CCL

Összesen 9 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM060807
Első szerző:Antcheva, Nikolinka
Cím:Proteins of circularly permuted sequence present within the same organism: The major serine proteinase inhibitor from Capsicum annuum seeds / Nikolinka Antcheva, Alessandro Pintar, András Patthy, András Simoncsits, Endre Barta, Bojidar Tchorbanov, Sándor Pongor
Dátum:2001
ISSN:0961-8368
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Protein chemistry
protein structure
proteinase inhibitors
evolution
Megjelenés:Protein Science. - 10 (2001), p. 2280-2290. -
További szerzők:Pintar, Alessandro Patthy András Simoncsits András Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Tchorbanov, Bojidar Pongor Sándor
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM060812
Első szerző:Barta Endre (molekuláris biológus)
Cím:IS: a web-site for intron statistics / Endre Barta, Laszló Kaján, Sandor Pongor
Dátum:2003
ISSN:1367-4803
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Bioinformatics. - 19 : 4 (2003), p. 543. -
További szerzők:Kaján László Pongor Sándor
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM060811
Első szerző:Barta Endre (molekuláris biológus)
Cím:Repeats with variations : accelerated evolution of the Pin2 family of proteinase inhibitors / Endre Barta, Alessandro Pintar, Sándor Pongor
Dátum:2002
ISSN:0168-9525
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Trends In Genetics. - 18 : 12 (2002), p. 600-603. -
További szerzők:Pintar, Alessandro Pongor Sándor
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM060805
Első szerző:Murvai János
Cím:The SBASE protein domain library, release 6.0 : a collection of annoted protein sequence segments / János Murvai, Kristian Vlahovicek, Endre Barta, Csaba Szepesvári, Cristina Acatrinei, Sándor Pongor
Dátum:1999
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 27 (1999), p. 257-259. -
További szerzők:Vlahovicek, Kristian Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Szepesvári Csaba Acatrinei, Cristina Pongor Sándor
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM060806
Első szerző:Murvai János
Cím:The SBASE protein domain library, release 7.0 : a collection of annoted protein sequence segments / János Murvai, Kristian Vlahovicek, Endre Barta, Bruno Cataletto, Sándor Pongor
Dátum:2000
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 28 : 1 (2000), p. 260-262. -
További szerzők:Vlahovicek, Kristian Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Cataletto, Bruno Pongor Sándor
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM060802
Első szerző:Murvai János
Cím:The domain-server : direct prediction of protein domain-homologies from BLAST search / János Murvai, Kristian Vlahovicek, Endre Barta, Subbiah Parthasarathy, Hedvig Hegyi, Friedhelm Pfeiffer, Sándor Pongor
Dátum:1999
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Bioinformatics Applications Note. - 15 : 4 (1999), p. 343-344. -
További szerzők:Vlahovicek, Kristian Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Parthasarathy, Subbiah Hegyi Hedvig Pfeiffer, Friedhelm Pongor Sándor
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM060808
Első szerző:Murvai János
Cím:The SBASE protein domain library, release 8.0: a collection of annoted protein sequence segments / János Murvai, Kristian Vlahovicek, Endre Barta, Sándor Pongor
Dátum:2001
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 29 : 1 (2001), p. 58-60. -
További szerzők:Vlahovicek, Kristian Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Pongor Sándor
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM065115
Első szerző:Nagy Gergely (molekuláris biológus)
Cím:Motif oriented high-resolution analysis of ChIP-seq data reveals the topological order of CTCF and cohesin proteins on DNA / Gergely Nagy, Erik Czipa, László Steiner, Tibor Nagy, Sándor Pongor, László Nagy, Endre Barta
Dátum:2016
ISSN:1471-2164
Megjegyzések:BACKGROUND:ChIP-seq provides a wealth of information on the approximate location of DNA-binding proteins genome-wide. It is known that the targeted motifs in most cases can be found at the peak centers. A high resolution mapping of ChIP-seq peaks could in principle allow the fine mapping of the protein constituents within protein complexes, but the current ChIP-seq analysis pipelines do not target the basepair resolution strand specific mapping of peak summits.RESULTS:The approach proposed here is based on i) locating regions that are bound by a sufficient number of proteins constituting a complex; ii) determining the position of the underlying motif using either a direct or a de novo motif search approach; and iii) determining the exact location of the peak summits with respect to the binding motif in a strand specific manner. We applied this method for analyzing the CTCF/cohesin complex, which holds together DNA loops. The relative positions of the constituents of the complex were determined with one-basepair estimated accuracy. Mapping the positions on a 3D model of DNA made it possible to deduce the approximate local topology of the complex that allowed us to predict how the CTCF/cohesin complex locks the DNA loops. As the positioning of the proteins was not compatible with previous models of loop closure, we proposed a plausible "double embrace" model in which the DNA loop is held together by two adjacent cohesin rings in such a way that the ring anchored by CTCF to one DNA duplex encircles the other DNA double helix and vice versa.CONCLUSIONS:A motif-centered, strand specific analysis of ChIP-seq data improves the accuracy of determining peak positions. If a genome contains a large number of binding sites for a given protein complex, such as transcription factor heterodimers or transcription factor/cofactor complexes, the relative position of the constituent proteins on the DNA can be established with an accuracy that allow one to deduce the local topology of the protein complex. The proposed high resolution mapping approach of ChIP-seq data is applicable for detecting the contact topology of DNA-binding protein complexes.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
CTCF
DNA loop
cohesin
ChIP-seq
Megjelenés:BMC Genomics. - 17 : 637 (2016), p. 1-9. -
További szerzők:Czipa Erik (1990-) (molekuláris biológus, bioinformatikus) Steiner László Nagy Tibor (Gödöllő) Pongor Sándor Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.2.C-11/1/KONV-2012-0010
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM060810
Első szerző:Vlahovicek, Kristian
Cím:The SBASE protein domain library, releasr 9.0 : an online resource for protein domain identification / Kristian Vlahovicek, János Murvai, Endre Barta, Sándor Pongor
Dátum:2002
ISSN:0305-1048 1362-4962
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Nucleic Acids Research. - 30 : 1 (2002), p. 273-275. -
További szerzők:Murvai János Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Pongor Sándor
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.