CCL

Összesen 3 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM101739
035-os BibID:(cikkazonosító)7144 (WOS)000790397500022 (Scopus)85129301911
Első szerző:Fidler Gábor (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Circulating microRNA sequencing revealed miRNome patterns in hematology and oncology patients aiding the prognosis of invasive aspergillosis / Fidler Gábor, Szilágyi-Rácz Anna Anita, Dávid Péter, Tolnai Emese, Rejtő László, Szász Róbert, Póliska Szilárd, Biró Sándor, Paholcsek Melinda
Dátum:2022
ISSN:2045-2322
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 12 : 1 (2022), p. 1-17. -
További szerzők:Szilágyi-Rácz Anna Anita (1995-) (molekuláris biológus) Dávid Péter (1984-) (biológia tanár) Szilágyi-Tolnai Emese (1988-) (Molekuláris biológus) Rejtő László (1963-) (belgyógyász, haematológus) Szász Róbert (1972-) (belgyógyász, haematológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM086507
035-os BibID:(cikkazonosító)3419 (WOS)000563230200016 (Scopus)85094851273
Első szerző:Fidler Gábor (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Tendentious effects of automated and manual metagenomic DNA purification protocols on broiler gut microbiome taxonomic profiling / Fidler Gabor, Tolnai Emese, Stagel Aniko, Remenyik Judit, Stundl Laszlo, Gal, Ferenc Biro Sandor, Paholcsek Melinda
Dátum:2020
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Here, we developed protocols to improve sensitivity, rigor and comparability of 16S rRNA gene amplification-based next-generation sequencing (NGS) results. A thorough study was performed by evaluating extraction efficiency with respect to the yield, purity, fragmentation of the purified DNA, and sequencing metrics considering the number of quality reads, amplicon sequence variants (ASVs), community structure and biodiversity. We identified batch-effects that significantly bias broiler gastrointestinal tract (GIT) community compositions and made recommendations to improve sensitivity, consistency, and cross-study comparability. We found that the purity of the extracted nucleic acid had a strong effect on the success rate of downstream library preparations. The preparation of stool bacterial suspensions from feces showed a significant positive influence on community biodiversity by enriching Gram-negative bacteria and cataloguing low abundant taxa with greater success than direct processing of fecal material. Applications relying on the automated Roche MagNa Pure 24 magnetic-bead based method provided results with high consistency therefore it seems to be the optimal choice in large-scale studies for investigating broiler GIT microbiota.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 10 : 1 (2020), p. 1-16. -
További szerzők:Szilágyi-Tolnai Emese (1988-) (Molekuláris biológus) Stágel Anikó (agrár) Gálné Remenyik Judit (1965-) (kémia tanár, okleveles vegyész) Stündl László (1970-) (agrármérnök) Gál Ferenc (1964-) (élelmiszertechnológia) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00042
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM088275
035-os BibID:(Cikkazonosító)16532 (WOS)000577291800043 (Scopus)85091981783
Első szerző:Szilágyi-Tolnai Emese (Molekuláris biológus)
Cím:Free circulating mircoRNAs support the diagnosis of invasive aspergillosis in patients with hematologic malignancies and neutropenia / Emese Tolnai, Gábor Fidler, Róbert Szász, László Rejtő, Kingsley Okechukwu Nwozor, Sándor Biró, Melinda Paholcsek
Dátum:2020
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Fungal infections represent a worrisome complication in hematologic cancer patients and in the absence of disease specific symptoms, it is important to establish new biological indicators, which can be used during mould-active prophylaxis. Recently, miRNAs have appeared as candidate diagnostic and prognostic markers of several diseases. A pilot clinical study was performed to evaluate the diagnostic utility of 14 microRNAs which can be related to invasive fungal infections. Based on our data miR-142-3p, miR-142-5p, miR-26b-5p and miR-21-5p showed significant overexpression (p < 0.005) due to invasive aspergillosis in hemato-oncology patients with profound neutropenia. A tetramiR assay was designed to monitor peripheral blood specimens. Optimal cut-off was estimated by using the median value (fold change 1.1) of the log10 transformed gene expressions. The biomarker panel was evaluated on two independent sample cohorts implementing different antimicrobial prophylactic strategies. The receiver operating characteristic analysis with area under the curve proved to be 0.97. Three miRNAs (miR-142-5p, miR-142-3p, miR-16-5p) showed significant expression alterations in episodes with sepsis. In summary, the tetramiR assay proved to be a promising diagnostic adjunct with sufficient accuracy and sensitivity to trace invasive aspergillosis in hemato-oncology patients.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 10 : 1 (2020), p. 1-12. -
További szerzők:Fidler Gábor (1987-) (molekuláris biológus, genetikus) Szász Róbert (1972-) (belgyógyász, haematológus) Rejtő László (1963-) (belgyógyász, haematológus) Nwozor, Kingsley Okechukwu Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Paholcsek Melinda (1984-) (molekuláris biológus, genetikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00042
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1