CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM112917
035-os BibID:(scopus)85162204904 (wos)001011863100001
Első szerző:Bedics Gábor
Cím:PersonALL : a genetic scoring guide for personalized risk assessment in pediatric B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia / Bedics Gábor, Egyed Bálint, Kotmayer Lili, Benard-Slagter Anne, de Groot Karel, Bekő Anna, Hegyi Lajos László, Bátai Bence, Krizsán Szilvia, Kriván Gergely, Erdélyi Dániel J., Müller Judit, Haltrich Irén, Kajtár Béla, Pajor László, Vojcek Ágnes, Ottóffy Gábor, Ujfalusi Anikó, Szegedi István, Tiszlavicz Lilla Györgyi, Bartyik Katalin, Csanádi Krisztina, Péter György, Simon Réka, Hauser Péter, Kelemen Ágnes, Sebestyén Endre, Jakab Zsuzsanna, Matolcsy András, Kiss Csongor, Kovács Gábor, Savola Suvi, Bödör Csaba, Alpár Donát
Dátum:2023
ISSN:0007-0920
Megjegyzések:BACKGROUND: Recurrent genetic lesions provide basis for risk assessment in pediatric acute lymphoblastic leukemia (ALL). However, current prognostic classifiers rely on a limited number of predefined sets of alterations. METHODS: Disease-relevant copy number aberrations (CNAs) were screened genome-wide in 260 children with B-cell precursor ALL. Results were integrated with cytogenetic data to improve risk assessment. RESULTS: CNAs were detected in 93.8% (n = 244) of the patients. First, cytogenetic profiles were combined with IKZF1 status (IKZF1normal, IKZF1del and IKZF1plus) and three prognostic subgroups were distinguished with significantly different 5-year event-free survival (EFS) rates, IKAROS-low (n = 215): 86.3%, IKAROS-medium (n = 27): 57.4% and IKAROS-high (n = 18): 37.5%. Second, contribution of genetic aberrations to the clinical outcome was assessed and an aberration-specific score was assigned to each prognostically relevant alteration. By aggregating the scores of aberrations emerging in individual patients, personalized cumulative values were calculated and used for defining four prognostic subgroups with distinct clinical outcomes. Two favorable subgroups included 60% of patients (n = 157) with a 5-year EFS of 96.3% (excellent risk, n = 105) and 87.2% (good risk, n = 52), respectively; while 40% of patients (n = 103) showed high (n = 74) or ultra-poor (n = 29) risk profile (5-year EFS: 67.4% and 39.0%, respectively). CONCLUSIONS: PersonALL, our conceptually novel prognostic classifier considers all combinations of co-segregating genetic alterations, providing a highly personalized patient stratification.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:British Journal Of Cancer. - 129 : 3 (2023), p. 455-465. -
További szerzők:Egyed Bálint Kotmayer Lili Benard-Slagter, Anne de Groot, Karel Bekő Anna Hegyi Lajos László Bátai Bence Krizsán Szilvia Kriván Gergely Erdélyi Dániel Müller Judit Haltrich Irén Kajtár Béla (1977-) (patológus) Pajor László (patológus) Vojcek Ágnes Ottóffy Gábor Ujfalusi Anikó (1968-) (gyermekorvos, laboratóriumi szakorvos) Szegedi István (1969-) (hematológus, onkológus, nefrológus) Tiszlavicz Lilla Györgyi Bartyik Katalin (haematológus) Csanádi Krisztina Péter György Simon Réka Hauser Péter Kelemen Ágnes Sebestyén Endre Jakab Zsuzsanna (gyermekgyógyász) Matolcsy András Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Kovács Gábor (gyermekhaematológus Budapest) Savola, Suvi Bödör Csaba Alpár Donát
Pályázati támogatás:FK20_134253
Egyéb
K21_137948
Egyéb
K22_143021
Egyéb
EU's Horizon 2020
Egyéb
Hungarian Pediatric Oncology Network,
Egyéb
KDP-2020-1008491
Egyéb
János Bolyai Research Scholarship program
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
ÚNKP-22-5-SE-7
Egyéb
TKP2021-EGA-24
Egyéb
TKP2021-NVA-15
Egyéb
Semmelweis University
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM110725
Első szerző:Bedics Gábor
Cím:Új, rizikóbecslő módszerek gyermekkkori akut llimfobalsztos leukémiában újgenerációs szekvenáláson alapuló átfogó kópiaszám-eltérés-profilozás által / Bedics Gábor, Egyed Bálint, Kotmayer Lili, Anne Benard-Slagter, Karel de Groot, Bekő Anna, Hegyi Lajos, Krizsán Szilvia, Kriván Gergely, Erdélyi Dániel, Kovács Gábor, Haltrich Irén, Kajtár Béla, Pajor László, Vojcek Ágnes, Ottóffy Gábor, Ujfalusi Anikó, Kiss Csongor, Szegedi István, Bartyik Katalin, Péter György, Sebestyén Endre, Jakab Zsuzsanna, Matolcsy András, Suvi Savola, Bödör Csaba, Alpár Donát
Dátum:2022
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idézhető absztrakt
folyóiratcikk
Megjelenés:Hematológia-Transzfuziológia. - Különszám (2022), p. 20. -
További szerzők:Egyed Bálint Kotmayer Lili Benard-Slagter, Anne de Groot, Karel Bekő Anna Hegyi Lajos Krizsán Szilvia Kriván Gergely Erdélyi Dániel Kovács Gábor (gyermekhaematológus Budapest) Haltrich Irén Kajtár Béla (1977-) (patológus) Pajor László (patológus) Vojcek Ágnes Ottóffy Gábor Ujfalusi Anikó (1968-) (gyermekorvos, laboratóriumi szakorvos) Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Szegedi István (1969-) (hematológus, onkológus, nefrológus) Bartyik Katalin (haematológus) Péter György Sebestyén Endre Jakab Zsuzsanna (gyermekgyógyász) Matolcsy András Savola, Suvi Bödör Csaba Alpár Donát
Pályázati támogatás:FK20_134253
Egyéb
K21_137948
Egyéb
H2020-73593
Egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
KDP-2020.1008491
Egyéb
TKP2021-EGA-24
Egyéb
TKP2021-NVA-15
Egyéb
Elixir Hungary
Egyéb
ÚNKP-22-5-SE-7
Egyéb
BOLYAI PROGRAM BO/125/22
MTA
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM092505
035-os BibID:(cikkazonosító)10761 (WOS)000546550700075 (Scopus)85087302594
Első szerző:Jakab Zsuzsanna (gyermekgyógyász)
Cím:Late mortality in survivors of childhood cancer in Hungary / Jakab Zsuzsanna, Garami Miklos, Bartyik Katalin, Csoka Monika, Erdelyi Daniel Janos, Hauser Peter, Juhasz Attila, Kelemen Agnes, Krivan Gergely, Masat Peter, Müller Judit, Nagy Csilla, Peter György, Renyi Imre, Szegedi Istvan, Vojcek Agnes, Zombori Marianna, Bardi Edit, Kovacs Gabor
Dátum:2020
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:The Hungarian Pediatric Oncology Network provides centralized treatment and population-based registration for cases of childhood cancer since 1973. We collected and analized data on late mortality, secondary malignancies and cardiac diseases in survivors (>?5 years) of childhood cancer to evaluate long-term risks. We extracted all solid tumour cases (3,650 followed up for 5?39.3 years, diagnosis: 1973?2008) from the database of the Hungarian Childhood Cancer Registry and checked against the Population Registry. Among the 301 patients who died after 5 years (8.2%) the most common causes of death were progression of primary cancer (52.5%), secondary malignancies (16%) and cardiovascular diseases (8%). Late mortality rates (SMR, total: 35,006 pyrs) showed highly elevated risk of death (SMR: 10.7 95% CI 9?12.4) for the second 5 years of follow up and moderately elevated risk for 10-year survivors (SMR: 3.5 95% CI 3?4.1). Marked differences were detected in the pattern of causes of death between diagnostic groups of primary cancer; with highest risks beyond 10 years for CNS tumours, Hodgkin disease, osteosarcoma and advanced stage neuroblastoma. The longstanding mortality risk for 5-year survivors underlines the need for tailored long-term follow-up and monitoring of late consequences according to the context of different primary diseases of childhood cancer.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
late mortality
Megjelenés:Scientific Reports. - 10 (2020), p. 1-9. -
További szerzők:Garami Miklós Bartyik Katalin (haematológus) Csóka Mónika Erdélyi Dániel Hauser, Peter Juhász Attila (1970-) (epidemiológus) Kelemen Ágnes Kriván Gergely Masát Péter (gyermekorvos Szombathely) Müller Judit Nagy Csilla (1970-) (epidemiológus, népegészségügyi szakember) Péter György Rényi Imre (gyermekhaematológus Budapest) Szegedi István (1969-) (hematológus, onkológus, nefrológus) Vojcek Ágnes Zombori Marianna Bárdi Edit (1971-) (csecsemő- és gyermekgyógyász) Kovács Gábor (gyermekhaematológus Budapest)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM112664
035-os BibID:(WoS)001051207800001 (Scopus)85166280976
Első szerző:Krizsán Szilvia
Cím:Next-Generation Sequencing-Based Genomic Profiling of Children with Acute Myeloid Leukemia / Szilvia Krizsán, Borbála Péterffy, Bálint Egyed, Tibor Nagy, Endre Sebestyén, Lajos László Hegyi, Zsuzsanna Jakab, Dániel J. Erdélyi, Judit Müller, György Péter, Krisztina Csanádi, Krisztián Kállay, Gergely Kriván, Gábor Barna, Gábor Bedics, Irén Haltrich, Gábor Ottóffy, Katalin Csernus, Ágnes Vojcek, Lilla Györgyi Tiszlavicz, Krisztina Mita Gábor, Ágnes Kelemen, Péter Hauser, Zsuzsanna Gaál, István Szegedi, Anikó Ujfalusi, Béla Kajtár, Csongor Kiss, András Matolcsy, Botond Tímár, Gábor Kovács, Donát Alpár, Csaba Bödör
Dátum:2023
ISSN:1525-1578 1943-7811
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:The Journal of Molecular Diagnostics. - 25 : 8 (2023), p. 555-568. -
További szerzők:Péterffy Borbála Egyed Bálint Nagy Tibor (1988-) (vegyész) Sebestyén Endre Hegyi Lajos László Jakab Zsuzsanna (gyermekgyógyász) Erdélyi Dániel Müller Judit Péter György Csanádi Krisztina Kállay Krisztián Kriván Gergely Barna Gábor Bedics Gábor Haltrich Irén Ottóffy Gábor Csernus Katalin Vojcek Ágnes Tiszlavicz Lilla Györgyi Gábor Krisztina Míta Kelemen Ágnes Hauser Péter Gaál Zsuzsanna (1990-) (csecsemő-és gyermekgyógyász központi gyakornok) Szegedi István (1969-) (hematológus, onkológus, nefrológus) Ujfalusi Anikó (1968-) (gyermekorvos, laboratóriumi szakorvos) Kajtár Béla (1977-) (patológus) Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Matolcsy András Timár Botond Kovács Gábor (gyermekhaematológus Budapest) Alpár Donát Bödör Csaba
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM113637
035-os BibID:(scopus)85160402060 (wos)000998417200001
Első szerző:Vodicska Barbara
Cím:Correction to : Real-world performance analysis of a novel computational method in the precision oncology of pediatric tumors / Vodicska Barbara, Déri Júlia, Tihanyi Dóra, Várkondi Edit, Kispéter Enikő, Dóczi Róbert, Lakatos Dóra, Dirner Anna, Vidermann Mátyás, Filotás Péter, Szalkai-Dénes Réka, Szegedi István, Bartyik Katalin, Gábor Krisztina Míta, Simon Réka, Hauser Péter, Péter György, Kiss Csongor, Garami Miklós, Peták István
Dátum:2023
ISSN:1708-8569 1867-0687
Megjegyzések:In the original publication, there are few errors in the figures. The corrections are as follows: Figure 1f: At the SUM row, numbers were missing. They have been added [35 (blue bar) and 18 (orange bar)] as they were originally in the manuscript. Figure 2b: scale, y axis had 00 instead of 20. The corrected figure has 20 as it was originally in the manuscript. Figure 2d: lower left panel?figure part indication was missing. Figure part indicator "d" has been added as it was originally in the manuscript. Figure 2d: scale, y axis had 00 instead of 20. The corrected figure has 20 as it was originally in the manuscript. Figure 2g: scale, y axis had 00 instead of 20. The corrected figure has 20 as it was originally in the manuscript. Figure 3a: scale, y axis had 00 instead of 20. The corrected figure has 20 as it was originally in the manuscript. Figure 3c: scale, y axis had 00 instead of 20. The corrected figure has 20 as it was originally in the manuscript. Figure 3c: under the first bar, x axis, category II, there was n?=?34 instead of n?=?7. The corrected figure now has n?=?7 as it was originally in the submitted manuscript. Figure 5a: ARHGEF1-2 was originally ARHGEF12. In the corrected version it is now accurately displayed as ARHGEF12. Figure 5a: "NG S50" has been changed to "NGS 50" at 2 occurrences. Figure 5a: in the Panel column, LB-AIO has been changed to LB-600 at 2 occurrences to align with figure legends. Figure 5b header: "DNA damage raesponse" has been corrected to "DNA damage response" as originally submitted. Figure 5 a, b and c parts: "MARK" has been corrected to "MAPK" all the three occurrences as originally submitted. Figure 5b: At patient ID 83 and 76 original data has been lost during figure editing. The panels WES and FISH, respectively have been reverted to NGS-600 to align with figure legends and research results. Figure 5b: At patient ID 19, original data have been lost during figure editing. The panel FISH now has been reverted to WES to align with research results as originally submitted. Figure 5c: At patient ID 13, original data have been lost during figure editing. The panel FISH now has been reverted to WES to align with research results as originally submitted. Besides, the corrected figures are as follows: (Figure presented.) (Figure presented.) (Figure presented.) (Figure presented.) Figure 1 Figure 2 Figure 3 Figure 5 The original article has been corrected. ? 2023, The Author(s).
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:World Journal of Pediatrics. - [Epub ahead of print] (2023). -
További szerzők:Déri Júlia Tihanyi Dóra Várkondi Edit Kispéter Enikő Dóczi Róbert Lakatos Dóra Dirner Anna Vidermann Mátyás Filotás Péter Szalkai-Dénes Réka Szegedi István (1969-) (hematológus, onkológus, nefrológus) Bartyik Katalin (haematológus) Gábor Krisztina Míta Simon Réka Hauser Péter Péter György Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Garami Miklós Peták István
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM109812
035-os BibID:(scopus)85149918954
Első szerző:Vodicska Barbara
Cím:Real-world performance analysis of a novel computational method in the precision oncology of pediatric tumors / Vodicska Barbara, Déri Júlia, Tihanyi Dóra, Várkondi Edit, Kispéter Enikő, Dóczi Róbert, Lakatos Dóra, Dirner Anna, Vidermann Mátyás, Filotás Péter, Szalkai-Dénes Réka, Szegedi István, Bartyik Katalin, Gábor Krisztina Míta, Simon Réka, Hauser Péter, Péter György, Kiss Csongor, Garami Miklós, Peták István
Dátum:2023
ISSN:1708-8569 1867-0687
Megjegyzések:Background The utility of routine extensive molecular profling of pediatric tumors is a matter of debate due to the high number of genetic alterations of unknown signifcance or low evidence and the lack of standardized and personalized deci sion support methods. Digital drug assignment (DDA) is a novel computational method to prioritize treatment options by aggregating numerous evidence-based associations between multiple drivers, targets, and targeted agents. DDA has been validated to improve personalized treatment decisions based on the outcome data of adult patients treated in the SHIVA01 clinical trial. The aim of this study was to evaluate the utility of DDA in pediatric oncology. Methods Between 2017 and 2020, 103 high-risk pediatric cancer patients (<21 years) were involved in our precision oncol ogy program, and samples from 100 patients were eligible for further analysis. Tissue or blood samples were analyzed by whole-exome (WES) or targeted panel sequencing and other molecular diagnostic modalities and processed by a software system using the DDA algorithm for therapeutic decision support. Finally, a molecular tumor board (MTB) evaluated the results to provide therapy recommendations. Results Of the 100 cases with comprehensive molecular diagnostic data, 88 yielded WES and 12 panel sequencing results. DDA identifed matching of-label targeted treatment options (actionability) in 72/100 cases (72%), while 57/100 (57%) showed potential drug resistance. Actionability reached 88% (29/33) by 2020 due to the continuous updates of the evidence database. MTB approved the clinical use of a DDA-top-listed treatment in 56 of 72 actionable cases (78%). The approved therapies had signifcantly higher aggregated evidence levels (AELs) than dismissed therapies. Filtering of WES results for targeted panels missed important mutations afecting therapy selection. Conclusions DDA is a promising approach to overcome challenges associated with the interpretation of extensive molecular profling in the routine care of high-risk pediatric cancers. Knowledgebase updates enable automatic interpretation of a con tinuously expanding gene set, a "virtual" panel, fltered out from genome-wide analysis to always maximize the performance of precision treatment planning
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:World Journal of Pediatrics. - [Epub ahead of print] (2023). -
További szerzők:Déri Júlia Tihanyi Dóra Várkondi Edit Kispéter Enikő Dóczi Róbert Lakatos Dóra Dirner Anna Vidermann Mátyás Filotás Péter Szalkai-Dénes Réka Szegedi István (1969-) (hematológus, onkológus, nefrológus) Bartyik Katalin (haematológus) Gábor Krisztina Míta Simon Réka Hauser Péter Péter György Kiss Csongor (1956-) (hematológus, onkológus) Garami Miklós Peták István
Pályázati támogatás:NVKP_16-1-2016-0005
Egyéb
KFI_16-1-2016-0048
Egyéb
NKFIH K_22 143021
NKFIH
2019-1.1.1-PIACI-KFI-2019-00367
Egyéb
K_143021
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1