CCL

Összesen 23 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM114434
035-os BibID:(Scopus)85169116190 (WoS)001063702100001
Első szerző:Csizmarik Anita
Cím:Comparative proteome and serum analysis identified FSCN1 as a marker of abiraterone resistance in castration-resistant prostate cancer / Csizmarik Anita, Nagy Nikolett, Keresztes Dávid, Váradi Melinda, Bracht Thilo, Sitek Barbara, Witzke Kathrin, Puhr Martin, Tornyi Ilona, Lázár József, Takács László, Kramer Gero, Sevcenco Sabina, Maj-Hes Agnieszka, Hadaschik Boris, Nyirády Péter, Szarvas Tibor
Dátum:2024
ISSN:1365-7852
Megjegyzések:Background: Abiraterone (Abi) is an androgen receptor signaling inhibitor that significantly improves patients' life expectancy in metastatic prostate cancer (PCa). Despite its beneficial effects, many patients have baseline or acquired resistance against Abi. The aim of this study was to identify predictive serum biomarkers for Abi treatment. Methods: We performed a comparative proteome analysis on three Abi sensitive (LNCaPabl, LAPC4, DuCaP) and resistant (LNCaPabl-Abi, LAPC4-Abi, DuCaP-Abi) PCa cell lines using liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) technique. Two bioinformatic selection workflows were applied to select the most promising candidate serum markers. Serum levels of selected proteins were assessed in samples of 100 Abi-treated patients with metastatic castration-resistant disease (mCRPC) using ELISA. Moreover, FSCN1 serum concentrations were measured in samples of 69 Docetaxel (Doc) treated mCRPC patients. Results: Our proteome analysis identified 68 significantly, at least two-fold upregulated proteins in Abi resistant cells. Using two filtering workflows four proteins (AMACR, KLK2, FSCN1 and CTAG1A) were selected for ELISA analyses. We found high baseline FSCN1 serum levels to be significantly associated with poor survival in Abi-treated mCRPC patients. Moreover, the multivariable analysis revealed that higher ECOG status (>1) and high baseline FSCN1 serum levels (>10.22 ng/ml by ROC cut-off) were independently associated with worse survival in Abi-treated patients (p < 0.001 and p = 0.021, respectively). In contrast, no association was found between serum FSCN1 concentrations and overall survival in Doc-treated patients. Conclusions: Our analysis identified baseline FSCN1 serum levels to be independently associated with poor survival of Abi-treated, but not Doc-treated mCRPC patients, suggesting a therapy specific prognostic value for FSCN1.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Prostate Cancer And Prostatic Diseases. - 27 : 3 (2024), p. 451-456. -
További szerzők:Nagy Nikoletta Keresztes Dávid Váradi Melinda Bracht, Thilo Sitek Barbara Witzke, Kathrin Puhr, Martin Tornyi Ilona (1982-) (molekuláris biológus) Lázár József Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Kramer, Gero Sevcenko, Sabina Maj-Hes, Agnieszka Hadaschik, Boris Nyirády Péter Szarvas Tibor (urológus)
Pályázati támogatás:NKFIH / FK 124431
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM102408
035-os BibID:(WoS)000813770800001 (Scopus)85132153955
Első szerző:Csizmarik Anita
Cím:Proteome profiling of enzalutamide-resistant cell lines and serum analysis identified as marker of resistance in castration-resistant prostate cancer / Csizmarik Anita, Keresztes Dávid, Nagy Nikolett, Bracht Thilo, Sitek Barbara, Witzke Kathrin, Puhr Martin, Tornyi Ilona, Lázár József, Takács László, Kramer Gero, Sevcenco Sabina, Maj-Hes Agnieszka, Jurányi Zsolt, Hadaschik Boris, Nyirády Péter, Szarvas Tibor
Dátum:2022
ISSN:0020-7136
