CCL

Összesen 4 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM057822
Első szerző:Dóró Renáta
Cím:Large-scale whole genome sequencing identifies country-wide spread of an emerging G9P[8] rotavirus strain in Hungary, 2012 / Renáta Dóró, Eszter Mihalov-Kovács, Szilvia Marton, Brigitta László, Judit Deák, Ferenc Jakab, Ágnes Juhász, Péter Kisfali, Vito Martella, Béla Melegh, Péter Molnár, Ildikó Sántha, Ferenc Schneider, Krisztián Bányai
Dátum:2014
ISSN:1567-1348
Megjegyzések:With the availability of rotavirus vaccines routine strain surveillance has been launched or continued in many countries worldwide. In this study relevant information is provided from Hungary in order to extend knowledge about circulating rotavirus strains. Direct sequencing of the RT-PCR products obtained by VP7 and VP4 genes specific primer sets was utilized as routine laboratory method. In addition we explored the advantage of random primed RT-PCR and semiconductor sequencing of the whole genome of selected strains. During the study year, 2012, we identified an increase in the prevalence of G9P[8] strains across the country. This genotype combination predominated in seven out of nine study sites (detection rates, 45-83%). In addition to G9P[8]s, epidemiologically major strains included genotypes G1P[8] (34.2%), G2P[4] (13.5%), and G4P[8] (7.4%), whereas unusual and rare strains were G3P[8] (1%), G2P[8] (0.5%), G1P[4] (0.2%), G3P[4] (0.2%), and G3P[9] (0.2%). Whole genome analysis of 125 Hungarian human rotaviruses identified nine major genotype constellations and uncovered both intra- and intergenogroup reassortment events in circulating strains. Intergenogroup reassortment resulted in several unusual genotype constellations, including mono-reassortant G1P[8] and G9P[8] strains whose genotype 1 (Wa-like) backbone gene constellations contained DS1-like NSP2 and VP3 genes, respectively, as well as, a putative bovine-feline G3P[9] reassortant strain. The conserved genomic constellations of epidemiologically major genotypes suggested the clonal spread of the re-emerging G9P[8] genotype and several co-circulating strains (e.g., G1P[8] and G2P[4]) in many study sites during 2012. Of interest, medically important G2P[4] strains carried bovine-like VP1 and VP6 genes in their genotype constellation. No evidence for vaccine associated selection, or, interaction between wild-type and vaccine strains was obtained. In conclusion, this study reports the reemergence of G9P[8] strains across the country and indicates the robustness of whole genome sequencing in routine rotavirus strain surveillance.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Genotype
Rotavirus
Surveillance
Whole genome sequencing
Megjelenés:Infection, Genetics and Evolution. - 28 (2014), p. 495-512. -
További szerzők:Mihalov-Kovács Eszter Marton Szilvia László Brigitta (1983-) (molekuláris biológus, mikrobiológus) Deák Judit (mikrobiológus) Jakab Ferenc Juhász Ágnes Kisfali Péter Martella, Vito Melegh Béla Molnár Péter (Budapest orvos) Sántha Ildikó (Miskolc) Schneider Ferenc Bányai Krisztián
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM040329
Első szerző:László Brigitta (molekuláris biológus, mikrobiológus)
Cím:First detection of P[6],G9 rotaviruses in Hungary : an imported strain from India? / László B., Nyúl Z., Kisfali P., Deák J., Kovács J., Kónya J., Mészner Zs., Molnár P., Pátri L., Schneider F., Tóth A., Melegh B., Iturriza-Gomara M., Gray J., Martella V., Szucs Gy., Bányai K.
