CCL

Összesen 8 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM098704
035-os BibID:(cikkazonosító)5652 (WoS)000723448300001 (Scopus)85118861202
Első szerző:Bankó Csaba (molekuláris biológus)
Cím:Isocyanide Substitution in Acridine Orange Shifts DNA Damage-Mediated Phototoxicity to Permeabilization of the Lysosomal Membrane in Cancer Cells / Bankó Csaba, Nagy Zsolt László, Nagy Miklós, Szemán-Nagy Gábor György, Rebenku István, Imre László, Tiba Attila, Hajdu András, Szöllősi János, Kéki Sándor, Bacso Zsolt
Dátum:2021
ISSN:2072-6694
Megjegyzések:Aside from tissue cell renewal, tumor cells are also produced every day. In ordinary conditions, immunologically controlled cell death mechanisms limit cancer development. There are several cell death processes used for how normal and tumor cells are eliminated at the end of their lifespan. In cancer therapy, cells dying via immunological death are more efficiently eradicated than cells dying by classical apoptosis. Photodynamic treatments with some photosensitizers target lysosomes. Lysosomal death diverts apoptosis to the immunologically more pertinent necrosis-like death pathways. Acridine orange (AO), a well-known photosensitizer, targets lysosomes as well. We have synthesized a new compound abbreviated as DM, a modified AO, and examined details of intracellular processes leading to photodynamic cell death. We have proven that DM targets lysosomes better than AO. Remarkably, with DM, we could visualize an abrupt nuclear DNA release from cells during the photodynamic process. Our work highlights which cellular events may enhance immunological cell death.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Cancers. - 13 : 22 (2021), p. 1-24. -
További szerzők:Nagy Zsolt László (1989-) (gyógyszerész) Nagy Miklós (1976-) (vegyész) Szemán-Nagy Gábor (1975-) (biológia tanár-molekuláris biológus) Rebenku István Imre László (1979-) (biológus) Tiba Attila (1990-) (informatikus, matematikus) Hajdu András (1973-) (matematikus, informatikus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Kéki Sándor (1964-) (polimer kémikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.2-15-2016-00041
GINOP
GINOP 2.3.4- 15-2020-00008
GINOP
K-132685
Egyéb
FIKP-20428-3/2018/FEKUTSTRAT
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM083358
035-os BibID:(Cikkazonosító)1107 (WOS)000562846500003 (Scopus)85078261936
Első szerző:Firouzi Niaki, Erfaneh
Cím:Interactions of Cisplatin and Daunorubicin at the Chromatin Level / Firouzi Niaki Erfaneh, Van Acker Thibaut, Imre László, Nánási Péter, Tarapcsák Szabolcs, Bacsó Zsolt, Vanhaecke Frank, Szabó Gábor
Dátum:2020
ISSN:2045-2322
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 10 : 1 (2020), p. 1-12. -
További szerzők:Van Acker, Thibaut Imre László (1979-) (biológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Tarapcsák Szabolcs (1989-) (Molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Vanhaecke, Frank Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:Richter Gedeon Talentum Fund
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
K128770
OTKA
COST CA 15214
Egyéb
Flemish Research Foundation FWO G017217N
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM004119
035-os BibID:WOS:000253576200009
Első szerző:Hegedűs Éva (biofizikus)
Cím:Heteroduplex analysis using flow cytometric microbead assays to detect deletions, insertions, and single-strand lesions / Hegedüs E., Imre L., Pataki J., Lizanecz E., Székvölgyi L., Fazakas F., Bacsó Z., Tóth A., Szabó M., Seres Z., Szabó G.
Dátum:2008
Megjegyzések:We explore the possibilities offered by flow cytometric microbead analysis to develop high throughput methods for the detection of deletions/insertions and single-strand DNA lesions. The products of PCR reactions derived from reference and test samples are denatured and reannealed, then exposed to enzymatic or chemical treatments distinguishing homoduplices from heteroduplices. The biotin- and dye labeled reaction products are immobilized on microbeads and the homo- and heteroduplices are assessed in separate fluorescence channels, by flow cytometry. Using a model system based on the mixed lineage leukemia gene breakpoint cluster region, we demonstrate that deletions and insertions in genomic DNA can be detected, using S1 nuclease and chemical cleavage to distinguish hetero- from homoduplices, or a restriction enzyme cleaving only the homoduplices. Single-strand discontinuities can also be detected, by combining nick-translation, using labeled nucleotide, and flow cytometric microbead analysis. The methodical approaches demonstrated are applicable in a versatile manner in basic cell and molecular biological research and also promise direct application for high throughput screening of genetic diseases and lesions, including insertions or deletions of short sequence elements and single-strand lesions formed at hypersensitive sites in response to apoptotic stimuli.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
microbead
heteroduplex
cytometry
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Cytometry. Part A. - 73 : 3 (2008), p. 238-245. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Pataki Judit (1980-) (biofizikus) Lizanecz Erzsébet (1978-) (orvos) Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Fazakas Ferenc (1969-) (molekuláris biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Tóth Attila (1971-) (biológus) Szabó Miklós Seres Zoltán Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM066777
Első szerző:Hrubi Edit
Cím:BMP-2 hatása a humán embrionális szájpadlásból származó mesenchymalis preosteoblast sejtek morfológiájára és proliferációjára / Hrubi Edit, Imre László, Bacsó Zsolt, Bíró Sándor, Jenei Attila, Hegedűs Csaba
Dátum:2015
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok magyar nyelvű folyóiratközlemény hazai lapban
Megjelenés:Fogorvosi Szemle 108 : 3 (2015), p. 99-105. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Biró Sándor (1949-) (molekuláris genetikus) Jenei Attila (1966-) (biofizikus) Hegedűs Csaba (1953-) (fogszakorvos)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM103651
035-os BibID:(cikkazonosító)109184 (scopus)85128192258 (wos)000793580100003
Első szerző:Imre László (biológus)
Cím:Nucleosome destabilization by polyamines / Imre Laszlo, Niaki Erfaneh Firouzi, Bosire Rosevalentine, Nanasi Peter Jr., Nagy Peter, Bacso Zsolt, Hamidova Nubar, Pommier Yves, Jordan Albert, Szabo Gabor
Dátum:2022
ISSN:0003-9861
Megjegyzések:The roles and molecular interactions of polyamines (PAs) in the nucleus are not fully understood. Here their effect on nucleosome stability, a key regulatory factor in eukaryotic gene control, is reported, as measured in agarose embedded nuclei of H2B-GFP expressor HeLa cells. Nucleosome stability was assessed by quantitative microscopy [1,2] in situ, in close to native state of chromatin, preserving the nucleosome constrained topology of the genomic DNA. A robust destabilizing effect was observed in the millimolar concentration range in the case of spermine, spermidine as well as putrescine, which was strongly pH and salt concentration-dependent, and remained significant also at neutral pH. The integrity of genomic DNA was not affected by PA treatment, excluding DNA break-elicited topological relaxation as a factor in destabilization. The binding of PAs to DNA was demonstrated by the displacement of ethidium bromide, both from deproteinized nuclear halos and from plasmid DNA. The possibility that DNA methylation patterns may be influenced by PA levels is contemplated in the context of gene expression and DNA methylation correlations identified in the NCI-60 panel-based CellMiner database: methylated loci in subsets of high-ODC1 cell lines and the dependence of PER3 DNA methylation on PA metabolism.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Archives Of Biochemistry And Biophysics. - 722 (2022), p. 1-11. -
További szerzők:Niaki, Erfaneh Firouzi Bosire, Rosevalentine (1988-) (biotechnológus) Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Hamidova, Nubar Pommier, Yves Jordan, Albert Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K128770
OTKA
K138524
OTKA
COST
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM072900
035-os BibID:(Cikkazonosító)12734 (WOS)000412491500006 (Scopus)85030764085
Első szerző:Imre László (biológus)
Cím:Nucleosome stability measured in situ by automated quantitative imaging / László Imre, Zoltán Simándi, Attila Horvath, György Fenyofalvi, Péter Nanasi Jr., Erfaneh Firouzi Niaki, Éva Hegedus, Zsolt Bacso, Urbain Weyemi, Rebekka Mauser, Juan Ausio, Albert Jeltsch, William Bonner, László Nagy, Hiroshi Kimura, Gábor Szabo
Dátum:2017
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Current approaches have limitations in providing insight into the functional properties of particular nucleosomes in their native molecular environment. Here we describe a simple and powerful method involving elution of histones using intercalators or salt, to assess stability features dependent on DNA superhelicity and relying mainly on electrostatic interactions, respectively, and measurement of the fraction of histones remaining chromatin-bound in the individual nuclei using histone type- or posttranslational modification- (PTM-) specific antibodies and automated, quantitative imaging. The method has been validated in H3K4me3 ChIP-seq experiments, by the quantitative assessment of chromatin loop relaxation required for nucleosomal destabilization, and by comparative analyses of the intercalator and salt induced release from the nucleosomes of different histones. The accuracy of the assay allowed us to observe examples of strict association between nucleosome stability and PTMs across cell types, differentiation state and throughout the cell-cycle in close to native chromatin context, and resolve ambiguities regarding the destabilizing effect of H2A.X phosphorylation. The advantages of the in situ measuring scenario are demonstrated via the marked effect of DNA nicking on histone eviction that underscores the powerful potential of topological relaxation in the epigenetic regulation of DNA accessibility.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Fluorescence imaging
Nuclear organization
Epigenetics
Molekuláris Medicina
Megjelenés:Scientific Reports. - 7 : 1 (2017), p. 1-15. -
További szerzők:Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Fenyőfalvi György Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Firouzi Niaki, Erfaneh Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Weyemi, Urbain Mauser, Rebekka Ausio, Juan Jeltsch, Albert Bonner, William Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Kimura, Hiroshi Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K72762
OTKA
NK101337
OTKA
TÁMOP-4.2.2-08/1-2008-0015
TÁMOP
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
I. ABC transzporterek; II. Magasabbrendű kromatinszerkezet
TÁMOP 4.2.2.A- 11/1/KONV-2012-0023 "VÉD-ELEM
TÁMOP
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM010362
Első szerző:Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:Flow Cytometric and Laser Scanning Microscopic Approaches in Epigenetics Research / Lorant Szekvolgyi, Laszlo Imre, Doan Xuan Quang Minh, Eva Hegedus, Zsolt Bacso, Gabor Szabo
Dátum:2009
ISSN:9781603274135
Megjegyzések:Our understanding of epigenetics has been transformed in recent years by the advance of technological possibilities based primarily on a powerful tool, chromatin immunoprecipitation (ChIP). However, in many cases, the detection of epigenetic changes requires methods providing a high-throughput (HTP) platform. Cytometry has opened a novel approach for the quantitative measurement of molecules, including PCR products, anchored to appropriately addressed microbeads (Pataki et al. 2005. Cytometry 68, 45-52). Here we show selected examples for the utility of two different cytometry-based platforms of epigenetic analysis: ChIP-on-beads, a flow-cytometric test of local histone modifications (Balint et al. 2005. Mol. Cell Biol. 25, 5648-5663), and the laser scanning cytometry-based measurement of global epigenetic modifications that might help predict clinical behavior in different pathological conditions. We anticipate that such alternative tools may shortly become indispensable in clinical practice, translating the systematic screening of epigenetic tags from basic research into routine diagnostics of HTP demand.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Chromatin
Chromatin Immunoprecipitation
Immunoprecipitation
methods
Megjelenés:Methods in Molecular Biology. - 567 (2009), p. 99-111. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Doan-Xuan, Quang-Minh (1986-) (biofizikus) Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM001049
035-os BibID:(scopus)35448970162 (wos)000249715100018
Első szerző:Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:Ribonucleoprotein-masked nicks at 50-kbp intervals in the eukaryotic genomic DNA / Lóránt Székvölgyi, Zsuzsa Rákosy, Bálint L. Bálint, Endre Kókai, László Imre, György Vereb, Zsolt Bacsó, Katalin Goda, Sándor Varga, Margit Balázs, Viktor Dombrádi, László Nagy, Gábor Szabó
Dátum:2007
Megjegyzések:By using a microscopic approach, field inversion single-cell gel electrophoresis, we show that preformed single-strand discontinuities are present in the chromatin of resting and proliferating mammalian and yeast cells. These single-strand breaks are primarily nicks positioned at approximately 50-kbp intervals throughout the entire genome that could be efficiently labeled in situ by DNA polymerase I holoenzyme but not by Klenow fragment and terminal transferase unless after ribonucleolytic treatments. The RNA molecules involved appear to comprise R-loops, recognized by the S9.6 RNA/DNA hybrid-specific antibody. By using the breakpoint cluster region of the Mixed Lineage Leukemia (MLL) gene as a model, we have found that the number of manifest nicks detected by FISH performed after field inversion single-cell gel electrophoresis depends on epigenetic context, but the difference between germ-line and translocated MLL alleles is abolished by protease treatment. Our data imply that the double-stranded genomic DNA is composed of contiguous rather than continuous single strands and reveal an aspect of higher-order chromatin organization with ribonucleoprotein-associated persistent nicks defining approximately 50-kbp domains.
Tárgyszavak:Orvostudományok Természettudományok Elméleti orvostudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
chromatin loop
RNA/DNA hybrid
translocation
Megjelenés:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 104 : 38 (2007), p. 14964-14969. -
További szerzők:Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Imre László (1979-) (biológus) Vereb György (1965-) (biofizikus, orvos) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Goda Katalin (1969-) (biofizikus) Varga Sándor (1943-) (biofizikus) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.