CCL

Összesen 3 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM103006
035-os BibID:(cikkazonosító)e2113749119 (WoS)000838706400006 (Scopus)85133105691
Első szerző:Göcz Balázs
Cím:Transcriptome profiling of kisspeptin neurons from the mouse arcuate nucleus reveals new mechanisms in estrogenic control of fertility / Balázs Göcz, Éva Rumpler, Miklós Sárvári, Katalin Skrapits, Szabolcs Takács, Imre Farkas, Veronika Csillag, Sarolta H. Trinh, Zsuzsanna Bardóczi, Yvette Ruska, Norbert Solymosi, Szilárd Póliska, Zsuzsanna Szőke, Lucia Bartoloni, Yassine Zouaghi, Andrea Messina, Nelly Pitteloud, Ross C. Anderson, Robert P. Millar, Richard Quinton, Stephen M. Manchishi, William H. Colledge, Erik Hrabovszky
Dátum:2022
ISSN:0027-8424 1091-6490
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 119 : 27 (2022), p. 1-12. -
További szerzők:Rumpler Éva Sárvári Miklós Skrapits Katalin Takács Szabolcs Farkas Imre Csillag Veronika Trinh, Sarolta H. Bardóczi Zsuzsanna Ruska, Yvette Solymosi Norbert Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Szőke Zsuzsanna Bartoloni, Lucia Zouaghi, Yassine Messina, Andrea Pitteloud, Nelly Anderson, Ross C. Millar, Robert P. Quinton, Richard Manchishi, Stephen M. Colledge, William H. Hrabovszky Erik
Pályázati támogatás:K128317
OTKA
K138137
OTKA
PD134837
OTKA
2017-1.2.1-NKP-2017-00002
Egyéb
Internet cím:DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM116728
035-os BibID:(cikkazonsoító)105121 (scopus)85168733631
Első szerző:Rumpler Éva
Cím:Development of a versatile LCM-Seq method for spatial transcriptomics of fluorescently tagged cholinergic neuron populations / Rumpler Éva, Göcz Balázs, Skrapits Katalin, Sárvári Miklós, Takács Szabolcs, Farkas Imre, Póliska Szilárd, Papp Márton, Solymosi Norbert, Hrabovszky Erik
Dátum:2023
ISSN:0021-9258 1083-351X
Megjegyzések:Single-cell transcriptomics are powerful tools to define neuronal cell types based on co-expressed gene clusters. Limited RNA input in these technologies necessarily compromises transcriptome coverage and accuracy of differential expression analysis. We propose that bulk RNA-Seq of neuronal pools defined by spatial position offers an alternative strategy to overcome these technical limitations. We report a laser-capture microdissection (LCM)-Seq method which allows deep transcriptome profiling of fluorescently tagged neuron populations isolated with LCM from histological sections of transgenic mice. Mild formaldehyde fixation of ZsGreen marker protein, LCM sampling of ?300 pooled neurons, followed by RNA isolation, library preparation and RNA-Seq with methods optimized for nanogram amounts of moderately degraded RNA enabled us to detect ?15,000 different transcripts in fluorescently labeled cholinergic neuron populations. The LCM-Seq approach showed excellent accuracy in quantitative studies, allowing us to detect 2891 transcripts expressed differentially between the spatially defined and clinically relevant cholinergic neuron populations of the dorsal caudate-putamen and medial septum. In summary, the LCM-Seq method we report in this study is a versatile, sensitive, and accurate bulk sequencing approach to study the transcriptome profile and differential gene expression of fluorescently tagged neuronal populations isolated from transgenic mice with high spatial precision.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
basal forebrain
cholinergic
formaldehyde
gene expression
laser-capture microdissection
RNA-Seq
spatial transcriptomics
transcriptome profiling
Megjelenés:Journal Of Biological Chemistry. - 299 : 9 (2023), p. 1-13. -
További szerzők:Göcz Balázs Skrapits Katalin Sárvári Miklós Takács Szabolcs Farkas Imre Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Papp Márton Solymosi Norbert Hrabovszky Erik
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

3.

001-es BibID:BIBFORM097909
035-os BibID:(cikkazonosító)e67714 (WoS)000669873900001 (Scopus)85108897919
Első szerző:Skrapits Katalin
Cím:The cryptic gonadotropin-releasing hormone neuronal system of human basal ganglia / Skrapits Katalin, Sárvári Miklós, Farkas Imre, Göcz Balázs, Takács Szabolcs, Rumpler Éva, Váczi Viktória, Vastagh Csaba, Rácz Gergely, Matolcsy András, Solymosi Norbert, Póliska Szilárd, Tóth Blanka, Erdélyi Ferenc, Szabó Gábor, Culler Michael D., Allet Cecile, Cotellessa Ludovica, Prévot Vincent, Giacobini Paolo, Hrabovszky Erik
Dátum:2021
ISSN:2050-084X
Tárgyszavak:Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:eLife. - 10 (2021), p. 1-26. -
További szerzők:Sárvári Miklós Farkas Imre Göcz Balázs Takács Szabolcs Rumpler Éva Váczi Viktória Vastagh Csaba Rácz Gergely Matolcsy András Solymosi Norbert Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Tóth Blanka Erdélyi Ferenc Szabó Gábor (budapesti orvos) Culler, Michael D. Allet, Cecile Cotellessa, Ludovica Prévot, Vincent Giacobini, Paolo Hrabovszky Erik
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1