Magyar
Toggle navigation
Tudóstér
Magyar
Tudóstér
Keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Böngészés
Saját polc tartalma
(
0
)
Korábbi keresések
Összesen 1 találat.
#/oldal:
12
36
60
120
Rövid
Hosszú
MARC
Részletezés:
Rendezés:
Szerző növekvő
Szerző csökkenő
Cím növekvő
Cím csökkenő
Dátum növekvő
Dátum csökkenő
1.
001-es BibID:
BIBFORM117884
035-os BibID:
(cikkazonosító)342162 (WoS)001147540500001 (Scopus)85181709291
Első szerző:
Nagy Cynthia (1994-)
Cím:
CZE-MS peptide mapping : To desalt or not to desalt? / Cynthia Nagy, Melinda Andrasi, Ruben Szabo, Attila Gaspar
Dátum:
2024
ISSN:
0003-2670
Megjegyzések:
Background: In "shotgun" approaches involving high-performance liquid chromatography or capillary zone electrophoresis (CZE), matrix removal prior to sample analysis is considered as an indispensable tool. Despite the fact that CZE offers a high tolerance towards salts, most publications reported on the use of desalting. There seems to be no clear consensus on the utilization of desalting in the CZE-MS community, most probably due to the absence of works addressing the comparison of desalted and non-desalted digests. Our aim was to fill this research gap using protein samples of varying complexity in different sample matrices. Results: First, standard protein digests were analyzed to build the knowledge on the effect of sample clean-up by solid-phase extraction (SPE) pipette tips and the possible stacking phenomena induced by different sample matrices. Desalting led to a somewhat altered peptide profile, the procedure affected mostly the hydrophilic peptides (although not to a devastating extent). Nevertheless, desalting samples allowed remarkable stacking efficiency owing to their low-conductivity sample background, enabling a so-called field-amplified sample stacking phenomenon. Non-desalted samples also produced a stacking event, the mechanism of which is based on transient-isotachophoresis due to the presence of high-mobility ions in the digestion buffer itself. Adding either extra ammonium ions or acetonitrile into the non-desalted digests enhanced the stacking efficiency. A complex sample (yeast cell lysate) was also analyzed with the optimal conditions, which yielded similar tendencies. Significance: Based on these results, we propose that sample clean-up in the bottom-up sample preparation process prior to CZE-MS analysis can be omitted. The preclusion of desalting can even enhance detection sensitivity, separation efficiency or sequence coverage.
Tárgyszavak:
Természettudományok
Kémiai tudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Bottom-up proteomics
Capillary zone electrophoresis
Desalting
Mass spectrometry
Peptide mapping
Megjelenés:
Analytica Chimica Acta. - 1288 (2024), p. 1-9. -
További szerzők:
Andrási Melinda (1979-) (gyógyszerész)
Szabó Ruben (1998-)
Gáspár Attila (1970-) (vegyész, kémikus)
Pályázati támogatás:
K-142134
Egyéb
ÚNKP-22-3-II
Egyéb
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
Rekordok letöltése
1
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27
© 2023
Monguz kft.
Minden jog fenntartva.