Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM087409
Első szerző:	Hajdu Tímea (biomérnök)
Cím:	Comprehensive Model for Epidermal Growth Factor Receptor Ligand Binding Involving Conformational States of the Extracellular and the Kinase Domains / Tímea Hajdu, Tímea Váradi, István Rebenku, Tamás Kovács, János Szöllösi, Péter Nagy
Dátum:	2020
ISSN:	2296-634X
Megjegyzések:	The epidermal growth factor (EGF) receptor (EGFR) undergoes ligand-dependent dimerization to initiate transmembrane signaling. Although crystallographic structures of the extracellular and kinase domains are available, ligand binding has not been quantitatively analyzed taking the influence of both domains into account. Here, we developed a model explicitly accounting for conformational changes of the kinase and extracellular domains, their dimerizations and ligand binding to monomeric and dimeric receptor species. The model was fitted to ligand binding data of suspended cells expressing receptors with active or inactive kinase conformations. Receptor dimers with inactive, symmetric configuration of the kinase domains exhibit positive cooperativity and very weak binding affinity for the first ligand, whereas dimers with active, asymmetric kinase dimers are characterized by negative cooperativity and subnanomolar binding affinity for the first ligand. The homodimerization propensity of EGFR monomers with active kinase domains is _100-times higher than that of dimers with inactive kinase domains. Despite this fact, constitutive, ligand-independent dimers are mainly generated from monomers with inactive kinase domains due to the excess of such monomers in the membrane. The experimental finding of increased positive cooperativity at high expression levels of EGFR was recapitulated by the model. Quantitative prediction of ligand binding to different receptor species revealed that EGF binds to receptor monomers and dimers in an expression-level dependent manner without significant recruitment of monomers to dimers upon EGF stimulation below the phase transition temperature of the membrane. Results of the fitting offer unique insight into the workings of the EGFR.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk EGF EGFR
Megjelenés:	Frontiers in Cell and Developmental Biology. - 8 (2020), p. 1-53. -
További szerzők:	Váradi Tímea (1973-) (biológus) Rebenku István Kovács Tamás (1985-) (általános orvos) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-2016-00020 GINOP GINOP-2.2.1-15-2017-00044 GINOP NKFIH K120302 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM050047
Első szerző:	Király Anna
Cím:	Hypoxia reduces the efficiency of elisidepsin by inhibiting hydroxylation and altering the structure of lipid rafts / Anna Király, Tímea Váradi, Tímea Hajdu, Ralph Rühl, Carlos M. Galmarini, János Szöllősi, Peter Nagy
Dátum:	2013
Megjegyzések:	The mechanism of action of elisidepsin (PM02734, Irvalec(R)) is assumed to involve membrane permeabilization via attacking lipid rafts and hydroxylated lipids. Here we investigate the role of hypoxia in the mechanism of action of elisidepsin. Culturing under hypoxic conditions increased the half-maximal inhibitory concentration and decreased the drug's binding to almost all cell lines which was reversed by incubation of cells with 2-hydroxy palmitic acid. The expression of fatty acid 2-hydroxylase was strongly correlated with the efficiency of the drug and inversely correlated with the effect of hypoxia. Number and brightness analysis and fluorescence anisotropy experiments showed that hypoxia decreased the clustering of lipid rafts and altered the structure of the plasma membrane. Although the binding of elisidepsin to the membrane is non-cooperative, its membrane permeabilizing effect is characterized by a Hill coefficient of ~3.3. The latter finding is in agreement with elisidepsin-induced clusters of lipid raft-anchored GFP visualized by confocal microscopy. We propose that the concentration of elisidepsin needs to reach a critical level in the membrane above which elisidepsin induces the disruption of the cell membrane. Testing for tumor hypoxia or the density of hydroxylated lipids could be an interesting strategy to increase the efficiency of elisidepsin
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban analysis Anisotropy article Biophysics cell biology Cell Line Cell Membrane Cells Confocal Confocal microscopy EXPRESSION Fluorescence FLUORESCENCE ANISOTROPY Hungary lipid raft LIPID RAFTS Lipids Microscopy Research Research Support Support
Megjelenés:	Marine Drugs. - 11 : 12 (2013), p. 4858-4875. -
További szerzők:	Váradi Tímea (1982-) (okleveles vegyész) Hajdu Tímea (1991-) (biomérnök) Rühl, Ralph (1969-) (vegyész) Galmarini, Carlos M. Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus)
Internet cím:	DOI Szerző által megadott URL Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM066288
035-os BibID:	(Cikkazonosító)35850 (WOS)000385927600001 (Scopus)84992409144
Első szerző:	Kovács Tamás (általános orvos)
Cím:	The Dipole Potential Modifies the Clustering and Ligand Binding Affinity of ErbB Proteins and Their Signaling Efficiency / Tamás Kovács, Gyula Batta, Tímea Hajdu, Ágnes Szabó, Tímea Váradi, Florina Zákány, István Csomós, János Szöllősi, Peter Nagy
Dátum:	2016
ISSN:	2045-2322
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Scientific Reports. - 6 (2016), p. 35850. -
További szerzők:	Batta Gyula (1979-) (biológus) Hajdu Tímea (1991-) (biomérnök) Nagyné Szabó Ágnes Timea (1982-) (vegyész) Váradi Tímea (1982-) (okleveles vegyész) Zákány Florina (1989-) (általános orvos) Csomós István (1983-) (molekuláris biológus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	K103906 OTKA NK101337 OTKA GINOP-2.3.2-15-2016-00020 GINOP TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0025 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: