CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM074760
035-os BibID:(WoS)000456709700016 (Scopus)85056716023
Első szerző:Hegedűs Éva (biofizikus)
Cím:Endogenous single-strand DNA breaks at RNA polymerase II promoters in Saccharomyces cerevisiae / Hegedűs Éva, Kókai Endre, Nánási Péter, Imre László, Halász László, Jossé Rozenn, Antunovics Zsuzsa, Webb Martin R., El Hage Aziz, Pommier Yves, Székvölgyi Lóránt, Dombrádi Viktor, Szabó Gábor
Dátum:2018
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
ssDNA breaks
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 46 : 20 (2018), p. 10649-10668. -
További szerzők:Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Imre László (1979-) (biológus) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Jossé, Rozenn Antunovics Zsuzsa (1978-) (molekuláris biológus, genetikus) Webb, Martin R. El Hage, Aziz Pommier, Yves Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K72762
OTKA
NK101337
OTKA
K128770
OTKA
4.2.2-08/1-2008-0015
TÁMOP
4.2.1/B09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
4.2.2.A-11/1/KONV2012-0023 "VÉD-ELEM"
TÁMOP
4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
NKFIH-ERC-HU-117670
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00024
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM004119
035-os BibID:WOS:000253576200009
Első szerző:Hegedűs Éva (biofizikus)
Cím:Heteroduplex analysis using flow cytometric microbead assays to detect deletions, insertions, and single-strand lesions / Hegedüs E., Imre L., Pataki J., Lizanecz E., Székvölgyi L., Fazakas F., Bacsó Z., Tóth A., Szabó M., Seres Z., Szabó G.
Dátum:2008
Megjegyzések:We explore the possibilities offered by flow cytometric microbead analysis to develop high throughput methods for the detection of deletions/insertions and single-strand DNA lesions. The products of PCR reactions derived from reference and test samples are denatured and reannealed, then exposed to enzymatic or chemical treatments distinguishing homoduplices from heteroduplices. The biotin- and dye labeled reaction products are immobilized on microbeads and the homo- and heteroduplices are assessed in separate fluorescence channels, by flow cytometry. Using a model system based on the mixed lineage leukemia gene breakpoint cluster region, we demonstrate that deletions and insertions in genomic DNA can be detected, using S1 nuclease and chemical cleavage to distinguish hetero- from homoduplices, or a restriction enzyme cleaving only the homoduplices. Single-strand discontinuities can also be detected, by combining nick-translation, using labeled nucleotide, and flow cytometric microbead analysis. The methodical approaches demonstrated are applicable in a versatile manner in basic cell and molecular biological research and also promise direct application for high throughput screening of genetic diseases and lesions, including insertions or deletions of short sequence elements and single-strand lesions formed at hypersensitive sites in response to apoptotic stimuli.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
microbead
heteroduplex
cytometry
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Cytometry. Part A. - 73 : 3 (2008), p. 238-245. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Pataki Judit (1980-) (biofizikus) Lizanecz Erzsébet (1978-) (orvos) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Fazakas Ferenc (1969-) (molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Tóth Attila (1971-) (biológus) Szabó Miklós Seres Zoltán Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM085444
Első szerző:Nánási Péter Pál (élettanász)
Cím:Breaking good : +1 nucleosome destabilizationby nicking / P. Nanasi, L. Imre, A. Horvath, L. Halasz, A. Szanto, H. Kimura, Székvölgyi Lóránt, L. Nagy, G. Szabo
Dátum:2017
ISSN:1742-464X
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idézhető absztrakt
folyóiratcikk
Megjelenés:Febs Journal. - 284 : Suppl. 1 (2017), p. 221. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Horváth Attila (orvos) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Szántó Attila (1976-) (orvos, biokémikus) Kimura, Hiroshi Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:72762
OTKA
101337
OTKA
4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023
TÁMOP
4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM040294
035-os BibID:(scopus)33750011602 (wos)000241117100006
Első szerző:Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:Chip-on-beads : flow-cytometric evaluation of chromatin immunoprecipitation / Székvölgyi L., Bálint B. L., Imre L., Goda K., Szabó M., Nagy L., Szabó G.
Dátum:2006
ISSN:1552-4922
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Cytometry. Part A. - 69A : 10 (2006), p. 1086-1091. -
További szerzők:Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Imre László (1979-) (biológus) Goda Katalin (1969-) (biofizikus) Szabó Miklós (vegyészmérnök) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM010362
Első szerző:Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:Flow Cytometric and Laser Scanning Microscopic Approaches in Epigenetics Research / Lorant Szekvolgyi, Laszlo Imre, Doan Xuan Quang Minh, Eva Hegedus, Zsolt Bacso, Gabor Szabo
Dátum:2009
ISSN:9781603274135
Megjegyzések:Our understanding of epigenetics has been transformed in recent years by the advance of technological possibilities based primarily on a powerful tool, chromatin immunoprecipitation (ChIP). However, in many cases, the detection of epigenetic changes requires methods providing a high-throughput (HTP) platform. Cytometry has opened a novel approach for the quantitative measurement of molecules, including PCR products, anchored to appropriately addressed microbeads (Pataki et al. 2005. Cytometry 68, 45-52). Here we show selected examples for the utility of two different cytometry-based platforms of epigenetic analysis: ChIP-on-beads, a flow-cytometric test of local histone modifications (Balint et al. 2005. Mol. Cell Biol. 25, 5648-5663), and the laser scanning cytometry-based measurement of global epigenetic modifications that might help predict clinical behavior in different pathological conditions. We anticipate that such alternative tools may shortly become indispensable in clinical practice, translating the systematic screening of epigenetic tags from basic research into routine diagnostics of HTP demand.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Chromatin
Chromatin Immunoprecipitation
Immunoprecipitation
methods
Megjelenés:Methods in Molecular Biology. - 567 (2009), p. 99-111. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Doan-Xuan, Quang-Minh (1986-) (biofizikus) Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM001049
035-os BibID:(scopus)35448970162 (wos)000249715100018
Első szerző:Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:Ribonucleoprotein-masked nicks at 50-kbp intervals in the eukaryotic genomic DNA / Lóránt Székvölgyi, Zsuzsa Rákosy, Bálint L. Bálint, Endre Kókai, László Imre, György Vereb, Zsolt Bacsó, Katalin Goda, Sándor Varga, Margit Balázs, Viktor Dombrádi, László Nagy, Gábor Szabó
Dátum:2007
Megjegyzések:By using a microscopic approach, field inversion single-cell gel electrophoresis, we show that preformed single-strand discontinuities are present in the chromatin of resting and proliferating mammalian and yeast cells. These single-strand breaks are primarily nicks positioned at approximately 50-kbp intervals throughout the entire genome that could be efficiently labeled in situ by DNA polymerase I holoenzyme but not by Klenow fragment and terminal transferase unless after ribonucleolytic treatments. The RNA molecules involved appear to comprise R-loops, recognized by the S9.6 RNA/DNA hybrid-specific antibody. By using the breakpoint cluster region of the Mixed Lineage Leukemia (MLL) gene as a model, we have found that the number of manifest nicks detected by FISH performed after field inversion single-cell gel electrophoresis depends on epigenetic context, but the difference between germ-line and translocated MLL alleles is abolished by protease treatment. Our data imply that the double-stranded genomic DNA is composed of contiguous rather than continuous single strands and reveal an aspect of higher-order chromatin organization with ribonucleoprotein-associated persistent nicks defining approximately 50-kbp domains.
Tárgyszavak:Orvostudományok Természettudományok Elméleti orvostudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
chromatin loop
RNA/DNA hybrid
translocation
Megjelenés:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 104 : 38 (2007), p. 14964-14969. -
További szerzők:Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Imre László (1979-) (biológus) Vereb György (1965-) (biofizikus, orvos) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Goda Katalin (1969-) (biofizikus) Varga Sándor (1943-) (biofizikus) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1