CCL

Összesen 2 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM054433
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The active enhancer network operated by liganded RXR supports angiogenic activity in macrophages / Bence Daniel, Gergely Nagy, Nasun Hah, Attila Horvath, Zsolt Czimmerer, Szilard Poliska, Tibor Gyuris, Jiri Keirsse, Conny Gysemans, Jo A. Van Ginderachter, Balint L. Balint, Ronald M. Evans, Endre Barta, Laszlo Nagy
Dátum:2014
ISSN:0890-9369
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Genes & Development. - 28 : 14 (2014), p. 1562-1577. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Hah, Nasun Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Gyuris Tibor Keirsse, Jiri Gysemans, Conny Van Ginderachter, Jo A. Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Evans, Ronald M. Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM049597
035-os BibID:PMID:23973299 WOS:000325840200014
Első szerző:Nagy Gergely (molekuláris biológus)
Cím:A novel method to predict regulatory regions based on histone mark landscapes in macrophages / Gergely Nagy, Bence Dániel, Dávid Jónás, László Nagy, Endre Barta
Dátum:2013
ISSN:0171-2985
Megjegyzések:Macrophages as phagocytes and professional antigen presenting cells play critical roles in both innate and adaptive immunity. Main transcription factors acting during their differentiation and function are known, but the behavior and co-operation of these factors still remained unexplored. We introduce a new approach to map nucleosome-free regions using exclusively active enhancer and core promoter marking histone modification ChIP-seq data. We could detect approximately 56,000 potential active enhancers/promoters showing different lengths and histone modification shapes. Beside the highly enriched PU.1 and C/EBP sites, we could also detect binding sites for RUNX and AP-1, as well as for the MiT (MITF-TFE) family and MEF2 proteins. The PU.1 and C/EBP transcription factors are known for transforming cells into macrophages. The other transcription factors found in this study can play a role in macrophages as well, since it is known that the MiT family proteins are responsible for phagocytic activity and the MEF2 proteins specify monocytic differentiation over the granulocyte direction. Our results imply that this method can provide novel information about transcription factor organization at enhancers and core promoters as well as about the histone modifications surrounding regulatory regions in any immune or other cell types.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
BWA
Burrows-Wheeler Alignment Tool
CRE
ChIP
DMEM
Dulbecco's modified Eagle's medium
ENCODE
Enhancer
FAIRE
HLH
HOMER
HTH
Histone modification
IGV
Macrophage
NFR
NOR
Nucleosome-free region
PU.1
Promoter
SRA
TSS
bZIP
basic leucine zipper
cAMP response element
chromatin immunoprecipitation
encyclopedia of DNA elements
formaldehyde-assisted isolation of regulatory elements
helix-loop-helix
helix-turn-helix
hypergeometric optimization of motif EnRichment
integrative genomics viewer
nucleosome occupied region
nucleosome-free region
sequence read archive
transcription start site
Megjelenés:Immunobiology. - 218 : 11 (2013), p. 1416-1427. -
További szerzők:Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Jonás Dávid Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
TÁMOP422_2012_002
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1