CCL

Összesen 5 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM085850
035-os BibID:(WoS)000637108600008 (Scopus)85085909474
Első szerző:Forgács Lajos
Cím:Comparison of in vivo pathogenicity of four Candida auris clades in a neutropenic bloodstream infection murine model / Lajos Forgács, Andrew M. Borman, Eszter Prépost, Zoltán Tóth, Gábor Kardos, Renátó Kovács, Adrien Szekely, Fruzsina Nagy, Ilona Kovacs, László Majoros
Dátum:2020
ISSN:2222-1751
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Emerging Microbes & Infections. - 9 : 1 (2020), p. 1160-1169. -
További szerzők:Borman, Andrew M. Prépost Eszter Tóth Zoltán (1990-) (molekuláris biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Kovács Renátó László (1987-) (molekuláris biológus) Székely Adrien Nagy Fruzsina (1991-) (molekuláris biológus) Kovács Ilona (1965-) (patológus) Majoros László (1966-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
ÚNKP-19
Egyéb
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM079570
035-os BibID:(PMID)31303773
Első szerző:Prépost Eszter
Cím:Efficacy of humanized single large doses of caspofungin on the lethality and fungal tissue burden in a deeply neutropenic murine model against Candida albicans and Candida dubliniensis / Eszter Prépost, Zoltán Tóth, David S. Perlin, Rudolf Gesztelyi, Gábor Kardos, Renátó Kovács, Fruzsina Nagy, Lajos Forgács, László Majoros
Dátum:2019
ISSN:1178-6973
Megjegyzések:BACKGROUND: Echinocandins are the first-line therapy for treatment of invasive Candida infections, but the mortality rate remains high, calling for novel strategies. Giving single larger echinocandin doses infrequently is an alternative regimen. Our aim was to test this novel approach in a neutropenic murine model. MATERIALS AND METHODS: We compared the in vivo efficacy of single 10 and 40 mg/kg of caspofungin (2.5x and 10x the normal humanized dose) to that of the same cumulative doses of daily 2 and 8 mg/kg doses for 5 days against 2 each of wild-type C. albicans and C. dubliniensis as well as echinocandin resistant C. albicans. As a comparator, we tested daily 1 mg/kg amphotericin B. RESULTS: In lethality experiments, all caspofungin and amphotericin B regimens improved survival against wild-type C. albicans and C. dubliniensis clinical isolates (P<0.0001) and decreased the mean fungal kidney burdens of both species compared to controls. However, fungal kidney burden decreases were not always statistically significant, especially with single 10 or 40 mg/kg caspofungin doses. Amphotericin B was the least active drug against wild-type C. albicans. Against echinocandin-resistant strains, monodose 40 mg/kg caspofungin and 1 mg/kg of daily amphotericin B were effective in lethality experiments. Although, significant kidney CFU decreases were never found, except for amphotericin B against one of the isolates (p<0.05 at day 3 and p<0.001 at day 6). CONCLUSION: Single 40 mg/kg caspofungin and 1 mg/kg amphotericin B proved to be effective in the lethality experiments against wild-type and echinocandin-resistant C. albicans and wild-type C. dubliniensis. This was not always shown regarding fungal tissue burdens. Single caspofungin doses used in mice in this study are attainable in humans as well, suggesting a potential place of this dosing strategy not only in prevention but also in curative treatment of evolved invasive Candida infections.
Tárgyszavak:Orvostudományok Gyógyszerészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Candida albicans complex
echinocandin resistance
fungal tissue burden
humanized caspofungin doses
intermittent dosing regimen of echinocandins
Megjelenés:Infection and Drug Resistance. - 12 (2019), p. 1805-1814. -
További szerzők:Tóth Zoltán (1990-) (molekuláris biológus) Perlin, David (1958-) (Biológus) Gesztelyi Rudolf (1969-) (kísérletes farmakológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Kovács Renátó László (1987-) (molekuláris biológus) Nagy Fruzsina (1991-) (molekuláris biológus) Forgács Lajos (1954-) (agrármérnök-kutató) Majoros László (1966-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus)
Pályázati támogatás:EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
ÚNKP-18-3
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM117877
035-os BibID:(cikkazonosító)45 (Scopus)85181689003 (WOS)001138932000001
Első szerző:Rádai Zoltán (biológus)
Cím:An overlooked phenomenon : complex interactions of potential error sources on the quality of bacterial de novo genome assemblies / Zoltán Rádai, Alex Váradi, Péter Takács, Nikoletta Andrea Nagy, Nicholas Schmitt, Eszter Prépost, Gábor Kardos, Levente Laczkó
Dátum:2024
ISSN:1471-2164
Megjegyzések:Background: Parameters adversely affecting the contiguity and accuracy of the assemblies from Illumina next-generation sequencing (NGS) are well described. However, past studies generally focused on their additive effects, overlooking their potential interactions possibly exacerbating one another's effects in a multiplicative manner. To investigate whether or not they act interactively on de novo genome assembly quality, we simulated sequencing data for 13 bacterial reference genomes, with varying levels of error rate, sequencing depth, PCR and optical duplicate ratios. Results: We assessed the quality of assemblies from the simulated sequencing data with a number of contiguity and accuracy metrics, which we used to quantify both additive and multiplicative effects of the four parameters. We found that the tested parameters are engaged in complex interactions, exerting multiplicative, rather than additive, effects on assembly quality. Also, the ratio of non-repeated regions and GC% of the original genomes can shape how the four parameters affect assembly quality. Conclusions: We provide a framework for consideration in future studies using de novo genome assembly of bacterial genomes, e.g. in choosing the optimal sequencing depth, balancing between its positive effect on contiguity and negative effect on accuracy due to its interaction with error rate. Furthermore, the properties of the genomes to be sequenced also should be taken into account, as they might influence the effects of error sources themselves.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Bacterial genomes
Optical duplicates
PCR duplicates
Sequencing depth
Sequencing error
Megjelenés:BMC Genomics. - 25 : 1 (2024), p. 1-8. -
További szerzők:Váradi Alex (1991-) (biológus) Takács Péter (1966-) (informatikus) Nagy Nikoletta Andrea (1990-) (biológus) Schmitt, Nicholas Prépost Eszter Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Laczkó Levente (1992-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM075784
Első szerző:Tóth Zoltán (molekuláris biológus)
Cím:Comparison of Killing Activity of Micafungin Against Six Candida Species Isolated from Peritoneal and Pleural Cavities in RPMI-1640, 10 and 30% Serum / Tóth Zoltán, Kardos Tamás, Kovács Renátó, Kardos Gábor, Nagy Fruzsina, Prépost Eszter, Barta Zsolt, Takacs István, Majoros László
Dátum:2018
ISSN:0301-486X
Tárgyszavak:Orvostudományok Gyógyszerészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Mycopathologia. - 183 : 6 (2018), p. 905-912. -
További szerzők:Kardos Tamás (1980-) (pulmonológus, klinikai onkológus) Kovács Renátó László (1987-) (molekuláris biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Nagy Fruzsina (1991-) (molekuláris biológus) Prépost Eszter Barta Zsolt (1964-) (belgyógyász, gasztroenterológus) Takács István Majoros László (1966-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM103796
035-os BibID:(cikkazonosító)e0274414 (WoS)000933375500038 (Scopus)85138452471
Első szerző:Váradi Alex (biológus)
Cím:Rapid genotyping of targeted viral samples using Illumina short-read sequencing data / Alex Váradi, Eszter Kaszab, Gábor Kardos, Eszter Prépost, Krisztina Szarka, Levente Laczkó
Dátum:2022
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:The most important information about microorganisms might be their accurate genome sequence. Using current Next Generation Sequencing methods, sequencing data can be generated at an unprecedented pace. However, we still lack tools for the automated and accurate reference-based genotyping of viral sequencing reads. This paper presents our pipeline designed to reconstruct the dominant consensus genome of viral samples and analyze their within-host variability. We benchmarked our approach on numerous datasets and showed that the consensus genome of samples could be obtained reliably without further manual data curation. Our pipeline can be a valuable tool for fast identifying viral samples. The pipeline is publicly available on the project's GitHub page (https://github.com/laczkol/QVG).
Tárgyszavak:Természettudományok Biológiai tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Plos One. - 17 : 9 (2022), p. 1-23. -
További szerzők:Kaszab Eszter (1989-) (biológus) Kardos Gábor (1974-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Prépost Eszter Szarka Krisztina (1971-) (molekuláris biológus, mikrobiológus) Laczkó Levente (1992-) (biológus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1