Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM072943
Első szerző:	Bokor Éva (vegyész)
Cím:	Nanomolar Inhibitors of Glycogen Phosphorylase Based on β-d-Glucosaminyl Heterocycles: A Combined Synthetic, Enzyme Kinetic, and Protein Crystallography Study / Éva Bokor, Efthimios Kyriakis, Theodora G. A. Solovou, Csenge Koppány, Anastassia L. Kantsadi, Katalin E. Szabó, Andrea Szakács, George A. Stravodimos, Tibor Docsa, Vassiliki T. Skamnaki, Spyros E. Zographos, Pál Gergely, Demetres D. Leonidas, László Somsák
Dátum:	2017
ISSN:	0022-2623 1520-4804
Megjegyzések:	Aryl substituted 1-(beta-D-glucosaminyl)-1,2,3-triazoles as well as C-?-D-glucosaminyl 1,2,4-triazoles and imidazoles were synthesized and tested as inhibitors against muscle and liver isoforms of glycogen phosphorylase (GP). While the N-?-D-glucosaminyl 1,2,3-triazoles showed weak or no inhibition, the C-?-D-glucosaminyl derivatives had potent activity, and the best inhibitor was the 2-(?-D-glucosaminyl)-4(5)-(2-naphthyl)-imidazole with a Ki value of 143 nM against human liver GPa. An X-ray crystallography study of the rabbit muscle GPb inhibitor complexes revealed structural features of the strong binding and offered an explanation for the differences in inhibitory potency between glucosyl and glucosaminyl derivatives and also for the differences between imidazole and 1,2,4-triazole analogues.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:	Journal of Medicinal Chemistry 60 : 22 (2017), p. 9251-9262. -
További szerzők:	Kyriakis, Efthimios Solovou, Theodora G. A. Koppány Csenge Kantsadi, Anastassia L. Szabó Erzsébet Katalin (1989-) (vegyész) Szakács Andrea Stravodimos, George A. Docsa Tibor (1975-) (vegyész, biokémikus) Skamnaki, Vassiliki T. Zographos, Spyros E. Gergely Pál (1947-) (biokémikus) Leonidas, Demetres D. Somsák László (1954-) (vegyész)
Pályázati támogatás:	PD105808 OTKA GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM096569
035-os BibID:	(cikkazonosító)113649 (WoS)000695696100030 (Scopus)85109505021
Első szerző:	Kiss Mariann (vegyész)
Cím:	Nanomolar inhibition of human OGA by 2-acetamido-2-deoxy-d-glucono-1,5-lactone semicarbazone derivatives / Mariann Kiss, Erna Szabó, Boglárka Bocska, Luu Thanh Sinh, Conceicao Piedade Fernandes, István Timári, Joseph M. Hayes, László Somsák, Teréz Barna
Dátum:	2021
ISSN:	0223-5234
Megjegyzések:	O-GlcNAcylation is a dynamic post-translational modification mediated by O-linked beta-N-acetylglucosamine transferase (OGT) and O-GlcNAc hydrolase (OGA), that adds or removes a single beta-N-acetylglucosamine (GlcNAc) moiety to or from serine/threonine residues of nucleocytosolic and mitochondrial proteins, respectively. The perturbed homeostasis of O-GlcNAc cycling results in several pathological conditions. Human OGA is a promising therapeutic target in diseases where aberrantly low levels of O-GlcNAc are experienced, such as tauopathy in Alzheimer's disease. A new class of potent OGA inhibitors, 2-acetamido-2-deoxy-D-glucono-1,5-lactone (thio)semicarbazones, have been identified. Eight inhibitors were designed and synthesized in five steps starting from d-glucosamine and with 15-55% overall yields. A heterologous OGA expression protocol with strain selection and isolation has been optimized that resulted in stable, active and full length human OGA (hOGA) isomorph. Thermal denaturation kinetics of hOGA revealed environmental factors affecting hOGA stability. From kinetics experiments, the synthesized compounds proved to be efficient competitive inhibitors of hOGA with K-i-s in the range of similar to 30-250 nM and moderate selectivity with respect to lysosomal beta-hexosaminidases. In silico studies consisting of Prime protein-ligand refinements, QM/MM optimizations and QM/MM-PBSA binding free energy calculations revealed the factors governing the observed potencies, and led to design of the most potent analogue 2-acetamido-2-deoxy-D-glucono-1,5-lactone 4-(2-naphthyl)-semicarbazone 6g (K-i = 36 nM). The protocol employed has applications in future structure based inhibitor design targeting OGA. (C) 2021 The Authors. Published by Elsevier Masson SAS.
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk hOGA Expression Inhibitor Glyconolactone semicarbazone QM/MM-PBSA Halogen HalogenHydrogen bond donor
Megjelenés:	European Journal of Medicinal Chemistry. - 223 (2021), p. 1-14. -
További szerzők:	Szabó Erna (1990-) (Biológus) Bocska Boglárka Sinh, Luu Thanh Fernandes, Conceicao Piedade Timári István (1989-) (vegyész) Hayes, Joseph M. Somsák László (1954-) (vegyész) Barna Teréz (1963-) (vegyész)
Pályázati támogatás:	K 109450 OTKA NKFIH FK125067 Egyéb NKFIH PD 135034 Egyéb GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP GINOP-2.3.3-15-2016-00004 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM072396
Első szerző:	Kun Sándor (vegyész)
Cím:	A multidisciplinary study of 3-(β-D-glucopyranosyl)-5-substituted-1,2,4-triazole derivatives as glycogen phosphorylase inhibitors : computation, synthesis, crystallography and kinetics reveal new potent inhibitors / Sandor Kun, Jaida Begum, Efthimios Kyriakis, Evgenia C. V. Stamati, Thomas A. Barkas, Eszter Szennyes, Eva Bokor, Katalin E. Szabo, George A. Stravodimos, Adam Sipos, Tibor Docsa, Pal Gergely, Colin Moffatt, Myrto S. Patraskaki, Maria C. Kokolaki, Alkistis Gkerdi, Vassiliki T. Skamnaki, Demetres D. Leonidas, Laszló Somsák, Joseph M. Hayes
Dátum:	2018
ISSN:	0223-5234
Megjegyzések:	3-(β-D-Glucopyranosyl)-5-substituted-1,2,4-triazoles have been revealed as an effective scaffold for the development of potent glycogen phosphorylase (GP) inhibitors but with the potency very sensitive to the nature of the alkyl/aryl 5-substituent (Kun et al., Eur. J. Med. Chem. 2014, 76, 567). For a training set of these ligands, quantum mechanics-polarized ligand docking (QM-PLD) demonstrated good potential to identify larger differences in potencies (predictive index PI = 0.82) and potent inhibitors with Ki's < 10 ?M (AU-ROC = 0.86). Accordingly, in silico screening of 2335 new analogues exploiting the ZINC docking database was performed and nine predicted candidates selected for synthesis. The compounds were prepared in O-perbenzoylated forms by either ring transformation of 5-?-D-glucopyranosyl tetrazole by N-benzyl-arenecarboximidoyl chlorides, ring closure of C-(?-D-glucopyranosyl)formamidrazone with aroyl chlorides, or that of N-(?-D-glucopyranosylcarbonyl)arenethiocarboxamides by hydrazine, followed by deprotections. Kinetics experiments against rabbit muscle GPb (rmGPb) and human liver GPa (hlGPa) revealed five compounds as potent low ?M inhibitors with three of these on the submicromolar range for rmGPa. X-ray crystallographic analysis sourced the potency to a combination of favorable interactions from the 1,2,4-triazole and suitable aryl substituents in the GP catalytic site. The compounds also revealed promising calculated pharmacokinetic profiles.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban 1,2,4-Triazole C-[beta]-D-glucopyranosyl derivatives Glycogen phosphorylase inhibitors QM/MM docking Kinetics X-ray crystallography
Megjelenés:	European Journal of Medicinal Chemistry 147 (2018), p. 266-278. -
További szerzők:	Begum, Jaida Kyriakis, Efthimios Stamati, Evgenia C. V. Barkas, Thomas A. Szennyes Eszter (1989-) (vegyész) Bokor Éva (1982-) (vegyész) Szabó Erzsébet Katalin (1989-) (vegyész) Stravodimos, George A. Sipos Ádám (1992-) (gyógyszerész) Docsa Tibor (1975-) (vegyész, biokémikus) Gergely Pál (1947-) (biokémikus) Moffatt, Colin Patraskaki, Myrto S. Kokolaki, Maria C. Gkerdi, Alkistis Skamnaki, Vassiliki T. Leonidas, Demetres D. Somsák László (1954-) (vegyész) Hayes, Joseph M.
Pályázati támogatás:	PD 105808 OTKA PD 121406 OTKA GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM070064
Első szerző:	Lehoczki Gábor (biológus, molekuláris biológus)
Cím:	Simple ITC method for activity and inhibition studies on human salivary α-amylase / Gábor Lehoczki, Kármen Szabó, István Takács, Lili Kandra, Gyöngyi Gyémánt
Dátum:	2016
ISSN:	1475-6366 1475-6374
Tárgyszavak:	Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban Molekulatudomány
Megjelenés:	Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. - 31 : 6 (2016), p. 1648-1653. -
További szerzők:	Nagy-Szabó Kármen Annamária (1990-) (vegyész) Takács István Kandra Lili (1943-) (biokémikus) Gyémánt Gyöngyi (1960-) (vegyész)
Pályázati támogatás:	TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP Glikoenzimek szerkezet/funkció vizsgálata, oligoszacharidok enzimatikus előállítása OTKA CK 77515 OTKA OTKA ANN 110821 OTKA
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: