Magyar
Toggle navigation
Tudóstér
Magyar
Tudóstér
Keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Böngészés
Saját polc tartalma
(
0
)
Korábbi keresések
Összesen 1 találat.
#/oldal:
12
36
60
120
Rövid
Hosszú
MARC
Részletezés:
Rendezés:
Szerző növekvő
Szerző csökkenő
Cím növekvő
Cím csökkenő
Dátum növekvő
Dátum csökkenő
1.
001-es BibID:
BIBFORM056299
Első szerző:
Gór Balázs
Cím:
A Novel High Accuracy Algorithm for Reference Assembly in Colour Space / Balazs Gor, Anett Balla, Edit Tukacs, Istvan Nagy, Zsolt Torok
Dátum:
2012
Megjegyzések:
Although numerous algorithms exist for genome alignment using Next Generation Sequencingtags, assembly of colour coded reads remains a challenge. We present a novel pairwisesequence aligner algorithm derived from Smith-Waterman method. Original feature of thealgorithm is that it translates the reference sequence into colour code and performs the alignmentin colour space. While operating on this base it can prevent most read error-derived assemblyerrors. Based on dynamic programming it gives the optimal alignment in colour space. Further,validation on empirical dataset with capillary sequencing proved high mapping accuracy. We canalso conclude that the novel algorithm provides performance comparable with the currentlyavailable solutions. The algorithm can be implemented into any reference assembly softwarethereby improving mapping accuracy while maintaining high speed mapping.
Tárgyszavak:
Orvostudományok
Klinikai orvostudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Sequencing
Bioinformatics
Assembly
Smith-Waterman
Reference Assembly
Colour Space Code
Algorithm
Next Generation Sequencing
Megjelenés:
International Journal of Biometrics and Bioinformatics (IJBB). - 6 : 4 (2012), p. 92-104.
További szerzők:
Balla Anett
Tukacs Edit
Nagy István
Török Zsolt (1975-) (orvos)
Internet cím:
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
Rekordok letöltése
1
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27
© 2023
Monguz kft.
Minden jog fenntartva.