CCL

Összesen 10 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM099008
035-os BibID:(cikkazonosító)12974 (scopus)85120073703 (wos)000735015000001
Első szerző:Csomós István (molekuláris biológus)
Cím:Opposing Effects of Chelidonine on Tyrosine and Serine Phosphorylation of STAT3 in Human Uveal Melanoma Cells / Csomós István, Nagy Péter, Filep Csenge, Rebenku István, Nizsalóczki Enikő, Kovács Tamás, Vámosi György, Mátyus László, Bodnár Andrea
Dátum:2021
ISSN:1661-6596 1422-0067
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 22 : 23 (2021), p. 1-14. -
További szerzők:Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Filep Csenge Boróka (1993-) (biomérnök) Rebenku István Nizsalóczki Enikő Kovács Tamás (1985-) (általános orvos) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Mátyus László (1956-) (biofizikus) Dóczy-Bodnár Andrea (1970-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
K 138075
OTKA
ANN 135107
Egyéb
ANN 133421
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM023492
Első szerző:Matkó János (biológus)
Cím:Analysis of cell surface molecular distributions and cellular signaling by flow cytometry / J. Matkó, L. Mátyus, J. Szöllősi, L. Bene, A. Jenei, P. Nagy, A. Bodnár, S. Damjanovich
Dátum:1994
ISSN:1053-0509
Megjegyzések:Flow cytometry is a fast analysis and separation method for large cell populations, based on collection and processing of optical signals gained on a cell-by-cell basis. These optical signals are scattered light and fluorescence. Owing to its unique potential ofStatistical data analysis and sensitive monitoring of (micro)heterogeneities in large cell populations, flow cytometry?in combination with microscopic imaging techniques?is a powerful tool to study molecular details of cellular signal transduction processes as well. The method also has a widespread clinical application, mostly in analysis of lymphocyte subpopulations for diagnostic (or research) purposes in diseases related to the immune system. A special application of flow cytometry is the mapping of molecular interactions (proximity relationships between membrane proteins) at the cell surface, on a cell-by-cell basis. We developed two approaches to study such questions; both are based ondistance-dependent quenching of excited state fluorophores (donors) by fluorescent or dark (nitroxide radical) acceptors via Förstertype dipole-dipole resonance energy transfer (FRET) and long-range electron transfer (LRET) mechanisms, respectively. A critical evaluation of these methods using donor- or acceptor-conjugated monoclonal antibodies (or their Fab fragments) to select the appropriate cell surface receptor or antigen will be presented in comparison with other approaches for similar purposes. The applicability of FRET and LRET for two-dimensional antigen mapping as well as for detection of conformational changes in extracellular domains of membrane-bound proteins is discussed and illustrated by examples of several lymphoma cell lines. Another special application area of flow cytometry is the analysis of different aspects of cellular signal transduction, e.g., changes of intracellular ion (Ca2+, H+, Na+) concentrations, regulation of ion channel activities, or more complex physiological responses of cell to external stimuli via correlated fluorescence and scatter signal analysis, on a cell-by-cell basis. This way different signaling events such as changes in membrane permeability, membrane potential, cell size and shape, ion distribution, cell density, chromatin structure, etc., can be easily and quickly monitored over large cell populations with the advantage of revealing microheterogeneities in the cellular responses. Flow cytometry also offers the possibility to follow the kinetics of slow (minute- and hour-scale) biological processes in cell populations. These applications are illustrated by the example of complex flow cytometric analysis of signaling in extracellular ATP-triggered apoptosis (programmed cell death) of murine thymic lymphocytes.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
fluorescence
flow cytometry
energy transfer
electron transfer
protein-protein interaction
signal transduction
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Journal Of Fluorescence 4 : 4 (1994), p. 303-314. -
További szerzők:Mátyus László (1956-) (biofizikus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Bene László (1963-) (biofizikus) Jenei Attila (1966-) (biofizikus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Dóczy-Bodnár Andrea (1970-) (biofizikus) Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változa
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM006044
Első szerző:Matkó János (biológus)
Cím:Biphasic effect of extracellular ATP on the membrane potential of mouse thymocytes / Matko J., Nagy P., Panyi G., Vereb G. Jr., Bene L., Matyus L., Damjanovich S.
