CCL

Összesen 7 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM051501
035-os BibID:(cikkazonosító)e55168 (WoS)000314610600070 (Scopus)84873137070
Első szerző:Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:A versatile method to design stem-loop primer-based quantitative PCR assays for detecting small regulatory RNA molecules / Zsolt Czimmerer, Julianna Hulvely, Zoltan Simandi, Eva Varallyay, Zoltan Havelda, Erzsebet Szabo, Attila Varga, Balazs Dezso, Maria Balogh, Attila Horvath, Balint Domokos, Zsolt Torok, Laszlo Nagy, Balint L. Balint
Dátum:2013
ISSN:1932-6203
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:PLoS One. - 8 : 1 (2013), p. 1-10. -
További szerzők:Hulvely Julianna Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Varallyay Éva Havelda Zoltán Szabó Erzsébet (1973-) (molekuláris biológus) Varga Attila (Astrid Research Ltd. Debrecen) Dezső Balázs (1951-) (pathológus) Balogh Mária Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Domokos Bálint (1974-) (programtervező matematikus) Török Zsolt (1975-) (orvos) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM075746
035-os BibID:(WoS)000447386700009 (Scopus)85054182103
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The Nuclear Receptor PPAR[gamma] Controls Progressive Macrophage Polarization as a Ligand-Insensitive Epigenomic Ratchet of Transcriptional Memory / Daniel Bence, Nagy Gergely, Czimmerer Zsolt, Horvath Attila, Hammers David W., Cuaranta-Monroy Ixchelt, Poliska Szilard, Tzerpos Petros, Kolostyak Zsuzsanna, Hays Tristan T., Patsalos Andreas, Houtman René, Sauer Sascha, Francois-Deleuze Jean, Rastinejad Fraydoon, Balint Balint L., Sweeney H. Lee, Nagy Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1074-7613
Tárgyszavak:idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Immunity. - 49 : 4 (2018), p. 615-626. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Hammers, David W. Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Tzerpos, Petros (1982-) (molekuláris biológus) Kolostyák Zsuzsanna Hays, Tristan T. Patsalos, Andreas Houtman, René Sauer, Sascha Francois-Deleuze, Jean Rastinejad, Fraydoon Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Sweeney, H. Lee Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K124298
OTKA
K126885
OTKA
K116855
OTKA
PD124843
OTKA
GINOP-2.3.2-15-2016-00006
GINOP
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM054433
Első szerző:Dániel Bence (molekuláris biológus)
Cím:The active enhancer network operated by liganded RXR supports angiogenic activity in macrophages / Bence Daniel, Gergely Nagy, Nasun Hah, Attila Horvath, Zsolt Czimmerer, Szilard Poliska, Tibor Gyuris, Jiri Keirsse, Conny Gysemans, Jo A. Van Ginderachter, Balint L. Balint, Ronald M. Evans, Endre Barta, Laszlo Nagy
Dátum:2014
ISSN:0890-9369
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Genes & Development. - 28 : 14 (2014), p. 1562-1577. -
További szerzők:Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Hah, Nasun Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Gyuris Tibor Keirsse, Jiri Gysemans, Conny Van Ginderachter, Jo A. Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Evans, Ronald M. Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM054857
Első szerző:Gyöngyösi Adrienn (biológus)
Cím:Measuring expression levels of small regulatory RNA molecules from body fluids and formalin-fixed, paraffin-embedded samples / Adrienn Gyongyosi, Otto Docs, Zsolt Czimmerer, Laszlo Orosz, Attila Horvath, Olga Török, Gabor Mehes, Laszlo Nagy, Balint L. Balint
Dátum:2014
Megjegyzések:MicroRNAs are involved in the regulation of various pathophysiological processes such as immune regulation and cancer. Next-generation sequencing methods enable us to monitor their presence in various types of samples but we need flexible methods for validating datasets generated by high-throughput methods. Here we describe the detailed protocols to be used with our MiRNA Primer Design Tool assay design system. The presented methods allow the flexible design of the oligonucleotides needed for the RT-qPCR detection of any variant of small regulatory RNA molecules from virtually any species. This method can be used to measure miRNA levels from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) samples and various body fluids. As an example, we show the results of the hsa-miR-515-3p, hsa-miR-325, and hsa-miR-155 quantification using a specific UPL probe (Universal Probe Library) and a stem-loop RT-qPCR assay. The small nucleolar RNA RNU43 is used as endogenous control for normalization of the results. Urine from healthy pregnant women and FFPE samples from patients diagnosed with colorectal cancer and treated with antibody-based anti-EGFR monotherapy were used as samples.
