CCL

Összesen 21 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM062194
Első szerző:Balázs Margit (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Cím:Hazai melanomakutatások : reményt keltő eredmények egy korábban reménytelen daganatban / Balázs Margit, Vízkeleti Laura, Ecsedi Szilvia, Ádány Róza, Rásó Erzsébet, Hegedűs Balázs, Ladányi Andrea, Tóvári József, Tímár József
Dátum:2015
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok magyar nyelvű folyóiratközlemény hazai lapban
Megjelenés:Magyar Onkológia. - 59 (2015), p. 275-281. -
További szerzők:Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Rásó Erzsébet Hegedűs Balázs Ladányi Andrea Tóvári József Tímár József
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM049634
Első szerző:Balázs Margit (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Cím:Genomics of human malignant melanoma / Margit Balázs, Szilvia Ecsedi, Laura Vízkeleti, Ágnes Bégány
Dátum:2011
ISBN:978 953 307 291 3
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok könyvfejezet
Egészség- és Környezettudomány
Megjelenés:Breakthroughs in Melanoma Research / ed. Yohei Tanaka. - p. 237-263. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Bégány Ágnes (1954-2011) (bőrgyógyász, kozmetológus, klinikai onkológus)
Pályázati támogatás:K75191
OTKA
TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Daganatprogresszió genetikai markerei
2006TKI247
MTA
193/09-ETT
Egyéb
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM051295
Első szerző:Ecsedi Szilvia (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:DNA methylation characteristics of primary melanomas with distinct biological behaviour / Szilvia Irina Ecsedi, Hector Hernandez-Vargas, Sheila Coelho Lima, Laura Vizkeleti, Reka Toth, Viktoria Lazar, Viktoria Koroknai, Timea Kiss, Gabriella Emri, Zdenko Herceg, Roza Adany, Margit Balazs
Dátum:2014
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
primary melanoma
tumour progression
epigenetics
DNa methylation
hypermethylation
hypomethylation
copy number alteration
array CGH
BRAF mutation
Megjelenés:Plos One. - 9 : 5 (2014), p. e96612. -
További szerzők:Hernandez-Vargas, Hector Lima, Sheila Coelho Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Tóth Réka Lázár Viktória (1981-) (molekuláris biológus) Koroknai Viktória (1986-) (molekuláris biológus) Kiss Tímea (1986-) (molekuláris biológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Herceg Zdenko Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:K75191
OTKA
TÁMOP 4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Egészség- és Környezettudomány
TÁMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0031
TÁMOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM004395
Első szerző:Ecsedi Szilvia (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Chromosomal imbalances are associated with increased proliferation and might contribute to bone destruction in cholesteatoma / Ecsedi S., Rákosy Z., Vízkeleti L., Juhász A., Sziklai I., Adány R., Balázs M.
Dátum:2008
Megjegyzések:Our aim was to evaluate the copy number alterations of chromosomes 3, 7, 8, and 17 in middle ear cholesteatomas and define the association between the rate of cell proliferation and chromosome number changes. METHODS: Tissues were obtained from 16 patients. Fluorescence in situ hybridization was performed on tumor imprint preparations. Cell proliferation was characterized with Ki-67 monoclonal antibody on cholesteatoma samples and on postauricular skins as control. RESULTS: Different degrees of aneusomy were found for all chromosomes except for chromosome 3. Chromosome copy number alterations were associated with elevated proliferative rate and related also with the aggressiveness of the lesions. CONCLUSIONS: Based on our results, we assume that aneusomy of chromosomes 7, 8, and 17 might play an important role during invasion of the adjacent bony structures of cholesteatoma, as well as associate with increased cell proliferation activity, which might lead to the aggressive behavior of the tissue.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
cholesteatoma
FISH
chromosomal alterations
Megjelenés:Otolaryngology and Head and Neck Surgery. - 139 : 5 (2008), p. 635-640. -
További szerzők:Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Juhász Attila (fül-orr-gégész) Sziklai István (1954-) (fül-orr-gégész) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Internet cím:elektronikus változat
DOI
elektronikus változat
Borító:

5.

001-es BibID:BIBFORM058659
Első szerző:Kiss Tímea (molekuláris biológus)
Cím:The role of osteopontin expression in melanoma progression / Timea Kiss, Szilvia Ecsedi, Laura Vizkeleti, Viktoria Koroknai, Gabriella Emri, Nora Kovács, Roza Adany, Margit Balazs
Dátum:2015
ISSN:1010-4283
Megjegyzések:It was shown that osteopontin (OPN), a glycophosphoprotein, plays divergent roles in cancer progression. In addition to multiple intra- and extracellular functions, it facilitates migration of tumour cells, has crucial role in cell adhesion and is associated with increased metastasis formation. In previous studies, we performed global gene expression profiling on a series of primary melanoma samples and found that OPN was significantly overexpressed in ulcerated melanomas. The major purpose of this study was to define OPN expression in primary melanomas with differing biological behaviours. OPN mRNA expression was analysed by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (qRT-PCR) in primary melanoma tissues. Immunohistochemistry was performed using a tissue microarray. Cox regression tests were used for survival analysis. Greater than 50 % of the tissues exhibited high protein expression that was significantly associated with tumour thickness and metastasis. OPN mRNA expression was significantly increased in thicker melanomas and lesions with an ulcerated surface. Increased expression was primarily detected in advanced-stage tumours. A multivariate Cox regression analysis revealed that high OPN expression, tumour thickness and metastasis were significantly associated with reduced relapse-free survival. In summary, high OPN mRNA and protein expression were associated with a less favourable clinical outcome of primary melanoma patients. We determined that OPN is a significant predictive factor for the survival of primary melanoma patients. Based on our and others data, the high expression of OPN may have a crucial stimulatory role in tumour progression and metastasis formation, which, thus, have been proposed as potential targets for cancer diagnosis and therapy
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Melanoma progression
Osteopontin
Protein expression
Tissue microarray
Megjelenés:Tumor Biology. - 36 : 10 (2015), p. 7841-7847. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Koroknai Viktória (1986-) (molekuláris biológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Kovács Nóra (1989-) (népegészségügyi szakember) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:K112327
OTKA
TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024
TÁMOP
Egészségtudományok Doktori Iskola
4.2.4.A/2-11/1-2012-0001
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0031
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

6.

001-es BibID:BIBFORM023148
Első szerző:Kitoh, Yusuke
Cím:Combined GM-CSF treatment and M-CSF inhibition of tumor-associated macrophages induces dendritic cell-like signaling in vitro / Yusuke Kitoh, Masanao Saio, Naoe Gotoh, Naoki Umemura, Kenichi Nonaka, Juncheng Bai, Laura Vizkeleti, Daniel Torocsik, Margit Balazs, Roza Adany, Tsuyoshi Takami
Dátum:2011
ISSN:1019-6439
Megjegyzések:Macrophages demonstrate plasticity, and tumor-associated macrophages (TAM) can function as immunosuppressive cells in the tumor microenvironment. Therefore, in this study, we aimed to reprogram TAM in vitro with cytokine signal alteration. Granulocyte macrophage colony stimulating factor (GM-CSF) treatment alone did not lead to changes in the expression of M1 (including IL-1?, TNF? and CXCL-10) or M2 (including CD36, CD206 and CCL17) molecules by TAM in vitro, although they adopted a round morphology and were less adhesive to the culture dish. When macrophage colony stimulating factor (M-CSF) signals were suppressed by siRNA against the M-CSF receptor (M-CSFR) in conjunction with GM-CSF treatment, the signal transduction pathway of TAM was altered, and the expression of STAT1, STAT5 and STAT6, which are usually expressed by dendritic cells, was increased. However, the same treatment did not alter the TAM expression pattern of M1/M2 marker molecules. With respect to the NF-?B pathway, GM-CSF and M-CSFR siRNA combination treatment significantly induced the expression of p65, which is usually not expressed by TAM, while p50 and p105 expression by TAM was not affected by the treatment. These findings indicate that our model could not redirect TAM to a monocyte-derived dendritic cell-like phenotype based on the analysis of M1/M2 marker expression, but it was able to modify cell signaling pathways toward a dendritic cell-like pattern. Therefore, the present data suggest that TAM demonstrate plasticity toward dendritic cell-like signal transduction patterns, and that the alteration of the tumor microenvironment has the potential to reverse the immunosuppressive properties of TAM.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
tumor-associated macrophages
granulocyte-macrophage colony stimulating factor
macrophage colony stimulating factor receptor
cell signaling
Megjelenés:International Journal Of Oncology 38 : 5 (2011), p. 1409-1419. -
További szerzők:Saio, Masanao Gotoh, Naoe Umemura, Naoki Nonaka, Kenichi Bai, Juncheng Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Töröcsik Dániel (1979-) (bőrgyógyász) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Takami, Tsuyoshi
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

7.

001-es BibID:BIBFORM082732
035-os BibID:(WoS)000496470300001 (Scopus)85075118233
Első szerző:Koroknai Viktória (molekuláris biológus)
Cím:DNA hypermethylation is associated with invasive phenotype of malignant melanoma / Viktória Koroknai, István Szász, Hector Hernandez-Vargas, Nora Fernandez-Jimenez, Cyrille Cuenin, Zdenko Herceg, Laura Vízkeleti, Róza Ádány, Szilvia Ecsedi, Margit Balázs
Dátum:2020
ISSN:0906-6705
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Experimental Dermatology. - 29 : 1 (2020), p. 39-50. -
További szerzők:Szász István (1985-) (Ph.D hallgató) Hernandez-Vargas, Hector Fernandez-Jimenez, Nora Cuenin, Cyrille Herceg Zdenko Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:OTKA K112327
OTKA
ÚNKP-18-3
egyéb
GINOP-2.3.2?15?2016?00005
GINOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

8.

001-es BibID:BIBFORM062197
Első szerző:Koroknai Viktória (molekuláris biológus)
Cím:Genomic profiling of invasive melanoma cell lines by array comparative genomic hybridization / Viktória Koroknai, Szilvia Ecsedi, Laura Vízkeleti, Tímea Kiss, István Szász, Andrea Lukács, Orsolya Papp, Róza Ádány, Margit Balázs
Dátum:2016
ISSN:0960-8931
Megjegyzések:Malignant melanoma is one of the most aggressive humancancers. Invasion of cells is the first step in metastasis,resulting in cell migration through tissue compartments.We aimed to evaluate genomic alterations specificallyassociated with the invasive characteristics of melanomacells. Matrigel invasion assays were used to determine theinvasive properties of cell lines that originated from primarymelanomas. Array comparative genomic hybridizationanalyses were carried out to define the chromosome copynumber alterations (CNAs). Several recurrent CNAs wereidentified by array comparative genomic hybridization thataffected melanoma-related genes. Invasive primary celllines showed high frequencies of CNAs, including the lossof 7q and gain of 12q chromosomal regions targetingPTPN12, ADAM22, FZD1, TFPI2, GNG11, COL1A2, SMURF1,VGF, RELN and GLIPR1 genes. Gain of the GDNF (5p13.1),GPAA1, PLEC and SHARPIN (8q24.3) genes wassignificantly more frequent in invasive cell lines comparedwith the noninvasive ones. Importantly, copy number gainsof these genes were also found in cell lines that originatedfrom metastases, suggesting their role in melanomametastasis formation. The present study describes genomicdifferences between invasive and noninvasive melanomacell lines that may contribute toward the aggressivephenotype of human melanoma cells.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
array comparative genomic hybridization
copy number alteration
invasion
malignant melanoma
Megjelenés:Melanoma Research. - 2 (2016), p. 100-107. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Kiss Tímea (1986-) (molekuláris biológus) Szász István (1985-) (Ph.D hallgató) Lukács Andrea (1989-) (biológus) Papp Orsolya Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

9.

001-es BibID:BIBFORM049631
Első szerző:Lázár Viktória (molekuláris biológus)
Cím:Marked genetic differences between BRAF and NRAS mutated primary melanomas as revealed by array comparative genomic hybridization / Viktória Lázár, Szilvia Ecsedi, Laura Vízkeleti, Zsuzsa Rákosy, Gábor Boross, Balázs Szappanos, Ágnes Bégány, Gabriella Emri, Róza Ádány, Margit Balázs
Dátum:2012
ISSN:0960-8931
Megjegyzések:Somatic mutations of BRAF and NRAS oncogenes are thought to be among the first steps in melanoma initiation, but these mutations alone are insufficient to cause tumor progression. Our group studied the distinct genomic imbalances of primary melanomas harboring different BRAF or NRAS genotypes. We also aimed to highlight regions of change commonly seen together in different melanoma subgroups. Array comparative genomic hybridization was performed to assess copy number changes in 47 primary melanomas. BRAF and NRAS were screened for mutations by melting curve analysis. Reverse transcription PCR and fluorescence in-situ hybridization were performed to confirm the array comparative genomic hybridization results. Pairwise comparisons revealed distinct genomic profiles between melanomas harboring different mutations. Primary melanomas with the BRAF mutation exhibited more frequent losses on 10q23-q26 and gains on chromosome 7 and 1q23-q25 compared with melanomas with the NRAS mutation. Loss on the 11q23-q25 sequence was found mainly in conjunction with the NRAS mutation. Primary melanomas without the BRAF or the NRAS mutation showed frequent alterations in chromosomes 17 and 4. Correlation analysis revealed chromosomal alterations that coexist more often in these tumor subgroups. To find classifiers for BRAF mutation, random forest analysis was used. Fifteen candidates emerged with 87% prediction accuracy. Signaling interactions between the EGF/MAPK-JAK pathways were observed to be extensively altered in melanomas with the BRAF mutation. We found marked differences in the genetic pattern of the BRAF and NRAS mutated melanoma subgroups that might suggest that these mutations contribute to malignant melanoma in conjunction with distinct cooperating oncogenic events.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
array comparative genomic hybridization
BRAF mutation
Egészség- és Környezettudomány
NRAS mutation
primary melanoma
signaling pathway
Egészség- és Környezettudomány
Megjelenés:Melanoma Research. - 22 : 3 (2012), p. 202-214. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Boross Gábor Szappanos Balázs Bégány Ágnes (1954-2011) (bőrgyógyász, kozmetológus, klinikai onkológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Daganatprogresszió genetikai markerei
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

10.

001-es BibID:BIBFORM042387
Első szerző:Lázár Viktória (molekuláris biológus)
Cím:Characterization of candidate gene copy number alterations in the 11q13 region along with BRAF and NRAS mutations in human melanoma / Lázár Viktória, Ecsedi Szilvia, Szöllősi Attila G., Tóth Réka, Vízkeleti Laura, Rákosy Zsuzsa, Bégány Ágnes, Ádány Róza, Balázs Margit
Dátum:2009
ISSN:0893-3952
Megjegyzések:Amplification of the 11q13 chromosomal region is a common event in primary melanomas. Several candidategenes are localized at this sequence; however, their role in melanoma has not been clearly defined. The aim ofthis study was to develop an accurate method for determining the amplification pattern of six candidate genesthat map to this amplicon core and to elucidate the possible relationship between BRAF, NRAS mutations andCCND1 copy number alterations, all of which are key components of the MAP kinase pathway. Characterizationof gene copy numbers was performed by quantitative PCR and, as an alternative method, fluorescence in situhybridization was used to define the CCND1 amplification pattern at the single cell level. Samples with amplifiedCCND1 (32%) were further analyzed for copy number alterations for the TAOS1, FGF3, FGF19, FGF4 and EMS1genes. Coamplification of the CCND1 and TAOS1 was present in 15% of tumors and was more frequent inulcerated lesions (P?0.017). Furthermore, 56% of primary melanomas had either BRAF or NRAS mutations, butthese two mutations were not present in any of the lesions analyzed. Of these cases, 34% also had CCND1amplification. There was a significant relationship between NRAS activating mutations and UV exposure(P?0.005). We did not find correlations between CCND1 gene amplification status and any of the patients'clinicopathological parameters. However, CCND1 amplification simultaneously with either BRAF or NRASactivation mutations was observed mainly in primary tumors with ulcerated surfaces (P?0.028). We assumethat coamplification of these candidate genes in the 11q13 region or CCND1 gene alterations along with eitherBRAF or NRAS mutations might be more important for prognosis than the presence of these alterations alone.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
melanoma
11q13 amplicon core
CCND1 gene amplification
TAOS1
BRAF
NRAS
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Modern Pathology. - 22 : 10 (2009), p. 1367-1378. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Szöllősi Attila Gábor (1982-) (élettanász) Tóth Réka Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Bégány Ágnes (1954-2011) (bőrgyógyász, kozmetológus, klinikai onkológus) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:T04875
OTKA
K75191
OTKA
NKFP1-00003/2005
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

11.

001-es BibID:BIBFORM054863
Első szerző:Mezey Géza (idegsebész)
Cím:Prognosis in human glioblastoma based on expression of ligand growth hormone-releasing hormone, pituitary-type growth hormone-releasing hormone receptor, its splicing variant receptors, EGF receptor and PTEN genes / Géza Mezey, Andrea Treszl, Andrew V. Schally, Normann L. Block, Laura Vízkeleti, Alíz Juhász, Álmos Klekner, János Nagy, Margit Balázs, Gábor Halmos, László Bognár
Dátum:2014
ISSN:0171-5216
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
GHRH
pGHRHR
Splice variants
SV1
EGFR
PTEN?
Human glioblastoma
Megjelenés:Journal of Cancer Research and Clinical Oncology. - 140 : 10 (2014), p. 1641-1649. -
További szerzők:Treszl Andrea (1974-) (molekuláris biológus) Schally, Andrew Victor Block, Norman L. Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Juhász Alíz (1977-) (molekuláris biológus) Klekner Álmos (1970-) (idegsebész) Nagy János (1956-) (matematikus) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus) Halmos Gábor (1962-) (gyógyszerész, receptorfarmakológus, experimentális onkológus) Bognár László (1958-) (idegsebész, gyermekidegsebész)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0031
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0025 (G.H.)
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

12.

001-es BibID:BIBFORM041549
Első szerző:Rákosy Zsuzsa (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Integrative genomics identifies gene signature associated with melanoma ulceration / Zsuzsa Rakosy, Szilvia Ecsedi, Reka Toth, Laura Vizkeleti, Hector Herandez-Vargas, Viktoria Lazar, Gabriella Emri, Istvan Szatmari, Zdenko Herceg, Roza Adany, Margit Balazs
Dátum:2013
Megjegyzések:BACKGROUND:Despite the extensive research approaches applied to characterise malignant melanoma, no specific molecular markers are available that are clearly related to the progression of this disease. In this study, our aims were to define a gene expression signature associated with the clinical outcome of melanoma patients and to provide an integrative interpretation of the gene expression -, copy number alterations -, and promoter methylation patterns that contribute to clinically relevant molecular functional alterations.METHODS:Gene expression profiles were determined using the Affymetrix U133 Plus2.0 array. The NimbleGen Human CGH Whole-Genome Tiling array was used to define CNAs, and the Illumina GoldenGate Methylation platform was applied to characterise the methylation patterns of overlapping genes.RESULTS:WE IDENTIFIED TWO SUBCLASSES OF PRIMARY MELANOMA: one representing patients with better prognoses and the other being characteristic of patients with unfavourable outcomes. We assigned 1,080 genes as being significantly correlated with ulceration, 987 genes were downregulated and significantly enriched in the p53, Nf-kappaB, and WNT/beta-catenin pathways. Through integrated genome analysis, we defined 150 downregulated genes whose expression correlated with copy number losses in ulcerated samples. These genes were significantly enriched on chromosome 6q and 10q, which contained a total of 36 genes. Ten of these genes were downregulated and involved in cell-cell and cell-matrix adhesion or apoptosis. The expression and methylation patterns of additional genes exhibited an inverse correlation, suggesting that transcriptional silencing of these genes is driven by epigenetic events.CONCLUSION:Using an integrative genomic approach, we were able to identify functionally relevant molecular hotspots characterised by copy number losses and promoter hypermethylation in distinct molecular subtypes of melanoma that contribute to specific transcriptomic silencing and might indicate a poor clinical outcome of melanoma.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:PLoS One. - 8 : 1 (2013), p. e54958. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Tóth Réka Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Hernandez-Vargas, Hector Lázár Viktória (1981-) (molekuláris biológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Szatmári István (1971-) (biológus) Herceg Zdenko Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:OTKA K75191
OTKA
TÁMOP 4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Egészség- és Környezettudomány
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0031
TÁMOP
A legnagyobb súlyú népbetegségek genetikai meghatározottsága a magyar populációban
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1 2