Találati lista | Tudóstér

1.

001-es BibID:	BIBFORM121603
035-os BibID:	(Scopus)85194393047 (WoS)001248542600001
Első szerző:	Farsang Róbert
Cím:	Glucose unit computation in capillary zone electrophoresis of carbohydrates using a numerical approximation based search for a virtual EOF marker. A tutorial / Robert Farsang, Anna Farkas, Gábor Jarvas, András Guttman
Dátum:	2024
ISSN:	0165-9936
Megjegyzések:	Several high-resolution carbohydrate separation methods are currently available for structural elucidation in the analytical glycomics field, but the associated glyco-informatics support is lagging. Identifying protein-bound glycan structures represents a multifaceted challenge with elements of separation science, bioinformatics, and sophisticated computational methods. In electroosmotic flow (EOF) driven separations with counter currently migrating sample components, the apparent migration times of the analyte molecules are the result of the interplay between their effective electrophoretic mobilities and the EOF. The resulting continuously increasing migration time distances between the consecutively migrating maltodextrin oligomers make glucose unit value calculation and the subsequent structural interpretation of unknown glycans extremely challenging. To correct this irregularity, a numerical approximation-based search-derived virtual electroosmotic flow marker is introduced and utilized. This tutorial guides the reader through the computation process for structural elucidation of N-linked carbohydrates by using a detailed worked example with a monoclonal antibody of biopharmaceutical interest.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Carbohydrates Capillary electrophoresis Virtual EOF marker Numerical approximation Maltodextrin ladder Glucose unit
Megjelenés:	Trac-Trends In Analytical Chemistry. - 176 (2024), p. 1-9. -
További szerzők:	Farkas Anna (1988-) (molekuláris biológus) Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	2023-1.2.1-ERA_NET-2023-00015 Egyéb 1G3DBK0CTUF247 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

2.

001-es BibID:	BIBFORM116213
035-os BibID:	(WoS)001104988800001 (Scopus)85178183698
Első szerző:	Farsang Róbert
Cím:	Capillary Zone Electrophoresis of 8-Aminopyrene-1,3,6-trisulfonic Acid Labeled Carbohydrates with Online Electrokinetic Sample Cleanup / Farsang Robert, Hogyor Kinga, Jarvas Gabor, Guttman Andras
Dátum:	2023
ISSN:	0003-2700
Megjegyzések:	Capillary electrophoresis is one of the frequently used separation techniques for the analysis of complex carbohydrates. Since sugars lack chromophore or fluorophore groups, their capillary electrophoresis analysis usually requires tagging by a charged fluorophore. To speed up the derivatization reaction, a large excess of the labeling reagent is typically used; therefore, a purification step is necessary prior to CE analysis using the industry standard low-pH gel-buffer system. In addition to representing an extra sample preparation step with the associated labor and cost, the purification process also holds the risk of losing some of the sample components. In this paper we introduce an online electrokinetic sample cleanup process with electroosmotic flow (EOF)-assisted separation in a bare fused silica capillary using alkaline pH background electrolyte and normal polarity separation voltage. 8-Aminopyrene-1,3,6-trisulfonic acid (APTS)-labeled maltooligosaccharides were analyzed first to understand the complex effect of the downstream EOF and the counter current electromigration of the sample components including the labeling dye. The use of 150 mM caproic acid?253 mM Tris (pH 8.1) running buffer facilitated the entrance of the sample components of interest into the separation capillary, while the excess labeling reagent was excluded and, therefore, did not interfere with the detection. The alkaline caproic acid?Tris running buffer was then applied to the N-glycome analysis of human serum samples, showing excellent separation performance, and more importantly, the extra sample purification step was not required.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Capillary electrophoresis Carbohydrates Electroosmosis Labeling Polarity
Megjelenés:	Analytical Chemistry. - 95 : 45 (2023), p. 16459-16464. -
További szerzők:	Hogyor Kinga Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	DE TUDFIN Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

3.

001-es BibID:	BIBFORM115940
035-os BibID:	(cikkazonosító)115812 (scopus)85175539824
Első szerző:	Farsang Róbert
Cím:	Purification free N-glycan analysis by capillary zone electrophoresis : Hunt for the lost glycans / Farsang Robert, Jarvas Gabor, Guttman Andras
Dátum:	2024
ISSN:	0731-7085
Megjegyzések:	Capillary gel electrophoresis is a widely used method for rapid separation of fluorophore labeled carbohydrates. Even though, many publications conferred about this popular technique, no report yet investigated the possible sample losses during the purification process of the fluorophore labeling reaction mixture. In the present work, normal polarity capillary zone electrophoresis separation mode was applied to take advantage of the opposite migration directions of the electroosmotic flow and the negatively charged sample components using Tris- hexanoic acid running buffer at basic pH. For purification free oligosaccharide analysis, the separation parameters were designed in such a way that the triple charged labeling reagent of aminopyrenetrisulfonate (APTS) could not enter the separation capillary in contrary to the labeled sample components of interest, therefore, the APTS did not have to be removed before analysis. The method was used to show electrophoretic profile differences possibly caused by the cleanup process that was immediately apparent by comparing the electropherograms of the purified and non-purified APTS labeled maltooligosaccharides. Furthermore, qualitative and quantitative N-glycosylation profile alterations were revealed during CZE separation of the fluorophore labeling reaction mixtures before and after purification along with the analysis of the consecutively used washing solutions for the well characterized standard glycoproteins of IgG, ribonuclease B and fetuin.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk N-glycans Capillary zone electrophoresis Purification Sample loss
Megjelenés:	Journal Of Pharmaceutical And Biomedical Analysis. - 238 (2024), p. 1-5. -
További szerzők:	Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

4.

001-es BibID:	BIBFORM106796
035-os BibID:	(cikkazonosító)339906 (scopus)85130784505 (wos)000833521000006
Első szerző:	Farsang Róbert
Cím:	Immobilized exoglycosidase matrix mediated solid phase glycan sequencing / Farsang Róbert, Kovács Noémi, Szigeti Márton, Jankovics Hajnalka, Vonderviszt Ferenc, Guttman András
Dátum:	2022
ISSN:	0003-2670
Megjegyzések:	Full characterization of the attached carbohydrate moieties of glycoproteins is of high importance for both the rapidly growing biopharmaceutical industry and the biomedical field. In this paper we report the design and production of three important 6HIS-tagged exoglycosidases (neuraminidase, ?-galactosidase and hexosaminidase) to support rapid solid phase N-glycan sequencing with high robustness using immobilized enzymes. The exoglycosidases were generated in bacterial expression systems with high yield. Oriented immobilization via the 6HIS-tag portion of the molecules supported easy accessibility to the active sites and consequently high digestion performance. The three exoglycosidases were premixed in an appropriate matrix format and processed in a low-salt buffer to support long term storage. The digestion efficiencies of the immobilized enzymes were demonstrated by using solid phase sequencing in conjunction with capillary electrophoresis analysis of the products on a commercial glycoprotein therapeutic (palivizumab) and human serum derived fluorophore labeled glycans.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Analytica Chimica Acta. - 1215 (2022), p. 1-8. -
További szerzők:	Kovács Noémi Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Jankovics Hajnalka Vonderviszt Ferenc Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017 Egyéb 2020-4.1.1-TKP2020 Egyéb NN 127062 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

5.

001-es BibID:	BIBFORM106794
035-os BibID:	(cikkazonosító)333 (scopus)85141755492 (wos)000881482500001
Első szerző:	Farsang Róbert
Cím:	Ultrahigh-Sensitivity Capillary Electrophoresis Analysis of Trace Amounts of Nitrate and Nitrite in Environmental Water Samples / Farsang Robert, Kovacs Zsofia, Jarvas Gabor, Guttman Andras
Dátum:	2022
ISSN:	2297-8739
Megjegyzések:	The role of nitrite (NO2?) and nitrate (NO3?) is essential in the global nitrogen cycle. Monitoring their concentration in environmental and industrial aqueous samples, surface water, soil, food and agricultural products are of high importance. Especially, the effect of anthropogenic emission, i.e., intensified agriculture is essential due to the overuse of nitrogen, phosphorus and potassium fertilizers. The most widely utilized methods for nitrate and nitrite determination are colorimetry, potentiometry, UV absorption and liquid chromatography. Among them, UV spectroscopy is the most frequently used technique due to the fact of its versatility and simplicity. However, there are industrial and academic needs to develop new methods to overcome some drawbacks of the currently used techniques such as an inadequate limit of detection and potential interferences with organic compounds in the sample. In this paper, we report on the development of a new analytical method based on capillary electrophoresis separation with high-sensitivity UV detection, capable of measuring trace concentrations of nitrite and nitrate well below the current limits of UV spectroscopy methods. During the development process special attention was paid to practical aspects, i.e., the method was tested to quantify nitrate and nitrite in various surface water samples.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Separations. - 9 : 11 (2022), p. 1-7. -
További szerzők:	Kovács Zsófia Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	RRF 2.3.1-21-2022-00008 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

6.

