CCL

Összesen 9 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM083028
Első szerző:Elek Zsuzsanna
Cím:High Throughput Multiplex SNP-analysis In Chronic Obstructive Pulmonary Disease and Lung Cancer / Zsuzsanna Elek, Zsuzsanna Kovács, Gergely Keszler, Miklós Szabó, Eszter Csanky, Jane Luo, András Guttman, Zsolt Rónai
Dátum:2020
ISSN:1566-5240
Megjegyzések:Background: A number of human inflammatory diseases and tumors have been shown to cause alterations in the glycosylation pattern of plasma proteins in a specific manner. These highly variable and versatile post-translational modifications finetune protein functions by influencing sorting, folding, enzyme activity and subcellular localization. However, relatively little is known about regulatory factors of this procedure and about the accurate causative connection between glycosylation and disease. Objective: The aim of the present study was to investigate whether certain single nucleotide polymorphisms (SNPs) in genes encoding glycosyltransferases and glycosidases could be associated with elevated risk for chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and lung adenocarcinoma. Methods: A total of 32 SNPs localized in genes related to N-glycosylation were selected for the association analysis. Polymorphisms with putative biological functions (missense or regulatory variants) were recruited. SNPs were genotyped by a TaqMan OpenArray platform. A single base extension-based method in combination with capillary gel electrophoresis was used for verification. Results: The TaqMan OpenArray approach provided accurate and reliable genotype data (global call rate: 94.9%, accuracy: 99.6%). No significant discrepancy was detected between the obtained and expected genotype frequency values (Hardy?Weinberg equilibrium) in the healthy control sample group in case of any SNP confirming reliable sampling and genotyping. Allele frequencies of the rs3944508 polymorphism localized in the 3' UTR of the MGAT5 gene significantly differed in the sample groups compared. Conclusion: Our results suggest that the rs34944508 SNP might modulate the risk for lung cancer by influencing the expression of MGAT5. This enzyme catalyzes the addition of N-acetylglucosamine (GlcNAc) in beta 1-6 linkage to the alpha-linked mannose of biantennary N-linked oligosaccharides, thus, increasing branching that is the characteristic of invasive malignancies.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
SNP
single-base primer extension
capillary gel electrophoresis
TaqMan OpenArray
lung adenocarcinoma
COPD
genetic association
Megjelenés:Current Molecular Medicine. - 20 : 3 (2020), p. 185-193. -
További szerzők:Kovács Zsuzsanna (1989-) Keszler Gergely Szabó Miklós (1980-) (tüdőgyógyász) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Luo, Jane Guttman András (1954-) (vegyészmérnök) Rónai Zsolt
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM091997
Első szerző:Farkas Anna (molekuláris biológus)
Cím:Modeling of the Desialylated Human Serum N-glycome for Molecular Diagnostic Applications in Inflammatory and Malignant Lung Diseases / Anna Farkas, Brigitta Mészáros, Máté Szarka, Márton Szigeti, János Kappelmayer, Miklós Szabó, Eszter Csánky, András Guttman
Dátum:2020
ISSN:1566-5240
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Current Molecular Medicine. - 20 : 10 (2020), p. 765-772. -
További szerzők:Mészáros Brigitta (1990-) (vegyészmérnök) Szarka Máté (1990-) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Kappelmayer János (1960-) (laboratóriumi szakorvos) Szabó Miklós (1980-) (tüdőgyógyász) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM117388
035-os BibID:(WoS)000432145700002 (Scopus)85046635574
Első szerző:Magorivska, I.
Cím:Glycosylation of random IgG distinguishes seropositive and seronegative rheumatoid arthritis / I. Magorivska, B. Döncző, T. Dumych, A. Karmash, M. Boichuk, K. Hychka, M. Mihalj, M. Szabó, E. Csánky, J. Rech, A. Guttman, S. G. Vari & R. Bilyy
Dátum:2018
ISSN:0891-6934
Megjegyzések:The N-glycosylation of human immunoglobulins, especially IgGs, plays a critical role in determining affinity of IgGs towards their effector (pro- and anti-inflammatory) receptors. However, it is still not clear whether altered glycosylation is involved in only antibody-dependent disorders like seropositive rheumatoid arthritis (RA) or also in pathologies with similar clinical manifestations, but no specific autoantibodies like seronegative RA. The clarification of that uncertainty was the aim of the current study. Another study aim was the detection of specific glycan forms responsible for altered exposure of native glycoepitopes. We studied sera from seropositive RA (n = 15) and seronegative RA (n = 12) patients for exposure of glycans in native IgG molecules, followed by determination of specific glycans by capillary electrophoresis with laser-induced fluorescent detection (CE-LIF). Aged-matched groups of normal healthy donors (NHD) and samples of intravenous immunoglobulin IgG preparations (IVIG) served as controls. There was significantly stronger binding of Lens culinaris agglutinin (LCA) and Aleuria aurantia lectin (AAL) lectins towards IgG from seropositive RA compared to seronegative RA or NHD. CE-LIF analysis revealed statistically significant increases in bisecting glycans FA2BG2 (p =.006) and FABG2S1 (p =.005) seropositive RA, accompanied by decrease of bisecting monogalactosylated glycan FA2(6)G1 (p =.074) and non-bisecting monosialylated glycan FA2(3)G1S1 (p =.055). The results suggest that seropositive RA is distinct from seronegative RA in terms of IgG glycan moieties, attributable to specific immunoglobulin molecules present in seropositive disease. These glycans were determined to be bisecting GlcNAc-bearing forms FA2BG2 and FABG2S1, and their appearance increased the availability of LCA and AAL lectin-binding sites in native IgG glycoepitopes.
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
ELISA
glycosylation
Immunoglobulin
lectins
rheumatoid arthritis
Megjelenés:Autoimmunity. - 51 : 3 (2018), p. 111-117. -
További szerzők:Döncző Boglárka (1987-) (biológiatanár-földrajztanár) Dumych, T. Karmash, A. Boichuk, M. Hychka, K. Mihalj, M. Szabó Miklós (1980-) (tüdőgyógyász) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Rech, J. Guttman András (1954-) (vegyészmérnök) Vári Sándor G. Bilyy, R.
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM092949
035-os BibID:(cikkazonosító)3700 (WoS)000601810900001 (Scopus)85098507561
Első szerző:Mészáros Brigitta (vegyészmérnök)
Cím:Machine Learning Based Analysis of Human Serum N-glycome Alterations to Follow up Lung Tumor Surgery / Brigitta Mészáros, Gábor Járvás, Renáta Kun, Miklós Szabó, Eszter Csánky, János Abonyi, András Guttman
Dátum:2020
ISSN:2072-6694
Megjegyzések:The human serum N-glycome is a valuable source of biomarkers for malignant diseases, already utilized in multiple studies. In this paper, the N-glycosylation changes in human serum proteins were analyzed after surgical lung tumor resection. Seventeen lung cancer patients were involved in this study and the N-glycosylation pattern of their serum samples was analyzed before and after the surgery using capillary electrophoresis separation with laser-induced fluorescent detection. The relative peak areas of 21 N-glycans were evaluated from the acquired electropherograms using machine learning-based data analysis. Individual glycans as well as their subclasses were taken into account during the course of evaluation. For the data analysis, both discrete (e.g., smoker or not) and continuous (e.g., age of the patient) clinical parameters were compared against the alterations in these 21 N-linked carbohydrate structures. The classification tree analysis resulted in a panel of N-glycans, which could be used to follow up on the e ects of lung tumor surgical resection.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Cancers. - 12 : 12 (2020), p. 1-13. -
További szerzők:Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Kun Renáta (1986-) (biotechnológus) Szabó Miklós (1980-) (tüdőgyógyász) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Abonyi János Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
egyéb
2018-2.1.17-TÉT-KR-2018-00010
egyéb
EFOP-3.6.3-VEKOP-16-2017-00009
EFOP
UNKP-20-5
egyéb
UNKP-19-3-I-DE-492
egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM083098
035-os BibID:(WoS)000509616900017 (Scopus)85076839168 (cikkazonosító)121913
Első szerző:Mészáros Brigitta (vegyészmérnök)
Cím:Comparative analysis of the human serum N-glycome in lung cancer, COPD and their comorbidity using capillary electrophoresis / Brigitta Mészáros, Gábor Járvás, Anna Farkas, Márton Szigeti, Zsuzsanna Kovács, Renáta Kun, Miklós Szabó, Eszter Csánky, András Guttman
Dátum:2020
ISSN:1570-0232
Megjegyzések:Lung cancer (LC) and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) are prevalent ailments with a great challenge to distinguish them based on symptoms only. Since they require different treatments, it is important to find non-invasive methods capable to readily diagnose them. Moreover, COPD increases the risk of lung cancer development, leading to their comorbidity. In this pilot study the N-glycosylation profile of pooled human serum samples (90 patients each) from lung cancer, COPD and comorbidity (LC with COPD) patients were investigated in comparison to healthy individuals (control) by capillary gel electrophoresis with high sensitivity laser-induced fluorescence detection. Sample preparation was optimized for human serum samples introducing a new temperature adjusted denaturation protocol to prevent precipitation and increased endoglycosidase digestion time to assure complete removal of the N-linked carbohydrates. The reproducibility of the optimized method was<3.5%. Sixty-one N-glycan structures were identified in the pooled control human serum sample and the profile was compared to pooled lung cancer, COPD and comorbidity of COPD with lung cancer patient samples. One important finding was that no other sugar structures were detected in any of the patient groups, only quantitative differences were observed. Based on this comparative exercise, a panel of 13 N-glycan structures were identified as potential glycobiomarkers to reveal significant changes (> 33% in relative peak areas) between the pathological and control samples. In addition to N-glycan profile changes, alterations in the individual N-glycan subclasses, such as total fucosylation, degree of sialylation and branching may also hold important glycobiomarker values.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Journal of Chromatography B-Analytical Technologies In The Biomedical And Life Sciences. - 1137 (2020), p. 1-7. -
További szerzők:Járvás Gábor (1982-) (vegyészmérnök) Farkas Anna (1988-) (molekuláris biológus) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Kovács Zsuzsanna (1989-) Kun Renáta (1986-) (biotechnológus) Szabó Miklós (1980-) (tüdőgyógyász) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:K 116263
NKFIH
BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
NN 127062
NKFIH
ÚNKP-18-3-I-DE-393
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM100812
035-os BibID:(cikkazonosító)839374 (WoS)000784285000001 (Scopus)85127370507
Első szerző:Szabó Miklós (tüdőgyógyász)
Cím:Introduction of a Capillary Gel Electrophoresis-Based Workflow for Biotherapeutics Characterization : size, Charge, and N-Glycosylation Variant Analysis of Bamlanivimab, an Anti-SARS-CoV-2 Product / Szabo Miklos, Sarkozy Daniel, Szigeti Marton, Farsang Robert, Kardos Zsofia, Kozma Adam, Csanky Eszter, Chung Doo Soo, Szekanecz Zoltan, Guttman Andras
Dátum:2022
ISSN:2296-4185
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
capillary electrophoresis
bamlanivimab
anti-SARS-CoV-2
product characterization
N-glycans
Megjelenés:Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. - 10 (2022), p. 1-9. -
További szerzők:Sárközy Dániel (1993-) (PhD hallgató) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Farsang Róbert Kardos Zsófia Kozma Ádám Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Chung, Doo Soo Szekanecz Zoltán (1964-) (reumatológus, belgyógyász, immunológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
NN 127062
NKFIH
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM099310
035-os BibID:(cikkazonosító)114483 (WoS)000734902900010 (Scopus)85120412465
Első szerző:Szabó Miklós (tüdőgyógyász)
Cím:N-glycosylation structure - function characterization of omalizumab, an anti-asthma biotherapeutic product / Miklos Szabo, Csenge Filep, Mate Nagy, Daniel Sarkozy, Marton Szigeti, Edit Sperling, Eszter Csanky, Andras Guttman
Dátum:2022
ISSN:0731-7085
Megjegyzések:Omalizumab, a glycoprotein based biotherapeutics, is one of the most frequently used targeted antibody biopharmaceutical to reduce asthma exacerbations, improve lung function and reduce oral corticosteroid use. The effector function and clearance time of such glycoprotein drugs is affected by their N-glycosylation, that defines the required administration frequency to improve the quality of life in appropriately selected patients. Therefore, the glycosylation of biologics is an important critical quality attribute (CQA). The profile of asparagine linked carbohydrates is greatly dependent on the manufacturing process. Even a small deviation may have a major effect on the structure and therefore the function of the biotherapeutic product. For this reason, comprehensive N-glycosylation analysis is of high importance during production and release. Capillary electrophoresis (CE) is one of the frequently used tools to characterize protein therapeutics and utilized by the biopharmaceutical industry for protein and glycan level analysis, which are key parts both for drug development and quality control. To reveal important structure ? function relationships, characterization of omalizumab is presented using capillary SDS gel electrophoresis with UV detection at the protein level and capillary gel electrophoresis with laser induced fluorescent detection at the N-linked carbohydrate level. This latter technique was also used for oligosaccharide sequencing for glycan structure validation. The results suggested no ADCC function ? structure relationship due to the mostly core fucosylated biantennary glycans found. However, the presence of the high mannose structures probably affects the clearance rate of the drug.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
mAb karakterizálás
kapilláris gélelektroforézis
Megjelenés:Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. - 209 (2022), p. 1-5. -
További szerzők:Filep Csenge Boróka (1993-) (biomérnök) Nagy Máté Sárközy Dániel (1993-) (PhD hallgató) Szigeti Márton (1986-) (környezetmérnök) Sperling Edit Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök)
Pályázati támogatás:BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
NN 127062
NKFIH
TKP2020-IKA-07
Egyéb
2020-4.1.1-TKP2020
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM092911
035-os BibID:(scopus)85078071018 (wos)000508231800001
Első szerző:Szabó Miklós (tüdőgyógyász)
Cím:Protein és glikán biomarkerek szerepe a krónikus obstruktív tüdőbetegség diagnosztikájában / Szabó Miklós, Kun Renáta, Hajba László, Koncz Roland, Guttman András, Csánky Eszter
Dátum:2020
ISSN:0030-6002 1788-6120
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok magyar nyelvű folyóiratközlemény hazai lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Orvosi Hetilap. - 161 : 4 (2020), p. 123-128. -
További szerzők:Kun Renáta (1986-) (biotechnológus) Hajba László Koncz Roland Guttman András (1954-) (vegyészmérnök) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus)
Pályázati támogatás:NKFIH K116263
egyéb
NKFIH NN127062
egyéb
2018-2.1.17-TÉT-KR-2018-00010
egyéb
BIONANO_GINOP-2.3.2-15-2016-00017
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM092951
035-os BibID:(WoS)000540216200003 (Scopus)85086318247
Első szerző:Szabó Miklós (tüdőgyógyász)
Cím:Proteomic and Glycomic Markers to Differentiate Lung Adenocarcinoma from COPD / Miklós Szabó, László Hajba, Renáta Kun, András Guttman, Eszter Csánky
Dátum:2020
ISSN:0929-8673
Megjegyzések:Lung adenocarcinoma is one of the leading causes of mortality among cancer patients worldwide and chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is also high in death statistics. In addition, patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) have a high risk of developing primary lung cancer. Prevention, risk estimation and a non-invasive diagnostics are essential to decrease COPD and lung cancer mortality. Therefore, better and more accurate molecular diagnostic markers (biomarkers) are needed for the early differential diagnosis of these lung diseases to help clinicians make better therapeutic decisions. This review focuses on recently discovered adenocarcinoma and COPD biomarkers at the proteome and glycome level. In the first part, the protein markers are summarized, while the second part is focused on glycan markers. Their use to differentiate between chronic inflammation (COPD) and malignant (adenocarcinoma) diseases is discussed in detail.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Current Medicinal Chemistry. - 27 : 20 (2020), p. 3302-3313. -
További szerzők:Hajba László Kun Renáta (1986-) (biotechnológus) Guttman András (1954-) (vegyészmérnök) Csánky Eszter (1959-) (tüdőgyógyász, klinikai immunológus, allergológus)
Pályázati támogatás:NKFIH K 116263
egyéb
BIONANO_GINOP-2.3-15-2016-00017
GINOP
NKFIH NN 127062
egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1