Dátum:1993
Megjegyzések:Extracellular ATP induced changes in the membrane potential of thymocytes from BALB/c mice were analyzed. At concentrations below 0.1 mM, ATP hyperpolarizes the cell membrane on the time scale of development of the Ca(2+)-signal. After a longer time hyperpolarization turns to depolarization. ATP concentrations higher than 0.5 mM caused rapid depolarization without previous hyperpolarization. Verapamil, quinine or the absence of extracellular Ca2+ blocked the hyperpolarization by ATP. In Na(+)-free medium the magnitude of depolarization decreased. Our data suggest a contribution of Ca(2+)-activated K+ channels to the hyperpolarizing effect of ATP at lower concentrations. The direction of membrane potential changes is determined presumably by a sensitive balance of ATP-receptor mediated Ca(2+)- and Na(+)-influx and the Ca(2+)-activated K(+)-channel activity.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Adenosine Triphosphate
Animal
Biophysics
Cell Membrane
cytology
drug effects
Hungary
Kinetics
Membrane Potentials
Mice
Mice,Inbred BALB C
pharmacology
physiology
Quinine
Support,Non-U.S.Gov't
Thymus Gland
Verapamil
Megjelenés:Biochemical and Biophysical Research Communications. - 191 : 2 (1993), p. 378-384. -
További szerzők:Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Panyi György (1966-) (biofizikus) Vereb György (1965-) (biofizikus, orvos) Bene László (1963-) (biofizikus) Mátyus László (1956-) (biofizikus) Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változa
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM059574
Első szerző:Nagy Péter (biofizikus)
Cím:Measuring FRET in flow cytometry and microscopy / Péter Nagy, György Vereb, Sándor Damjanovich, László Mátyus, János Szöllősi
Dátum:2006
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok könyvfejezet
Flow Cytometry
Microscopy
Megjelenés:Current Protocols in Cytometry. - p. 1-13.
További szerzők:Vereb György (1965-) (biofizikus, orvos) Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus) Mátyus László (1956-) (biofizikus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:OTKA-F049025
OTKA
OTKA-T043509
OTKA
OTKA-T043061
OTKA
OTKA-T037831
OTKA
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM004687
Első szerző:Nagy Péter (biofizikus)
Cím:Cell fusion experiments reveal distinctly different association characteristics of cell-surface receptors / Péter Nagy, László Mátyus, Attila Jenei, György Panyi, Sándor Varga, János Matkó, János Szöllősi, Rezső Gáspár, Thomas M. Jovin, Sándor Damjanovich
Dátum:2001
Megjegyzések:The existence of small- and large-scale membrane protein clusters, containing dimers, oligomers and hundreds of proteins, respectively, has become widely accepted. However, it is largely unknown whether the internal structure of these formations is dynamic or static. Cell fusion was used to perturb the distribution of existing membrane protein clusters, and to investigate their mobility and associations. Scanning near-field optical microscopy, confocal and electron microscopy were applied to detect the exchange of proteins between large-scale protein clusters, whereas photobleaching fluorescence energy transfer was used to image the redistribution of existing small-scale membrane protein clusters. Large-scale clusters of major histocompatibility complex (MHC)-I exchanged proteins with each other and with MHC-II clusters. Similarly to MHC-I, large-scale MHC-II clusters were also dynamic. Exchange of components between small-scale protein clusters was not universal: intermixing did not take place in the case of MHC-II homoclusters; however, it was observed for homoclusters of MHC-I and for heteroclusters of MHC-I and MHC-II. These processes required a fluid state of the plasma membrane, and did not depend on endocytosis-mediated recycling of proteins. The redistribution of large-scale MHC-I clusters precedes the intermixing of small-scale clusters of MHC-I indicating a hierarchy in protein association. Investigation of a set of other proteins (alpha subunit of the interleukin 2 receptor, CD48 and transferrin receptor) suggested that a large-scale protein cluster usually exchanges components with the same type of clusters. These results offer new insight into processes requiring time-dependent changes in membrane protein interactions.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Biophysics
Cell Fusion
Cell Line
Cell Membrane
chemistry
Dyes
Energy Transfer
Fluorescence
Fluorescent Dyes
Gold Colloid
Histocompatibility Antigens
Histocompatibility Antigens Class I
Histocompatibility Antigens Class II
Human
Hungary
Interleukin-2
Major Histocompatibility Complex
Membrane Microdomains
metabolism
methods
Microscopy
Microscopy,Fluorescence
physiology
Proteins
Receptor Aggregation
Receptors,Cell Surface
Receptors,Interleukin-2
Support,Non-U.S.Gov't
Megjelenés:Journal of Cell Science 114 : Pt 22 (2001), p. 4063-4071. -
További szerzők:Mátyus László (1956-) (biofizikus) Jenei Attila (1966-) (biofizikus) Panyi György (1966-) (biofizikus) Varga Sándor (1943-) (biofizikus) Matkó János (1952-) (biológus) Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Gáspár Rezső (1944-) (biofizikus) Jovin, Thomas M. Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus)
Internet cím:elektronikus változat
Szerző által megadott URL
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM076128
035-os BibID:(Wos)000450299400006 (Scopus)85055751019
Első szerző:Nizsalóczki Enikő
Cím:Minimum degree of overlap between IL-9R and IL-2R on human T lymphoma cells : a quantitative CLSM and FRET analysis / Nizsalóczki Enikő, Nagy Péter, Mocsár Gábor, Szabó Ágnes, Csomós István, Waldmann Thomas A., Vámosi György, Mátyus László, Bodnár Andrea
Dátum:2018
ISSN:1552-4922 1552-4930
Megjegyzések:The heterodimeric receptor complex of IL-9 consists of the cytokine-speci?c ?-subunit and the common ? -chain shared with other cytokines, including IL-2, a central regulator of T cell function. We have shown previously the bipartite spatial relationship of IL-9 and IL-2 receptors at the surface of human T lymphoma cells: in addition to common clusters, expression of the two receptor kinds could also be observed in segregated membrane areas. Here we analyzed further the mutual cell surface organization of IL-9 and IL-2 receptors. Complementing Pearson correlation data with co-occurrence analysis of confocal microscopic images revealed that a minimum degree of IL-9R/IL-2R co-localization exists at the cell surface regardless of the overall spatial correlation of the two receptor kinds. Moreover, our FRET experiments demonstrated molecular scale assemblies of the elements of the IL-9/IL-2R system. Binding of IL-9 altered the structure and/or composition of these clusters. It is hypothesized, that by sequestering receptor subunits in common membrane areas, the overlapping domains of IL-9R and IL-2R provide a platform enabling both the formation of the appropriate receptor complex as well as subunit sharing between related cytokines.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
IL-9 and -2 receptors
uorescence resonance energy transfer
Manders coef-cient
co-occurrence analysis
Pearson correlation analysis
confocal microscopy
human T lymphoma cells
co-localization of membrane proteins
Megjelenés:Cytometry Part A. - 93 : 11 (2018), p. 1106-1117. -
További szerzők:Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Mocsár Gábor (1981-) (biofizikus) Nagyné Szabó Ágnes Timea (1982-) (vegyész) Csomós István (1983-) (molekuláris biológus) Waldmann, Thomas A. Vámosi György (1967-) (biofizikus) Mátyus László (1956-) (biofizikus) Dóczy-Bodnár Andrea (1970-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00026
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00003
GINOP
K120302
OTKA
Intramural research program of the National Cancer Institute, NIH
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM057902
Első szerző:Nizsalóczki Enikő
Cím:Distinct spatial relationship of the interleukin-9 receptor with interleukin-2 receptor and major histocompatibility complex glycoproteins in human T lymphoma cells / Enikő Nizsalóczki, István Csomós, Péter Nagy, Zsolt Fazekas, Carolyn K. Goldman, Thomas A. Waldmann, Sándor Damjanovich, György Vámosi, László Mátyus, Andrea Bodnár
Dátum:2014
ISSN:1439-4235
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
confocal microscopy
membrane proteins
FRET
protein protein interactions
receptors
Molekuláris Medicina
Doktori iskola
Megjelenés:Chemphyschem. - 15 : 18 (2014), p. 3969-3978. -
További szerzők:Csomós István (1983-) (molekuláris biológus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Fazekas Zsolt (1971-) (biofizikus) Goldman, Caroline K. Waldmann, Thomas A. Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus) Mátyus László (1956-) (biofizikus) Dóczy-Bodnár Andrea (1970-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Sejtfelszíni fehérjék szerveződése: az MHC I. szerepe
TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024
TÁMOP
Molekuláris Orvostudomány Doktori Iskola
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0025
TÁMOP
TÁMOP-4.2.4.A/2-11/1-2012-0001
TÁMOP
CK 78179
OTKA
K 103965
OTKA
K 103906
OTKA
NK 101337
OTKA
Baross Gábor Program REG-EA-09-1-2009-0010
Egyéb
Internal Research Program of the University of Debrecen RH/885/2013
Egyéb
Intramural Research Program of the National Cancer Institute, National Institutes of Health
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM073622
Első szerző:Szöllősi János (biofizikus)
Cím:Principles of resonance energy transfer / Szöllősi János, Damjanovich Sándor, Nagy Péter, Vereb György, Mátyus László
Dátum:2006
ISBN:Unit1 12.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok könyvfejezet
energy transfer
Megjelenés:Current Protocols in Cytometry / Ed. J. Paul Robinson. - p. 1.12.1-1.12.16.
További szerzők:Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Vereb György (1965-) (biofizikus, orvos) Mátyus László (1956-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:F049025
OTKA
T043509
OTKA
T043061
OTKA
K626h8
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM059568
Első szerző:Szöllősi János (biofizikus)
Cím:Applications of fluorescence resonance energy transfer for mapping biological membranes / János Szöllősi, Péter Nagy, Zsolt Sebestyén, Sándor Damjanovich, John W. Park, László Mátyus
Dátum:2002
ISSN:1389-0352
Megjegyzések:The interaction of the cell surface proteins plays a key role in the process of transmembrane signaling. Receptor clustering and changes in their conformation are often essential factors in the final outcome of ligand receptor interactions. Fluorescence resonance energy transfer (FRET) is an excellent tool for determining distance relationships and supramolecular organization of cell surface molecules. This paper reviews the theoretical background of fluorescence resonance energy transfer, its flow cytometric and microscopic applications (including the intensity based and photobleaching versions), and provides a critical evaluation of the methods as well. In order to illustrate the applicability of the method, we summarize a few biological results: clustering of lectin receptors, cell surface distribution of hematopoietic cluster of differentiation (CD) molecules, and that of the receptor tyrosine kinases, conformational changes of Major Histocompatibility Complex (MHC) I molecules upon membrane potential change and ligand binding.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Biophysics
Energy Transfer
Fluorescence
Hungary
Major Histocompatibility Complex
methods
Proteins
Megjelenés:Reviews in Molecular Biotechnology. - 82 : 3 (2002), p. 251-266. -
További szerzők:Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Sebestyén Zsolt Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus) Park, John W. Mátyus László (1956-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:OTKA-T30399
OTKA
OTKA-T023835
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM004743
035-os BibID:(scopus)0038492661 (wos)000184222500005
Első szerző:Vereb György (biofizikus, orvos)
Cím:Dynamic, yet structured : the cell membrane three decades after the Singer-Nicolson model / Vereb, G., Szollosi, J., Matko, J., Nagy, P., Farkas, T., Vigh, L., Matyus, L., Waldmann, T. A., Damjanovich, S.
Dátum:2003
ISSN:027-8424 (Print)
Megjegyzések:The fluid mosaic membrane model proved to be a very useful hypothesis in explaining many, but certainly not all, phenomena taking place in biological membranes. New experimental data show that the compartmentalization of membrane components can be as important for effective signal transduction as is the fluidity of the membrane. In this work, we pay tribute to the Singer-Nicolson model, which is near its 30th anniversary, honoring its basic features, "mosaicism" and "diffusion," which predict the interspersion of proteins and lipids and their ability to undergo dynamic rearrangement via Brownian motion. At the same time, modifications based on quantitative data are proposed, highlighting the often genetically predestined, yet flexible, multilevel structure implementing a vast complexity of cellular functions. This new "dynamically structured mosaic model" bears the following characteristics: emphasis is shifted from fluidity to mosaicism, which, in our interpretation, means nonrandom codistribution patterns of specific kinds of membrane proteins forming small-scale clusters at the molecular level and large-scale clusters (groups of clusters, islands) at the submicrometer level. The cohesive forces, which maintain these assemblies as principal elements of the membranes, originate from within a microdomain structure, where lipid-lipid, protein-protein, and protein-lipid interactions, as well as sub- and supramembrane (cytoskeletal, extracellular matrix, other cell) effectors, many of them genetically predestined, play equally important roles. The concept of fluidity in the original model now is interpreted as permissiveness of the architecture to continuous, dynamic restructuring of the molecular- and higher-level clusters according to the needs of the cell and as evoked by the environment.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Animals
Biophysics
Cell Membrane
chemistry
Chemistry,Physical
Diffusion
Extracellular Matrix
Fluorescence Resonance Energy Transfer
Hungary
Lipid Bilayers
Membrane Fluidity
Membrane Lipids
Membrane Microdomains
Membrane Proteins
Microscopy,Electron
Models,Biological
Motion
physiology
Proteins
Research
Signal Transduction
Support
Megjelenés:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 100 : 14 (2003), p. 8053-8058. -
További szerzők:Szöllősi János (1953-) (biofizikus) Matkó János (1952-) (biológus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Farkas Tamás (1971-) (biológus) Vígh L. Mátyus László (1956-) (biofizikus) Waldmann, Thomas A. Damjanovich Sándor (1936-2017) (biofizikus)
Internet cím:DOI
elektronikus változat
Borító:
Rekordok letöltése1