001-es BibID:	BIBFORM095052
035-os BibID:	(cikkazonosító)338492
Első szerző:	Filep Csenge Boróka (biomérnök)
Cím:	Multilevel capillary gel electrophoresis characterization of new antibody modalities / Csenge Filep, Marton Szigeti, Robert Farsang, Markus Haberger, Dietmar Reusch, Andras Guttman
Dátum:	2021
ISSN:	0003-2670
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk New modalities Monoclonal antibody SDS-CGE N-Glycan analysis Trypsin digestion
Megjelenés:	Analytica Chimica Acta. - 1166 (2021), p. 1-9. -
További szerzők:	Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Farsang Róbert Haberger, Markus Reusch, Dietmar Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	2.3.2- 15-2016-00017 GINOP 2018-2.1.17-TÉT-KR-2018-00010 Egyéb TKP2020-IKA-07 Egyéb UNKP-20-5 Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

7.

001-es BibID:	BIBFORM111840
035-os BibID:	(cikkazonosító)115434 (WoS)001002773400001 (Scopus)85159380613
Első szerző:	Sárközy Dániel (PhD hallgató)
Cím:	Capillary electrophoresis analysis of industrial galactooligosaccharides / Daniel Sarkozy, Robert Farsang, Marton Szigeti, Sean Austin, Stephen Lock, Andras Guttman
Dátum:	2023
ISSN:	0731-7085
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Journal Of Pharmaceutical And Biomedical Analysis. - 233 (2023), p. 1-5. -
További szerzők:	Farsang Róbert Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Austin, Sean Lock, Stephen Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

8.

001-es BibID:	BIBFORM100812
035-os BibID:	(cikkazonosító)839374 (WoS)000784285000001 (Scopus)85127370507
Első szerző:	Szabó Miklós (tüdőgyógyász)
Cím:	Introduction of a Capillary Gel Electrophoresis-Based Workflow for Biotherapeutics Characterization : size, Charge, and N-Glycosylation Variant Analysis of Bamlanivimab, an Anti-SARS-CoV-2 Product / Szabo Miklos, Sarkozy Daniel, Szigeti Marton, Farsang Robert, Kardos Zsofia, Kozma Adam, Csanky Eszter, Chung Doo Soo, Szekanecz Zoltan, Guttman Andras
Dátum:	2022
ISSN:	2296-4185
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk capillary electrophoresis bamlanivimab anti-SARS-CoV-2 product characterization N-glycans
Megjelenés:	Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. - 10 (2022), p. 1-9. -
További szerzők:	Sárközy Dániel (1993-) (PhD hallgató) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Farsang Róbert Kardos Zsófia Kozma Ádám Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Chung, Doo Soo Szekanecz Zoltán (1964-) (reumatológus, belgyógyász, immunológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017 GINOP NN 127062 NKFIH
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

9.

001-es BibID:	BIBFORM106825
035-os BibID:	(cikkazonosító)8192 (scopus)85143597041 (wos)000896340300001
Első szerző:	Torok Rebeka
Cím:	The Effect of Sample Glucose Content on PNGase F-Mediated N-Glycan Release Analyzed by Capillary Electrophoresis / Torok Rebeka, Auer Felicia, Farsang Robert, Jona Eszter, Jarvas Gabor, Guttman Andras
Dátum:	2022
ISSN:	1420-3049
Megjegyzések:	Protein therapeutics have recently gained high importance in general health care along with applied clinical research. Therefore, it is important to understand the structure?function relationship of these new generation drugs. Asparagine-bound carbohydrates represent an important critical quality attribute of therapeutic glycoproteins, reportedly impacting the efficacy, immunogenicity, clearance rate, stability, solubility, pharmacokinetics and mode of action of the product. In most instances, these linked N-glycans are analyzed in their unconjugated form after endoglycosidase-mediated release, e.g., PNGase F-mediated liberation. In this paper, first, N-glycan release kinetics were evaluated using our previously reported in-house produced 6His-PNGase F enzyme. The resulting deglycosylation products were quantified by sodium dodecyl sulfate capillary gel electrophoresis to determine the optimal digestion time. Next, the effect of sample glucose content was investigated as a potential endoglycosidase activity modifier. A comparative Michaelis-Menten kinetics study was performed between the 6His-PNGase F and a frequently employed commercial PNGase F product with and without the presence of glucose in the digestion reaction mixture. It was found that 1 mg/mL glucose in the sample activated the 6His-PNGase F enzyme, while did not affect the release efficiency of the commercial PNGase F. Capillary isoelectric focusing revealed subtle charge heterogeneity differences between the two endoglycosidases, manifested by the lack of extra acidic charge variants in the cIEF trace of the 6His-PNGase F enzyme, which might have possibly influenced the glucose-mediated enzyme activity differences.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Molecules. - 27 : 23 (2022), p. 1-8. -
További szerzők:	Auer, Felicia Farsang Róbert Jóna Eszter Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:	UNKP-22-3-I Egyéb
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

Rekordok letöltése

1

Corvina könyvtári katalógus v8.2.27 © 2023 Monguz kft. Minden jog fenntartva.