ISBN:978-1-4939-1061-8 (Print) 978-1-4939-1062-5 (Online)
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok könyvfejezet
miRNS
FFPE
Megjelenés:RNA Mapping : Methods and Protocols / ed. M. Lucrecia Alvarez, Mahtab Nourbakhsh. - p. 105-119. -
További szerzők:Dócs Ottó Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Orosz László (1984-) (szülész-nőgyógyász) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Török Olga (1956-) (szülész-nőgyógyász, humángenetikus) Méhes Gábor (1966-) (patológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM077785
035-os BibID:(Cikkazonosító)4889 (WOS)000461762600006 (Scopus)85063344159
Első szerző:Ozgyin Lilla (molekuláris biológus)
Cím:Extensive epigenetic and transcriptomic variability between genetically identical human B-lymphoblastoid cells with implications in pharmacogenomics research / Lilla Ozgyin, Attila Horvath, Zsuzsanna Hevessy, Balint L. Balint
Dátum:2019
ISSN:2045-2322
Megjegyzések:Genotyped human B-lymphoblastoid cell lines (LCLs) are widely used models in mapping quantitative trait loci for chromatin features, gene expression, and drug response. The extent of genotype-independent functional genomic variability of the LCL model, although largely overlooked, may inform association study design. In this study, we use flow cytometry, chromatin immunoprecipitation sequencing and mRNA sequencing to study surface marker patterns, quantify genome-wide chromatin changes (H3K27ac) and transcriptome variability, respectively, among five isogenic LCLs derived from the same individual. Most of the studied LCLs were non-monoclonal and had mature B cell phenotypes. Strikingly, nearly one-fourth of active gene regulatory regions showed significantly variable H3K27ac levels, especially enhancers, among which several were classified as clustered enhancers. Large, contiguous genomic regions showed signs of coordinated activity change. Regulatory differences were mirrored by mRNA expression changes, preferentially affecting hundreds of genes involved in specialized cellular processes including immune and drug response pathways. Differential expression of DPYD, an enzyme involved in 5-fluorouracil (5-FU) catabolism, was associated with variable LCL growth inhibition mediated by 5-FU. The extent of genotype-independent functional genomic variability might highlight the need to revisit study design strategies for LCLs in pharmacogenomics.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Scientific Reports. - 9 (2019), p. 1-16. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Hevessy Zsuzsanna (1966-) (laboratóriumi szakorvos) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Pályázati támogatás:GINOP-2.3.3-15-2016-00007
GINOP
EFOP-3.6.1-16-2016-00022
EFOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM074593
Első szerző:Ozgyin Lilla (molekuláris biológus)
Cím:Lyophilized human cells stored at room temperature preserve multiple RNA species at excellent quality for RNA sequencing / Ozgyin Lilla, Horvath Attila, Balint Balint Laszlo
Dátum:2018
ISSN:1949-2553
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
liofilizálás
fagyasztva-szárítás
RNS
Megjelenés:Oncotarget. - 9 : 59 (2018), p. 31312-31329. -
További szerzők:Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos)
Pályázati támogatás:TAMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM055639
035-os BibID:(scopus)84923228096 (wos)000349849000009
Első szerző:Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:PRMT1 and PRMT8 regulate retinoic acid-dependent neuronal differentiation with implications to neuropathology / Zoltan Simandi, Erik Czipa, Attila Horvath, Aron Koszeghy, Csilla Bordas, Szilárd Póliska, István Juhász, László Imre, Gábor Szabó, Balazs Dezso, Endre Barta, Sascha Sauer, Katalin Karolyi, Ilona Kovacs, Gábor Hutóczky, László Bognár, Álmos Klekner, Peter Szucs, Bálint L. Bálint, Laszlo Nagy
Dátum:2015
ISSN:1066-5099
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
stem cells
neuronal differentiation
retinoic acid
PRMT1
PRMT8
Megjelenés:Stem Cells. - 33 : 3 (2015), p. 726-741. -
További szerzők:Czipa Erik (1990-) (molekuláris biológus, bioinformatikus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Kőszeghy Áron (1983-) (Ph.D hallgató, élettanász) Bordás Csilla Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Juhász István (1956-) (bőrgyógyász, bőrsebész, kozmetológus, klinikai onkológus) Imre László (1979-) (biológus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus) Dezső Balázs (1951-) (pathológus) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Sauer, Sascha Károlyi Katalin Kovács Ilona (1965-) (patológus) Hutóczki Gábor (1983-) (Ph.D. hallgató) Bognár László (1958-) (idegsebész, gyermekidegsebész) Klekner Álmos (1970-) (idegsebész) Szűcs Péter (1974-) (kutatóorvos) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:K100196
OTKA
TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024
TÁMOP
Molekuláris Sejt- és Immunbiológiai Doktori Iskola
TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001/A2-JADJ-13
TÁMOP
F68254
OTKA
TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:
Rekordok letöltése1