CCL

Összesen 12 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM096176
035-os BibID:(WoS)000660626300005 (Scopus)85107510241
Első szerző:Fuxreiter Mónika (kutató vegyész)
Cím:Generic nature of the condensed states of proteins / Monika Fuxreiter, Michele Vendruscolo
Dátum:2021
ISSN:1465-7392
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nature Cell Biology. - 23 : 6 (2021), p. 587-594. -
További szerzők:Vendruscolo, Michele
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM082548
035-os BibID:(WoS)000465084800019 (Scopus)85063767805 (PMID)30936495
Első szerző:Giannakis, Nikolas
Cím:Dynamic changes to lipid mediators support transitions among macrophage subtypes during muscle regeneration / Nikolas Giannakis, Brian E. Sansbury, Andreas Patsalos, Tristan T. Hays, Colin O. Riley, Xianlin Han, Matthew Spite, Laszlo Nagy
Dátum:2019
ISSN:1529-2908
Megjegyzések:Muscle damage elicits a sterile immune response that facilitates complete regeneration. Here, we used mass spectrometry-based lipidomics to map the mediator lipidome during the transition from inflammation to resolution and regeneration in skeletal muscle injury. We observed temporal regulation of glycerophospholipids and production of pro-inflammatory lipid mediators (for example, leukotrienes and prostaglandins) and specialized pro-resolving lipid mediators (for example, resolvins and lipoxins) that were modulated by ibuprofen. These time-dependent profiles were recapitulated in sorted neutrophils and Ly6Chi and Ly6Clo muscle-infiltrating macrophages, with a distinct pro-resolving signature observed in Ly6Clo macrophages. RNA sequencing of macrophages stimulated with resolvin D2 showed similarities to transcriptional changes found during the temporal transition from Ly6Chi macrophage to Ly6Clo macrophage. In vivo, resolvin D2 increased Ly6Clo macrophages and functional improvement of the regenerating muscle. These results reveal dynamic lipid mediator signatures of innate immune cells and provide a proof of concept for their exploitable effector roles in muscle regeneration.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nature Immunology. - 20 : 5 (2019), p. 626-636. -
További szerzők:Sansbury, Brian E. Patsalos, Andreas Hays, Tristan T. Riley, Colin O. Han, Xianlin Spite, Matthew Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:OTKA-116855
OTKA
K124298
OTKA
KH126885
OTKA
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
GINOP-2.1.7-15-2016-01487
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM109720
035-os BibID:(scopus)85149937196 (WoS)000955761600010 (cikkazonosító)1329
Első szerző:Gönczi Mónika (élettanász)
Cím:Alternatively spliced exon regulates context-dependent MEF2D higher-order assembly during myogenesis / Mónika Gönczi, Joao M. C. Teixeira, Susana Barrera-Vilarmau, Laura Mediani, Francesco Antoniani, Tamás Milán Nagy, Krisztina Fehér, Zsolt Ráduly, Viktor Ambrus, József Tőzsér, Endre Barta, Katalin E. Kövér, László Csernoch, Serena Carra, Monika Fuxreiter
Dátum:2023
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nature Communications. - 14 (2023), p. 1329. -
További szerzők:Teixeira, João M. C. Barrera-Vilarmau, Susana Mediani, Laura Antoniani, Francesco Nagy Tamás Milán (1993-) (vegyész, nmr) Fehér Krisztina (1974-) (vegyész) Ráduly Zsolt (1992-) (gyógyszerész) Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Kövér Katalin, E. (1956-2023) (vegyész) Csernoch László (1961-) (élettanász) Carra, Serena Fuxreiter Mónika (1969-) (kutató vegyész)
Pályázati támogatás:NN 128368
OTKA
2019-1.1.1-PIACI-KFI-2019-00109
Egyéb
TKP2021-NKTA-34
Egyéb
HAS-11015
Egyéb
GINOP-2.3.3-15-2016-00004
GINOP
GINOP-2.3.2-15- 2016-00044
GINOP
K 137600
OTKA
K 132814
OTKA
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM115590
035-os BibID:(Scopus)85177589789
Első szerző:Gruper, Yael
Cím:Autoimmune amelogenesis imperfecta in patients with APS-1 and coeliac disease / Yael Gruper, Anette S. B. Wolff, Liad Glanz, Frantisek Spoutil, Mihaela Cuida Marthinussen, Adriana Osičková, Yonatan Herzig, Yael Goldfarb, Goretti Aranaz-Novaliches, Jan Dobeš, Noam Kadouri, Osher Ben-Nun, Amit Binyamin, Bar Lavi, Tal Givony, Razi Khalaila, Tom Gome, Tomáš Wald, Blanka Mrazkova, Carmel Sochen, Marine Besnard, Shifra Ben-Dor, Ester Feldmesser, Elisaveta M. Orlova, Csaba Hegedűs, István Lampé, Tamás Papp, Szabolcs Felszeghy, Radislav Sedlacek, Esti Davidovich, Noa Tal, Dror S. Shouval, Raanan Shamir, Carole Guillonneau, Zsuzsa Szondy, Knut E. A. Lundin, Radim Osička, Jan Prochazka, Eystein S. Husebye, Jakub Abramson
Dátum:2023
ISSN:0028-0836
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nature. - 624 (2023), p. 653-662. -
További szerzők:Wolff, Anette S. B. Glanz, Liad Spoutil, Frantisek Marthinussen, Mihaela Cuida Osičková, Adriana Herzig, Yonatan Goldfarb, Yael Aranaz-Novaliches, Goretti Dobeš, Jan Kadouri, Noam Ben-Nun, Osher Binyamin, Amit Lavi, Bar Givony, Tal Khalaila, Razi Gome, Tom Wald, Tomáš Mrazkova, Blanka Sochen, Carmel Besnard, Marine Ben-Dor, Shifra Feldmesser, Ester Orlova, Elisaveta M. Hegedűs Csaba (1953-) (fogszakorvos) Lampé István (1960-) (fogszakorvos) Papp Tamás (1987-) (orvos) Felszeghy Szabolcs Béla (1972-) (fogorvos, anatómus, kötőszövetbiológus) Sedlacek, Radislav Davidovich, Esti Tal, Noa Shouval, Dror S. Shamir, Raanan (gyermekgyógyász) Guillonneau, Carole Szondy Zsuzsanna (1959-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Lundin, Knut Erik Aslaksen Osička, Radim Prochazka, Jan Husebye, Eystein S. Abramson, Jakub
Pályázati támogatás:OTKA-138162
OTKA
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM019005
Első szerző:Iacovino, Michelina
Cím:HoxA3 is an apical regulator of haemogenic endothelium / Iacovino Michelina, Chong Diana, Szatmari Istvan, Hartweck Lynn, Rux Danielle, Caprioli Arianna, Cleaver Ondine, Kyba Michael
Dátum:2011
ISSN:1465-7392
Megjegyzések:During development, haemogenesis occurs invariably at sites of vasculogenesis. Between embryonic day (E) 9.5 and E10.5 in mice, endothelial cells in the caudal part of the dorsal aorta generate haematopoietic stem cells and are referred to as haemogenic endothelium. The mechanisms by which haematopoiesis is restricted to this domain, and how the morphological transformation from endothelial to haematopoietic is controlled are unknown. We show here that HoxA3, a gene uniquely expressed in the embryonic but not yolk sac vasculature, restrains haematopoietic differentiation of the earliest endothelial progenitors, and induces reversion of the earliest haematopoietic progenitors into CD41-negative endothelial cells. This reversible modulation of endothelial-haematopoietic state is accomplished by targeting key haematopoietic transcription factors for downregulation, including Runx1, Gata1, Gfi1B, Ikaros, and PU.1. Through loss-of-function, and gain-of-function epistasis experiments, and the identification of antipodally regulated targets, we show that among these factors, Runx1 is uniquely able to erase the endothelial program set up by HoxA3. These results suggest both why a frank endothelium does not precede haematopoiesis in the yolk sac, and why haematopoietic stem cell generation requires Runx1 expression only in endothelial cells.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok levél
Megjelenés:Nature Cell Biology. - 13 : 1 (2011), p. 72-78. -
További szerzők:Chong, Diana Szatmári István (1971-) (biológus) Hartweck, Lynn Rux, Danielle Caprioli, Arianna Cleaver, Ondine Kyba, Michael
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM003812
Első szerző:Itoh, Toshimasa
Cím:Structural basis for the activation of PPARgamma by oxidized fatty acids / Itoh, T., Fairall, L., Amin, K., Inaba, Y., Szántó, A., Bálint, L. B., Nagy, L., Yamamoto, K., Schwabe, J. W. R.
Dátum:2008
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Nature Structural and Molecular Biology. - 15 : 9 (2008), p. 924-931. -
További szerzők:Fairall, Louise Amin, Kush Inaba, Yuka Szántó Attila (1976-) (orvos, biokémikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Yamamoto, Keiko Schwabe, John W. R.
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM103379
035-os BibID:(cikkazonosító)5058 (WoS)000846449200018 (Scopus)85137080090
Első szerző:Karányi Zsolt (biostatisztikus, bioinformatikus)
Cím:NODULIN HOMEOBOX is required for heterochromatin homeostasis in Arabidopsis / Zsolt Karányi, Ágnes Mosolygó-L., Orsolya Feró, Adrienn Horváth, Beáta Boros-Oláh, Éva Nagy, Szabolcs Hetey, Imre Holb, Henrik Szaker, Marton Miskei, Tibor Csorba, Lóránt Székvölgyi
Dátum:2022
ISSN:2041-1723
Megjegyzések:Arabidopsis NODULIN HOMEOBOX (NDX) is a nuclear protein described as a regulator of specific euchromatic genes within transcriptionally active chromosome arms. Here we show that NDX is primarily a heterochromatin regulator that functions in pericentromeric regions to control siRNA production and non-CG methylation. Most NDX binding sites coincide with pericentromeric het-siRNA loci that mediate transposon silencing, and are antagonistic with R-loop structures that are prevalent in euchromatic chromosomal arms. Inactivation of NDX leads to differential siRNA accumulation and DNA methylation, of which CHH/CHG hypomethylation colocalizes with NDX binding sites. Hi-C analysis shows significant chromatin structural changes in the ndx mutant, with decreased intrachromosomal interactions at pericentromeres where NDX is enriched in wild-type plants, and increased interchromosomal contacts between KNOT-forming regions, similar to those observed in DNA methylation mutants. We conclude that NDX is a key regulator of heterochromatin that is functionally coupled to het-siRNA loci and non-CG DNA methylation pathways.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nature Communications. - 13 (2022), p. 1-20. -
További szerzők:Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Feró Orsolya Horváth Adrienn Boros-Oláh Beáta (1989-) (molekuláris biológus) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Hetey Szabolcs Holb Imre (1973-) (agrármérnök) Szaker Henrik Miskei Márton (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Csorba Tibor Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:MTA-DE Lendület
MTA
Élettudományok - Biológiai tudományok
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
NNE-130913
OTKA
137678
OTKA
TKP2021-EGA-18
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM104008
035-os BibID:(Wos)000475671200005 (Scopus)85069899297
Első szerző:Kerekes Viola
Cím:Analysis of habitat use, activity, and body condition scores of Przewalski's horses in Hortobagy National Park, Hungary / Viola Kerekes, Katalin Ozogány, István Sándor, Zsolt Vegvari, Csilla Czető, Bettina Nyírő, Timea Szabados, Lajos Széles, Zoltán Barta
Dátum:2019
ISSN:2500-008X
Megjegyzések:A founder population of Przewalski's horses (Equus ferus przewalskii) was set free in a semi-reserve called Pentezug in the Hortobagy National Park (Hungary) in 1997. Beside the Przewalski's horses reconstructed aurochs (Bos taurus taurus) were bred as well in the 24.5-km2 large area. Both species reproduced successfully in this steppe reserve, which was once the homeland of their distant ancestors. The number of large grazers has grown so quickly that different strategies of population control had to be implemented for reconstructed aurochs and horses in 2007 and 2013, respectively. The activity, habitat use, and body condition of Przewalski's horses were monitored regularly throughout the 22 years. We detected seasonal changes in the activity of the horses but the proportions of the main activity types were similar in two distant time periods. In contrast, habitat use and body condition scores for the horses showed remarkable differences between early vs. late years of the project, implying that horses were forced to use non-preferable areas and their condition was worsened in parallel with the increased population density of the large grazers. During the cold spring in 2018, there was a massive loss of both horses and cattle. These observations suggest that limited food sources could lead to changes in habitat use and/or worse body condition and a greater death rate in extreme weather conditions. In summary, strict birth control measures must be implemented in dense Przewalski's horse populations, and the habitat use and body conditions must be monitored to balance the population size and carrying capacity of the areas.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Bos taurus taurus, carrying capacity, Equus ferus przewalskii, large grazers, population control, Pentezug Reserve, reconstructed aurochs, semi-reserve
Megjelenés:Nature Conservation Research. - 4 : Suppl.2 (2019), p. 31-40. -
További szerzők:Ozogány Katalin (1982-) (biológiai fizikus) Sándor István Végvári Zsolt (1969-) (biológus) Czető Csilla Nyírő Bettina Szabados Timea Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus) Barta Zoltán (1967-) (biológus, zoológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM019010
Első szerző:Oberoi, Jasmeen
Cím:Structural basis for the assembly of the SMRT/NCoR core transcriptional repression machinery / Jasmeen Oberoi, Louise Fairall, Peter J. Watson, Ji-Chun Yang, Zsolt Czimmerer, Thorsten Kampmann, Benjamin T. Goult, Jacquie A. Greenwood, John T. Gooch, Bettina C. Kallenberger, László Nagy, David Neuhaus, John W. R. Schwabe
Dátum:2011
ISSN:1545-9993
Megjegyzések:Eukaryotic transcriptional repressors function by recruiting large coregulatory complexes that target histone deacetylase enzymes to gene promoters and enhancers. Transcriptional repression complexes, assembled by the corepressor NCoR and its homolog SMRT, are crucial in many processes, including development and metabolic physiology. The core repression complex involves the recruitment of three proteins, HDAC3, GPS2 and TBL1, to a highly conserved repression domain within SMRT and NCoR. We have used structural and functional approaches to gain insight into the architecture and biological role of this complex. We report the crystal structure of the tetrameric oligomerization domain of TBL1, which interacts with both SMRT and GPS2, and the NMR structure of the interface complex between GPS2 and SMRT. These structures, together with computational docking, mutagenesis and functional assays, reveal the assembly mechanism and stoichiometry of the corepressor complex.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Nature Structural & Molecular Biology 18 : 2 (2011), p. 177-184. -
További szerzők:Fairall, Louise Watson, Peter J. Yang, Ji-Chun Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Kampmann, Thorsten Goult, Benjamin T. Greenwood, Jacquie A. Gooch, John T. Kallenberger, Bettina C. Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Neuhaus, David Schwabe, John W. R.
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM074473
035-os BibID:(WoS)000444174100032 (Scopus)85050544773
Első szerző:Patten, Darren K.
Cím:Enhancer mapping uncovers phenotypic heterogeneity and evolution in patients with luminal breast cancer / Darren K. Patten, Giacomo Corleone, Balázs Győrffy, Ylenia Perone, Neil Slaven, Iros Barozzi, Edina Erdős, Alina Saiakhova, Kate Goddard, Andrea Vingiani, Sami Shousha, Lőrinc Sándor Pongor, Dimitri J. Hadjiminas, Gaia Schiavon, Peter Barry, Carlo Palmieri, Raul C. Coombes, Peter Scacheri, Giancarlo Pruneri, Luca Magnani
Dátum:2018
ISSN:1078-8956
Megjegyzések:The degree of intrinsic and interpatient phenotypic heterogeneity and its role in tumor evolution is poorly understood. Phenotypic drifts can be transmitted via inheritable transcriptional programs. Cell-type specific transcription is maintained through the activation of epigenetically defined regulatory regions including promoters and enhancers. Here we have annotated the epigenome of 47 primary and metastatic estrogen-receptor (ERα)-positive breast cancer clinical specimens and inferred phenotypic heterogeneity from the regulatory landscape, identifying key regulatory elements commonly shared across patients. Shared regions contain a unique set of regulatory information including the motif for transcription factor YY1. We identify YY1 as a critical determinant of ERα transcriptional activity promoting tumor growth in most luminal patients. YY1 also contributes to the expression of genes mediating resistance to endocrine treatment. Finally, we used H3K27ac levels at active enhancer elements as a surrogate of intra-tumor phenotypic heterogeneity to track the expansion and contraction of phenotypic subpopulations throughout breast cancer progression. By tracking the clonality of SLC9A3R1-positive cells, a bona fide YY1-ERα-regulated gene, we show that endocrine therapies select for phenotypic clones under-represented at diagnosis. Collectively, our data show that epigenetic mechanisms significantly contribute to phenotypic heterogeneity and evolution in systemically treated breast cancer patients.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
epigenetic
breast cancer
tumor evolution
Megjelenés:Nature Medicine. - 24 : 9 (2018), p. 1469-1480. -
További szerzők:Corleone, Giacomo Győrffy Balázs Perone, Ylenia Slaven, Neil Barozzi, Iros Erdős Edina (1989-) (klinikai laboratóriumi kutató) Saiakhova, Alina Goddard, Kate Vingiani, Andrea Shousha, Sami Pongor Lőrinc Sándor Hadjiminas, Dimitri J. Schiavon, Gaia Barry, Peter Palmieri, Carlo Coombes, Raul C. Scacheri, Peter Pruneri, Giancarlo Magnani, Luca
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM072628
Első szerző:Sormanni, Pietro
Cím:Simultaneous quantification of protein order and disorder / Pietro Sormanni, Damiano Piovesan, Gabriella T. Heller, Massimiliano Bonomi, Predrag Kukic, Carlo Camilloni, Monika Fuxreiter, Zsuzsanna Dosztanyi, Rohit V. Pappu, M. Madan Babu, Sonia Longhi, Peter Tompa, A. Keith Dunker, Vladimir N. Uversky, Silvio C. E. Tosatto, Michele Vendruscolo
Dátum:2017
ISSN:1552-4450
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Nature Chemical Biology 13 : 4 (2017), p. 339-342. -
További szerzők:Piovesan, Damiano Heller, Gabriella T. Bonomi, Massimiliano Kukic, Predrag Camilloni, Carlo Fuxreiter Mónika (1969-) (kutató vegyész) Dosztányi Zsuzsanna Pappu, Rohit V. Babu, M. Madan Longhi, Sonia Tompa Péter Dunker, A. Keith Uversky, Vladimir N. Tosatto, Silvio C. E. Vendruscolo, Michele
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM106912
035-os BibID:(scopus)85141945790 (wos)000883836600024 (cikkazonosító)6954
Első szerző:Zelenka, Tomas
Cím:The 3D enhancer network of the developing T cell genome is shaped by SATB1 / Zelenka Tomas, Klonizakis Antonios, Tsoukatou Despina, Papamatheakis Dionysios-Alexandros, Franzenburg Sören, Tzerpos Petros, Tzonevrakis Ioannis-Rafail, Papadogkonas George, Kapsetaki Manouela, Nikolaou Christoforos, Plewczynski Dariusz, Spilianakis Charalampos
Dátum:2022
ISSN:2041-1723
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nature Communications. - 13 : 1 (2022), p. 1-22. -
További szerzők:Klonizakis, Antonios Tsoukatou, Despina Papamatheakis, Dionysios-Alexandros Franzenburg, Sören Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Tzonevrakis, Ioannis-Rafail Papadogkonas, George Kapsetaki, Manouela Nikolaou, Christoforos Plewczynski, Dariusz Spilianakis, Charalampos G.
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1