Dátum:2009
ISSN:1195-1982
Megjegyzések:EuroRotaNet was launched to monitor rotavirus strain prevalence during and after introduction of rotavirus vaccines in Europe. In early 2007, we detected P[6],G9 rotaviruses to appear in Hungary, representing the first documented occurrence of this strain in our surveillance area. Epidemiologic data suggested that this strain was introduced from India.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal Of Travel Medicine. - 16 : 2 (2009), p. 141-143. -
További szerzők:Nyúl Zoltán Kisfali Péter Deák Judit (mikrobiológus) Kovács Julianna Kónya József (1964-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Mészner Zsófia Molnár Péter (Budapest orvos) Pátri László Schneider Ferenc Tóth András (Budapest) Melegh Béla Iturriza-Gomara, Miren Gray, Jim Martella, Vito Szűcs György Bányai Krisztián
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM039987
035-os BibID:PMID:22841750
Első szerző:László Brigitta (molekuláris biológus, mikrobiológus)
Cím:Surveillance of human rotaviruses in 2007-2011, Hungary : exploring the genetic relatedness between vaccine and field strains / Brigitta László, József Kónya, Eszter Dandár, Judit Deák, Ágnes Farkas, Jim Gray, Gábor Grósz, Miren Iturriza-Gomara, Ferenc Jakab, Ágnes Juhász, Péter Kisfali, Julianna Kovács, György Lengyel, Vito Martella, Béla Melegh, Júlia Mészáros, Péter Molnár, Zoltán Nyúl, Hajnalka Papp, László Pátri, Erzsébet Puskás, Ildikó Sántha, Ferenc Schneider, Katalin Szomor, András Tóth, Erzsébet Tóth, György Szűcs, Krisztián Bányai
Dátum:2012
ISSN:1386-6532
Megjegyzések:The availability of rotavirus vaccines has resulted in an intensification of post vaccine strain surveillance efforts worldwide to gain information on the impact of vaccines on prevalence of circulating rotavirus strains. OBJECTIVES: In this study, the distribution of human rotavirus G and P types in Hungary is reported. In addition, the VP4 and VP7 genes of G1P[8] strains were sequenced to monitor if vaccine-derived strains were introduced and/or some strains/lineages were selected against. STUDY DESIGN: The study was conducted in 8 geographic areas of Hungary between 2007 and 2011. Rotavirus positive stool samples were collected from diarrheic patients mostly <5 years of age. Viral RNA was amplified by multiplex genotyping RT-PCR assay, targeting the medically most important G and P types. When needed, sequencing of the VP7 and VP4 genes was performed. RESULTS: In total, 2380 strains were genotyped. During the 5-year surveillance we observed the dominating prevalence of genotype G1P[8] (44.87%) strains, followed by G4P[8] (23.4%), G2P[4] (14.75%) and G9P[8] (6.81%) genotypes. Uncommon strains were identified in a low percentage of samples (4.12%). Phylogenetic analysis of 318 G1P[8] strains identified 55 strains similar to the Rotarix strain (nt sequence identities; VP7, up to 97.9%; VP4, up to 98.5%) although their vaccine origin was unlikely. CONCLUSIONS: Current vaccines would have protected against the majority of identified rotavirus genotypes. A better understanding of the potential long-term effect of vaccine use on epidemiology and evolutionary dynamics of co-circulating wild type strains requires continuous strain surveillance.
Tárgyszavak:Orvostudományok Gyógyszerészeti tudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Journal Of Clinical Virology 55 : 2 (2012), p. 140-146. -
További szerzők:Kónya József (1964-) (szakorvos, klinikai mikrobiológus) Dandár Eszter (Budapest) Deák Judit (mikrobiológus) Farkas Ágnes (Budapest) Gray, Jim Grósz Gábor (Budapest) Iturriza-Gomara, Miren Jakab Ferenc Juhász Ágnes Kisfali Péter Kovács Julianna Lengyel György Martella, Vito Melegh Béla Mészáros Júlia Molnár Péter (Budapest orvos) Nyúl Zoltán Papp Hajnalka Pátri László Puskás Erzsébet Sántha Ildikó (Miskolc) Schneider Ferenc Szomor Katalin (Budapest) Tóth András (Budapest) Tóth Erzsébet (Nyíregyháza) Szűcs György Bányai Krisztián
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM069224
Első szerző:Ndze, Valentine N.
Cím:One Year Survey of Human Rotavirus Strains Suggests the Emergence of Genotype G12 in Cameroon / Ndze Valentine N., Papp Hajnalka, Achidi Eric A., Gonsu Kamga H., László Brigitta, Farkas Szilvia, Kisfali Péter, Melegh Béla, Esona Mathew D., Bowen Michael D., Bányai K., Gentsch Jon R., Odama Abena M. T.
Dátum:2013
ISSN:0146-6615
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:Journal Of Medical Virology 85 : 8 (2013), p. 1485-1490. -
További szerzők:Papp Hajnalka Achidi, Eric A. Gonsu, Kamga H. László Brigitta (1983-) (molekuláris biológus, mikrobiológus) Farkas Szilvia Kisfali Péter Melegh Béla Esona, Mathew D. Bowen, Michael D. Bányai Krisztián Gentsch, Jon R. Odama, Abena M.T.
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1