Megjegyzések:Enzalutamide (ENZA) is a frequently used therapy in metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC). Baseline or acquired resistance to ENZA have been observed, but the molecular mechanisms of resistance are poorly understood. We aimed to identify proteins involved in ENZA resistance and to find therapy-predictive serum markers. We performed comparative proteome analyses on ENZA-sensitive parental (LAPC4, DuCaP) and -resistant prostate cancer cell lines (LAPC4-ENZA, DuCaP-ENZA) using liquid chromatography tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). The top 4 most promising candidate markers were selected using bioinformatic approaches. Serum concentrations of selected markers (ALCAM, AGR2, NDRG1, IDH1) were measured in pre-treatment samples of 72 ENZA-treated mCRPC patients using ELISA. In addition, ALCAM serum levels were measured in 101 Abiraterone (ABI) and 100 Docetaxel (DOC)-treated mCRPC patients' baseline samples. Results were correlated with clinical and follow-up data. The functional role of ALCAM in ENZA resistance was assessed in vitro using siRNA. Our proteome analyses revealed 731 significantly differentially abundant proteins between ENZA-sensitive and -resistant cells and our filtering methods identified 4 biomarker candidates. Serum analyses of these proteins revealed only ALCAM to be associated with poor patient survival. Furthermore, higher baseline ALCAM levels were associated with poor survival in ABI- but not in DOC-treated patients. In LAPC4-ENZA resistant cells, ALCAM silencing by siRNA knockdown resulted in significantly enhanced ENZA sensitivity. Our analyses revealed that ALCAM serum levels may help to identify ENZA- and ABI-resistant patients and may thereby help to optimize future clinical decision-making. Our functional analyses suggest the possible involvement of ALCAM in ENZA resistance.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal Of Cancer. - 151 : 8 (2022), p. 1405-1419. -
További szerzők:Keresztes Dávid Nagy Nikoletta Bracht, Thilo Sitek Barbara Witzke, Kathrin Puhr, Martin Tornyi Ilona (1982-) (molekuláris biológus) Lázár József Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Kramer, Gero Sevcenko, Sabina Maj-Hes, Agnieszka Jurányi Zsolt Hadaschik, Boris Nyirády Péter Szarvas Tibor (urológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM092340
Első szerző:Csizmarik Anita
Cím:Az abirateron rezisztenciában szerepet játszó fehérje markerek azonosítása prosztatarákban / Csizmarik Anita, Nagy Nikolett, Váradi Melinda, Keresztes Dávid, Thilo Bracht, Barbara Sitek, Martin Puhr, Tornyi Ilona, Lázár József, Takács László, Boris Hadaschik, Nyirády Péter, Szarvas Tibor
Dátum:2020
ISSN:0864-8921
Megjegyzések:Bevezetés: A metasztatikus, kasztráció-rezisztens prosztatarák (mCRPC) kezelésére használt abirateron (ABI) egy olyan CYP17A1 enzim blokkoló, mely az androgén bioszintézis gátlásán keresztül csökkenti az endogén tesztoszteron szintet, ezzel növelve a betegek életminőségét és túlélését. Azonban az ABI terápiánál is megfigyelhető a kezelés kezdetén vagy a kezelés során fellépő rezisztencia mechanizmusa. Ezért kutatásunk célja olyan rezisztenciában részt vevő fehérjék azonosítása, melyekkel előre jelezhetjük a terápia hatékonyságát, ezzel segítve a klinikai döntéshozatalt. Anyag és módszer: Kutatásunk során komparatív proteomikai analízist végeztünk három ABI ellen rezisztenssé tett (LNCaPabl-AR, DUCaP-AR, LAPC4-AR) és érzékeny prosztatarákos sejtvonal páron (LNCaPabl, DUCaP, LAPC4) melyhez az LC-MS/MS módszert használtuk. A kapott proteomikai eredmények kiértékeléséhez többféle bioinformatikai megközelítést is alkalmaztunk. Az így kiválasztott fehérjék (AMARC, KLK2, CTAG1, APOD, AHNAK és FSCN1) szérumkoncentrációját 100 ABI kezelt beteg mintáiban határoztuk meg ELISA módszerrel. A kapott eredményeket a betegek klinikopatológiai adataival és betegségfüggő túlélésével vetettük össze. Eredmények: A proteomikai vizsgálatunkkal azonosítottunk 68 szignifikánsan emelkedett expressziójú fehérjét az ABI rezisztens sejtekben, melyekből kiválasztottunk 6 fehérjét további ELISA vizsgálatra. A vizsgált fehérjék közül a KLK2 és a FSCN1 emelkedett szérumkoncentráció mutattak összefüggést a betegek rövidebb túlélésével. A multivariancia analízis alapján a kezelés előtti emelkedett PSA, KLK2 és FSCN1 koncentrációk egymástól független prognosztikus faktornak bizonyultak a betegek túlélésének tekintetében. Következtetés: Eredményeink alapján a KLK2 és FSCN1 szérumkoncentrációinak meghatározása alkalmas lehet az ABI rezisztencia előrejelzésére, ezáltal segítségül szolgálhat az mCRPC betegek megfelelő terápiájának a kiválasztására. A jövőben a két fehérje rezisztenciában betöltött szerepét fogjuk vizsgálni sejtkultúrás módszerekkel, továbbá az ABI-érzékeny és rezisztens sejteken teljes exom, metilom és transzkriptom szekvenálását is végzünk.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok poszter
folyóiratcikk
Megjelenés:Magyar Urológia. - 32 : 3 (2020), p. 1-2. -
További szerzők:Nagy Nikoletta Váradi Melinda Keresztes Dávid Bracht, Thilo Sitek Barbara Puhr, Martin Tornyi Ilona (1982-) (molekuláris biológus) Lázár József Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Hadaschik, Boris Nyirády Péter Szarvas Tibor (matematikus informatikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM092329
Első szerző:Csizmarik Anita
Cím:A prognosztarák enzalutamid elleni rezisztenciájában szerepet játszó fehérjék azonosítása / Csizmarik Anita, Thilo Bracht, Barbara Sitek, Martin Puhr, Tornyi Ilona, Lázár József, Takács László, Keresztes Dávid, Nagy Nikolett, Váradi Melinda, Boris Hadaschik, Nyirády Péter, Szarvas Tibor
Dátum:2020
ISSN:0864-8921
Megjegyzések:Bevezetés: A metasztatikus kasztráció-rezisztens prosztatarák (mCRPC) kezelésében alkalmazott új-generációs antiandrogén terápiák közé tartozó enzalutamid (ENZA) esetében is megfigyelhető a kezdeti (baseline) vagy a kezelés során fellépő (szerzett) rezisztencia. Ezért célunk olyan fehérje biomarkerek azonosítása, melyek előre jelezhetik a terápiarezisztenciát, ezzel segítve a helyes terápiás döntéshozatalt. Anyag és módszer: Összehasonlító proteomikai vizsgálatot végeztünk ENZA-érzékeny (LNCaPabl, LAPC4, DUCAP) és rezisztens (LNCaPabl-ER, LAPC4-ER, DUCAP-ER) prosztatarák sejtvonalpárokon, folyadékkromatográfiához kapcsolt, tandem tömegspektroszkópiás módszerrel (LC-MS/MS). A kapott eredmények kiértékeléséhez bioinformatikai módszereket alkalmaztunk. Az így kiválasztott 6 fehérje (ALCAM, AGR2, NDRG1, RRM2, GR, IDH1) szérumkoncentrációját 72 ENZA kezelt CRPC beteg kezelés előtti mintáiban mértük meg ELISA módszer segítségével. Mérési eredményeinket a betegek klinikopatológiai paramétereivel és a betegségfüggő túléléssel vetettük össze. Eredmények: Proteomikai vizsgálatunkkal 278 - az ENZA rezisztens sejtekben szignifikánsan felülexpresszálódó - fehérjét azonosítottunk, melyekből bioinformatikai szűréssel hat szérumfehérjét választottunk ki ELISA vizsgálatra. A vizsgált 6 közül 5 fehérjét sikerült kimutatnunk a betegek szérum mintáiban. Közülük egyedül az ALCAM magasabb koncentrációi mutattak szignifikáns összefüggést az ENZA-kezelt betegek rövidebb túlélésével. Multivariancia analízissel vizsgálva a csont metasztázis jelenléte, a magas kezelés előtti PSA és ALCAM szérumszintek egymástól független prognosztikus faktornak bizonyoltuk a betegek túlélésének tekintetében. Következtetés: Eredményeink azt mutatják, hogy az ALCAM koncentráció meghatározása segítséget nyújthat az mCRPC betegek megfelelő terápiájának a megválasztásában. A továbbiakban a proteomikai vizsgálattal azonosított 278 rezisztencia fehérje közül továbbiak kiválasztását és vizsgálatát tervezzük, valamint laboratóriumi módszerekkel vizsgálni fogjuk az ALCAM fehérje ENZA rezisztenciában betöltött funkcionális szerepét is.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok poszter
folyóiratcikk
Megjelenés:Magyar Urológia. - 32 : 1 (2020), p. 1-2. -
További szerzők:Bracht, Thilo Sitek Barbara Puhr, Martin Tornyi Ilona (1982-) (molekuláris biológus) Lázár József Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Keresztes Dávid Nagy Nikoletta Váradi Melinda Hadaschik, Boris Nyirády Péter Szarvas Tibor (matematikus informatikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM065593
Első szerző:Gall-Debreceni Anna
Cím:Specific detection and quantitation of bovine IgG in bioreactor derived mouse mAb preparations / Anna Gall-Debreceni, Jozsef Lazar, Janos Kadas, Attila Balogh, Annamaria Ferenczi, Endre Sos, Laszlo Takacs, Istvan Kurucz
Dátum:2016
ISSN:0022-1759
Megjegyzések:Monoclonal antibody and recombinant protein production benefits greatly from bovine serum as an additive. The caveat is that bovine serum IgG, co-purifies with mAbs and IgG Fc-containing fusion proteins and it presents a contaminant in the end products. In order to analytically validate the products, species specific reagents are needed that react with bovine IgG exclusively. Our attempts to find such commercially available reagents failed. Here, we report the production of species specific mAbs which recognize bovine IgG even in the presence of excess amount of mouse IgG. We present five mAbs: Bsi4028, Bsi4032, Bsi4033, Bsi4034 and Bsi4035 suitable to determine the presence of bovine IgG contamination via ELISA or immunoblotting in bioreactor derived mouse mAb preparations. To quantitate bovine IgG content we developed sensitive sandwich ELISAs capable to detect bovine IgG contaminant in the ng/ml (~10-11M/l) range. Finally, we show that bovine IgG is efficiently removed from bioreactor produced mouse mAb preparation via affinity depletion columns prepared with Bsi4028, Bsi4032, Bsi4033, Bsi4034, Bsi4035 mAbs.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Bovine IgG contamination
Detection
Monoclonal antibody
Purification
Megjelenés:Journal of Immunological Methods. - 438 (2016), p. 26-34. -
További szerzők:Lázár József Kádas János (1976-) (molekuláris biológus, biokémikus, kertészmérnök) Balogh Attila Ferenczi Annamária (1986-) (molekuláris biológus, mikrobiológus) Sós Endre Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Kurucz István
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM069259
Első szerző:Hajdú István (Dunakeszi)
Cím:Monoclonal antibody proteomics : use of antibody mimotope displaying phages and the relevant synthetic peptides for mAb scouting / Hajdú István, Flachner Beáta, Bognár Melinda, Végh Barbara M., Dobi Krisztina, Lőrincz Zsolt, Lázár József, Cseh Sándor, Takács László, Kurucz István
Dátum:2014
ISSN:0165-2478
Megjegyzések:Monoclonal antibody proteomics uses nascent libraries or cloned (PlasmascanTM, QuantiPlasmaTM)libraries of mAbs that react with individual epitopes of proteins in the human plasma. At the initialphase of library creation, cognate protein antigen and the epitope interacting with the antibodies arenot known. Scouting for monoclonal antibodies (mAbs) with the best binding characteristics is of highimportance for mAb based biomarker assay development. However, in the absence of the identity ofthe cognate antigen the task represents a challenge. We combined phage display, and surface plasmonresonance (Biacore) experiments to test whether specific phages and the respective mimotope peptidesobtained from large scale studies are applicable to determine key features of antibodies for scouting. Weshow here that mAb captured phage-mimotope heterogeneity that is the diversity of the selected peptidesequences, is inversely correlated with an important binding descriptor; the off-rate of the antibodies andthat represents clues for driving the selection of useful mAbs for biomarker assay development. Carefullychosen synthetic mimotope peptides are suitable for specificity testing in competitive assays using thetarget proteome, in our case the human plasma.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Proteomics
Monoclonal antibod
y Phage-display
Surface plasmon resonance
Affinity
Megjelenés:Immunology Letters. - 160 : 2 (2014), p. 172-177. -
További szerzők:Flachner Beáta Bognár Melinda Végh Barbara M. Dobi Krisztina Lőrincz Zsolt (1979-) (Biológus) Lázár József Cseh Sándor (1954-) (állatorvos) Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Kurucz István
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM099495
035-os BibID:(WoS)000736442000001 (Scopus)85122081449
Első szerző:Keresztes Dávid
Cím:Comparative proteome analysis identified CD44 as a possible serum marker for docetaxel resistance in castration-resistant prostate cancer / Keresztes Dávid, Csizmarik Anita, Nagy Nikolett, Módos Orsolya, Fazekas Tamás, Bracht Thilo, Sitek Barbara, Witzke Kathrin, Puhr Martin, Sevcenco Sabina, Kramer Gero, Shariat Shahrokh, Küronya Zsófia, Takács László, Tornyi Ilona, Lázár József, Hadaschik Boris, Lászik András, Szűcs Miklós, Nyirády Péter, Szarvas Tibor
Dátum:2022
ISSN:1582-1838 1582-4934
Megjegyzések:Baseline or acquired resistance to docetaxel (DOC) represents a significant risk for patients with metastatic prostate cancer (PC). In the last years, novel therapy regimens have been approved providing reasonable alternatives for DOC-resistant patients making prediction of DOC resistance of great clinical importance. We aimed to identify serum biomarkers, which are able to select patients who will not benefit from DOC treatment. DOC-resistant PC3-DR and DU145-DR sublines and their sensitive parental cell lines (DU145, PC3) were comparatively analyzed using liquid chromatography-coupled tandem mass spectrometry (LC-MS/MS). Results were filtered using bioinformatics approaches to identify promising serum biomarkers. Serum levels of five proteins were determined in serum samples of 66 DOC-treated metastatic castration-resistant PC patients (mCRPC) using ELISA. Results were correlated with clinicopathological and survival data. CD44 was subjected to further functional cell culture analyses. We found at least 177 two-fold significantly overexpressed proteins in DOC-resistant cell lines. Our bioinformatics method suggested 11/177 proteins to be secreted into the serum. We determined serum levels of five (CD44, MET, GSN, IL13RA2 and LNPEP) proteins in serum samples of DOC-treated patients and found high CD44 serum levels to be independently associated with poor overall survival (p = 0.001). In accordance, silencing of CD44 in DU145-DR cells resulted in re-sensitization to DOC. In conclusion, high serum CD44 levels may help identify DOC-resistant patients and may thereby help optimize clinical decision-making regarding type and timing of therapy for mCRPC patients. In addition, our in vitro results imply the possible functional involvement of CD44 in DOC resistance.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
biomarker research
castration-resistant prostate cancer
comparative proteome analysis
docetaxel resistance
LC-MS/MS
Megjelenés:Journal Of Cellular And Molecular Medicine. - 26 : 4 (2022), p. 1332-1337. -
További szerzők:Csizmarik Anita Nagy Nikoletta Módos Orsolya Fazekas Tamás (1950-) (kardiológus) Bracht, Thilo Sitek Barbara Witzke, Kathrin Puhr, Martin Sevcenko, Sabina Kramer, Gero Shariat, Sharokh Küronya Zsófia Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Tornyi Ilona (1982-) (molekuláris biológus) Lázár József Hadaschik, Boris Lászik András Szűcs Miklós (urológus SOTE) Nyirády Péter Szarvas Tibor (matematikus informatikus)
Pályázati támogatás:FK 124431
NKFIH
NVKP_16-1-2016-004
NKFIH
ÚNKP-20- 5-SE-1
Egyéb
ÚNKP-20-3-II-SE-8
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM047874
035-os BibID:PMID:21732557
Első szerző:Kovács András László (biológus, biológia-kémia tanár)
Cím:Fractionation of the human plasma proteome for monoclonal antibody proteomics-based biomarker discovery / András Kovács, Edit Sperling, József Lázár, Attila Balogh, János Kádas, Ákos Szekrényes, László Takács, István Kurucz, András Guttman
Dátum:2011
ISSN:0173-0835
Megjegyzések:mAb proteomics, a reversed biomarker discovery approach, is a novel methodology to recognize the proteins of biomarker potential, but requires subsequent antigen identification steps. While in case of high-abundant proteins, it generally does not represent a problem, for medium or lower abundant proteins, the identification step requires a large amount of sample to assure the proper amount of antigen for the ID process. In this article, we report on the use of combined chromatographic and precipitation techniques to generate a large set of fractions representing the human plasma proteome, referred to as the Analyte