CCL

Összesen 8 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM086696
035-os BibID:(WoS)000553333300022 (Scopus)85088493600
Első szerző:Fadel, Lina (gyógyszerész)
Cím:Agonist binding directs dynamic competition among nuclear receptors for heterodimerization with retinoid X receptor / Lina Fadel, Bálint Rehó, Julianna Volkó, Dóra Bojcsuk, Zsuzsanna Kolostyák, Gergely Nagy, Gabriele Müller, Zoltán Simándi, Éva Hegedüs, Gábor Szabó, Katalin Tóth, Laszlo Nagy, György Vámosi
Dátum:2020
ISSN:0021-9258 1083-351X
Megjegyzések:Retinoid X receptor (RXR) plays a pivotal role as a transcriptional regulator and serves as an obligatory heterodimerization partner for at least 20 other nuclear receptors (NRs). Given a potentially limiting/sequestered pool of RXR and simultaneous expression of several RXR partners, we hypothesized that NRs compete for binding to RXR and that this competition may be directed by specific agonist treatment. Here, we tested this hypothesis on three NRs: peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ), vitamin D receptor (VDR), and retinoic acid receptor α (RARα). Evaluation of competition relied on a nuclear-translocation assay applied in a three-color imaging model system by detecting changes in heterodimerization between RXRα and one of its partners (NR1), in the presence of another competing partner (NR2). Our results indicated dynamic competition between the NRs governed by two mechanisms. First, in the absence of agonist treatment, there is a hierarchy of affinities between RXRα and its partners in the following order: RARα>PPARγ>VDR. Second, upon agonist treatment, RXRα favors the liganded partner. We conclude that recruiting RXRα by the liganded NR not only facilitates a stimulus-specific cellular response, but might also impede other NR pathways involving RXRα.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Biological Chemistry. - 295 : 29 (2020), p. 10045-10061. -
További szerzők:Rehó Bálint (1992-) Volkó Julianna (1983-) (biotechnológus) Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Kolostyák Zsuzsanna Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Müller, Gabriele Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus) Tóth Katalin Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:NKFIH NN129371
egyéb
NKFIH KKP129909
egyéb
NKFIH K124298
egyéb
GINOP-2.3.2-15-2016-00050
GINOP
GINOP-2.3.3-15-2016-00003
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM072900
035-os BibID:(Cikkazonosító)12734 (WOS)000412491500006 (Scopus)85030764085
Első szerző:Imre László (biológus)
Cím:Nucleosome stability measured in situ by automated quantitative imaging / László Imre, Zoltán Simándi, Attila Horvath, György Fenyofalvi, Péter Nanasi Jr., Erfaneh Firouzi Niaki, Éva Hegedus, Zsolt Bacso, Urbain Weyemi, Rebekka Mauser, Juan Ausio, Albert Jeltsch, William Bonner, László Nagy, Hiroshi Kimura, Gábor Szabo
Dátum:2017
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Current approaches have limitations in providing insight into the functional properties of particular nucleosomes in their native molecular environment. Here we describe a simple and powerful method involving elution of histones using intercalators or salt, to assess stability features dependent on DNA superhelicity and relying mainly on electrostatic interactions, respectively, and measurement of the fraction of histones remaining chromatin-bound in the individual nuclei using histone type- or posttranslational modification- (PTM-) specific antibodies and automated, quantitative imaging. The method has been validated in H3K4me3 ChIP-seq experiments, by the quantitative assessment of chromatin loop relaxation required for nucleosomal destabilization, and by comparative analyses of the intercalator and salt induced release from the nucleosomes of different histones. The accuracy of the assay allowed us to observe examples of strict association between nucleosome stability and PTMs across cell types, differentiation state and throughout the cell-cycle in close to native chromatin context, and resolve ambiguities regarding the destabilizing effect of H2A.X phosphorylation. The advantages of the in situ measuring scenario are demonstrated via the marked effect of DNA nicking on histone eviction that underscores the powerful potential of topological relaxation in the epigenetic regulation of DNA accessibility.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Fluorescence imaging
Nuclear organization
Epigenetics
Molekuláris Medicina
Megjelenés:Scientific Reports. - 7 : 1 (2017), p. 1-15. -
További szerzők:Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Fenyőfalvi György Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Firouzi Niaki, Erfaneh Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Weyemi, Urbain Mauser, Rebekka Ausio, Juan Jeltsch, Albert Bonner, William Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Kimura, Hiroshi Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:K72762
OTKA
NK101337
OTKA
TÁMOP-4.2.2-08/1-2008-0015
TÁMOP
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
I. ABC transzporterek; II. Magasabbrendű kromatinszerkezet
TÁMOP 4.2.2.A- 11/1/KONV-2012-0023 "VÉD-ELEM
TÁMOP
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM085444
Első szerző:Nánási Péter Pál (élettanász)
Cím:Breaking good : +1 nucleosome destabilizationby nicking / P. Nanasi, L. Imre, A. Horvath, L. Halasz, A. Szanto, H. Kimura, Székvölgyi Lóránt, L. Nagy, G. Szabo
Dátum:2017
ISSN:1742-464X
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idézhető absztrakt
folyóiratcikk
Megjelenés:Febs Journal. - 284 : Suppl. 1 (2017), p. 221. -
További szerzők:Imre László (1979-) (biológus) Horváth Attila (orvos) Halász László (1989-) (molekuláris biológus) Szántó Attila (1976-) (orvos, biokémikus) Kimura, Hiroshi Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:72762
OTKA
101337
OTKA
4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023
TÁMOP
4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM055639
035-os BibID:(scopus)84923228096 (wos)000349849000009
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:PRMT1 and PRMT8 regulate retinoic acid-dependent neuronal differentiation with implications to neuropathology / Zoltan Simandi, Erik Czipa, Attila Horvath, Aron Koszeghy, Csilla Bordas, Szilárd Póliska, István Juhász, László Imre, Gábor Szabó, Balazs Dezso, Endre Barta, Sascha Sauer, Katalin Karolyi, Ilona Kovacs, Gábor Hutóczky, László Bognár, Álmos Klekner, Peter Szucs, Bálint L. Bálint, Laszlo Nagy
Dátum:2015
ISSN:1066-5099
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
stem cells
neuronal differentiation
retinoic acid
PRMT1
PRMT8
Megjelenés:Stem Cells. - 33 : 3 (2015), p. 726-741. -
További szerzők:Czipa Erik (1990-) (molekuláris biológus, bioinformatikus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Kőszeghy Áron (1983-) (Ph.D hallgató, élettanász) Bordás Csilla Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Juhász István (1956-) (bőrgyógyász, bőrsebész, kozmetológus, klinikai onkológus) Imre László (1979-) (biológus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus) Dezső Balázs (1951-) (pathológus) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Sauer, Sascha Károlyi Katalin Kovács Ilona (1965-) (patológus) Hutóczki Gábor (1983-) (Ph.D. hallgató) Bognár László (1958-) (idegsebész, gyermekidegsebész) Klekner Álmos (1970-) (idegsebész) Szűcs Péter (1974-) (kutatóorvos) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024
TÁMOP
Molekuláris Sejt- és Immunbiológiai Doktori Iskola
TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001/A2-JADJ-13
TÁMOP
F68254
OTKA
TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM048379
035-os BibID:(dekdb) bibKLT00349891
Első szerző:Szabó Gábor (biofizikus)
Cím:A sejt legfontosabb anyagi összetevői és alapvető molekuláris mechanizmusai. A sejtbiológia molekuláris biológiai eszköztára / Szabó Gábor, Nagy László
Dátum:2004
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok könyvfejezet
Sejttan
Sejtélettan
Megjelenés:Sejtbiológia / szerk Szabó Gábor. - p. 63-74
További szerzők:Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM040294
035-os BibID:(scopus)33750011602 (wos)000241117100006
Első szerző:Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:Chip-on-beads : flow-cytometric evaluation of chromatin immunoprecipitation / Székvölgyi L., Bálint B. L., Imre L., Goda K., Szabó M., Nagy L., Szabó G.
Dátum:2006
ISSN:1552-4922
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Cytometry. Part A. - 69A : 10 (2006), p. 1086-1091. -
További szerzők:Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Imre László (1979-) (biológus) Goda Katalin (1969-) (biofizikus) Szabó Miklós (vegyészmérnök) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM001049
035-os BibID:(scopus)35448970162 (wos)000249715100018
Első szerző:Székvölgyi Lóránt (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Cím:Ribonucleoprotein-masked nicks at 50-kbp intervals in the eukaryotic genomic DNA / Lóránt Székvölgyi, Zsuzsa Rákosy, Bálint L. Bálint, Endre Kókai, László Imre, György Vereb, Zsolt Bacsó, Katalin Goda, Sándor Varga, Margit Balázs, Viktor Dombrádi, László Nagy, Gábor Szabó
Dátum:2007
Megjegyzések:By using a microscopic approach, field inversion single-cell gel electrophoresis, we show that preformed single-strand discontinuities are present in the chromatin of resting and proliferating mammalian and yeast cells. These single-strand breaks are primarily nicks positioned at approximately 50-kbp intervals throughout the entire genome that could be efficiently labeled in situ by DNA polymerase I holoenzyme but not by Klenow fragment and terminal transferase unless after ribonucleolytic treatments. The RNA molecules involved appear to comprise R-loops, recognized by the S9.6 RNA/DNA hybrid-specific antibody. By using the breakpoint cluster region of the Mixed Lineage Leukemia (MLL) gene as a model, we have found that the number of manifest nicks detected by FISH performed after field inversion single-cell gel electrophoresis depends on epigenetic context, but the difference between germ-line and translocated MLL alleles is abolished by protease treatment. Our data imply that the double-stranded genomic DNA is composed of contiguous rather than continuous single strands and reveal an aspect of higher-order chromatin organization with ribonucleoprotein-associated persistent nicks defining approximately 50-kbp domains.
Tárgyszavak:Orvostudományok Természettudományok Elméleti orvostudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
chromatin loop
RNA/DNA hybrid
translocation
Megjelenés:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 104 : 38 (2007), p. 14964-14969. -
További szerzők:Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Kókai Endre (1971-) (biokémikus, biológus) Imre László (1979-) (biológus) Vereb György (1965-) (biofizikus, orvos) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Goda Katalin (1969-) (biofizikus) Varga Sándor (1943-) (biofizikus) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Dombrádi Viktor (1953-) (biokémikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM067230
035-os BibID:(Cikkazonosító)41376 (WOS)000393137000001 (Scopus)85011264087
Első szerző:Tarapcsák Szabolcs (Molekuláris biológus)
Cím:Interactions of retinoids with the ABC transporters P-glycoprotein and Breast Cancer Resistance Protein / Szabolcs Tarapcsák, Gábor Szalóki, Ágnes Telbisz, Zsuzsanna Gyöngy, Krisztina Matúz, Éva Csősz, Péter Nagy, Imre J. Holb, Ralph Rühl, László Nagy, Gábor Szabó, Goda Katalin
Dátum:2017
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Retinoids - derivatives of vitamin A - are important cell permeant signaling molecules that regulate gene expression through activation of nuclear receptors. P-glycoprotein (Pgp) and ABCG2 are plasma membrane efflux transporters affecting the tissue distribution of numerous structurally unrelated lipophilic compounds. In the present work we aimed to study the interaction of the above ABC transporters with retinoid derivatives. We have found that 13-cis-retinoic acid, retinol and retinyl-acetate inhibited the Pgp and ABCG2 mediated substrate transport as well as the substrate stimulated ATPase activity of these transporters. Interestingly, 9-cis-retinoic acid and ATRA (all-trans retinoic acid), both are stereoisomers of 13-cis-retinoic acid, did not have any effect on the transporters' activity. Our fluorescence anisotropy measurements revealed that 13-cis-retinoic acid, retinol and retinyl-acetate selectively increase the viscosity and packing density of the membrane. Thus, the mixed-type inhibition of both transporters by retinol and ABCG2 by 13-cis-retinoic acid may be the collective result of direct interactions of these retinoids with the substrate binding site(s) and of indirect interactions mediated by their membrane rigidifying effects.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
retinoid derivatives
P-glycoprotein
ABCG2
ABC transporter
membrane fluidity
intramembrane localization
Megjelenés:Scientific Reports. - 7 : 41376 (2017), p. 1-31. -
További szerzők:Szalóki Gábor (1986-) (molekuláris biológus) Telbisz Ágnes Gyöngy Zsuzsanna (1991-) (molekuláris biológus) Matúz Krisztina (1980-) (vegyész, biokémikus) Csősz Éva (1977-) (biokémikus, molekuláris biológus) Nagy Péter (1971-) (biofizikus) Holb Imre (1973-) (agrármérnök) Rühl, Ralph (1969-) (vegyész) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus) Goda Katalin (1969-) (biofizikus)
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1