Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM118188
035-os BibID:	(cikkazonosító)123 (Scopus)85183013078
Első szerző:	Feró Orsolya
Cím:	DNA methylome, R-loop and clinical exome profiling of patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis / Orsolya Feró, Dóra Varga, Éva Nagy, Zsolt Karányi, Éva Sipos, József Engelhardt, Nóra Török, István Balogh, Borbála Vető, István Likó, Ábel Fóthi, Zoltán Szabó, Gábor Halmos, László Vécsei, Tamás Arányi, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2024
ISSN:	2052-4463
Megjegyzések:	Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a fatal neurodegenerative disorder characterized by the death of motor neurons, the aetiology of which is essentially unknown. Here, we present an integrative epigenomic study in blood samples from seven clinically characterised sporadic ALS patients to elucidate molecular factors associated with the disease. We used clinical exome sequencing (CES) to study DNA variants, DNA-RNA hybrid immunoprecipitation sequencing (DRIP-seq) to assess R-loop distribution, and reduced representation bisulfite sequencing (RRBS) to examine DNA methylation changes. The above datasets were combined to create a comprehensive repository of genetic and epigenetic changes associated with the ALS cases studied. This repository is well-suited to unveil new correlations within individual patients and across the entire patient cohort. The molecular attributes described here are expected to guide further mechanistic studies on ALS, shedding light on the underlying genetic causes and facilitating the development of new epigenetic therapies to combat this life-threatening disease.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk R-loop ALS DNA methylation mutation
Megjelenés:	Scientific Data. - 11 : 1 (2024), p. 1-12. -
További szerzők:	Varga Dóra (gyógyszerész) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Sipos Éva (1989-) (gyógyszerész) Engelhardt József Török Nóra (Szeged) Balogh István (1972-) (molekuláris biológus, genetikus) Vető Borbála Liko István Fóthi Ábel Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Vécsei László (1954-) (neurológus) Arányi Tamás Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM112379
035-os BibID:	(cikkazonosító)364 (WoS)001003037300001 (Scopus)85161068901
Első szerző:	Feró Orsolya
Cím:	Coding and noncoding transcriptomes of NODULIN HOMEOBOX (NDX)-deficient Arabidopsis inflorescence / Feró Orsolya, Karányi Zsolt, Nagy Éva, Mosolygó-L. Ágnes, Szaker Henrik Mihály, Csorba Tibor, Székvölgyi Lóránt
Dátum:	2023
ISSN:	2052-4463
Megjegyzések:	Arabidopsis NODULIN HOMEOBOX (NDX) is a plant-specific transcriptional regulator whose role in small RNA biogenesis and heterochromatin homeostasis has recently been described. Here we extend our previous transcriptomic analysis to the flowering stage of development. We performed mRNA-seq and small RNA-seq measurements on inflorescence samples of wild-type and ndx1-4 mutant (WiscDsLox344A04) Arabidopsis plants. We identified specific groups of differentially expressed genes and noncoding heterochromatic siRNA (hetsiRNA) loci/regions whose transcriptional activity was significantly changed in the absence of NDX. In addition, data obtained from inflorescence were compared with seedling transcriptomics data, which revealed development-specific changes in gene expression profiles. Overall, we provide a comprehensive data source on the coding and noncoding transcriptomes of NDX-deficient Arabidopsis flowers to serve as a basis for further research on NDX function.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk kromatinszerkezet big data bioinformatika genomika
Megjelenés:	Scientific Data. - 10 : 1 (2023), p. 1-12. -
További szerzők:	Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Nagy Éva (1980-) (molekuláris biológus) Mosolygó Ágnes (1986-) (biológus) Szaker Henrik Csorba Tibor Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	NKFIH-K-142137 Egyéb NKFIH-NNE-130913 Egyéb TKP2021-EGA-18 Egyéb UNKP-21-5-DE-11 Egyéb NKFIH-K129283 Egyéb K137722 OTKA K136513 OTKA
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM106015
035-os BibID:	(cikkazonosító)763 (WoS)000897492900003 (Scopus)85143655424
Első szerző:	Laczik Miklós (bioinformatikus/molekuláris biológus)
Cím:	Extensive proteome and functional genomic profiling of variability between genetically identical human B-lymphoblastoid cells / Laczik Miklós, Erdős Edina, Ozgyin Lilla, Hevessy Zsuzsanna, Csősz Éva, Kalló Gergő, Nagy Tibor, Barta Endre, Póliska Szilárd, Szatmári István, Bálint Bálint László
Dátum:	2022
ISSN:	2052-4463
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Scientific Data. - 9 : 1 (2022), p. 1-12. -
További szerzők:	Erdős Edina (1989-) (klinikai laboratóriumi kutató) Ozgyin Lilla (1989-) (molekuláris biológus) Hevessy Zsuzsanna (1966-) (laboratóriumi szakorvos) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Kalló Gergő (1989-) (molekuláris biológus) Nagy Tibor (Gödöllő) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Szatmári István (1971-) (biológus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.3-15-2016-00007 GINOP GINOP-2.3.3-15-2016-00020 GINOP EFOP-3.6.1-16-2016-00022 EFOP OTKA K 129166 OTKA OTKA K 124890 OTKA TAMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: