CCL

Összesen 4 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM062511
Első szerző:Fehér Krisztina (vegyész)
Cím:Probing pattern and dynamics of disulfide bridges using synthesis and NMR of an ion channel blocker peptide toxin with multiple diselenide bonds / Krisztina Fehér, István Timári, Kinga Rákosi, János Szolomájer, Tünde Z. Illyés, Ádám Bartók, Zoltán Varga, György Panyi, Gábor K. Tóth, Katalin E. Kövér
Dátum:2016
ISSN:2041-6520 2041-6539
Megjegyzések:Anuroctoxin (AnTx), a 35-amino-acid scorpion toxin containing four disulfide bridges, is a high affinity blocker of the voltage-gated potassium channel Kv1.3, but also blocks Kv1.2. To improve potential therapeutic use of the toxin, we have designed a double substituted analog, [N17A/F32T]-AnTx, which showed comparable Kv1.3 affinity to the wild-type peptide, but also a 2500-fold increase in the selectivity for Kv1.3 over Kv1.2. In the present study we have achieved the chemical synthesis of a Sec-analog in which all cysteine (Cys) residues have been replaced by selenocysteine (Sec) forming four diselenide bonds. To the best of our knowledge this is the first time to replace, by chemical synthesis, all disulfide bonds with isosteric diselenides in a peptide/protein. Gratifyingly, the key pharmacological properties of the Sec-[N17A/F32T]-AnTx are retained since the peptide is functionally active. We also propose here a combined experimental and theoretical approach including NOE- and 77Se-based NMR supplemented by MD simulations for conformational and dynamic characterization of the Sec-[N17A/F32T]-AnTx. Using this combined approach allowed us to attain unequivocal assignment of all four diselenide bonds and supplemental MD simulations allowed characterization of the conformational dynamics around each disulfide/diselenide bridge.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
peptide toxin
ion channels
disulfide bridge
Megjelenés:Chemical Science 7 (2016), p. 2666-2673. -
További szerzők:Timári István (1989-) (vegyész) Rákosi Kinga Szolomájer János Illyés Tünde Zita (1970-) (kémia-fizika szakos tanár) Bartók Ádám (1984-) (biotechnológus) Varga Zoltán (1969-) (biofizikus, szakfordító) Panyi György (1966-) (biofizikus) Tóth Gábor K. Kövér Katalin, E. (1956-2023) (vegyész)
Pályázati támogatás:TAMOP-4.2.2/A-11/1/KONV-2012-0025
TÁMOP
TAMOP-4.2.2/A-11/1/KONV-2012-0035
TÁMOP
OTKA K 75904
OTKA
OTKA NK 101337
OTKA
OTKA K 105459
OTKA
KTIA_NAP_13-2-2015?0009
Egyéb
KTIA_13_NAP-A-III/8
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM118500
035-os BibID:(cikkazonosító)1742
Első szerző:Hőgye Fanni
Cím:Saturation Transfer Difference NMR and Molecular DockingInteraction Study of Aralkyl-Thiodigalactosides as Potential Inhibitors of the Human-Galectin-3 Protein / Fanni Hőgye, László Bence Farkas, Álex Kálmán Balogh, László Szilágyi, Samar Alnukari, István Bajza, Anikó Borbás, Krisztina Fehér, Tünde Zita Illyés, István Timár
Dátum:2024
ISSN:1422-0067
Megjegyzések:Human Galectin-3 (hGal-3) is a protein that selectively binds to ?-galactosides and holds diverse roles in both normal and pathological circumstances. Therefore, targeting hGal-3 has become a vibrant area of research in the pharmaceutical chemistry. As a step towards the development of novel hGal-3 inhibitors, we synthesized and investigated derivatives of thiodigalactoside (TDG) modified with different aromatic substituents. Specifically, we describe a high-yielding synthetic route of thiodigalactoside (TDG); an optimized procedure for the synthesis of the novel 3,3·-di-O-(quinoline- 2-yl)methyl)-TDG and three other known, symmetric 3,3·-di-O-TDG derivatives ((naphthalene- 2yl)methyl, benzyl, (7-methoxy-2H-1-benzopyran-2-on-4-yl)methyl). In the present study, using competition Saturation Transfer Difference (STD) NMR spectroscopy, we determined the dissociation constant (Kd) of the former three TDG derivatives produced to characterize the strength of the interaction with the target protein (hGal-3). Based on the Kd values determined, the (naphthalen-2- yl)methyl, the (quinolin-2-yl)methyl and the benzyl derivatives bind to hGal-3 94, 30 and 24 times more strongly than TDG. Then, we studied the binding modes of the derivatives in silico by molecular docking calculations. Docking poses similar to the canonical binding modes of well-known hGal-3 inhibitors have been found. However, additional binding forces, cation?? interactions between the arginine residues in the binding pocket of the protein and the aromatic groups of the ligands, have been established as significant features. Our results offer a molecular-level understanding of the varying affinities observed among the synthesized thiodigalactoside derivatives, which can be a key aspect in the future development of more effective ligands of hGal-3.
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
lectin
galectin-3
thiodigalactosides
NMR spectroscopy
STD NMR
molecular docking
Megjelenés:International Journal Of Molecular Sciences. - 25 : 3 (2024), p.1-18. -
További szerzők:Farkas László Bence (1993-) (vegyész) Balogh Álex Kálmán (1994-) (vegyész) Szilágyi László (1941-) (vegyész) Samar Alnukari (1998-) (vegyész) Bajza István (1971-) (vegyész) Borbás Anikó (1965-) (vegyész) Fehér Krisztina (1974-) (vegyész) Illyés Tünde Zita (1970-) (kémia-fizika szakos tanár) Timári István (1989-) (vegyész)
Pályázati támogatás:NN 128368
OTKA
PD 135034
OTKA
KDP-2021
Egyéb
KDP-2023
Egyéb
BO/00372/20/7
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM068585
Első szerző:Illyés Tünde Zita (kémia-fizika szakos tanár)
Cím:Exploring the Syntheses of Novel Glycomimetics : Carbohydrate Derivatives with Se-S- or Se-Se- Glycosidic Linkages / Tünde-Zita Illyés, Sára Balla, Attila Bényei, Ambati Ashok Kumar, István Timári, Katalin E. Kövér, László Szilágyi
Dátum:2016
ISSN:2365-6549
Megjegyzések:A convenient route to Se-S-glycoside derivatives was developed using glycosyl isoselenuronium salts as glycosylselenenyl transfer reagents toward thiols. Aliphatic and aromatic thiols were found to react in the presence of N,N-diisopropylethylamine as a base and furnished alkyl- or aryl glycosylselenenylsulfide derivatives. S-glycosylselenenyl-cysteines were obtained similarly via reactions with O,N-protected cysteine. Reactions with monosaccharide thiols provided disaccharide mimics featuring Se-S- interglycosidic bonds. Further disaccharide mimics with Se-Se interglycosidic linkage were obtained from the starting isoselenuronium salts via reactions with protected monosaccharide derivatives bearing selenol groups in 6- or 4-position. The novel glycomimetics are expected to open new perspectives in biological activities and/or mechanistic studies due, i.a., to the rather uncommon Se-S- or Se-Se bonds incorporated into a carbohydrate framework.
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Carbohydrate
selenosugar
selenenylsulfide
Se-Se-bond
Megjelenés:ChemistrySelect 1 : 10 (2016), p. 2383-2388. -
További szerzők:Balla Sára Bényei Attila (1962-) (vegyész) Kumar, Ambati Ashok Timári István (1989-) (vegyész) Kövér Katalin, E. (1956-2023) (vegyész) Szilágyi László (1941-) (vegyész)
Pályázati támogatás:NN 109671
OTKA
K 105459
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM057871
Első szerző:Timári István (vegyész)
Cím:Precise Measurement of Long-Range Heteronuclear Coupling Constants by a Novel Broadband Proton-Proton-Decoupled CPMG-HSQMBC Method / István Timári, Tünde Z. Illyés, Ralph W. Adams, Mathias Nilsson, László Szilágyi, Gareth A. Morris, Katalin E. Kövér
Dátum:2015
ISSN:0947-6539
Megjegyzések:A broadband proton-proton-decoupled CPMG-HSQMBC method for the precise and direct measurement of long-range heteronuclear coupling constants is presented. The Zangger-Sterk-based homodecoupling scheme reported herein efficiently removes unwanted proton-proton splittings from the heteronuclear multiplets, so that the desired heteronuclear couplings can be determined simply by measuring frequency differences between singlet maxima in the resulting spectra. The proposed pseudo-1D/2D pulse sequences were tested on nucleotides, a metal complex incorporating P heterocycles, and diglycosyl (di)selenides, as well as on other carbohydrate derivatives, for the extraction of (n) J((1) H,(31) P), (n) J((1) H,(77) Se), and (n) J((1) H,(13) C) values, respectively.
Tárgyszavak:Természettudományok Kémiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
HSQMBC
heteronuclear coupling constants
NMR spectroscopy
proton-proton decoupling
structure elucidation
Megjelenés:Chemistry-A European Journal. - 21 : 8 (2015), p. 3472-3479. -
További szerzők:Illyés Tünde Zita (1970-) (kémia-fizika szakos tanár) Adams, Ralph W. Nilsson, Mathias Szilágyi László (1941-) (vegyész) Morris, Gareth A. Kövér Katalin, E. (1956-2023) (vegyész)
Pályázati támogatás:K 405459, NN 109671
OTKA
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0025
TÁMOP
TÁMOP-4.2.4/A/2-11/1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1