CCL

Összesen 7 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM105564
035-os BibID:(cikkazonosító)108182 (WOS)000793864700010 (Scopus)85129532315
Első szerző:Decsi Kincső
Cím:RNA-seq datasets of field soybean cultures conditioned by Elice16Indures(R) biostimulator / Kincső Decsi, Barbara Kutasy, Márta Kiniczky, Géza Hegedűs, Eszter Virág
Dátum:2022
ISSN:2352-3409
Megjegyzések:The herbal drug-containing plant conditioner Elice16Indures (R) may help elicit plant immune responses in field dicotyledonous cultures. Application of this conditioner is also allowed in organic farming and recommended its drone spraying application in small doses. In this way, even distribution and better yields may be reached leading to economical and safe plant growing. The high protein content soy is an important food both in animal and human aspects which ecological cultivation is gaining prominence over GMO technology in the European Union. We present RNA-seq datasets of control and Elice16Indures treated soybean plants cultivated in field conditions from 01/05/2020 to 20/07/2020. For RNA seq experiments six samples were collected from vegetative tissues two times during the vegetation cycle: before and in flowering after 48 h of drone exposure. The 86 bp long Illumina NextSeq 550 reads were preprocessed and deposited in the NCBI SRA database. De novo assembly of combined read sets was performed and transcripts were deposited in the NCBI TSA database. Data of functional analysis of annotated transcripts are presented. The SRA and TSA datasets are under the Bioproject accession PRJNA778970. The presented datasets may help new strategies of ecological production of soy.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Organic farming
Plant conditioner
Soybean
RNA-seq
Glycine max
Transcriptome
Illumina sequencing
Megjelenés:Data in Brief. - 42 (2022), p. 1-7. -
További szerzők:Kutasy Barbara Kiniczky Márta Hegedűs Géza Virág Eszter (1982-) (biológus)
Pályázati támogatás:KFI_16-1-2017-0457
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM104298
035-os BibID:(cikkazonosító)108602
Első szerző:Decsi Kincső
Cím:RNA-seq datasets of field rapeseed (Brassica napus) cultures conditioned by Elice16Indures? biostimulator / Kincső Decsi, Géza Hegedűs, Barbara Kutasy, Eszter Virág
Dátum:2022
ISSN:2352-3409
Tárgyszavak:Agrártudományok Növénytermesztési és kertészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
transcriptome
Brassica napus
biostimulator
Elice16Indures
Megjelenés:Data in Brief. - 45 (2022), p. 1-7. -
További szerzők:Hegedűs Géza Kutasy Barbara Virág Eszter (1982-) (biológus)
Pályázati támogatás:KFI_16-1-2017-0457
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM105562
035-os BibID:(cikkazonosító)107983 (WOS)000778990600005 (Scopus)85125459654
Első szerző:Hegedűs Géza
Cím:Transcriptome datasets of Beta-Aminobutyric acid (BABA)-primed mono- and dicotyledonous plants, Hordeum vulgare and Arabidopsis thaliana / Géza Hegedűs, Ágnes Nagy, Kincső Decsi, Barbara Kutasy, Eszter Virág
Dátum:2022
ISSN:2352-3409
Megjegyzések:The non-protein amino acid beta-Aminobutyric acid (BABA) may trigger the immune responses of plants to various biotic and abiotic stresses leading to a long-term resistance (primed state). We present RNA-seq datasets of BABA -primed mono-and dicotyledonous plants, such as Arabidopsis thaliana and Hordeum vulgare. Illumina NextSeq550 sequencing were car-ried out after 72 h of BABA exposure. 87 bp long sequence reads were preprocessed of treated and control samples and deposited in the NCBI SRA database. Transcriptome datasets were de novo assembled of each species and deposited in the NCBI TSA database. These SRA and TSA depositions are un-der the Bioproject accession: PRJNA791573. Pairwise differ-ential expression with enrichment analyses were performed and the most specific DEGs were determined and annotated in both plants.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Beta-Aminobutyric acid
Arabidopsis thaliana
Hordeum vulgare
Transcriptome
Illumina sequencing
Megjelenés:Data in Brief. - 41 (2022), p. 1-7. -
További szerzők:Nagy Ágnes Decsi Kincső Kutasy Barbara Virág Eszter (1982-) (biológus)
Pályázati támogatás:KFI_16-1-2017-0457
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM105925
035-os BibID:(cikkazonosító)108287 (WOS)000809084000019 (Scopus)85131083726
Első szerző:Kutasy Barbara
Cím:Time-course gene expression profiling data of Triticum aestivum treated by supercritical CO2 garlic extract encapsulated in nanoscale liposomes / Barbara Kutasy, Kincső Decsi, Márta Kiniczky, Géza Hegedűs, Eszter Virág
Dátum:2022
ISSN:2352-3409
Megjegyzések:The biostimulant phytochemicals as alternatives to synthetic chemicals are gaining ground in sustainable agricultural production nowadays. The medicinal herb, garlic (Allium sativum) has a spectacular therapeutic reputation due to its antimicrobial properties. The effectiveness of supercritical carbon dioxide (SC-CO2) extraction of A. sativum could help preserve bioactive compounds and be used as a biostimulant agent. The SC-CO2 garlic was formulated in liposomes and used as a nanoscale drug delivery system to reach better efficiency of penetration and translocation. The SC-CO2 garlic extracts were used in Triticum aestivum timecourse experiments to monitor conditioning effects such as improving crop quality and priming its defense responses against different pathogens. Fresh leaves were collected after SC-CO2 garlic exposure at 15 min, 24, and 48 hours for QuantSeq 3' mRNA sequencing at Illumina NextSeq 550 platform. RNA quantification datasets are presented. Raw data such as Illumina 85bp single-end read sequences and reconstructed transcripts were deposited in the NCBI SRA and TSA databases under the BioProject PRJNA808851. Functional annotation of transcripts and time-course expression data are presented here to support gene expression analysis experiments.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Illumina sequencing
Allium sativum
Nanotechnology
Whole-genome transcriptional profiling
Defense response
Biostimulant
Megjelenés:Data in Brief. - 42 (2022), p. 1-7. -
További szerzők:Decsi Kincső Kiniczky Márta Hegedűs Géza Virág Eszter (1982-) (biológus)
Pályázati támogatás:KFI_16-1-2017-0457
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM105811
035-os BibID:(cikkazonosító)108800 (WoS)000906982200001 (Scopus)85143856929
Első szerző:Kutasy Barbara
Cím:Dataset of conditioning effect of herbal extract-based plant biostimulants in pea (Pisum sativum) / Barbara Kutasy, Kincső Decsi, Géza Hegedűs, Eszter Virág
Dátum:2023
ISSN:2352-3409
Megjegyzések:Nowadays, many researchers, farmers and companies focus on the development of an environmentally friendly approach for enhancing field vegetable production and protection. Using next-generation plant biostimulants (PBs) could be effective to enhance tolerance to abiotic and biotic stresses, vegetable crop quality or nutrient efficiency which is particularly important for vegetables with a short growing season, such as Pisum sativum. Two herbal drug-containing plant conditioners Elice16Indures® (supercritical carbon dioxide extract SC-CO2) and Fitokondi® (aqueous extract) developed in the RIMPH Ltd (Hungary) were used in pea field experiments to monitor the potential of enhancing crop quality and defense response against different stress factors. Fresh leaves were collected after treatments for QuantSeq 3` mRNA sequencing at Illumina NextSeq 550 platform and libraries were investigated by genome-wide transcriptional profiling focusing on genes associated with defense response pathways. RNA quantification datasets are presented and 86 bp long sequence reads were pre-processed and assembled that were deposited in the National Center for Biotechnology Information (NCBI), Sequence Read Archive (SRA) and Transcriptome Shotgun Assembly (TSA) databases under the BioProject PRJNA870114. Functional annotation of transcripts and pairwise differential expression with enrichment analyses are presented here to support gene expression analysis experiments.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
llumina sequencingwhole-genome transcriptional profiling
defense response
nanotechnology
plant conditioner
RNA dataset
Elice16Indures
Megjelenés:Data in Brief. - 46 (2023), p. 1-17. -
További szerzők:Decsi Kincső Hegedűs Géza Virág Eszter (1982-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM105350
035-os BibID:(cikkazonosító)108736
Első szerző:Mutuku, Christopher
Cím:Plasmid sequence dataset of multidrug-resistant Enterobacterales isolated from hospital effluents and wastewater treatment plant / Christopher Mutuku, Barbara Kutasy, Peter Urban, Szilvia Melegh, Robert Herczeg, Zoltan Gazdag, Eszter Virág
Dátum:2022
ISSN:2352-3409
Megjegyzések:We present plasmid sequences of 21 multidrug resistant isolates of Enterobacterales belonging to Escherichia coli (n=10), Klebsiella pneumoniae (n=9), Klebsiella oxytoca (n=1), and Citrobacter freundii (n=1). The isolates originated from effluent collected from hospital sewer pipes and from a wastewater treatment plant (WWTP) in a southwestern Hungarian city. Isolation was carried out using eosin methylene blue agar supplemented with ceftriaxone and the isolates were identified with MALDI-TOF MS. Screening for multidrug resistance was conducted by determining susceptibility to four chemical classes namely, beta-lactams, aminoglycoside, fluoroquinolone, and sulfonamide. Plasmid DNA was isolated by alkaline lysis method using the Monarch plasmid DNA miniprep kit from freshly grown pure colonies. Molecular typing and Illumina sequencing of plasmid DNA of multiresistant strains were performed. After the assembly of contigs, genes localized on plasmid sequences were determined and functionally annotated. These reconstructed plasmid sequences supplemented with gene functional annotations were deposited in the Mendeley data. Using these datasets different plasmid incompatibility groups were identified. These conjugative plasmids appear to play a key role in the transmission of multiple resistance genes in enteric bacteria via wastewater. The presented data may provide useful insight on the correlations between environmental antibiotic contamination and the development of bacterial resistance, which poses a serious public health threat.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Hospital effluents
Wastewater treatment plant
Enterobacterales
Beta-lactamases
Resistance genes
Plasmid
antibiotic resistance
Megjelenés:Data in Brief. - 45 (2022), p. 1-9. -
További szerzők:Kutasy Barbara Urbán Péter Melegh Szilvia Herczeg Róbert Gazdag Zoltán Virág Eszter (1982-) (biológus)
Pályázati támogatás:PTE
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM105352
035-os BibID:(cikkazonosító)108426 (WOS)000824070700002 (Scopus)85133712790
Első szerző:Virág Eszter (biológus)
Cím:Transcriptome profiling dataset of different developmental stage flowers of soybean (Glycine max) / Eszter Virág, Géza Hegedűs, Barbara Kutasy, Kincső Decsi
Dátum:2022
ISSN:2352-3409
Megjegyzések:TThe dynamic of flower development is a key agronomic characteristic affecting soybean yield. RNA-seq dataset of fieldcultivated soybean flowers in four developmental stages including flower buds, and early, mature, and overblown stage flowers are reported in this paper. Gene Expression (Gex) library construction and Illumina NextSeq550 sequencing were carried out to produce 86 bp long forward reads. Reads were preprocessed and deposited in the National Center for Biotechnology Information Sequence Read Archive (NCBI SRA) database. These SRA depositions are under the BioProject accession: PRJNA807844. A reference transcriptome dataset was de novo assembled using these SRA reads. Annotation, differential expression, and gene set enrichment analyses were performed and deposited in the Mendeley Data.
Tárgyszavak:Agrártudományok Növénytermesztési és kertészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Glycine max
Soybean
Flower
Development
Transcriptome
Megjelenés:Data in Brief. - 43 (2022), p. 1-8. -
További szerzők:Hegedűs Géza Kutasy Barbara Decsi Kincső
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1