Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM095728
Első szerző:	Mátyus E.
Cím:	Structural investigation of syringomycin-E using molecular dynamics simulation and NMR / E. Mátyus, L. Monticelli, K. E. Kövér, Z. Xu, K. Blaskó, J. Fidy, D. P. Tieleman
Dátum:	2006
ISSN:	0175-7571 1432-1017
Megjegyzések:	Syringomycin-E (SR-E) is a cyclic lipodepsinonapeptide produced by certain strains of the bacterium Pseudomonas syringae pv. syringae. It shows inhibitory effects against many fungal species, including human pathogens. Its primary biological target is the plasma membrane, where it forms channels comprised of at least six SR-E molecules. The high-resolution structure of SR-E and the structure of the channels are currently not known. In this paper, we investigate in atomic detail the molecular features of SR-E in water by NMR and in water and octane by molecular dynamics simulation (MD). We built a model of the peptide and examined its structure in water and octane in 200 ns MD simulations both with and without distance restraints derived from NMR NOE data. The resulting trajectories show good agreement with the measured NOEs and circular dichroism data from the literature and provide atomistic models of SR-E that are an important step toward a better understanding of the antifungal and antibacterial activity of this peptide.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	European Biophysics Journal. - 35 : 6 (2006), p. 459-467. -
További szerzők:	Monticelli, L. Kövér Katalin, E. (1956-2023) (vegyész) Xu, Z. Blaskó Katalin Fidy Judit Tieleman, D. P.
Pályázati támogatás:	F 043192 OTKA D 048670 OTKA T 048713 OTKA
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: