by soluble ligands takes place in this environment, its influence on receptor activation is usually overlooked. In the current manuscript, we quantitatively measured the concentration of epidermal growth factor (EGF) at the cell membrane and found that ligand distribution is non-homogeneous due to two concentration peaks causing significantly higher EGF concentrations at the membrane than in the bulk solution. Using experiments, calculations, and simulations, we show that the membrane-proximal peak is caused by membrane turnover, while the more distant one, only present in ErbB2-expressing cells, is generated by locally hindered diffusion possibly caused by the extracellular matrix. Both theory and experiments reveal that these phenomena increase the apparent affinity and decrease the apparent cooperativity of the receptor-ligand complex. Interpretation of the effects of soluble ligands interacting with receptors must involve this non-homogenous concentration profile.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Theoretical physics
Biological sciences
Membranes
Biophysics
Computer simulation
Megjelenés:iScience. - 28 : 7 (2025), p. 1-12. -
További szerzők:Tóth Gabriella (1996-) (tudományos segédmunkatárs) Szatmári Tímea (1989-) (molekuláris biológus) Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Rebenku István (1990-) (molekuláris biológus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K138075
OTKA
ANN133421
OTKA
EKÖP-24-4-I-DE-281
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM076128
035-os BibID:(Wos)000450299400006 (Scopus)85055751019
Első szerző:Nizsalóczki Enikő
Cím:Minimum degree of overlap between IL-9R and IL-2R on human T lymphoma cells : a quantitative CLSM and FRET analysis / Nizsalóczki Enikő, Nagy Péter, Mocsár Gábor, Szabó Ágnes, Csomós István, Waldmann Thomas A., Vámosi György, Mátyus László, Bodnár Andrea
Dátum:2018
ISSN:1552-4922 1552-4930
Megjegyzések:The heterodimeric receptor complex of IL-9 consists of the cytokine-speci?c ?-subunit and the common ? -chain shared with other cytokines, including IL-2, a central regulator of T cell function. We have shown previously the bipartite spatial relationship of IL-9 and IL-2 receptors at the surface of human T lymphoma cells: in addition to common clusters, expression of the two receptor kinds could also be observed in segregated membrane areas. Here we analyzed further the mutual cell surface organization of IL-9 and IL-2 receptors. Complementing Pearson correlation data with co-occurrence analysis of confocal microscopic images revealed that a minimum degree of IL-9R/IL-2R co-localization exists at the cell surface regardless of the overall spatial correlation of the two receptor kinds. Moreover, our FRET experiments demonstrated molecular scale assemblies of the elements of the IL-9/IL-2R system. Binding of IL-9 altered the structure and/or composition of these clusters. It is hypothesized, that by sequestering receptor subunits in common membrane areas, the overlapping domains of IL-9R and IL-2R provide a platform enabling both the formation of the appropriate receptor complex as well as subunit sharing between related cytokines.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
IL-9 and -2 receptors
uorescence resonance energy transfer
Manders coef-cient
co-occurrence analysis
Pearson correlation analysis
confocal microscopy
human T lymphoma cells
co-localization of membrane proteins
Megjelenés:Cytometry Part A. - 93 : 11 (2018), p. 1106-1117. -
További szerzők:Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Nagyné Szabó Ágnes Timea (1982-) (vegyész) Csomós István (1983-) (molekuláris biológus) Waldmann, Thomas A. Vámosi György (1967-) (biofizikus) Mátyus László (1956-) (biofizikus) Dóczy-Bodnár Andrea (1970-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00003
GINOP
K120302
OTKA
Intramural research program of the National Cancer Institute, NIH
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM036992
Első szerző:Volkó Julianna (biotechnológus)
Cím:MHC I organizes protein clusters and inhibits IL-2/IL-15 signaling in human T cells / Volkó Julianna, Mocsár Gábor, Menczel Enikő, Nagy Péter, Tóth Katalin, Thomas A. Waldmann, Damjanovich Sándor, Bodnár Andrea, Vámosi György
Dátum:2011
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idézhető absztrakt
MHC I
interleukin-2 receptor
IL-15 receptor
protein cluster
FRET
IL-2 signaling
Molekuláris Medicina
Molekuláris Medicina
Megjelenés:European Biophysics Journal : with Biophysics Letters. - 40 : 1 (2011), p. 86-86. -
További szerzők:Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Menczel Enikő (1989-) (molekuláris biológus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Tóth Katalin Waldmann, Thomas A. Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus) Dóczy-Bodnár Andrea (1970-) (biofizikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Fehérje-fehérje kölcsönhatások limfociták membránjában és a sejtmagban
K77600
OTKA
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Receptor tirozin kinázok mint terápiás célpontok: működésük szabályozásának, és a közöttük fellépő molekuláris kölcsönhatások vizsgálata
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v10.11.18-SNAPSHOT © 2024 Monguz kft. Minden jog fenntartva.