CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM076746
Első szerző:Bozóki Beáta (molekuláris biológus)
Cím:Use of Recombinant Fusion Proteins in a Fluorescent Protease Assay Platform and Their In-gel Renaturation / Bozóki Beáta, Mótyán János András, Miczi Márió, Gazda Lívia Diána, Tőzsér József
Dátum:2019
ISSN:1940-087X
Megjegyzések:Proteases are intensively studied enzymes due to their essential roles in several biological pathways of living organisms and in pathogenesis; therefore, they are important drug targets. We have developed a magnetic-agarose-bead-based assay platform for the investigation of proteolytic activity, which is based on the use of recombinant fusion protein substrates. In order to demonstrate the use of this assay system, a protocol is presented on the example of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) protease. The introduced assay platform can be utilized efficiently in the biochemical characterization of proteases, including enzyme activity measurements in mutagenesis, kinetic, inhibition, or specificity studies, and it may be suitable for high-throughput substrate screening or may be adapted to other proteolytic enzymes. In this assay system, the applied substrates contain N-terminal hexahistidine (His6) and maltose-binding protein (MBP) tags, cleavage sites for tobacco etch virus (TEV) and HIV-1 proteases, and a C-terminal fluorescent protein. The substrates can be efficiently produced in Escherichia coli cells and easily purified using nickel (Ni)-chelate-coated beads. During the assay, the proteolytic cleavage of bead-attached substrates leads to the release of fluorescent cleavage fragments, which can be measured by fluorimetry. Additionally, cleavage reactions can be analyzed by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). A protocol for the in-gel renaturation of assay components is also described, as partial renaturation of fluorescent proteins enables their detection based on molecular weight and fluorescence.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
recombinant fusion protein substrate
protease assay
Ni-NTA magnetic agarose beads
fluorescent protein
in-gel renaturation
human immunodeficiency virus type 1 protease
Megjelenés:Journal of Visualized Experiments. - 143 (2019), p. 1-15. -
További szerzők:Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Miczi Márió Gazda Lívia Diána (1989-) Tőzsér József (1959-) (molekuláris biológus, biokémikus, vegyész)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM114079
035-os BibID:(cikkazonosító)e64485 (WoS)001073487400016 (Scopus)85168335908
Első szerző:Guti Eliza (Molekuláris biológus)
Cím:High-Content Screening Assay for the Identification of Antibody-Dependent Cellular Cytotoxicity Modifying Compounds / Eliza Guti, Ákos Máté Bede, Csongor Váróczy, Csaba Hegedűs, Máté Á. Demény, László Virág
Dátum:2023
ISSN:1940-087X
Megjegyzések:Immunotherapy with antigen-specific antibodies or immune checkpoint inhibitors has revolutionized the therapy of breast cancer. Breast cancer cells expressing the epidermal growth factor receptor HER2 can be targeted by the anti-HER-2 antibody trastuzumab. Antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC) is an important mechanism implicated in the antitumor action of HER-2. Trastuzumab bound to cancer cells can be recognized by the Fc receptors of ADCC effector cells (e.g., natural killer (NK) cells, macrophages, and granulocytes), triggering the cytotoxic activity of these immune cells leading to cancer cell death. We set out to develop an image-based assay for the quantification of ADCC to identify novel ADCC modulator compounds by high-content screening. In the assay, HER2 overexpressing JIMT-1 breast cancer cells are co-cultured with NK-92 cells in the presence of trastuzumab, and target cell death is quantified by automated microscopy and quantitative image analysis. Target cells are distinguished from effector cells based on their EGFP fluorescence. We show how compound libraries can be tested in the assay to identify ADCC modulator drugs. For this purpose, a compound library test plate was set up using randomly selected fine chemicals off the lab shelf. Three microtubule destabilizing compounds (colchicine, vincristine, podophyllotoxin) expected to interfere with NK cell migration and degranulation were also included in the test library. The test screen identified all three positive control compounds as hits proving the suitability of the method to identify ADCC-modifying drugs in a chemical library. With this assay, compound library screens can be performed to identify ADCC-enhancing compounds that could be used as adjuvant therapeutic agents for the treatment of patients receiving anticancer immunotherapies. In addition, the method can also be used to identify any undesirable ADCC-inhibiting side effects of therapeutic drugs taken by cancer patients for different indications.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Visualized Experiments. - 198 (2023), p. 1-12. -
További szerzők:Bede Ákos Máté Váróczy Csongor Hegedűs Csaba (1980-) (biokémikus, molekuláris biológus) Demény Máté Ágoston (1976-) (molekuláris biológus) Virág László (1965-) (biokémikus, sejtbiológus, farmakológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00020
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00048
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:bibEBI00026272
Első szerző:Jenei Csaba (kardiológus)
Cím:Three-Dimensional Echocardiographic Method for the Visualization and Assessment of Specific Parameters of the Pulmonary Veins / Csaba Jenei, Laszlo Nagy, Reka Urbancsek, Daniel Czuriga, Zoltan Csanádi
Dátum:2020
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Visualized Experiments. - 164 (2020), p. 1-13. -
További szerzők:Nagy László Tibor (1969-) (belgyógyász, kardiológus) Urbancsek Réka (1991-) (általános orvos) Czuriga Dániel (1982-) (kardiológus) Csanádi Zoltán (1960-) (kardiológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00043
GINOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM065035
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:Prediction and Validation of Gene Regulatory Elements Activated During Retinoic Acid Induced Embryonic Stem Cell Differentiation / Zoltan Simandi, Attila Horvath, Peter Gergely Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2016
ISSN:1940-087X
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal of Visualized Experiments. - 2016 : 112 (2016), p. e53978. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Nagy Péter (1986-) (tudományos segédmunkatárs) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
K111941
OTKA
KTIA_13_NAP-A-I/9
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM120442
Első szerző:Sturniolo, Isotta
Cím:Quantifying antibody-dependent cellular cytotoxicity in a tumor spheroid model : application for drug discovery / Isotta Sturniolo, Csongor Váróczy, Ákos Máté Bede, Csaba Hegedűs, Máté Á. Demény, László Virág
Dátum:2024
ISSN:1940-087X
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Jove-Journal of Visualized Experiments. - [Epub ahead of print] (2024). -
További szerzők:Váróczy Csongor Bede Ákos Máté Hegedűs Csaba (1980-) (biokémikus, molekuláris biológus) Demény Máté Ágoston (1976-) (molekuláris biológus) Virág László (1965-) (biokémikus, sejtbiológus, farmakológus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00010 TUMORDNS
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00048-STAYALIVE
GINOP
K132193
OTKA
K147482
OTKA
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM095083
035-os BibID:(cikkazonosító)e62241
Első szerző:Vámosi György (biofizikus)
Cím:Assessing Protein Interactions in Live-Cells with FRET-Sensitized Emission / György Vámosi, Sarah Miller, Molika Sinha, Gabor Mocsár, Malte Renz
Dátum:2021
ISSN:1940-087X
Megjegyzések:Förster Resonance Energy Transfer (FRET) is the radiationless transfer of energy from an excited donor to an acceptor molecule and depends upon the distance and orientation of the molecules as well as the extent of overlap between the donor emission and acceptor absorption spectra. FRET permits to study the interaction of proteins in the living cell over time and in different subcellular compartments. Different intensity-based algorithms to measure FRET using microscopy have been described in the literature. Here, a protocol and an algorithm are provided to quantify FRET efficiency based on measuring both the sensitized emission of the acceptor and quenching of the donor molecule. The quantification of ratiometric FRET in the living cell not only requires the determination of the crosstalk (spectral spill-over, or bleedthrough) of the fluorescent proteins but also the detection efficiency of the microscopic setup. The protocol provided here details how to assess these critical parameters
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Visualized Experiments. - 2021 : 170 (2021), p. 1-15. -
További szerzők:Miller, Sarah Sinha, Molika Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Renz, Malte
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00030
GINOP
NN129371
OTKA
ANN135107
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.