CCL

Összesen 5 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM069210
035-os BibID:(WoS)000399448400018 (Scopus)85019057713
Első szerző:Bojcsuk Dóra (klinikai laboratóriumi kutató)
Cím:Inducible super-enhancers are organized based on canonical signal-specific transcription factor binding elements / Dóra Bojcsuk, Gergely Nagy, Balint L. Balint
Dátum:2017
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
super-enhancer
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 45 : 7 (2017), p. 3693-3706. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Pályázati támogatás:TAMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM082431
035-os BibID:(WoS)000518532100013 (Scopus)85077771431
Első szerző:Csumita Mária (biomérnök)
Cím:Specific enhancer selection by IRF3, IRF5 and IRF9 is determined by ISRE half-sites, 5' and 3' flanking bases, collaborating transcription factors and the chromatin environment in a combinatorial fashion / Mária Csumita, Attila Csermely, Attila Horvath, Gergely Nagy, Fanny Monori, Loránd Göczi, Hans-Acha Orbea, Walter Reith, Lajos Széles
Dátum:2020
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 48 : 2 (2020), p. 589-604. -
További szerzők:Csermely Attila Horváth Attila (orvos) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Monori Fanny (mérnökinformatikus) Göczi Loránd (informatikus) Orbea, Hans-Acha Reith, Walter Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM076312
035-os BibID:(WoS)000433056900015 (Scopus)85054167767
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The IL-4/STAT6/PPAR[gamma] signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages / Daniel Bence, Nagy Gergely, Horvath Attila, Czimmerer Zsolt, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Poliska Szilard, Hays Tristan T., Sauer Sascha, Francois-Deleuze Jean, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 46 : 9 (2018), p. 4425-4439. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Hays, Tristan T. Sauer, Sascha Francois-Deleuze, Jean Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:PD124843
OTKA
K124298
OTKA
K126885
OTKA
K116855
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM131886
035-os BibID:(scopus)105002543351 (wos)001458817600010
Első szerző:Mianesaz, Hamidreza (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Genomic regions occupied by both RARα and VDR are involved in the convergence and cooperation of retinoid and vitamin D signaling pathways / Mianesaz Hamidreza, Göczi Loránd, Nagy Gergely, Póliska Szilárd, Fadel Lina, Bojcsuk Dóra, Penyige András, Szirák Krisztina, AlHaman Farah, Nagy László, Vámosi György, Széles Lajos
Dátum:2025
ISSN:0305-1048 1362-4962
Megjegyzések:Retinoic acid receptors (RARs) and the vitamin D receptor (VDR) regulate distinct but o v erlapping gene sets in multiple cell types. The abun- dance and characteristics of regulatory regions, occupied by both RARs and VDR are largely unexplored. We used global approaches (ChIP-seq, RNA-seq, and A T AC-seq) and bioinformatics tools to map and characterize common binding regions of RAR ?and VDR in differentiated human THP -1 cells. W e f ound that the cistromes of ligand-activ ated RAR ?and VDR largely o v erlapped, and their agonists (AM580 and calcitriol) co- regulated se v eral genes, often cooperativ ely. Common binding regions w ere frequently (but not e x clusiv ely) annotated with co-regulated genes and exhibited increased MED1 occupancy upon ligand stimulation, suggesting their in v olv ement in gene regulation. Chromatin accessibility was typically higher in the common regions than in regions occupied e x clusiv ely b y RAR ?or VDR. DNA response elements f or RAR ?(DR1 / 2 / 5) and VDR (DR3) were enriched in the common regions, albeit the co-occurrence of the two types of canonical motifs w as lo w (8.4%), suggesting that "degenerate"DR1 / 2 / 5 and DR3 motifs or other sequences could mediate the binding. In summary, common binding regions of RAR ?and VDR are at the crossroads of the retinoid and vitamin D pathw a y s, pla ying important roles in their con v ergence and cooperation.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 53 : 6 (2025), p. 1-20. -
További szerzők:Göczi Loránd (1993-) (PhD Hallgató) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Fadel, Lina (1988-) (gyógyszerész) Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Penyige András (1954-) (molekuláris genetikus) Szirák Krisztina (1973-) (molekuláris genetikus) AlHaman, Farah Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:FK146945
OTKA
PD137902
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM119741
035-os BibID:(Scopus)85190768639 (WoS)001160675100001
Első szerző:Nagy Gergely (molekuláris biológus)
Cím:Lineage-determining transcription factor-driven promoters regulate cell type-specific macrophage gene expression / Gergely Nagy, Dóra Bojcsuk, Petros Tzerpos, Tímea Cseh, László Nagy
Dátum:2024
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 52 : 8 (2024), p. 4234-4256. -
További szerzők:Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Silye-Cseh Timea (1985-) (Biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:NKFIH KKP129909
Egyéb
NKFIH PD137902
Egyéb
NKFIH PD135102
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1