CCL

Összesen 9 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM106588
035-os BibID:(WOS)000875220200001 (Scopus)85140591206 (cikkazonosító)511
Első szerző:Kardos Gábor (szakorvos, klinikai mikrobiológus)
Cím:Genetic Diversity of Actinobacillus pleuropneumoniae Serovars in Hungary / Gábor Kardos, Rita Sárközi, Levente Laczkó, Szilvia Marton, László Makrai, Krisztián Bányai, László Fodor
Dátum:2022
ISSN:2306-7381
Tárgyszavak:Agrártudományok Állatorvosi tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Veterinary Sciences. - 9 : 10 (2022), p. 1-12. -
További szerzők:Sárközi Rita Laczkó Levente (1992-) (biológus) Marton Szilvia Makrai László Bányai Krisztián Fodor László
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM117255
035-os BibID:(cikkazonosító)1281473 (WoS)001111568000001 (Scopus)85178472490
Első szerző:Kaszab Eszter (biológus)
Cím:Antimicrobial resistance genes and associated mobile genetic elements in Lactobacillales from various sources / Eszter Kaszab, Levente Laczkó, Gábor Kardos, Krisztián Bányai
Dátum:2023
ISSN:1664-302X
Megjegyzések:Lactobacillales are commonly used in food products and as probiotics in animal and human medicine. Despite being generally recognized as safe, lactic acid bacteria may harbor a variety of antimicrobial resistance genes (ARGs), which may be transferable to human or veterinary pathogens, thus, may pose veterinary and public health concerns. This study investigates the resistome of Lactobacillales. A total of 4,286 whole-genome sequences were retrieved from NCBI RefSeq database. We screened ARGs in whole genome sequences and assessed if they are transmissible by plasmid transfer or by linkage to integrative mobile genetic elements. In the database, 335 strains were found to carry at least one ARG, and 194 strains carried at least one potentially transferable ARG. The most prevalent transferable ARG were tetM and tetW conferring antibiotic resistance to tetracycline. This study highlights the importance of the One Health concept by demonstrating the potential for Lactobacillales, commonly used in food products, to serve as reservoirs and vectors for ARGs.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
antimicrobial resistance genes
iMGE
Lactobacillales
one health
plasmid
Megjelenés:Frontiers in Microbiology. - 14 (2023), p. 1-8. -
További szerzők:Laczkó Levente (1992-) (biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Bányai Krisztián
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM107320
035-os BibID:(WOS)000746032300036 (Scopus)85123453070 (cikkazonosító)e00921-21
Első szerző:Kaszab Eszter (biológus)
Cím:Draft Genome Sequences of Lacticaseibacillus rhamnosus cek-R1, Lacticaseibacillus paracasei cek-R2, and Lentilactobacillus otakiensis cek-R3, Isolated from a Beetroot Product / Eszter Kaszab, Levente Laczkó, Krisztina Bali, Eszter Fidrus, Krisztián Bányai, Gábor Kardos
Dátum:2022
ISSN:2576-098X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Microbiology Resource Announcements. - 11 : 1 (2022), p. e00921-21. -
További szerzők:Laczkó Levente (1992-) (biológus) Bali Krisztina Fidrus Eszter (1992-) (biotechnológus) Bányai Krisztián Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM117396
035-os BibID:(cikkazonosító)1728 (WoS)001132459800001 (Scopus)85180500655
Első szerző:Kerek Ádám
Cím:In Vitro Microevolution and Co-Selection Assessment of Florfenicol Impact on Escherichia coli Resistance Development / Ádám Kerek, Bence Török, Levente Laczkó, Gábor Kardos, Krisztián Bányai, Zoltán Somogyi, Eszter Kaszab, Krisztina Bali, Ákos Jerzsele
Dátum:2023
ISSN:2079-6382
Megjegyzések:The issue of antimicrobial resistance is becoming an increasingly serious challenge in both human and veterinary medicine. Prudent antimicrobial use in veterinary medicine is warranted and supported by international guidelines, with the Antimicrobial Advice Ad Hoc Expert Group (AMEG) placing particular emphasis on the critically important group B antimicrobials. These antimicrobials are commonly employed, especially in the poultry and swine industry. The impact of florfenicol, a veterinary antibiotic, was studied on the resistance development of Escherichia coli. The aim of the study was to investigate the effect of the use of florfenicol on the development of phenotypic and genomic resistances, not only to the drug itself but also to other drugs. The minimum inhibitory concentrations (MICs) of the antibiotics were investigated at 1x, 10x, 100x and 1000x concentrations using the adapted Microbial Evolution and Growth Arena (MEGA-plate) method. The results demonstrate that florfenicol can select for resistance to fluoroquinolone antibiotics (167x MIC value increase) and cephalosporins (67x MIC value increase). A total of 44 antimicrobial resistance genes were identified, the majority of which were consistent across the samples. Chromosomal point mutations, including alterations in resistance-associated and regulatory genes (acrB, acrR, emrR and robA), are thought to trigger multiple drug efflux pump activations, leading to phenotypically increased resistance. The study underscores the impact of florfenicol and its role in the development of antimicrobial resistance, particularly concerning fluoroquinolone antibiotics and cephalosporins. This study is the first to report florfenicol's dose-dependent enhancement of other antibiotics' MICs, linked to mutations in SOS-box genes (mdtABC-tolC, emrAB-tolC and acrAB-tolC) and increased multidrug efflux pump genes. Mutations in the regulatory genes acrR, emrR and rpbA support the possibility of increased gene expression. The results are crucial for understanding antimicrobial resistance and its development, highlighting the promising potential of in vitro evolutionary and coselection studies for future research.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Antibiotics-Basel. - 12 : 12 (2023), p. 1-18. -
További szerzők:Török Bence Laczkó Levente (1992-) (biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Bányai Krisztián Somogyi Zoltán Kaszab Eszter (1989-) (biológus) Bali Krisztina Jerzsele Ákos
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM116764
035-os BibID:(cikkazonosító)1294771 (WoS)001122459000001 (Scopus)85179311017
Első szerző:Miklós Máté (biológus)
Cím:Environmental bacteria increase population growth of hydra at low temperature / Máté Miklós, Karolina Cseri, Levente Laczkó, Gábor Kardos, Sebastian Fraune, Jácint Tökölyi
Dátum:2023
ISSN:1664-302X
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Frontiers in Microbiology. - 14 (2023), p. 1-14. -
További szerzők:Cseri Karolina (1985-) (molekuláris biológus) Laczkó Levente (1992-) (biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Fraune, Sebastian Tökölyi Jácint (1984-) (biológus)
Pályázati támogatás:MTA-DE Lendület
MTA
Élettudományok - Biológiai tudományok
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM116026
035-os BibID:(Scopus)85175859931
Első szerző:Nagy József Bálint (molekuláris biológus)
Cím:Carbapenem-resistant Escherichia coli in Black-headed gulls, the Danube, and human clinical samples : a One Health comparison of contemporary isolates / József Bálint Nagy, Balázs Koleszár, Bernadett Khayer, Eszter Róka, Levente Laczkó, Erika Ungvári, Eszter Kaszab, Krisztina Bali, Krisztián Bányai, Márta Vargha, Ádám Lovas-Kiss, Ákos Tóth, Gábor Kardos
Dátum:2023
ISSN:2213-7165
Megjegyzések:Objectives: Our aim was to characterize and compare contemporary carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) isolates from gulls, the River Danube, and humans in Hungary, Budapest. Methods: Multiresistant Enterobacterales were sought for in 227 gull faecal and 24 Danube water samples from 2019 to 2020. Eosin-methylene blue agar containing 2 mg/L cefotaxime and Colilert-test containing 10 mg/L cefotaxime were used for gull and water samples, respectively. Isolates were characterized by polymerase chain reactions (PCRs); acquired carbapenemase producers were further analysed by whole-genome sequencing, together with 21 Hungarian human CR Escherichia coli (CREc) isolates. Results: Gull and water samples exhibited a CRE prevalence of 7.4% (9/122) and 6.7% (7/105), none and 5/12 water samples yielded CRE from 2019 and 2020, respectively; CRE were found only in samples taken downstream of Budapest. The dominant species was Escherichia coli and the most prevalent carbapenemase was blaNDM-1. High-risk CREc clones were found both in gulls (ST224, ST372, ST744) and the Danube (ST10, ST354, ST410); the closest associations were between ST410 from humans and the Danube, among ST1437 among gulls, and between ST1437 in gulls and the Danube (46, 0, and 22?24 allelic distances, respectively). Direct links between human and gull isolates were not demonstrated. Conclusion: The study demonstrates potential epidemiological links among humans, a river crossing a city, and urbanised birds, suggesting a local transmission network. Water bodies receiving influent wastewater, together with animals using such habitats, may serve as a local reservoir system for CRE, highlighting the importance of One Health in CRE transmission, even in a country with a low CRE prevalence in humans.
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Antibiotic resistance
blaNDM-1
carbapenemase
Human-animal interaction
ST410
Urbanised birds
Megjelenés:Journal of Global Antimicrobial Resistance. - 35 (2023), p. 257-261. -
További szerzők:Koleszár Balázs Khayer Bernadett Róka Eszter (1989-) (gyógyszerész, gyógyszertechnológus) Laczkó Levente (1992-) (biológus) Ungvári Erika Kaszab Eszter (1989-) (biológus) Bali Krisztina Bányai Krisztián Vargha Márta Lovas-Kiss Ádám (1991-) (biológus, botanikus) Tóth Ákos Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM117877
035-os BibID:(cikkazonosító)45 (Scopus)85181689003 (WOS)001138932000001
Első szerző:Rádai Zoltán (biológus)
Cím:An overlooked phenomenon : complex interactions of potential error sources on the quality of bacterial de novo genome assemblies / Zoltán Rádai, Alex Váradi, Péter Takács, Nikoletta Andrea Nagy, Nicholas Schmitt, Eszter Prépost, Gábor Kardos, Levente Laczkó
Dátum:2024
ISSN:1471-2164
Megjegyzések:Background: Parameters adversely affecting the contiguity and accuracy of the assemblies from Illumina next-generation sequencing (NGS) are well described. However, past studies generally focused on their additive effects, overlooking their potential interactions possibly exacerbating one another's effects in a multiplicative manner. To investigate whether or not they act interactively on de novo genome assembly quality, we simulated sequencing data for 13 bacterial reference genomes, with varying levels of error rate, sequencing depth, PCR and optical duplicate ratios. Results: We assessed the quality of assemblies from the simulated sequencing data with a number of contiguity and accuracy metrics, which we used to quantify both additive and multiplicative effects of the four parameters. We found that the tested parameters are engaged in complex interactions, exerting multiplicative, rather than additive, effects on assembly quality. Also, the ratio of non-repeated regions and GC% of the original genomes can shape how the four parameters affect assembly quality. Conclusions: We provide a framework for consideration in future studies using de novo genome assembly of bacterial genomes, e.g. in choosing the optimal sequencing depth, balancing between its positive effect on contiguity and negative effect on accuracy due to its interaction with error rate. Furthermore, the properties of the genomes to be sequenced also should be taken into account, as they might influence the effects of error sources themselves.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Bacterial genomes
Optical duplicates
PCR duplicates
Sequencing depth
Sequencing error
Megjelenés:BMC Genomics. - 25 : 1 (2024), p. 1-8. -
További szerzők:Váradi Alex (1991-) (biológus) Takács Péter (1966-) (informatikus) Nagy Nikoletta Andrea (1990-) (biológus) Schmitt, Nicholas Prépost Eszter Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Laczkó Levente (1992-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM082111
Első szerző:Szinai Mihály
Cím:Comparative analysis of human papillomavirus type 6 complete genomes originated from head and neck and anogenital disorders / Szinai Mihály, Nagy Zsófia, Máté Petra, Kovács Dávid, Laczkó Levente, Kardos Gábor, Sápy Tamás, Szűcs Attila, Szarka Krisztina
Dátum:2019
ISSN:1567-1348
Megjegyzések:It is increasingly recognized that fundamental differences exist between high-risk and low-risk human papillomavirus (HPV) genotypes regarding interactions with the host. This study aims to join the recently emerging efforts to uncover these differences at the complete genome level and to study how they may influence the disease caused. Sixteen samples of thirteen patients with various HPV6-mediated benign mucosal disorders (nine recurrent respiratory papillomatoses with 2-8 recurrences, one condyloma acuminatum and three premalignant lesions of the genital mucosa) were sampled to determine the complete virus genomes. We collected the 197 HPV6 complete genomes deposited in the GenBank for cluster analysis to determine (sub)lineages. Genome polymorphisms were determined against the reference sequences of the (sub)lineages. Genome polymorphisms of the long control region (LCR) were tested for putative transcription factor binding sites; their functional analysis was performed by transient transfection of cloned whole LCRs into HEp-2 cells using a luciferase reporter system. Genomes from the same patients were always identical. Three, nine and one patients carried HPV6 lineage A, sublineage B1 and B2 variants, respectively. The three lineage A sequences were highly similar to each other, but distinct from the reference genome. A unique non-synonymous single nucleotide polymorphism (SNP) was found in the E5a open reading frame (ORF). Sublineage B1 genomes were more diverse, exhibited unique non-synonymous SNPs in the LCR and the E2/E4, L1, L2 ORFs. LCR activity of lineage A and sublineage B1 differed significantly; activity of one sublineage B1 LCR exhibiting two unique SNPs was significantly higher than that of other B1 LCR variants, close to the mean of LCR activities of lineage A variants. Different HPV6 lineages showed marked differences in variability patterns of the different genome regions. This may be involved in the differences in their distribution in different diseases or patient populations.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Cervical atypia
Condyloma acuminatum
Genome polymorphisms
Intratypic variation
Low-risk human papillomavirus
Recurrent respiratory papillomatosis
Megjelenés:INFECTION GENETICS AND EVOLUTION. - 71 (2019), p. 140-150. -
További szerzők:Nagy Zsófia (1991-) (molekuláris biológus) Máté Petra Kovács Dávid (1989-) (fül-orr-gégész) Laczkó Levente (1992-) (biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Sápy Tamás (1970-) (szülész-nőgyógyász) Szűcs Attila (1970-) (fül-orr-gégész) Szarka Krisztina (1971-) (molekuláris biológus, mikrobiológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM103796
035-os BibID:(cikkazonosító)e0274414 (WoS)000933375500038 (Scopus)85138452471
Első szerző:Váradi Alex (biológus)
Cím:Rapid genotyping of targeted viral samples using Illumina short-read sequencing data / Alex Váradi, Eszter Kaszab, Gábor Kardos, Eszter Prépost, Krisztina Szarka, Levente Laczkó
Dátum:2022
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:The most important information about microorganisms might be their accurate genome sequence. Using current Next Generation Sequencing methods, sequencing data can be generated at an unprecedented pace. However, we still lack tools for the automated and accurate reference-based genotyping of viral sequencing reads. This paper presents our pipeline designed to reconstruct the dominant consensus genome of viral samples and analyze their within-host variability. We benchmarked our approach on numerous datasets and showed that the consensus genome of samples could be obtained reliably without further manual data curation. Our pipeline can be a valuable tool for fast identifying viral samples. The pipeline is publicly available on the project's GitHub page (https://github.com/laczkol/QVG).
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Plos One. - 17 : 9 (2022), p. 1-23. -
További szerzők:Kaszab Eszter (1989-) (biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Prépost Eszter Szarka Krisztina (1971-) (molekuláris biológus, mikrobiológus) Laczkó Levente (1992-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 
Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.