CCL

Összesen 6 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM015547
Első szerző:Bálint Bálint László (kutató orvos)
Cím:Genome-wide localization of histone 4 arginine 3 methylation in a differentiation primed myeloid leukemia cell line / Balint Balint Laszlo, Gabor Petra, Nagy Laszlo
Dátum:2005
ISSN:0171-2985
Megjegyzések:Methylation of arginine residues in proteins is involved in modulation of various protein-protein interactions. At the chromatin level H4R3 methylation provides a signal integration step during myeloid differentiation. In order to globally characterize the role of arginine methylation in signal integration and developmental processes we decided to map genomic loci marked by protein arginine methyl transferase 1 (PRMT1) via histone H4 arginine 3 methylation. For this, we used the myeloid leukemia cell line, HL60, which is known to differentiate along the monocyte/macrophage or granulocyte lineage. We used chromatin immunoprecipitation with an antibody specific for the H4 arginine 3 methyl epitope followed by cloning to isolate genomic loci marked by this modification. After sequencing and in silico analysis we found that all of the genomic hits identified were intronic or within 5 kb of 5' ends of specific genes. The locations identified were enriched in conserved transcription factor binding sites of POU2F1, MEF-2 and FOXL1 factors. A significant number of the genes in the proximity of the identified genomic loci are involved in signaling pathways and developmental processes including immune response of myeloid cells.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Immunobiology. - 210 : 2-4 (2005), p. 141-152. -
További szerzők:Gábor Petra Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:Egyéb
OTKA
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM042249
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:Identification of novel markers of alternative activation and potential endogenous PPARgamma ligand production mechanisms in human IL-4 stimulated differentiating macrophages / Czimmerer Zsolt, Varga Tamas, Poliska Szilard, Nemet Istvan, Szanto Attila, Nagy Laszlo
Dátum:2012
ISSN:0171-2985
Megjegyzések:We analyzed global gene expression profiles of IL-4 induced alternatively activated as well as IFNγ+TNFα stimulated classically activated human monocyte derived macrophages and identified novel IL-4 regulated alternative activation marker genes including MS4A4A, SLA, CD180, and ENPP2. Transcription factor prediction analysis of IL-4 regulated genes suggested that the regulated genes are involved in a complex regulation of lipid metabolism, defense against cell metabolism derived reactive oxygen species, and basal expression of inflammation linked genes. Both an in silico transcription activation prediction as well as experimental data suggested the presence of alternative macrophage activation specific endogenous PPARγ ligand producing mechanisms. We found the induction of three enzymes whose activity can potentially generate endogenous PPARγ ligands in an IL-4 dependent manner. These are MAOA, ENPP2, and ALOX15 producing 5-methoxy-indole acetate, lysophosphatidic acid (LPA) and 13-hydroxyoctadienoic acid (13-HODE), and/or 15-hydroxyeicosatetraenoic acid (15-HETE), respectively. Our data suggest that global gene expression profiling, combined with computational transcription activity prediction, can lead to identification of transcriptional networks that underpin cellular subtype specification.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Molekuláris Medicina
Megjelenés:Immunobiology. - 217 : 12 (2012), p. 1301-1314. -
További szerzők:Varga Tamás (1971-) (biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Német István (1982-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Szántó Attila (1976-) (orvos, biokémikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:NK72730
OTKA
K100196
OTKA
REGPOT-2008-1-01/MOLMEDREX/229920
FP7
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Magreceptor természetes ligandok azonosítása
TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM049597
035-os BibID:PMID:23973299 WOS:000325840200014
Első szerző:Nagy Gergely (molekuláris biológus)
Cím:A novel method to predict regulatory regions based on histone mark landscapes in macrophages / Gergely Nagy, Bence Dániel, Dávid Jónás, László Nagy, Endre Barta
Dátum:2013
ISSN:0171-2985
Megjegyzések:Macrophages as phagocytes and professional antigen presenting cells play critical roles in both innate and adaptive immunity. Main transcription factors acting during their differentiation and function are known, but the behavior and co-operation of these factors still remained unexplored. We introduce a new approach to map nucleosome-free regions using exclusively active enhancer and core promoter marking histone modification ChIP-seq data. We could detect approximately 56,000 potential active enhancers/promoters showing different lengths and histone modification shapes. Beside the highly enriched PU.1 and C/EBP sites, we could also detect binding sites for RUNX and AP-1, as well as for the MiT (MITF-TFE) family and MEF2 proteins. The PU.1 and C/EBP transcription factors are known for transforming cells into macrophages. The other transcription factors found in this study can play a role in macrophages as well, since it is known that the MiT family proteins are responsible for phagocytic activity and the MEF2 proteins specify monocytic differentiation over the granulocyte direction. Our results imply that this method can provide novel information about transcription factor organization at enhancers and core promoters as well as about the histone modifications surrounding regulatory regions in any immune or other cell types.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
BWA
Burrows-Wheeler Alignment Tool
CRE
ChIP
DMEM
Dulbecco's modified Eagle's medium
ENCODE
Enhancer
FAIRE
HLH
HOMER
HTH
Histone modification
IGV
Macrophage
NFR
NOR
Nucleosome-free region
PU.1
Promoter
SRA
TSS
bZIP
basic leucine zipper
cAMP response element
chromatin immunoprecipitation
encyclopedia of DNA elements
formaldehyde-assisted isolation of regulatory elements
helix-loop-helix
helix-turn-helix
hypergeometric optimization of motif EnRichment
integrative genomics viewer
nucleosome occupied region
nucleosome-free region
sequence read archive
transcription start site
Megjelenés:Immunobiology. - 218 : 11 (2013), p. 1416-1427. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Jonás Dávid Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
TÁMOP422_2012_002
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM051527
Első szerző:Nagy László (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Cím:EMDS 2012 : 26th Meeting of the European Society for Macrophage and Dendritic Cell Biology in Debrecen, Hungary, September 1-3, 2012 / László Nagy, Éva Rajnavolgyi
Dátum:2013
ISSN:0171-2985
Megjegyzések:The EMDS Meeting has established itself as a regular key event on the calendars of macrophage and dendritic cells biologists in Europe during the past two decades. The Societies' 26th Annual Meeting was held in Debrecen, in a University town in Hungary composed of 250,000 inhabitants and more than 30,000 students. 2012 was the centennial year of the establishment of the Royal University of Debrecen back in 1912, while the roots of higher education in Debrecen can be traced back to a far as 1538 when the Reformed (Calvinist) Church established its college in the city. The field of Immunology has set roots in Debrecen early on as well, with both, basic research and as well as clinical immunology.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok szerkesztőségi anyag
macrophage
dendritic cell
Megjelenés:Immunobiology. - 218 : 11 (2013), p. 1311. -
További szerzők:Rajnavölgyi Éva (1950-) (immunológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM049606
Első szerző:Nagy Zsuzsanna (okleveles középiskolai kémia-fizika szakos tanár)
Cím:Pro-inflammatory cytokines negatively regulate PPARγ mediated gene expression in both human and murine macrophages via multiple mechanisms / Zsuzsanna S. Nagy, Zsolt Czimmerer, Attila Szanto, Laszlo Nagy
Dátum:2013
ISSN:0171-2985
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Doktori iskola
Megjelenés:Immunobiology. - 218 : 11 (2013), p. 1336-1344. -
További szerzők:Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Szántó Attila (1976-) (orvos, biokémikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K 100196
OTKA
TÁMOP-422/2012-0023
TÁMOP
MTA János Bolyai Research Fellowship
Egyéb
NKTH-OTKA-EU 7KP (Marie Curie actions) Reintegration Grant (OTKA MB08C 84630 HUMAN MB08-3-2011-0002)
OTKA
TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024
TÁMOP
Molekuláris Sejt- és Immunbiológiai Doktori Iskola
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM003921
Első szerző:Szántó Attila (orvos, biokémikus)
Cím:The many faces of PPARgamma : anti-inflammatory by any means? / Szántó, A., Nagy, L.
Dátum:2008
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Immunobiology. - 213 : 9-10 (2008), p. 789-803. -
További szerzők:Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.