CCL

Összesen 4 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM051295
Első szerző:Ecsedi Szilvia (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:DNA methylation characteristics of primary melanomas with distinct biological behaviour / Szilvia Irina Ecsedi, Hector Hernandez-Vargas, Sheila Coelho Lima, Laura Vizkeleti, Reka Toth, Viktoria Lazar, Viktoria Koroknai, Timea Kiss, Gabriella Emri, Zdenko Herceg, Roza Adany, Margit Balazs
Dátum:2014
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
primary melanoma
tumour progression
epigenetics
DNa methylation
hypermethylation
hypomethylation
copy number alteration
array CGH
BRAF mutation
Megjelenés:Plos One. - 9 : 5 (2014), p. e96612. -
További szerzők:Hernandez-Vargas, Hector Lima, Sheila Coelho Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Tóth Réka Lázár Viktória (1981-) (molekuláris biológus) Koroknai Viktória (1986-) (molekuláris biológus) Kiss Tímea (1986-) (molekuláris biológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Herceg Zdenko Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:K75191
OTKA
TÁMOP 4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Egészség- és Környezettudomány
TÁMOP 4.2.4.A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0031
TÁMOP
Internet cím:Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
DOI
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM042387
Első szerző:Lázár Viktória (molekuláris biológus)
Cím:Characterization of candidate gene copy number alterations in the 11q13 region along with BRAF and NRAS mutations in human melanoma / Lázár Viktória, Ecsedi Szilvia, Szöllősi Attila G., Tóth Réka, Vízkeleti Laura, Rákosy Zsuzsa, Bégány Ágnes, Ádány Róza, Balázs Margit
Dátum:2009
ISSN:0893-3952
Megjegyzések:Amplification of the 11q13 chromosomal region is a common event in primary melanomas. Several candidategenes are localized at this sequence; however, their role in melanoma has not been clearly defined. The aim ofthis study was to develop an accurate method for determining the amplification pattern of six candidate genesthat map to this amplicon core and to elucidate the possible relationship between BRAF, NRAS mutations andCCND1 copy number alterations, all of which are key components of the MAP kinase pathway. Characterizationof gene copy numbers was performed by quantitative PCR and, as an alternative method, fluorescence in situhybridization was used to define the CCND1 amplification pattern at the single cell level. Samples with amplifiedCCND1 (32%) were further analyzed for copy number alterations for the TAOS1, FGF3, FGF19, FGF4 and EMS1genes. Coamplification of the CCND1 and TAOS1 was present in 15% of tumors and was more frequent inulcerated lesions (P?0.017). Furthermore, 56% of primary melanomas had either BRAF or NRAS mutations, butthese two mutations were not present in any of the lesions analyzed. Of these cases, 34% also had CCND1amplification. There was a significant relationship between NRAS activating mutations and UV exposure(P?0.005). We did not find correlations between CCND1 gene amplification status and any of the patients'clinicopathological parameters. However, CCND1 amplification simultaneously with either BRAF or NRASactivation mutations was observed mainly in primary tumors with ulcerated surfaces (P?0.028). We assumethat coamplification of these candidate genes in the 11q13 region or CCND1 gene alterations along with eitherBRAF or NRAS mutations might be more important for prognosis than the presence of these alterations alone.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
melanoma
11q13 amplicon core
CCND1 gene amplification
TAOS1
BRAF
NRAS
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:Modern Pathology. - 22 : 10 (2009), p. 1367-1378. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Szöllősi Attila Gábor (1982-) (élettanász) Tóth Réka Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Bégány Ágnes (1954-2011) (bőrgyógyász, kozmetológus, klinikai onkológus) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:T04875
OTKA
K75191
OTKA
NKFP1-00003/2005
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM041549
Első szerző:Rákosy Zsuzsa (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Integrative genomics identifies gene signature associated with melanoma ulceration / Zsuzsa Rakosy, Szilvia Ecsedi, Reka Toth, Laura Vizkeleti, Hector Herandez-Vargas, Viktoria Lazar, Gabriella Emri, Istvan Szatmari, Zdenko Herceg, Roza Adany, Margit Balazs
Dátum:2013
Megjegyzések:BACKGROUND:Despite the extensive research approaches applied to characterise malignant melanoma, no specific molecular markers are available that are clearly related to the progression of this disease. In this study, our aims were to define a gene expression signature associated with the clinical outcome of melanoma patients and to provide an integrative interpretation of the gene expression -, copy number alterations -, and promoter methylation patterns that contribute to clinically relevant molecular functional alterations.METHODS:Gene expression profiles were determined using the Affymetrix U133 Plus2.0 array. The NimbleGen Human CGH Whole-Genome Tiling array was used to define CNAs, and the Illumina GoldenGate Methylation platform was applied to characterise the methylation patterns of overlapping genes.RESULTS:WE IDENTIFIED TWO SUBCLASSES OF PRIMARY MELANOMA: one representing patients with better prognoses and the other being characteristic of patients with unfavourable outcomes. We assigned 1,080 genes as being significantly correlated with ulceration, 987 genes were downregulated and significantly enriched in the p53, Nf-kappaB, and WNT/beta-catenin pathways. Through integrated genome analysis, we defined 150 downregulated genes whose expression correlated with copy number losses in ulcerated samples. These genes were significantly enriched on chromosome 6q and 10q, which contained a total of 36 genes. Ten of these genes were downregulated and involved in cell-cell and cell-matrix adhesion or apoptosis. The expression and methylation patterns of additional genes exhibited an inverse correlation, suggesting that transcriptional silencing of these genes is driven by epigenetic events.CONCLUSION:Using an integrative genomic approach, we were able to identify functionally relevant molecular hotspots characterised by copy number losses and promoter hypermethylation in distinct molecular subtypes of melanoma that contribute to specific transcriptomic silencing and might indicate a poor clinical outcome of melanoma.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:PLoS One. - 8 : 1 (2013), p. e54958. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Tóth Réka Vízkeleti Laura (1984-) (molekuláris biológus, genetikus) Hernandez-Vargas, Hector Lázár Viktória (1981-) (molekuláris biológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Szatmári István (1971-) (biológus) Herceg Zdenko Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:OTKA K75191
OTKA
TÁMOP 4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Egészség- és Környezettudomány
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0031
TÁMOP
A legnagyobb súlyú népbetegségek genetikai meghatározottsága a magyar populációban
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

4.

001-es BibID:BIBFORM030298
Első szerző:Vízkeleti Laura (molekuláris biológus, genetikus)
Cím:Prognostic relevance of the expressions of CAV1 and TES genes on 7q31 in melanoma / Vizkeleti Laura, Ecsedi Szilvia, Rákosy Zsuzsa, Bégány Ágnes, Emri Gabriella, Tóth Réka, Orosz Adrienn, Szőllősi Attila Gábor, Méhes Gábor, Ádány Róza, Balázs Margit
Dátum:2012
ISSN:1945-0494
Megjegyzések:The 7q31 locus contains several genes affected in cancer progression. Although evidences exist regarding its impact on tumorigenesis, the role of genetic alterations and the expressions of locus-related genes are still controversial. Our study aimed to define the 7q31 copy number alterations in primary melanomas, primary-metastatic tumor pairs and cell lines. Data were correlated with clinical-pathological parameters. Genetic data show that 7q31 copy number distribution was heterogeneous in both primary and metastatic tumors. Extra copies were highly accompanied by chromosome 7 polisomy, and significantly increased in primary lesions with poor prognosis. Additionally, we determined the mRNA and protein levels of the locus-related CAV1 and TES genes. TES mRNA level was associated with metastatic location. CAV1 mRNA and protein levels were significantly higher in thicker tumors, however, lack of protein was also observed in a subpopulation of thin lesions. Expressions of CAV1 and TES were not associated with 7q31 alterations. In conclusion, 7q31 amplification can predict unfavorable outcome. Alterations of TES mRNA level may predict the location of metastasis. CAV1 possibly affect the cancer cell invasion.
Tárgyszavak:Orvostudományok Egészségtudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Egészség- és Környezettudomány
Megjelenés:Frontiers in Bioscience (elite edition) E4 : 1 (2012), p. 1802-1812. -
További szerzők:Ecsedi Szilvia (1982-) (molekuláris biológus, genetikus) Rákosy Zsuzsa (1978-) (sejtbiológus, molekuláris biológus, genetikus) Bégány Ágnes (1954-2011) (bőrgyógyász, kozmetológus, klinikai onkológus) Emri Gabriella (1972-) (bőrgyógyász, allergológus, onkológus) Tóth Réka Orosz Adrienn Szöllősi Attila Gábor (1982-) (élettanász) Méhes Gábor (1966-) (patológus) Ádány Róza (1952-) (megelőző orvostan és népegészségtan szakorvos) Balázs Margit (1952-) (sejtbiológus, molekuláris genetikus)
Pályázati támogatás:TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007
TÁMOP
Daganatprogresszió genetikai markerei
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1