CCL

Összesen 5 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM072111
035-os BibID:(WoS)000423645700002 (Scopus)85034832211
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based approaches / Czimmerer Zsolt, Horvath Attila, Daniel Bence, Nagy Gergely, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Kiss Mate, Kolostyak Zsuzsanna, Poliska Szilard, Steiner Laszlo, Giannakis Nikolas, Varga Tamas, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1874-9399
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Biochimica et Biophysica Acta (BBA). Gene Regulatory Mechanisms. - 1861 : 1 (2018), p. 14-28. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Kiss Máté Kolostyák Zsuzsanna Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Steiner László Giannakis, Nikolas Varga Tamás (1971-) (biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM082548
035-os BibID:(WoS)000465084800019 (Scopus)85063767805 (PMID)30936495
Első szerző:Giannakis, Nikolas
Cím:Dynamic changes to lipid mediators support transitions among macrophage subtypes during muscle regeneration / Nikolas Giannakis, Brian E. Sansbury, Andreas Patsalos, Tristan T. Hays, Colin O. Riley, Xianlin Han, Matthew Spite, Laszlo Nagy
Dátum:2019
ISSN:1529-2908
Megjegyzések:Muscle damage elicits a sterile immune response that facilitates complete regeneration. Here, we used mass spectrometry-based lipidomics to map the mediator lipidome during the transition from inflammation to resolution and regeneration in skeletal muscle injury. We observed temporal regulation of glycerophospholipids and production of pro-inflammatory lipid mediators (for example, leukotrienes and prostaglandins) and specialized pro-resolving lipid mediators (for example, resolvins and lipoxins) that were modulated by ibuprofen. These time-dependent profiles were recapitulated in sorted neutrophils and Ly6Chi and Ly6Clo muscle-infiltrating macrophages, with a distinct pro-resolving signature observed in Ly6Clo macrophages. RNA sequencing of macrophages stimulated with resolvin D2 showed similarities to transcriptional changes found during the temporal transition from Ly6Chi macrophage to Ly6Clo macrophage. In vivo, resolvin D2 increased Ly6Clo macrophages and functional improvement of the regenerating muscle. These results reveal dynamic lipid mediator signatures of innate immune cells and provide a proof of concept for their exploitable effector roles in muscle regeneration.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nature Immunology. - 20 : 5 (2019), p. 626-636. -
További szerzők:Sansbury, Brian E. Patsalos, Andreas Hays, Tristan T. Riley, Colin O. Han, Xianlin Spite, Matthew Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:OTKA-116855
OTKA
K124298
OTKA
KH126885
OTKA
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
GINOP-2.1.7-15-2016-01487
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM077627
035-os BibID:(WoS)000467964800013 (Scopus)85064477457
Első szerző:Horváth Attila (programtervező informatikus)
Cím:Labelled regulatory elements are pervasive features of the macrophage genome and are dynamically utilized by classical and alternative polarization signals / Attila Horvath, Bence Daniel, Lajos Szeles, Ixchelt Cuaranta-Monroy, Zsolt Czimmerer, Lilla Ozgyin, Laszlo Steiner, Mate Kiss, Zoltan Simandi, Szilard Poliska, Nikolas Giannakis, Emanuele Raineri, Ivo G. Gut, Benedek Nagy, Laszlo Nagy
Dátum:2019
ISSN:0305-1048 1362-4962
Megjegyzések:The concept of tissue-specific gene expression posits that lineage-determining transcription factors (LDTFs) determine the open chromatin profile of a cell via collaborative binding, providing molecular beacons to signal-dependent transcription factors (SDTFs). However, the guiding principles of LDTF binding, chromatin accessibility and enhancer activity have not yet been systematically evaluated. We sought to study these features of the macrophage genome by the combination of experimental (ChIP-seq, ATAC-seq and GRO-seq) and computational approaches. We show that Random Forest and Support Vector Regression machine learning methods can accurately predict chromatin accessibility using the binding patterns of the LDTF PU.1 and four other key TFs of macrophages (IRF8, JUNB, CEBPA and RUNX1). Any of these TFs alone were not sufficient to predict open chromatin, indicating that TF binding is widespread at closed or weakly opened chromatin regions. Analysis of the PU.1 cistrome revealed that two-thirds of PU.1 binding occurs at low accessible chromatin. We termed these sites labelled regulatory elements (LREs), which may represent a dormant state of a future enhancer and contribute to macrophage cellular plasticity. Collectively, our work demonstrates the existence of LREs occupied by various key TFs, regulating specific gene expression programs triggered by divergent macrophage polarizing stimuli.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 47 : 6 (2019), p. 2778-2792. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Széles Lajos (1971-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Ozgyin Lilla (1989-) (molekuláris biológus) Steiner László Kiss Máté Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Giannakis, Nikolas Raineri, Emanuele Gut, Ivo G. Nagy Benedek (1973-) (informatikus, matematikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:NKFIH K116855
NKFIH
NKFIH K124298
NKFIH
NKFIH KH126885
NKFIH
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
GINOP-2.1.7-15-2016-01487
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM082549
035-os BibID:(PMID)31405954
Első szerző:Patsalos, Andreas
Cím:The BACH1-HMOX1 Regulatory Axis Is Indispensable for Proper Macrophage Subtype Specification and Skeletal Muscle Regeneration / Andreas Patsalos, Petros Tzerpos, Laszlo Halasz, Gergely Nagy, Attila Pap, Nikolas Giannakis, Konstantina Lyroni, Vasiliki Koliaraki, Eva Pintye, Balazs Dezso, George Kollias, Charalampos G. Spilianakis, Laszlo Nagy
Dátum:2019
ISSN:0022-1767 1550-6606
Megjegyzések:The infiltration and subsequent in situ subtype specification of monocytes to effector/inflammatory and repair macrophages is indispensable for tissue repair upon acute sterile injury. However, the chromatin-level mediators and regulatory events controlling this highly dynamic macrophage phenotype switch are not known. In this study, we used a murine acute muscle injury model to assess global chromatin accessibility and gene expression dynamics in infiltrating macrophages during sterile physiological inflammation and tissue regeneration. We identified a heme-binding transcriptional repressor, BACH1, as a novel regulator of this process. Bach1 knockout mice displayed impaired muscle regeneration, altered dynamics of the macrophage phenotype transition, and transcriptional deregulation of key inflammatory and repair-related genes. We also found that BACH1 directly binds to and regulates distal regulatory elements of these genes, suggesting a novel role for BACH1 in controlling a broad spectrum of the repair response genes in macrophages upon injury. Inactivation of heme oxygenase-1 (Hmox1), one of the most stringently deregulated genes in the Bach1 knockout in macrophages, impairs muscle regeneration by changing the dynamics of the macrophage phenotype switch. Collectively, our data suggest the existence of a heme-BACH1--HMOX1 regulatory axis, that controls the phenotype and function of the infiltrating myeloid cells upon tissue damage, shaping the overall tissue repair kinetics.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Immunology. - 203 : 6 (2019), p. 1532-1547. -
További szerzők:Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Pap Attila (1980-) (biológus) Giannakis, Nikolas Lyroni, Konstantina Koliaraki, Vasiliki Pintye Éva (1955-) (fizikus) Dezső Balázs (1951-) (pathológus) Kollias, George Spilianakis, Charalampos G. Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:124298
OTKA
126885
OTKA
KKP129909
OTKA
20428-3/2018/FEKUTSTRAT
FIKP
Horizon2020 GA: 622934
Egyéb
PD124843
OTKA
"Nuclear Receptor-Network" Consortium Grant PITN-GA-2013-606806
FP7
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM088311
035-os BibID:(WoS)000546764000010 (Scopus)85087097446
Első szerző:Sansbury, Brian E.
Cím:Myeloid ALX/FPR2 regulates vascularization following tissue injury / Brian E. Sansbury, Xiaofeng Li, Blenda Wong, Andreas Patsalos, Nikolas Giannakis, Michael J. Zhang, Laszlo Nagy, Matthew Spite
Dátum:2020
ISSN:0027-8424 1091-6490
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States Of America. - 117 : 25 (2020), p. 14354-14364. -
További szerzők:Li, Xiaofeng Wong, Blenda Patsalos, Andreas Giannakis, Nikolas Zhang, Michael Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Spite, Matthew
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.