CCL

Összesen 12 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM122684
035-os BibID:(WoS)001252108600001 (Scopus)85195189410
Első szerző:Baranyi József (biomatematikus)
Cím:From data to models and predictions in food microbiology / József Baranyi, Maha Rockaya, Mariem Ellouze
Dátum:2024
ISSN:2214-7993
Megjegyzések:This paper emphasizes the importance of structured databases, visualization techniques, statistics, and mathematical models as milestones when developing predictive models of bacterial responses to food environments. Predictions generated by such models are vital in decision-making on food safety and quality issues. The paper suggests that while refinements, such as reparameterization, rescaling, and fine-tuning smoothness-characterizing parameters, are useful for numerical/statistical point of view, the result should not be considered as new models. It is proposed that novel predictive models should be linked to those widely accepted in related disciplines, such as biotechnology, systems biology, or biochemistry.
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Current Opinion in Food Science. - 57 (2024), p. 1-6. -
További szerzők:Rockaya, Maha (1993-) (PhD hallgató) Ellouze, Mariem
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM103800
035-os BibID:(WoS)000852426500002 (Scopus)85138128529
Első szerző:Pacza Tünde (alkalmazott matematikus, informatikus, prediktív táplálkozástudomány)
Cím:MilkyBase, a database of human milk composition as a function of maternal-, infant- and measurement conditions / Tünde Pacza, Mayara L. Martins, Maha Rockaya, Katalin Müller, Ayan Chatterjee, Albert-László Barabási, József Baranyi
Dátum:2022
ISSN:2052-4463
Megjegyzések:This study describes the development of a database, called MilkyBase, of the biochemical composition of human milk. The data were selected, digitized and curated partly by machine-learning, partly manually from publications. The database can be used to find patterns in the milk composition as a function of maternal-, infant- and measurement conditions and as a platform for users to put their own data in the format shown here. The database is an Excel workbook of linked sheets, making it easy to input data by non-computationally minded nutritionists. The hierarchical organisation of the fields makes sure that statistical inference methods can be programmed to analyse the data. Uncertainty quantification and recording dynamic (time-dependent) compositions offer predictive potentials.
Tárgyszavak:Természettudományok Matematika- és számítástudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Data. - 9 : 1 (2022), p. 1-7. -
További szerzők:Martins, Mayara Lopes (1993-) Rockaya, Maha (1993-) (PhD hallgató) Müller Katalin Eszter Chatterjee, Ayan Barabási Albert-László Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM134156
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Exploring the Microbial Dynamics of Plant-Based Milk through its Biochemical Composition / Maha Rockaya, József Baranyi
Dátum:2024
Megjegyzések:Plant-based milk has emerged as a significant commodity for health-conscious consumers. While science-based judgment on the health-related advantages and possible harmful effects of these beverages are widely documented, much less is known about its microbiology, from either safety or spoilage point of view. In the field of predictive microbiology researchers studied deeply the various factors that define the bacterial kinetics in the foods, like temperature, pH, water activity and preservatives. In our study we aim to increase the resolution of the predictions by investigating the biochemical composition of the food as the next refinement factor because it is quantifiable, generic enough and there are indications that this could be the case to make our predictions in-vitro or in-silico as close as possible to the real scenario in the food matrices (in-vivo). This needs a lot of data to confirm but it is too complex to be done in the lab, so our aim is to summarize the plant-based milk biochemical- and microbiological data that are already published and integrate them into a database with well-defined ontology. A properly set-up database is key to find patterns in the data, draw conclusions and predictions and helps to find gaps and fill them with new laboratory observations. It will also play a decision support tool for a scientifically proper extrapolation from similar food such as bovine milk and infant formulae.
ISBN:978-963-306-986-8
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:ICOSTEE 2024 - Book of Abstracts / szerk. Bíró István et al. - p. 86. -
További szerzők:Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM134017
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Database building to study the microbiology of plant-based milk / Rockaya M., Ellouze M., Baranyi J.
Dátum:2022
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:FoodMicro2022 - Athens Abstract Book. - p. 211.
További szerzők:Ellouze, Mariem Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM134018
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Modeling microbial growth in plant-based milks: the role of nutrients and experimental design / Maha Rockaya, Bence Pecsenye, József Baranyi, Endre Máthé
Dátum:2025
ISBN:978-615-5606-17-5
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:A Magyar Táplálkozástudományi Társaság XLVIII. Vándorgyűlésének Programja és az Előadások Összefoglalói / szerk. Biró Lajos, Gelencsér Éva, Lugasi Andrea, Rurik Imre. - p. 46. -
További szerzők:Pecsenye Bence (1992-) (vegyészmérnök, vegyész analitikus) Baranyi József (1956-) (biomatematikus) Máthé Endre (1964-) (genetikus, molekuláris sejtbiológus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM134016
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Incorporating biochemical composition into predictive growth models for plant-based milk products / Maha Rockaya, József Baranyi
Dátum:2025
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:ICPMF - Athens Abstract Book. - p. 7.
További szerzők:Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM134015
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Refining Predictive Models for Microbial Growth in Plant-Based Milks through Biochemical Composition and Experimental Design / Maha Rockaya, József Baranyi
Dátum:2025
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:IAFP's European Symposium - Madrid Programme Application. - p. 1.
További szerzők:Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM134014
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Linking the Error of Parameter Estimates for Primary and Secondary Models in Predictive Microbiology / Maha Rockaya, Mariem Ellouze, József Baranyi
Dátum:2024
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:IAFP's European Symposium - Geneva Programme Application. - p. 1.
További szerzők:Ellouze, Mariem Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM134013
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Comparing the Performance of Two Predictive Models When Fitting Noisy Data / Maha Rockaya, Mariem Ellouze, József Baranyi
Dátum:2023
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:IAFP's European Symposium - Aberdeen Programme Book. - p. 38-39
További szerzők:Ellouze, Mariem Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM134019
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Safety and stability of plant-based milk - can predictive microbiology help? / Maha Rockaya, Mariem Ellouze, József Baranyi
Dátum:2022
ISBN:978-963-306-860-1
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok előadáskivonat
könyvrészlet
Megjelenés:19th Wellmann International Scientific Conference : Book of abstract / ed. Kiss Orsolya. - p. 73. -
További szerzők:Ellouze, Mariem Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM133086
035-os BibID:(Scopus)105020926675
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Cardinal Temperatures of Bacillus licheniformis Growing in Various Plant-based Milk Alternatives / Maha Rockaya, Bence Pecsenye, Mariem Ellouze, Endre Máthé, József Baranyi
Dátum:2025
ISSN:0168-1605
Megjegyzések:We demonstrate that the commonly assumed matrix-independence of the cardinal (minimum, optimum and maximum) temperatures for bacterial growth is not necessarily valid for Bacillus licheniformis growing in plant-based milk. If confirmed, a consequence is that the ratio (called correction factor) between the maximum specific growth rate in a specific food matrix and in culture medium is not temperature-independent for every food matrix, opposed to general expectations. We found that, while the cardinal temperatures of B. licheniformis growing in either white almond or coconut beverages did not significantly differ from those in culture medium, this was not the case for another almond-based beverage, where we observed a smaller growth range and lower optimum temperature. A possible reason for this is that the food composition affects the cardinal temperatures. Our investigation is an example of "tertiary modelling" inasmuch it studies the effect of food matrix (a category variable) on the parameters of secondary models.
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
predictive modelling
Bacillus licheniformis
food matrix
tertiary modelling
almond milk
coconut milk
Megjelenés:International Journal of Food Microbiology. - 445 (2025), p. 1-8. -
További szerzők:Pecsenye Bence (1992-) (vegyészmérnök, vegyész analitikus) Ellouze, Mariem Máthé Endre (1964-) (genetikus, molekuláris sejtbiológus) Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM128333
035-os BibID:(Scopus)85214585262
Első szerző:Rockaya, Maha (PhD hallgató)
Cím:Variability of growth parameter estimates - The role of rescaling and reparametrization / Maha Rockaya, József Baranyi
Dátum:2025
ISSN:0740-0020
Megjegyzések:The focus of this paper is to analyze the reliability of the error estimation when well-known primary models of predictive microbiology are used to fit growth parameters. We also demonstrate the application of rescaling and reparametrization to improve this reliability. We highlight that the technique can be useful for achieving linearity and homoscedasticity, reducing the complexity of the model, generating initial parameter estimates when fitting experimental data by non-linear regression, and obtaining realistic standard errors for the parameter estimates, which are crucial for decision-making in food safety. We classify the sources of the total variability and correlation of the parameter estimates as "wet" and "dry". We point out that, rescaling and reparametrization do not change the model in a mechanistic sense but they can reduce the variances of (and/or the correlation between) the parameter estimates, thus mitigate the effects of such "dry" (i.e. statistical) relationships. We analyze the reliability of the error estimation when the model of Baranyi and Roberts (BRM) and the Gompertz function (GF) are used to fit data. The comparison is based on the distribution of the standard error of the maximum specific growth rate estimates. The results show that the error structure of the BRM-fit is closer to that of the linear regression, making BRM more reliable for constructing confidence intervals by conventional means, using the t-distribution assumption for the parameter estimates.
Tárgyszavak:Agrártudományok Élelmiszertudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Predictive microbiology
Regression
Rescaling
Reparametrization
Monte Carlo simulation
Variability
Megjelenés:Food Microbiology. - 128 (2025), p. 1-8. -
További szerzők:Baranyi József (1956-) (biomatematikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1