Library, with the goal to use the relevant library fractions for antigen identification in conjunction with mAb proteomics. Starting from 500mL normal pooled human plasma, this process resulted in 783 fractions with the average protein concentration of 1mg/mL. First, the serum albumin and immunoglobulins were depleted followed by prefractionation by ammonium sulfate precipitation steps. Each precipitate was then separated by size exclusion chromatography, followed by cation and anion exchange chromatography. The 20 most concentrated ion exchange chromatography fractions were further separated by hydrophobic interaction chromatography. All chromatography and precipitation steps were carefully designed aiming to maintain the native forms of the intact proteins throughout the fractionation process. The separation route of vitamin D-binding protein (an antibody proteomics lead) was followed in all major fractionation levels by dot blot assay in order to identify the library fraction it accumulated in and the identity of the antigen was verified by Western blot.
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Electrophoresis. - 32 : 15 (2011), p. 1916-1925. -
További szerzők:Sperling Edit Lázár József Balogh Attila (bőrgyógyász) Kádas János (1976-) (molekuláris biológus, biokémikus, kertészmérnök) Szekrényes Ákos (1983-) (vegyészmérnök) Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Kurucz István Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:K81839
OTKA
TECH-09-A1-2009-0113; mABCHIC
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM111963
035-os BibID:(Scopus)85165521769
Első szerző:Lázár József
Cím:Large-scale plasma proteome epitome profiling is an efficient tool for the discovery of cancer biomarkers / Lazar Jozsef, Antal-Szalmas Peter, Kurucz Istvan, Ferenczi Annamaria, Jozsi Mihaly, Tornyi Ilona, Muller Monika, Fekete Janos Tibor, Lamont John, FitzGerald Peter, Gall-Debreceni Anna, Kadas Janos, Vida Andras, Tardieu Nadege, Kieffer Yann, Jullien Anne, Guergova-Kuras Mariana, Hempel William, Kovacs Andras, Kardos Tamas, Bittner Nora, Csanky Eszter, Szilasi Maria, Losonczy Gyorgy, Szondy Klara, Galffy Gabriella, Csada Edit, Szalontai Klara, Somfay Attila, Malka David, Cottu Paul, Bogos Krisztina, Takacs Laszlo
Dátum:2023
ISSN:1535-9476
Megjegyzések:Current proteomic technologies focus on the quantification of protein levels, while little effort is dedicated to the development of systems approaches to simultaneously monitor proteome variability and abundance. Protein variants may display different immunogenic epitopes detectable by monoclonal antibodies. Epitope variability results from alternative splicing, posttranslational modifications, processing, degradation, and complex formation and possess dynamically changing availability of interacting surface structures frequently serve as reachable epitopes, and often carry different functions. Thus, it is highly likely, that the presence of some of the accessible epitopes correlate with function under physiological and pathological conditions. To enable the exploration of the impact of protein variation on the immunogenic epitome first; here, we present a robust and analytically validated protein epitome profiling (PEP) technology for characterizing immunogenic epitopes of the plasma. To this end we prepared mAb libraries directed against the normalized human plasma proteome as a complex natural immunogen. Resulting hybridoma supernatants were selected for mAb production and the corresponding hybridomas were cloned. Monoclonal antibodies react with single epitopes, thus profiling with the libraries is expected to profile many epitopes which we define by the mimotopes, as we present here. Screening blood plasma samples from control subjects (n = 558) and cancer patients (n = 598) for merely 69 native epitopes displayed by 20 abundant plasma proteins resulted in distinct cancer-specific epitope panels that showed high accuracy (AUC 0.826?0.966) and specificity for lung, breast, and colon cancer. Deeper profiling (?290 epitopes of approximately 100 proteins) showed unexpected granularity of the epitope-level expression data and detected neutral and lung-cancer associated epitopes of individual proteins. Biomarker epitope panels selected from a pool of 21 epitopes of 12 proteins were validated in independent clinical cohorts. The results demonstrate the value of PEP as a rich and thus far unexplored source of protein biomarkers with diagnostic potential.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Molecular & Cellular Proteomics. - 22 : 7 (2023), p. 1-18. -
További szerzők:Antal-Szalmás Péter (1968-) (laboratóriumi szakorvos) Kurucz István Ferenczi Annamária (1986-) (molekuláris biológus, mikrobiológus) Józsi Mihály Tornyi Ilona (1982-) (molekuláris biológus) Müller Mónika Fekete János Tibor Lamont, John FitzGerald, Peter Gall-Debreceni Anna Kádas János (1976-) (molekuláris biológus, biokémikus, kertészmérnök) Vida András (1979-) (molekuláris biológus, genetikus) Tardieu, Nadège Kieffer, Yann Jullien, Anne Guergova-Kuras, Mariana Hempel, William Kovács András László (1969-) (biológus, biológia-kémia tanár) Kardos Tamás (1980-) (pulmonológus, klinikai onkológus) Bittner Nóra (1963-) (orvos) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Szilasi Mária (1953-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus, belgyógyász) Losonczy György Szondy Klára Gálffy Gabriella Csada Edit Szalontai Klára Somfay Attila Malka, David Cottu, Paul Bogos Krisztina Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus)
Pályázati támogatás:TECH-09-A1-2009-0113; mAbCHIC
Egyéb
GOP-1.2.1-09-2010-0019
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM098736
035-os BibID:(WoS)000789143800010 (Scopus)85129250973
Első szerző:Lázár József
Cím:Detection of leucine-rich alpha-2-glycoprotein 1-containing immunocomplexes in the plasma of lung cancer patients with epitope-specific mAbs / Lázár József, Kovács András, Tornyi Ilona, Takács László, Kurucz István
Dátum:2022
ISSN:1574-0153 1875-8592
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
LRG1
autoantibody immunocomplexes
biomarker
lung cancer
epitope-oriented ELISA
Megjelenés:Cancer Biomarkers. - 34 : 1 (2022), p. 113-122. -
További szerzők:Kovács András László (1969-) (biológus, biológia-kémia tanár) Tornyi Ilona (1982-) (molekuláris biológus) Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Kurucz István
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM082284
Első szerző:Lázár József
Cím:Plasma protein epitomics profiling detects lung cancer association of various clinical parameters (gender, BMI, copd, staging) / József Lázár, Saima Nur, Péter Antal-Szalmás, György Losonczy, Mária Szilasi, Támas Kardos, Klára Szondy, Gabriella Gálffy, Eszter Csánky, Attila Somfay, László Takács
Dátum:2019
Megjegyzések:Central European Lung Cancer Conference and Best of WCLC 2019 (18)(2019)(Budapest)
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok nem besorolt
További szerzők:Nur, Saima Antal-Szalmás Péter (1968-) (laboratóriumi szakorvos) Losonczy György Szilasi Mária (1953-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus, belgyógyász) Kardos Tamás (1980-) (pulmonológus, klinikai onkológus) Szondy Klára Gálffy Gabriella Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Somfay Attila Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM082277
Első szerző:Rácz Márta
Cím:Removal of abundant proteins to enable global proteome analysis of the human plasma : QC methodlogy development using immunoglobulin and albumin as markers / Márta Rácz, László Takács, András Guttman, József Lázár
Dátum:2013
ISSN:0009-2770
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok poszter
folyóiratcikk
Megjelenés:Chemicke Listy. - 107 (2013), p. S428. -
További szerzők:Takács László (1955-) (genombiológus, immunológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök) Lázár József
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2 
Corvina könyvtári katalógus v10.11.18-SNAPSHOT © 2024 Monguz kft. Minden jog fenntartva.