Összesen 1 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM103796
035-os BibID:(cikkazonosító)e0274414 (WoS)000933375500038 (Scopus)85138452471
Első szerző:Váradi Alex (biológus)
Cím:Rapid genotyping of targeted viral samples using Illumina short-read sequencing data / Alex Váradi, Eszter Kaszab, Gábor Kardos, Eszter Prépost, Krisztina Szarka, Levente Laczkó
Dátum:2022
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:The most important information about microorganisms might be their accurate genome sequence. Using current Next Generation Sequencing methods, sequencing data can be generated at an unprecedented pace. However, we still lack tools for the automated and accurate reference-based genotyping of viral sequencing reads. This paper presents our pipeline designed to reconstruct the dominant consensus genome of viral samples and analyze their within-host variability. We benchmarked our approach on numerous datasets and showed that the consensus genome of samples could be obtained reliably without further manual data curation. Our pipeline can be a valuable tool for fast identifying viral samples. The pipeline is publicly available on the project's GitHub page (https://github.com/laczkol/QVG).
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Plos One. - 17 : 9 (2022), p. 1-23. -
További szerzők:Kaszab Eszter (1989-) (biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Prépost Eszter Szarka Krisztina (1971-) (molekuláris biológus, mikrobiológus) Laczkó Levente (1992-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.