Magyar
Toggle navigation
Tudóstér
Magyar
Tudóstér
Keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Egyszerű keresés
Összetett keresés
CCL keresés
Böngészés
Saját polc tartalma
(
0
)
Korábbi keresések
CCL parancs
CCL
Összesen 2 találat.
#/oldal:
12
36
60
120
Rövid
Hosszú
MARC
Részletezés:
Rendezés:
Szerző növekvő
Szerző csökkenő
Cím növekvő
Cím csökkenő
Dátum növekvő
Dátum csökkenő
1.
001-es BibID:
BIBFORM082083
035-os BibID:
(cikkazonosító)baz141 (WoS)000521180700001 (Scopus)85077942032
Első szerző:
Czipa Erik (molekuláris biológus, bioinformatikus)
Cím:
ChIPSummitDB : a ChIP-seq based database of human transcription factor binding sites and the topological arrangements of the proteins bound to them / Czipa Erik, Schiller Mátyás, Nagy Tibor, Kontra Levente, Steiner László, Koller Júlia, Pálné Szén Orsolya, Barta Endre
Dátum:
2020
ISSN:
1758-0463
Megjegyzések:
ChIP-Seq reveals genomic regions where proteins, e.g. transcription factors (TFs) interact with DNA. A substantial fraction of these regions, however, do not contain the cognate binding site for the TF of interest. This phenomenon might be explained by protein-protein interactions and co-precipitation of interacting gene regulatory elements. We uniformly processed 3,727 human ChIP-Seq data sets and determined the cistrome of 292 TFs, as well as the distances between the TF binding motif centers and the ChIP-Seq peak summits. ChIPSummitDB enables the analysis of ChIP-Seq data using multiple approaches. The 292 cistromes and corresponding ChIP-Seq peak sets can be browsed in GenomeView. Overlapping SNPs can be inspected in dbSNPView. Most importantly, the MotifView and PairShiftView pages show the average distance between motif centers and overlapping ChIP-Seq peak summits and distance distributions thereof, respectively. In addition to providing a comprehensive human TF binding site collection, the ChIPSummitDB database and web interface allows for the examination of the topological arrangement of TF complexes genome-wide. ChIPSummitDB is freely accessible at http://summit.med.unideb.hu/summitdb/. The database will be regularly updated and extended with the newly available human and mouse ChIP-Seq data sets.
Tárgyszavak:
Orvostudományok
Elméleti orvostudományok
idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
ChIP-seq
database
Transcription factor binding site
peak summit
Megjelenés:
Database - The Journal of Biological Databases and Curation. - 2020 (2020), p. 1-12. -
További szerzők:
Schiller Mátyás
Nagy Tibor (orvos)
Kontra Levente
Steiner László
Koller Júlia
Pálné Szén Orsolya
Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus)
Pályázati támogatás:
GINOP-2.3.2-15-2016-00044
GINOP
20428-3_2018_FELITSTRAT
FIKP
2017-1.3.1-vke-2017-00026
Egyéb
Internet cím:
Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
2.
001-es BibID:
BIBFORM112702
Első szerző:
Nagy Tibor (Gödöllő)
Cím:
The golden jackal (Canis aureus) reference genome assembly and annotation / Tibor Nagy, Erika Csányi, Maher Alnajjar, Péter Fehér, Nóra Ninausz, Orsolya Feró, Morten Skage, Spyridon Kollias, Zsófia Fekete, Levente Kontra, Gyula Sándor, Miklós Heltai, Lóránt Székvölgyi, Viktor Stéger and Endre Barta
Dátum:
2022
Tárgyszavak:
Természettudományok
Biológiai tudományok
tanulmány, értekezés
könyvrészlet
Megjelenés:
3rd International Jackal Symposium 02-04. November 2022. Gödöllő, Hungary : Abstract Book / ed. Miklós Heltai. - p. 61. -
További szerzők:
Csányi Erika
Alnajjar, Maher
Fehér Péter
Ninausz Nóra
Feró Orsolya
Skage, Morten
Kollias, Spyridon
Fekete Zsófia
Kontra Levente
Sándor Gyula
Heltai Miklós
Székvölgyi Lóránt (1977-) (biofizikus, biokémikus, sejtbiológus)
Stéger Viktor
Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus)
Internet cím:
Szerző által megadott URL
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:
Rekordok letöltése
1
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27
© 2023
Monguz kft.
Minden jog fenntartva.