Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM079818
035-os BibID:	(cikkazonosító)102642 (Scopus)85068486502 (PMID)31300387
Első szerző:	Boros-Oláh Beáta (molekuláris biológus)
Cím:	Drugging the R-loop interactome : RNA-DNA hybrid binding proteins as targets for cancer therapy / Beáta Boros-Oláh, Nikoletta Dobos, Lilla Hornyák, Zoltán Szabó, Zsolt Karányi, Gábor Halmos, Jason Roszik, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2019
ISSN:	1568-7864
Megjegyzések:	Unravelling the origin of genetic alterations from point mutations to chromosomal rearrangements was greatly enhanced by the discovery of RNA-DNA hybrids (R-loops) that behave as hotspots of genomic instability in a variety of organisms. Current models suggest that uncontrolled R-loops are a hazard to genome integrity, therefore, identifying proteins that are involved in recognising and signalling R-loop structures are of key importance. Herein we analysed key RNA-DNA hybrid binding proteins in humans taking advantage of large-scale gene expression, survival rate, and drug-sensitivity data from cancer genomics databases. We show that ex- pression of RNA-DNA hybrid binding proteins in various cancer types is associated with survival and may have contrasting outcomes in responding to therapeutic treatments. Based on the revealed pharmacogenomic land- scape of human RNA-DNA hybrid binding proteins, we propose that R-loops and R-loop binding proteins are potentially relevant new epigenetic markers and therapeutic targets in multiple cancers
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Cancer diagnostics and therapy Chemotherapy Clinical trial Drug sensitivity R-loop RNA-DNA hybrid Survival association
Megjelenés:	DNA Repair. - 84 (2019), p. 1-10. -
További szerzők:	Dobos Nikoletta (1981-) (biológus) Hornyák Lilla Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Roszik, Jason Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP GINOP-2.3.2-15-2016-00043 GINOP GINOP-2.3.2-15-2016-00062 GINOP Lendület program LP2015-9/2015 egyéb 20428-3/2018/FEKUTSTRAT egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM071957
035-os BibID:	(cikkazonosító)151 (WoS)000423697600001 (Scopus)85041621018
Első szerző:	Hornyák Lilla
Cím:	The role of indoleamine-2,3-dioxygenase (IDO) in cancer development, diagnostics, and therapy / Lilla Hornyák, Nikoletta Dobos, Gábor Koncz, Zsolt Karányi, Dénes Páll, Zoltán Szabó, Gábor Halmos, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2018
ISSN:	1664-3224
Megjegyzések:	Tumors are composed of abnormally transformed cell types and tissues that differ from normal tissues in their genetic and epigenetic makeup, metabolism and immunology. Molecular compounds that modulate the immune response against neoplasms offer promising new strategies to combat cancer. Inhibitors targeting the indoleamine-2,3-dioxygenase 1 enzyme (IDO1) represent one of the most potent therapeutic opportunities to inhibit tumor growth. Herein we assess the biochemical role of IDO1 in tumor metabolism and immune surveillance, and review current diagnostic and therapeutic approaches that are intended to increase the effectiveness of immunotherapies against highly aggressive and difficult-to-treat IDO-expressing cancers.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk IDO Gene Expression Metabolism Immunotherapy immune surveillance Cancer diagnostics Clinical Trials as Topic
Megjelenés:	Frontiers in Immunology. - 9 : 151 (2018), p. 1-8. -
További szerzők:	Dobos Nikoletta (1981-) (biológus) Koncz Gábor (1970-) (biológus, immunológus) Karányi Zsolt (1961-) (biostatisztikus, bioinformatikus) Páll Dénes (1967-) (belgyógyász, kardiológus) Szabó Zoltán (1973-) (belgyógyász, kardiológus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP NKFIH-ERC-HU-117670 NKFIH
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat Szerző által megadott URL DOI
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM082546
Első szerző:	Karányi Zsolt (biostatisztikus, bioinformatikus)
Cím:	Histone H3 lysine 56 acetylation is required for formation of normal levels of meiotic DNA breaks in S. cerevisiae / Zsolt Karányi, Lilla Hornyák, Lóránt Székvölgyi
Dátum:	2020
Megjegyzések:	Meiotic recombination is initiated by Spo11-catalyzed DNA double-strand breaks (DSBs) that are promoted by histone modifications and histone modifying enzymes. Herein we investigated the role of histone H3 lysine 56 acetylation (H3K56ac) located near the entry/exit points of the DNA in the globular H3 domain. We generated a series of mutant cells (asf1?, rtt109?, hst3/4?, and H3K56A) in which the endogenous level of H3K56ac was manipulated and tracked during meiotic growth. We show that complete loss or increased abundance of H3K56ac in these mutants allows timely entry into meiosis and sporulation and does not impair S phase progression, first and second meiotic cell divisions, and spore viability. In the asf1?, rtt109?, hst3/4? mutants, DSBs and crossovers form normal levels with a short (60-min) delay at the HIS4-LEU2 artificial recombination hotspot, however, DSB formation shows a ~3-fold decrease in the H3K56A mutant at the natural BUD23-ARE1 hotspot. The latter DSB phenotype, showing significant DSB reduction in the H3K56A mutant, was also observed at DSB sites using genome-wide mapping of Rfa1-coated single-stranded DNA flanking DSBs (RPA ChIP). Parallel mapping of H3K56-acetylated histones in wild type cells revealed strong depletion of the H3K56ac ChIP signal over Spo11-oligo DSBs, albeit most H3K56-acetylated histones were enriched adjacent to the identified RPA ChIP binding sites. Taken together, these associations demonstrate a prominent role of H3 lysine 56 acetylation in the formation of DNA breaks within recombination hotspot regions.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Frontiers in Cell and Developmental Biology. - 7 (2020), p. 1-18. -
További szerzők:	Hornyák Lilla Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-2016-00024 GINOP MTA-DE Lendület MTA Élettudományok - Biológiai tudományok NKFIH-NNE 130913 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: