CCL

Összesen 17 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM096526
Első szerző:Aranyi Sándor Csaba (programtervező informatikus)
Cím:Dynamic Causal Modeling Evaluation of Multidimensional Model Space Using High Performance Computing / Aranyi Sándor Csaba, Opposits Gábor, Nagy Marianna, Berényi Ervin, Emri Miklós
Dátum:2016
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok előadáskivonat
könyvrészlet
orvosi képalkotás
neuroimaging
idegtudományok
agyi konnektivitás
Megjelenés:ESMRMB 33th Annual Scientific Meeting Abstract Book / ed. Cozzone, Patrick J.. - p. 99
További szerzők:Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM096525
Első szerző:Aranyi Sándor Csaba (programtervező informatikus)
Cím:Interface development for supporting curve based DCM / Aranyi Sándor Csaba, Kis Sándor Attila, Opposits Gábor, Berényi Ervin, Emri Miklós
Dátum:2015
Megjegyzések:Background and goals EEG and fMRI based Dynamic Causal Modeling is an increasingly used effective connectivity method which is useful to estimate the neural connection strengths of a known brain network model. However, in the cases when the model is not known the finding the best one is computationally demanding because of the exponentially increasing combination of possible connections. Our first aim was to extend the functionality of DCM12 toolbox by an BOLD-curve importing feature which enables the usage of post-processed or simulated fMRI data. Secondly, using this extension we started to develop a modelspace shrinking algorithm which could help to find the best connection model of the investigated network. Methods The evaluated software creates DCM-compatible structures from fMRI and VOI image-files or from CSV- files containing BOLD-signals. The first option was used in the validation procedure in which we compared the results of image and curve based DCM analyses of the DMN of a population of 12 healthy subjects. The CSV-input was used for calculating the connection strength from simulated BOLD-signals by MULAN toolbox. Results and Further plans The image and curve based DCM analyses resulted the same connection strengths verifying the usability of our software. The simulated BOLD-signal based analysis did not evaluate adequate results, hence further investigation is required to solve this problem. Expanding the DCM for reading stimulated curves enables the development of a model-space shrinking algorithm, furthermore it empowers the use the outputs of real neural state simulators such as the Virtual Brain.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok előadáskivonat
könyvrészlet
orvosi képalkotás
neuroimaging
idegtudományok
Megjelenés:Neuroimaging Workshop : Abstract Book. - p. 1
További szerzők:Kis Sándor Attila (1973-) (fizikus) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM095112
Első szerző:Aranyi Sándor Csaba (programtervező informatikus)
Cím:Characterizing Network Search Algorithms Developed for Dynamic Causal Modeling / Sándor Csaba Aranyi, Marianna Nagy, Gábor Opposits, Ervin Berényi, Miklós Emri
Dátum:2021
ISSN:1662-5196
Megjegyzések:Dynamic causal modeling (DCM) is a widely used tool to estimate the effective connectivity of specified models of a brain network. Finding the model explaining measured data is one of the most important outstanding problems in Bayesian modeling. Using heuristic model search algorithms enables us to find an optimal model without having to define a model set a priori. However, the development of such methods is cumbersome in the case of large model-spaces. We aimed to utilize commonly used graph theoretical search algorithms for DCM to create a framework for characterizing them, and to investigate relevance of such methods for single-subject and group-level studies. Because of the enormous computational demand of DCM calculations, we separated the model estimation procedure from the search algorithm by providing a database containing the parameters of all models in a full model-space. For test data a publicly available fMRI dataset of 60 subjects was used. First, we reimplemented the deterministic bilinear DCM algorithm in the ReDCM R package, increasing computational speed during model estimation. Then, three network search algorithms have been adapted for DCM, and we demonstrated how modifications to these methods, based on DCM posterior parameter estimates, can enhance search performance. Comparison of the results are based on model evidence, structural similarities and the number of model estimations needed during search. An analytical approach using Bayesian model reduction (BMR) for efficient network discovery is already available for DCM. Comparing model search methods we found that topological algorithms often outperform analytical methods for single-subject analysis and achieve similar results for recovering common network properties of the winning model family, or set of models, obtained by multi-subject family-wise analysis. However, network search methods show their limitations in higher level statistical analysis of parametric empirical Bayes. Optimizing such linear modeling schemes the BMR methods are still considered the recommended approach. We envision the freely available database of estimated model-spaces to help further studies of the DCM model-space, and the ReDCM package to be a useful contribution for Bayesian inference within and beyond the field of neuroscience.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
fMRI
dynamic causal modeling
search algorithm
network topology
model-space
Megjelenés:Frontiers in Neuroinformatics. - 15 (2021), p. 1-14. -
További szerzők:Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Pályázati támogatás:2020-4.1.1-TKP2020
Egyéb
2017-1.2.1-NKP-2017-00002
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM066041
Első szerző:Aranyi Sándor Csaba (programtervező informatikus)
Cím:Population-level Correction of Systematic Motion Artifacts in fMRI in Patients with Ischemic Stroke / Csaba Aranyi, Gábor Opposits, Marianna Nagy, Ervin Berényi, Csilla Vér, László Csiba, Péter Katona, Tamás Spisák, Miklós Emri
Dátum:2017
ISSN:1051-2284
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
motion correction
fMRI
Megjelenés:Journal of Neuroimaging. - 27 : 4 (2017), p. 397-408. -
További szerzők:Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Nagy Marianna (1987-) (orvosdiagnosztikai képalkotó) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Vér Csilla (1985-) (neurológus) Csiba László (1952-) (neurológus, pszichiáter) Katona Péter Spisák Tamás (1986-) (programtervező matematikus, informatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Pályázati támogatás:KTIA_13_NAP-A-II/3
Egyéb
OTKA 109712
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Szerző által megadott
DOI
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM015756
Első szerző:Emri Miklós (fizikus)
Cím:The importance of MRI-PET registration in clinical routine / M. Emri, G. Opposits, L. Trón, Á. Klekner, L. Novák, J. Kollár, L. Bognár, E. Berényi
Dátum:2007
Megjegyzések:Registered images produced by MRI based multi-modality image processing are essential tools of diagnostic and surgical planning of neurological and neurosurgical diseases. The aim of this study was to investigate how fused images produced by various MRI (T1, T2, fMRI, DTI, MRS) and PET (FDG, Metionine) data can be used in clinical routine. Material and methods: In our study the complex multi-modality tomographic data sets of 6 patients (3 glioblastoma, 2 oligoastrocitóma és 1 pilocitás astrocitoma) were used. For the image registration as well as the production of 2D- and 3D fused images free, commercial and in-house developed software were utilized. Result: We found that our images significantly assisted clinicians in preparing therapeutic and surgical plans. Optimizing the established software and automatizing image registration tasks needs further development.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idézhető absztrakt
Megjelenés:Nuclear Medicine Review. - 10 : 1 (2007), p. 59. -
További szerzők:Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Trón Lajos (1941-) (biofizikus) Klekner Álmos (1970-) (idegsebész) Novák László (1964-) (idegsebész) Kollár József (1950-) (radiológus) Bognár László (1958-) (idegsebész, gyermekidegsebész) Berényi Ervin (1964-) (radiológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM103068
Első szerző:Nagy Marianna (orvosdiagnosztikai képalkotó)
Cím:Investigation of the applicabilityof brain atlas technique in patients with intracranial space occupying lesions / Nagy Marianna, Aranyi Csaba, Opposits Gábor, Spisák Tamás, Lánczi Levente István, Kovács Kázmér, Tarjányi Eszter, Berényi Ervin, Emri Miklós
Dátum:2016
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok poszter
folyóiratcikk
Megjelenés:ESMRMB 33th Annual Scientific Meeting Abstract Book. - 2016 (2016), p. 102
További szerzők:Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Spisák Tamás (1986-) (programtervező matematikus, informatikus) Lánczi Levente (1990-) (általános orvos) Kovács Kázmér Tarjányi Eszter Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM086220
035-os BibID:(WoS)000535415100003 (Scopus)85091956719
Első szerző:Nagy Marianna (orvosdiagnosztikai képalkotó)
Cím:Effective connectivity differences in motor network during passive movement of paretic and non-paretic ankles in subacute stroke patients / Marianna Nagy, Csaba Aranyi, Gábor Opposits, Tamás Papp, Levente Lánczi, Ervin Berényi, Csilla Vér, László Csiba, Péter Katona, Tamás Spisák, Miklós Emri
Dátum:2020
ISSN:2167-8359
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:PeerJ. - 8 (2020), p. 1-22. -
További szerzők:Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Papp Tamás (1987-) (orvos) Lánczi Levente (1990-) (általános orvos) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Vér Csilla (1985-) (neurológus) Csiba László (1952-) (neurológus, pszichiáter) Katona Péter Spisák Tamás (1986-) (programtervező matematikus, informatikus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Pályázati támogatás:2017-1.2.1-NKP-2017-00002
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM086467
Első szerző:Opposits Gábor (fizikus, szoftver fejlesztő)
Cím:OAR sparing 3D radiotherapy planning supported by fMRI brain mapping investigations / Gábor Opposits, Csaba Aranyi, Csaba Glavák, Zsolt Cselik, Lajos Trón, Dávid Sipos, Janaki Hadjiev, Ervin Berényi, Imre Repa, Miklós Emri, Árpád Kovács
Dátum:2020
ISSN:0958-3947
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Medical Dosimetry. - 45 : 4 (2020), p. e1-e8. -
További szerzők:Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Glavák Csaba Cselik Zsolt Trón Lajos (1941-) (biofizikus) Sipos Dávid Hadjiev, Janaki Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Repa Imre (1950-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus) Kovács Árpád (1979-) (onkoradiológus, klinikai onkológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM061713
Első szerző:Opposits Gábor (fizikus, szoftver fejlesztő)
Cím:Population based ranking of frameless CT-MRI registration methods / G. Opposits, S. A. Kis, L. Trón, E. Berényi, E. Takács, J. G. Dobai, L. Bognár, B. Szűcs, M. Emri
Dátum:2015
ISSN:0939-3889
Megjegyzések:Background: Clinical practice often requires simultaneous information obtained by two different imaging modalities. Registration algorithms are commonly used for this purpose. Automated procedures are very helpful in cases when the same kind of registration has to be performed on images of a high number of subjects. Radiotherapists would prefer to use the best automated method to assist therapy planning, however there are not accepted procedures for ranking the different registration algorithms. Purpose: We were interested in developing a method to measure the population level performance of CT-MRI registration algorithms by a parameter of values in the [0,1] interval. Materials and Methods: Pairs of CT and MRI images were collected from 1051 subjects. Results of an automated registration were corrected manually until a radiologist and a neurosurgeon expert both accepted the result as good. This way 1051 registered MRI images were produced by the same pair of experts to be used as gold standards for the evaluation of the performance of other registration algorithms. Pearson correlation coefficient, mutual information, normalized mutual information, KullbackLeibler divergence, L1 norm and square L2 norm (dis)similarity measures were tested for sensitivity to indicate the extent of (dis)similarity of a pair of individual mismatched images. Results: The square Hellinger distance proved suitable to grade the performance of registration algorithms at population level providing the developers with a valuable tool to rank algorithms. Conclusions: The developed procedure provides an objective method to find the registration algorithm performing the best on the population level out of newly constructed or available preselected ones.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
CT
MRI
medical image registration
segmentation
computer applications-general
Megjelenés:Zeitschrift für Medizinische Physik 25 : 4 (2015), p. 353-367. -
További szerzők:Kis Sándor Attila (1973-) (fizikus) Trón Lajos (1941-) (biofizikus) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Takács Endre (1965-) (fizikus) Dobai József (1969-) (idegsebész) Bognár László (1958-) (idegsebész, gyermekidegsebész) Szűcs Bernadett Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM024809
Első szerző:Opposits Gábor (fizikus, szoftver fejlesztő)
Cím:Automated region analysis of brain PET examinations / G. Opposits, T. Spisak, I. Lajtos, L. Pohubi, L. Galuska, A. Jakab, E. Berenyi, M. Emri
Dátum:2011
ISSN:1619-7070
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idézhető absztrakt
Megjelenés:European Journal of Nuclear Medicine And Molecular Imaging 38 : Suppl. 2 (2011), S333. p. -
További szerzők:Spisák Tamás (1986-) (programtervező matematikus, informatikus) Lajtos Imre (1986-) (fizikus) Pohubi László (1959-) (fizikus) Galuska László (1946-) (belgyógyász, izotópdiagnoszta) Jakab András (1985-) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM113487
035-os BibID:(scopus)85164204449
Első szerző:Rácz Szilvia (molekulársi biológus)
Cím:Laboratóriumi paraméterek kódolása a LOINC-rendszer szerint a Debreceni Egyetem Klinikai Központjában / Rácz Szilvia, Emri Miklós, Opposits Gábor, Berényi Ervin, Benczik Lajos, Ludman István Attila, Kappelmayer János, Bhattoa Harjit Pal
Dátum:2023
ISSN:0030-6002 1788-6120
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok magyar nyelvű folyóiratközlemény hazai lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Orvosi Hetilap. - 164 : 27 (2023), p. 1043-1051. -
További szerzők:Emri Miklós (1962-) (fizikus) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Benczik Lajos Ludman István Attila Kappelmayer János (1960-) (laboratóriumi szakorvos) Bhattoa Harjit Pal (1973-) (laboratóriumi szakorvos)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM054630
035-os BibID:Article ID: e10494
Első szerző:Spisák Tamás (programtervező matematikus, informatikus)
Cím:Voxel-Wise Motion Artifacts in Population-Level W Brain Connectivity Analysis of Resting-State fMRI / Tamás Spisák, András Jakab, Sándor A. Kis, Gábor Opposits, Csaba Aranyi, Ervin Berényi, Miklós Emri
Dátum:2014
ISSN:1932-6203
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:PLOS ONE. - 9 : 9 (2014),p. e10494. -
További szerzők:Jakab András (1985-) Kis Sándor Attila (1973-) (fizikus) Opposits Gábor (1974-) (fizikus, szoftver fejlesztő) Aranyi Sándor Csaba (1988-) (programtervező informatikus) Berényi Ervin (1964-) (radiológus) Emri Miklós (1962-) (fizikus)
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.