Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM087417
035-os BibID:	(Cikkazonosító)6022 (WOS)000549142200022 (Scopus)85083071536
Első szerző:	Ág Norbert (okleveles biomérnök)
Cím:	Complex intron generation in the yeast genus Lipomyces / Norbert Ág, Napsugár Kavalecz, Fruzsina Pénzes, Levente Karaffa, Claudio Scazzocchio, Michel Flipphi, Erzsébet Fekete
Dátum:	2020
ISSN:	2045-2322
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Scientific Reports. - 10 (2020), p. 1-10. -
További szerzők:	Kavalecz Napsugár (1992-) (biomérnök) Pénzes Fruzsina (1995-) (okleveles biomérnök) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár) Scazzocchio, Claudio Flipphi, Michel (1964-) Fekete Erzsébet (1975-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:	GINOP-2.3.2-15-2016-00008 GINOP EFOP-3.6.1-16-2016-00022 EFOP BO/00093/18/8 Egyéb ÚNKP-19-3 Egyéb ÚNKP-19-4 Egyéb KH129602 Egyéb NN128867 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM101910
035-os BibID:	(cikkazonosító)397 (WoS)000787051700001 (Scopus)85129122957
Első szerző:	Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:	Unique and Repeated Stwintrons (Spliceosomal Twin Introns) in the Hypoxylaceae / Erzsébet Fekete, Fruzsina Pénzes, Norbert Ág, Viktória Ág-Rácz, Erzsébet Sándor, Claudio Scazzocchio, Michel Flipphi, Levente Karaffa
Dátum:	2022
ISSN:	2309-608X
Megjegyzések:	Introns are usually non-coding sequences interrupting open reading frames in pre-mRNAs [D1,2]. Stwintrons are nested spliceosomal introns, where an internal intron splits a second donor sequence into two consecutive splicing reactions leading to mature mRNA. In Hypoxylon sp. CO27-5, 36 highly sequence-similar [D1,2] stwintrons are extant (sister stwintrons). An additional 81 [D1,2] sequence-unrelated stwintrons are described here. Most of them are located at conserved gene positions rooted deep in the Hypoxylaceae. Absence of exonic sequence bias at the exon?stwintron junctions and a very similar phase distribution were noted for both groups. The presence of an underlying sequence symmetry in all 117 stwintrons was striking. This symmetry, more pronounced near the termini of most of the full-length sister stwintrons, may lead to a secondary structure that brings into close proximity the most distal splice sites, the donor of the internal and the acceptor of the external intron. The Hypoxylon stwintrons were overwhelmingly excised by consecutive splicing reactions precisely removing the whole intervening sequence, whereas one excision involving the distal splice sites led to a frameshift. Alternative (mis)splicing took place for both sister and uniquely occurring stwintrons. The extraordinary symmetry of the sister stwintrons thus seems dispensable for the infrequent, direct utilisation of the distal splice sites.
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk spliceosomal introns splicing; stwintrons comparative genomics stwintron dissemination stwintron propagation internal symmetry single-stranded RNA secondary structure prediction Hypoxylon sp. CO27-5 Hypoxylaceae
Megjelenés:	Journal of Fungi. - 8 : 4 (2022), p. 1-23. -
További szerzők:	Pénzes Fruzsina (1995-) (okleveles biomérnök) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Ág-Rácz Viktória (1991-) (mikrobiológus) Karaffa Erzsébet Mónika (1972-) (mikrobiológus, egyetemi tanár) Scazzocchio, Claudio Flipphi, Michel (1964-) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM096118
035-os BibID:	(cikkazonosító)710 (WoS)000699660000001 (Scopus)85114371224
Első szerző:	Fekete Erzsébet (biotechnológus, egyetemi tanár)
Cím:	Internally Symmetrical Stwintrons and Related Canonical Introns in Hypoxylaceae Species / Erzsébet Fekete, Fruzsina Pénzes, Norbert Ág, Claudio Scazzocchio, Michel Flipphi, Levente Karaffa
Dátum:	2021
ISSN:	2309-608X
Megjegyzések:	Spliceosomal introns are pervasive in eukaryotes. Intron gains and losses have occurred throughout evolution, but the origin of new introns is unclear. Stwintrons are complex intervening sequences where one of the sequence elements (5·?donor, lariat branch point element or 3·?acceptor) necessary for excision of a U2 intron (external intron) is itself interrupted by a second (internal) U2 intron. In Hypoxylaceae, a family of endophytic fungi, we uncovered scores of donor?disrupted stwintrons with striking sequence similarity among themselves and also with canonical introns. Intron-exon structure comparisons suggest that these stwintrons have proliferated within diverging taxa but also give rise to proliferating canonical introns in some genomes. The proliferated (stw)introns have integrated seamlessly at novel gene positions. The recently proliferated (stw)introns appear to originate from a conserved ancestral stwintron characterised by terminal inverted repeats (45-55 nucleotides), a highly symmetrical structure that may allow the formation of a double?stranded intron RNA molecule. No short tandem duplications flank the putatively inserted intervening sequences, which excludes a DNA transposition?based mechanism of proliferation. It is tempting to suggest that this highly symmetrical structure may have a role in intron proliferation by (an)other mechanism(s).
Tárgyszavak:	Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Journal of Fungi. - 7 (2021), p. 1-21. -
További szerzők:	Pénzes Fruzsina (1995-) (okleveles biomérnök) Ág Norbert (1987-) (okleveles biomérnök) Scazzocchio, Claudio Flipphi, Michel (1964-) Karaffa Levente (1971-) (biotechnológus, egyetemi tanár)
Pályázati támogatás:	ÚNKP-20-3-I-DE-40 Egyéb ÚNKP-20-5-DE-13 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: