Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM072111
035-os BibID:	(WoS)000423645700002 (Scopus)85034832211
Első szerző:	Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:	Dynamic transcriptional control of macrophage miRNA signature via inflammation responsive enhancers revealed using a combination of next generation sequencing-based approaches / Czimmerer Zsolt, Horvath Attila, Daniel Bence, Nagy Gergely, Cuaranta-Monroy Ixchelt, Kiss Mate, Kolostyak Zsuzsanna, Poliska Szilard, Steiner Laszlo, Giannakis Nikolas, Varga Tamas, Nagy Laszlo
Dátum:	2018
ISSN:	1874-9399
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Biochimica et Biophysica Acta (BBA). Gene Regulatory Mechanisms. - 1861 : 1 (2018), p. 14-28. -
További szerzők:	Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Cuaranta-Monroy, Ixchelt (1979-) (Ph.D. hallgató) Kiss Máté Kolostyák Zsuzsanna Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Steiner László Giannakis, Nikolas Varga Tamás (1971-) (biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM065040
Első szerző:	Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:	The IL-4/STAT6 signaling axis establishes a conserved microRNA signature in human and mouse macrophages regulating cell survival via miR-342-3p / Zsolt Czimmerer, Tamas Varga, Mate Kiss, Cesaré Ovando Vázquez, Quang Minh Doan-Xuan, Dominik Rückerl, Sudhir Gopal Tattikota, Xin Yan, Zsuzsanna S. Nagy, Bence Daniel, Szilard Poliska, Attila Horvath, Gergely Nagy, Eva Varallyay, Matthew N. Poy, Judith E. Allen, Zsolt Bacso, Cei Abreu-Goodger, Laszlo Nagy
Dátum:	2016
ISSN:	1756-994X
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Megjelenés:	Genome Medicine. - 8 : 1 (2016), p. 1-22. -
További szerzők:	Varga Tamás (1971-) (biológus) Kiss Máté Vázquez, Cesaré Ovando Doan-Xuan, Quang-Minh (1986-) (biofizikus) Rückerl, Dominik Tattikota, Sudhir Gopal Yan, Xin Nagy Zsuzsanna S. Dániel Bence (1987-) (molekuláris biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Varallyay Éva Poy, Matthew N. Allen, Judith E. Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Abreu-Goodger, Cei Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:	K100196 OTKA 116855 OTKA 4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023 TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001 TÁMOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM042249
Első szerző:	Czimmerer Zsolt (molekuláris biológus)
Cím:	Identification of novel markers of alternative activation and potential endogenous PPARgamma ligand production mechanisms in human IL-4 stimulated differentiating macrophages / Czimmerer Zsolt, Varga Tamas, Poliska Szilard, Nemet Istvan, Szanto Attila, Nagy Laszlo
Dátum:	2012
ISSN:	0171-2985
Megjegyzések:	We analyzed global gene expression profiles of IL-4 induced alternatively activated as well as IFNγ+TNFα stimulated classically activated human monocyte derived macrophages and identified novel IL-4 regulated alternative activation marker genes including MS4A4A, SLA, CD180, and ENPP2. Transcription factor prediction analysis of IL-4 regulated genes suggested that the regulated genes are involved in a complex regulation of lipid metabolism, defense against cell metabolism derived reactive oxygen species, and basal expression of inflammation linked genes. Both an in silico transcription activation prediction as well as experimental data suggested the presence of alternative macrophage activation specific endogenous PPARγ ligand producing mechanisms. We found the induction of three enzymes whose activity can potentially generate endogenous PPARγ ligands in an IL-4 dependent manner. These are MAOA, ENPP2, and ALOX15 producing 5-methoxy-indole acetate, lysophosphatidic acid (LPA) and 13-hydroxyoctadienoic acid (13-HODE), and/or 15-hydroxyeicosatetraenoic acid (15-HETE), respectively. Our data suggest that global gene expression profiling, combined with computational transcription activity prediction, can lead to identification of transcriptional networks that underpin cellular subtype specification.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban Molekuláris Medicina
Megjelenés:	Immunobiology. - 217 : 12 (2012), p. 1301-1314. -
További szerzők:	Varga Tamás (1971-) (biológus) Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Német István (1982-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Szántó Attila (1976-) (orvos, biokémikus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:	NK72730 OTKA K100196 OTKA REGPOT-2008-1-01/MOLMEDREX/229920 FP7 TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP Magreceptor természetes ligandok azonosítása TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024 TÁMOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM016595
Első szerző:	Varga Tamás (biológus)
Cím:	PPARs are a unique set of fatty acid regulated transcription factors controlling both lipid metabolism and inflammation / Tamas Varga, Zsolt Czimmerer, Laszlo Nagy
Dátum:	2011
ISSN:	0925-4439
Megjegyzések:	Cells are constantly exposed to a large variety of lipids. Traditionally, these molecules were thought to serve as simple energy storing molecules. More recently it has been realized that they can also initiate and regulate signaling events that will decisively influence development, cellular differentiation, metabolism and related functions through the regulation of gene expression. Multicellular organisms dedicate a large family of nuclear receptors to these tasks. These proteins combine the defining features of both transcription factors and receptor molecules, and therefore have the unique ability of being able to bind lipid signaling molecules and transduce the appropriate signals derived from lipid environment to the level of gene expression. Intriguingly, the members of a subfamily of the nuclear receptors, the peroxisome proliferator-activated receptors (PPARs) are able to sense and interpret fatty acid signals derived from dietary lipids, pathogenic lipoproteins or essential fatty acid metabolites. Not surprisingly, PPARs were found to be key regulators of lipid and carbohydrate metabolism. Unexpectedly, later studies revealed that PPARs are also able to modulate inflammatory responses. Here we summarize our understanding on how these transcription factors/receptors connect lipid metabolism to inflammation and some of the novel regulatory mechanisms by which they contribute to homeostasis and certain pathological conditions. This article is part of a Special Issue entitled: Translating nuclear receptors from health to disease.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban PPAR Inflammation Lipid metabolism Transcriptional regulation
Megjelenés:	Biochimica et Biophysica Acta (BBA). Molecular Basis of Disease. - 1812 : 8 (2011), p. 1007-1022. -
További szerzők:	Czimmerer Zsolt (1981-) (molekuláris biológus) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Internet cím:	DOI Szerző által megadott URL Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: