Magyar
Toggle navigation
Tudóstér
Magyar
Tudóstér
Keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Böngészés
Saját polc tartalma
(
0
)
Korábbi keresések
Összesen 1 találat.
#/oldal:
12
36
60
120
Rövid
Hosszú
MARC
Részletezés:
Rendezés:
Szerző növekvő
Szerző csökkenő
Cím növekvő
Cím csökkenő
Dátum növekvő
Dátum csökkenő
1.
001-es BibID:
BIBFORM100891
035-os BibID:
(cikkazonosító)843086 (WoS)000820299300001 (Scopus)85127499983
Első szerző:
Ramírez-Sánchez, Aarón D.
Cím:
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Mononuclear Cells From Pediatric Coeliac Disease Patients Suggests Potential Pre-Seroconversion Markers / Ramírez-Sánchez Aarón D., Chu Xiaojing, Modderman Rutger, Kooy-Winkelaar Yvonne, Koletzko Sibylle, Korponay-Szabó Ilma R., Troncone Riccardo, Wijmenga Cisca, Mearin Luisa, Withoff Sebo, Jonkers Iris H., Li Yang
Dátum:
2022
ISSN:
1664-3224
Megjegyzések:
Celiac Disease (CeD) is a complex immune disorder involving villous atrophy in the small intestine that is triggered by gluten intake. Current CeD diagnosis is based on late-stage pathophysiological parameters such as detection of specific antibodies in blood and histochemical detection of villus atrophy and lymphocyte infiltration in intestinal biopsies. To date, no early onset biomarkers are available that would help prevent widespread villous atrophy and severe symptoms and co-morbidities. To search for novel CeD biomarkers, we used single-cell RNA sequencing (scRNAseq) to investigate PBMC samples from 11 children before and after seroconversion for CeD and 10 control individuals matched for age, sex and HLA-genotype. We generated scRNAseq profiles of 9559 cells and identified the expected major cellular lineages. Cell proportions remained stable across the different timepoints and health conditions, but we öbserved differences in gene expression profiles in specific cell types when comparing patient samples before and after disease development and comparing patients with controls. Based on the time when transcripts were differentially expressed, we could classify the deregulated genes as biomarkers for active CeD or as potential pre-diagnostic markers. Pathway analysis showed that active CeD biomarkers display a transcriptional profile associated with antigen activation in CD4+ T cells, whereas NK cells express a subset of biomarker genes even before CeD diagnosis. Intersection of biomarker genes with CeD-associated genetic risk loci pinpointed genetic factors that might play a role in CeD onset.Investigation of potential cellular interaction pathways of PBMC cell subpopulations highlighted the importance of TNF pathways in CeD. Altogether, our results pinpoint genes and pathways that are altered prior to and during CeD onset, thereby identifying novel potential biomarkers for CeD diagnosis in blood.
Tárgyszavak:
Orvostudományok
Elméleti orvostudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
celiac disease
scRNAseq
PBMC
differential gene expression
pre-diagnostic biomarkers
Megjelenés:
Frontiers in Immunology. - 13 (2022), p. 1-14. -
További szerzők:
Chu, Xiaojing
Modderman, Rutger
Kooy-Winkelaar, Yvonne
Koletzko, Sibylle
Korponay-Szabó Ilma (1959-) (gyermekgyógyász)
Troncone, Riccardo
Wijmenga, Cisca
Mearin, Maria Luisa
Withoff, Sebo
Jonkers, Iris
Li, Yang
Pályázati támogatás:
NKFI 120392
Egyéb
GINOP-2.3.2-15-2016-00015
GINOP
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
Rekordok letöltése
1
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27
© 2023
Monguz kft.
Minden jog fenntartva.