Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM079818
035-os BibID:	(cikkazonosító)102642 (Scopus)85068486502 (PMID)31300387
Első szerző:	Boros-Oláh Beáta (molekuláris biológus)
Cím:	Drugging the R-loop interactome : RNA-DNA hybrid binding proteins as targets for cancer therapy / Beáta Boros-Oláh, Nikoletta Dobos, Lilla Hornyák, Zoltán Szabó, Zsolt Karányi, Gábor Halmos, Jason Roszik, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2019
ISSN:	1568-7864
Megjegyzések:	Unravelling the origin of genetic alterations from point mutations to chromosomal rearrangements was greatly enhanced by the discovery of RNA-DNA hybrids (R-loops) that behave as hotspots of genomic instability in a variety of organisms. Current models suggest that uncontrolled R-loops are a hazard to genome integrity, therefore, identifying proteins that are involved in recognising and signalling R-loop structures are of key importance. Herein we analysed key RNA-DNA hybrid binding proteins in humans taking advantage of large-scale gene expression, survival rate, and drug-sensitivity data from cancer genomics databases. We show that ex- pression of RNA-DNA hybrid binding proteins in various cancer types is associated with survival and may have contrasting outcomes in responding to therapeutic treatments. Based on the revealed pharmacogenomic land- scape of human RNA-DNA hybrid binding proteins, we propose that R-loops and R-loop binding proteins are potentially relevant new epigenetic markers and therapeutic targets in multiple cancers
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Cancer diagnostics and therapy Chemotherapy Clinical trial Drug sensitivity R-loop RNA-DNA hybrid Survival association
Megjelenés:	DNA Repair. - 84 (2019), p. 1-10. -
További szerzők:	Dobos Nikoletta (1981-) (biológus) Hornyák Lilla Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Roszik, Jason Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP GINOP-2.3.2-15-2016-00043 GINOP GINOP-2.3.2-15-2016-00062 GINOP Lendület program LP2015-9/2015 egyéb 20428-3/2018/FEKUTSTRAT egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM014291
Első szerző:	Huber, Aline
Cím:	PARP-1, PARP-2 and ATM in the DNA damage response : functional synergy in mouse development / Huber, A., Bai, P., de Murcia, J. M., de Murcia, G.
Dátum:	2004
ISSN:	1568-7864 (Print)
Megjegyzések:	Poly(ADP-ribosyl)ation is an immediate DNA damage-dependent posttranslational modification of histones and nuclear proteins that contributes to the survival of injured proliferating cells. Poly(ADP-ribose) polymerases (PARPs) now constitute a superfamily of 18 proteins, encoded by different genes and displaying a common conserved catalytic domain. PARP-1 (113kDa), the founding member, and PARP-2 (62kDa) are both involved in DNA-break sensing and signaling when single strand break repair (SSBR) or base excision repair (BER) pathways are engaged. The generation by homologous recombination of deficient mouse models have confirmed the caretaker function of PARP-1 and PARP-2 in mammalian cells under genotoxic stress. This review summarizes our present knowledge on their physiological role in the cellular response to DNA damage and on the genetic interactions between PARP-1, PARP-2, Atm that play an essential role during early embryogenesis.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban Animals Catalytic Domain Cell Cycle Proteins Cell Proliferation DNA Damage DNA Repair DNA-Binding Proteins Gene Expression Regulation, Developmental Heterozygote Histones/metabolism Humans Mice Models, Biological Oxidative Stress Poly(ADP-ribose) Polymerases/metabolism/ physiology Protein-Serine-Threonine Kinases/metabolism/ physiology Signal Transduction Tumor Suppressor Proteins
Megjelenés:	DNA Repair. - 3 : 8-9 (2004), p. 1103-1108. -
További szerzők:	Bai Péter (1976-) (biokémikus) de Murcia, Josiane Ménissier de Murcia, Gilbert
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat elektronikus változat DOI
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM016570
Első szerző:	Varga Tamás (biológus)
Cím:	Chromosomal aberrations induced by double strand DNA breaks / Varga Tamas, Aplan Peter D.
Dátum:	2005
ISSN:	1568-7864
Megjegyzések:	It has been suggested that introduction of double-strand DNA breaks into mammalian chromosomes can lead to gross chromosomal rearrangements through improper DNA repair. To study this phenomenon, we employed a model system in which a double-strand DNA break (DSB) can be produced in human cells in vivo at a predetermined location. The ensuing chromosomal changes flanking the breakage site can then be cloned and characterized. In this system, the recognition site for the I-SceI endonuclease, whose 18 bp recognition sequence is not normally found in the human genome, is placed between a strong constitutive promoter and the Herpes simplex virus thymidine kinase (HSV-tk) gene, which serves as a negative selectable marker. We found that the most common mutation following aberrant DSB repair was an interstitial deletion; these deletions typically showed features of non-homologous end joining (NHEJ), such as microhomologies and insertions of direct or inverted repeat sequences. We also detected more complex rearrangements, including large insertions from adjacent or distant genomic regions. The insertion events that involved distant genomic regions typically represented transcribed sequences, and included both L1 LINE elements and sequences known to be involved in genomic rearrangements. This type of aberrant repair could potentially lead to gene inactivation via deletion of coding or regulatory sequences, or production of oncogenic fusion genes via insertion of coding sequences.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban Chromosomal rearrangement Double strand DNA break I-SceI Insertion Non-homologous end joining
Megjelenés:	Dna Repair. - 4 : 9 (2005), p. 1038-1046. -
További szerzők:	Aplan, Peter D.
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM072185
Első szerző:	Zhang, Lihong
Cím:	Natural product [béta]-thujaplicin inhibits homologous recombination repair and sensitizes cancer cells to radiation therapy / Zhang L., Peng Y., Uray I., Shen J., Wang L., Peng X., Brown P. H., Tu W., Peng G.
Dátum:	2017
ISSN:	1568-7864
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:	Dna Repair 60 (2017), p. 89-101. -
További szerzők:	Peng, Yang Uray Iván Péter (1970-) (kutatóorvos) Shen, Jianfeng Wang, Lulu Peng, Xiangdong Brown, Powel H. Tu, Wei Peng, Guang
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: