CCL

Összesen 10 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM069210
035-os BibID:(WoS)000399448400018 (Scopus)85019057713
Első szerző:Bojcsuk Dóra (klinikai laboratóriumi kutató)
Cím:Inducible super-enhancers are organized based on canonical signal-specific transcription factor binding elements / Dóra Bojcsuk, Gergely Nagy, Balint L. Balint
Dátum:2017
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
super-enhancer
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 45 : 7 (2017), p. 3693-3706. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Pályázati támogatás:TAMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM082431
035-os BibID:(WoS)000518532100013 (Scopus)85077771431
Első szerző:Csumita Mária (biomérnök)
Cím:Specific enhancer selection by IRF3, IRF5 and IRF9 is determined by ISRE half-sites, 5' and 3' flanking bases, collaborating transcription factors and the chromatin environment in a combinatorial fashion / Mária Csumita, Attila Csermely, Attila Horvath, Gergely Nagy, Fanny Monori, Loránd Göczi, Hans-Acha Orbea, Walter Reith, Lajos Széles
Dátum:2020
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 48 : 2 (2020), p. 589-604. -
További szerzők:Csermely Attila Horváth Attila (orvos) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Monori Fanny (mérnökinformatikus) Göczi Loránd (informatikus) Orbea, Hans-Acha Reith, Walter Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM076312
035-os BibID:(WoS)000433056900015 (Scopus)85054167767
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The IL-4/STAT6/PPAR[gamma] signaling axis is driving the expansion of the RXR heterodimer cistrome, providing complex ligand responsiveness in macrophages / Daniel Bence, Nagy Gergely, Horvath Attila, Czimmerer Zsolt, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Poliska Szilard, Hays Tristan T., Sauer Sascha, Francois-Deleuze Jean, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 46 : 9 (2018), p. 4425-4439. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Hays, Tristan T. Sauer, Sascha Francois-Deleuze, Jean Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:PD124843
OTKA
K124298
OTKA
K126885
OTKA
K116855
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM106904
035-os BibID:(scopus)85122220907 (wos)000743496700062
Első szerző:Hatos András
Cím:FuzDB : a new phase in understanding fuzzy interactions / Hatos Andras, Monzon Alexander Miguel, Tosatto Silvio C. E., Piovesan Damiano, Fuxreiter Monika
Dátum:2022
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 50 : D1 (2022), p. D509-D517. -
További szerzők:Monzon, Alexander Miguel Tosatto, Silvio C. E. Piovesan, Damiano Fuxreiter Mónika (1969-) (kutató vegyész)
Pályázati támogatás:MTA-DE Lendület
MTA
Fehérjedinamikai Kutatócsoport
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM074760
035-os BibID:(WoS)000456709700016 (Scopus)85056716023
Első szerző:Hegedűs Éva (biofizikus)
Cím:Endogenous single-strand DNA breaks at RNA polymerase II promoters in Saccharomyces cerevisiae / Hegedűs Éva, Kókai Endre, Nánási Péter, Imre László, Halász László, Jossé Rozenn, Antunovics Zsuzsa, Webb Martin R., El Hage Aziz, Pommier Yves, Székvölgyi Lóránt, Dombrádi Viktor, Szabó Gábor
Dátum:2018
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
ssDNA breaks
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 46 : 20 (2018), p. 10649-10668. -
További szerzők:Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Imre László (1979-) (biológus) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Jossé, Rozenn Antunovics Zsuzsa (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Webb, Martin R. El Hage, Aziz Pommier, Yves Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K72762
OTKA
NK101337
OTKA
K128770
OTKA
4.2.2-08/1-2008-0015
TÁMOP
4.2.1/B09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
4.2.2.A-11/1/KONV2012-0023 "VÉD-ELEM"
TÁMOP
4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
NKFIH-ERC-HU-117670
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM077627
035-os BibID:(WoS)000467964800013 (Scopus)85064477457
Első szerző:Horváth Attila (programtervező informatikus)
Cím:Labelled regulatory elements are pervasive features of the macrophage genome and are dynamically utilized by classical and alternative polarization signals / Attila Horvath, Bence Daniel, Lajos Szeles, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Zsolt Czimmerer, Lilla Ozgyin, Laszlo Steiner, Mate Kiss, Zoltan Simandi, Szilard Poliska, Nikolas Giannakis, Emanuele Raineri, Ivo G. Gut, Benedek Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2019
ISSN:0305-1048 1362-4962
Megjegyzések:The concept of tissue-specific gene expression posits that lineage-determining transcription factors (LDTFs) determine the open chromatin profile of a cell via collaborative binding, providing molecular beacons to signal-dependent transcription factors (SDTFs). However, the guiding principles of LDTF binding, chromatin accessibility and enhancer activity have not yet been systematically evaluated. We sought to study these features of the macrophage genome by the combination of experimental (ChIP-seq, ATAC-seq and GRO-seq) and computational approaches. We show that Random Forest and Support Vector Regression machine learning methods can accurately predict chromatin accessibility using the binding patterns of the LDTF PU.1 and four other key TFs of macrophages (IRF8, JUNB, CEBPA and RUNX1). Any of these TFs alone were not sufficient to predict open chromatin, indicating that TF binding is widespread at closed or weakly opened chromatin regions. Analysis of the PU.1 cistrome revealed that two-thirds of PU.1 binding occurs at low accessible chromatin. We termed these sites labelled regulatory elements (LREs), which may represent a dormant state of a future enhancer and contribute to macrophage cellular plasticity. Collectively, our work demonstrates the existence of LREs occupied by various key TFs, regulating specific gene expression programs triggered by divergent macrophage polarizing stimuli.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 47 : 6 (2019), p. 2778-2792. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Ozgyin Lilla (1989-) (molekuláris biológus) Steiner László Kiss Máté Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Giannakis, Nikolas Raineri, Emanuele Gut, Ivo G. Nagy Benedek (1973-) (informatikus, matematikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:NKFIH K116855
NKFIH
NKFIH K124298
NKFIH
NKFIH KH126885
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
GINOP-2.1.7-15-2016-01487
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM071118
035-os BibID:(WoS)000396575500034 (Scopus)85016050879
Első szerző:Miskei Márton (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:FuzDB : database of fuzzy complexes, a tool to develop stochastic structure-function relationships for protein complexes and higher-order assemblies / Marton Miskei, Csaba Antal, Monika Fuxreiter
Dátum:2017
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 45 (2017), p. D228-D235. -
További szerzők:Antal Csaba Fuxreiter Mónika (1969-) (kutató vegyész)
Pályázati támogatás:NN 106562
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM119741
035-os BibID:(WoS)001160675100001
Első szerző:Nagy Gergely (molekuláris biológus)
Cím:Lineage-determining transcription factor-driven promoters regulate cell type-specific macrophage gene expression / Gergely Nagy, Dóra Bojcsuk, Petros Tzerpos, Tímea Cseh, László Nagy
Dátum:2024
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - [Epub ahead of print] (2024). -
További szerzők:Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Silye-Cseh Timea (1985-) (Biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:NKFIH KKP129909
Egyéb
NKFIH PD137902
Egyéb
NKFIH PD135102
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM024421
Első szerző:Szatmári István (biológus)
Cím:Telomeric repeat amplification, without shortening or lengthening of the telomerase products: a method to analyze the processivity of telomerase enzyme / Istvan Szatmari, Janos Aradi
Dátum:2001
ISSN:1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 29 : 2 (2001), p. e3. -
További szerzők:Aradi János (1942-) (biokémikus, vegyész)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM110342
035-os BibID:(wos)000958922300001
Első szerző:Takács Roland Ádám (molekuláris biológus, biokémikus)
Cím:The temporal transcriptomic signature of cartilage formation / Takács Roland, Vágó Judit, Póliska Szilárd, Pushparaj Peter Natesan, Ducza László, Kovács Patrik, Jin Eun-Jung, Barrett-Jolley Richard, Zákány Róza, Matta Csaba
Dátum:2023
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 51 : 8 (2023), p. 3590-3617. -
További szerzők:Vágó Judit (1990-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Pushparaj, Peter Natesan Ducza László (1987-) (molekuláris biológus) Kovács Patrik (1996-) (orvos) Jin, Eun-Jung Barrett-Jolley, Richard Zákány Róza (1963-) (anatómus-, kötőszövetbiológus) Matta Csaba (1980-) (molekuláris biológus, genetikus, angol szakfordító)
Pályázati támogatás:FK-134304
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
TKP2020-NKA-04
Egyéb
2020- 4.1.1-TKP2020
Egyéb
TKP2021-NKTA-34
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.