Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM108258
035-os BibID:	(Scopus)85147780412
Első szerző:	Chang Chien, Yi-Che (pathológus)
Cím:	Molecular Identification and In Silico Protein Analysis of a Novel BCOR-CLGN Gene Fusion in Intrathoracic BCOR-Rearranged Sarcoma / Chang Chien Yi-Che, Madarász Kristóf, Csoma Szilvia Lilla, Mótyán János András, Huang Hsuan-Ying, Méhes Gábor, Mokánszki Attila
Dátum:	2023
ISSN:	2072-6694
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Cancers. - 15 : 3 (2023), p. 1-17. -
További szerzők:	Madarász Kristóf (1996-) (biológus) Csoma Szilvia Lilla (1994-) (Klinikai laboratóriumi kutató) Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Huang, Hsuan-Ying Méhes Gábor (1966-) (patológus) Mokánszki Attila (1983-) (molekuláris biológus Ph.D hallgató)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM129427
035-os BibID:	(scopus)105002288198
Első szerző:	Madarász Kristóf (biológus)
Cím:	BCOR-rearranged sarcomas : In silico insights into altered domains and BCOR interactions / Madarász Kristóf, Mótyán János András, Chang Chien Yi-Che, Bedekovics Judit, Csoma Szilvia Lilla, Méhes Gábor, Mokánszki Attila
Dátum:	2025
ISSN:	0010-4825
Megjegyzések:	BCOR (BCL-6 corepressor) rearranged small round cell sarcoma (BRS) represents an uncommon soft tissue malignancy, frequently characterized by the BCOR::CCNB3 fusion. Other noteworthy fusions include BCOR::MAML3, BCOR::CLGN, BCOR::MAML1, ZC3H7B::BCOR, KMT2D::BCOR, CIITA::BCOR, RTL9::BCOR, and AHR::BCOR. The BCOR gene plays a pivotal role in the Polycomb Repressive Complex 1 (PRC1), essential for histone modification and gene silencing. It interfaces with the Polycomb group RING finger homolog (PCGF1). This study employed comprehensive in silico methodologies to investigate the structural and functional effects of BCOR fusion events in BRS. The analysis revealed significant alterations in the domain architecture of BCOR, which resulted in the loss of BCL6-regulated transcriptional repression. Furthermore, IUPred3 prediction indicated a significant increase in disorder in the C-terminal regions of the BCOR in the fusion proteins. A detailed analysis of the physicochemical properties by ProtParam revealed a decrease in isoelectric point, stability, and hydrophobicity. The analysis of protein structures predicted by AlphaFold3 using the PRODIGY algorithm revealed statistically significant deviations in binding affinities for BCOR-PCGF1 dimers and a non-canonical PRC1 variant tetramer compared to the wild-type BCOR. The findings provide a comprehensive summary and elucidation of the fusion proteome associated with BRS, suggesting a substantial impact on the stability and functionality of the fusion proteins, thereby contributing to the oncogenic mechanisms underlying BRS. In this study, we provide the first compilation and comparative analysis of the known BCOR fusions of BRS and introduce a new in silico approach to enhance a better understanding of the molecular basis of BRS.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk BRS BCOR AlphaFold3 Szarkóma Bioinformatika
Megjelenés:	Computers in Biology and Medicine. - 191 (2025), p. 1-22. -
További szerzők:	Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Chang Chien, Yi-Che (1975-) (pathológus) Bedekovics Judit (1986-) (orvos) Csoma Szilvia Lilla (1994-) (Klinikai laboratóriumi kutató) Méhes Gábor (1966-) (patológus) Mokánszki Attila (1983-) (molekuláris biológus Ph.D hallgató)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM090242
035-os BibID:	(WoS)000610128400001 (Scopus)85108842730
Első szerző:	Mokánszki Attila (molekuláris biológus Ph.D hallgató)
Cím:	Novel RB1 and MET Gene Mutations in a Case with Bilateral Retinoblastoma Followed by Multiple Metastatic Osteosarcoma / Mokánszki Attila, Chang Chien Yi-Che, Mótyán János András, Juhász Péter, Bádon Emese Sarolta, Madar László, Szegedi István, Kiss Csongor, Méhes Gábor
Dátum:	2021
ISSN:	2075-4418
Megjegyzések:	Retinoblastoma (Rb) is a malignant tumor of the developing retina that affects children before the age of five years in association with inherited or early germline mutations of the RB1 gene. The genetic predisposition is also a driver for other primary malignancies, which have become the leading cause of death in retinoblastoma survivors. Other malignancies can occur as a consequence of radiotherapy. We describe a patient with retinoblastoma in which we detected a novel RB1 c.2548C > T, p.(Gln850Ter) and a synchronous MET c.3029C > T, p.(Thr1010Ile) mutation as well. After presenting with bilateral retinoblastoma, the patient developed at least four different manifestations of two independent osteosarcomas. Our goal was to identify all germline and somatic genetic alterations in available tissue samples from different time periods and to reconstruct their clonal relations using next generation sequencing (NGS). We also used structural and functional prediction of the mutant RB and MET proteins to find interactions between the defected proteins with potential causative role in the development of this unique form of retinoblastoma. Both histopathology and NGS findings supported the independent nature of a chondroblastic osteosarcoma of the irradiated facial bone followed by an osteoblastic sarcoma of the leg (tibia).
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk retinoblastoma next-generation sequencing ngs somatic mutations MET gene RB1 gene osteosarcoma
Megjelenés:	Diagnostics. - 11 : 1 (2021), p. 1-11. -
További szerzők:	Chang Chien, Yi-Che (1975-) (pathológus) Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Juhász Péter (1987-) Bádon Emese Sarolta (1991-) (orvos) Madar László (1972-) (klinikai laboratóriumi kutató) Szegedi István (1969-) (hematológus, onkológus, nefrológus) Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Méhes Gábor (1966-) (patológus)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-2016-00039 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: