CCL

Összesen 3 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM069210
035-os BibID:(WoS)000399448400018 (Scopus)85019057713
Első szerző:Bojcsuk Dóra (klinikai laboratóriumi kutató)
Cím:Inducible super-enhancers are organized based on canonical signal-specific transcription factor binding elements / Dóra Bojcsuk, Gergely Nagy, Balint L. Balint
Dátum:2017
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
super-enhancer
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 45 : 7 (2017), p. 3693-3706. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Pályázati támogatás:TAMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM074760
035-os BibID:(WoS)000456709700016 (Scopus)85056716023
Első szerző:Hegedűs Éva (biofizikus)
Cím:Endogenous single-strand DNA breaks at RNA polymerase II promoters in Saccharomyces cerevisiae / Hegedűs Éva, Kókai Endre, Nánási Péter, Imre László, Halász László, Jossé Rozenn, Antunovics Zsuzsa, Webb Martin R., El Hage Aziz, Pommier Yves, Székvölgyi Lóránt, Dombrádi Viktor, Szabó Gábor
Dátum:2018
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
ssDNA breaks
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 46 : 20 (2018), p. 10649-10668. -
További szerzők:Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Imre László (1979-) (biológus) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Jossé, Rozenn Antunovics Zsuzsa (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Webb, Martin R. El Hage, Aziz Pommier, Yves Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K72762
OTKA
NK101337
OTKA
K128770
OTKA
4.2.2-08/1-2008-0015
TÁMOP
4.2.1/B09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
4.2.2.A-11/1/KONV2012-0023 "VÉD-ELEM"
TÁMOP
4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
NKFIH-ERC-HU-117670
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM077627
035-os BibID:(WoS)000467964800013 (Scopus)85064477457
Első szerző:Horváth Attila (programtervező informatikus)
Cím:Labelled regulatory elements are pervasive features of the macrophage genome and are dynamically utilized by classical and alternative polarization signals / Attila Horvath, Bence Daniel, Lajos Szeles, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Zsolt Czimmerer, Lilla Ozgyin, Laszlo Steiner, Mate Kiss, Zoltan Simandi, Szilard Poliska, Nikolas Giannakis, Emanuele Raineri, Ivo G. Gut, Benedek Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2019
ISSN:0305-1048 1362-4962
Megjegyzések:The concept of tissue-specific gene expression posits that lineage-determining transcription factors (LDTFs) determine the open chromatin profile of a cell via collaborative binding, providing molecular beacons to signal-dependent transcription factors (SDTFs). However, the guiding principles of LDTF binding, chromatin accessibility and enhancer activity have not yet been systematically evaluated. We sought to study these features of the macrophage genome by the combination of experimental (ChIP-seq, ATAC-seq and GRO-seq) and computational approaches. We show that Random Forest and Support Vector Regression machine learning methods can accurately predict chromatin accessibility using the binding patterns of the LDTF PU.1 and four other key TFs of macrophages (IRF8, JUNB, CEBPA and RUNX1). Any of these TFs alone were not sufficient to predict open chromatin, indicating that TF binding is widespread at closed or weakly opened chromatin regions. Analysis of the PU.1 cistrome revealed that two-thirds of PU.1 binding occurs at low accessible chromatin. We termed these sites labelled regulatory elements (LREs), which may represent a dormant state of a future enhancer and contribute to macrophage cellular plasticity. Collectively, our work demonstrates the existence of LREs occupied by various key TFs, regulating specific gene expression programs triggered by divergent macrophage polarizing stimuli.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 47 : 6 (2019), p. 2778-2792. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Ozgyin Lilla (1989-) (molekuláris biológus) Steiner László Kiss Máté Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Giannakis, Nikolas Raineri, Emanuele Gut, Ivo G. Nagy Benedek (1973-) (informatikus, matematikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:NKFIH K116855
NKFIH
NKFIH K124298
NKFIH
NKFIH KH126885
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
GINOP-2.1.7-15-2016-01487
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.