Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM030851
Első szerző:	Bubán Tamás (belgyógyász, gasztroenterológus)
Cím:	Detection of internal tandem duplications in the FLT3 gene by different electrophoretic methods / Tamás Bubán, Katalin Koczok, Róza Földesi, Gabriella Szabó, Andrea Sümegi, Miklós Tanyi, László Szerafin, Miklós Udvardy, János Kappelmayer, Péter Antal-Szalmás
Dátum:	2011
Megjegyzések:	Abstract Background: In acute myeloid leukemia (AML), the internal tandem duplication (ITD) in the juxtamembrane domain of the FLT3 (Fms-like tyrosine kinase 3) gene is one of the most frequent genetic alterations associated with poor prognosis. Methods: A complex evaluation of the analytical properties of the three most frequently used detection methods - PCR followed by agarose (AGE), polyacrylamide (PAGE) or capillary electrophoresis (CE) - was performed on 95 DNA samples obtained from 73 AML patients. Results: All the three methods verified the presence of a mutant allele in 20 samples from 18 patients. AGE and PAGE could detect the presence of 1%-2% mutant allele, while the detection limit of CE was 0.28%. However, acceptable reproducibility (inter-assay CV <25%) of the mutant allele rate determination was only achievable above 1.5% mutant/total allele rate. The reproducibility of the ITD size determination by CE was much better, but the ITD size calculated by PeakScanner or GeneScan analysis was 7% lower as compared to values obtained by DNA sequencing. The presence of multiple ITD was over-estimated by PAGE and AGE due to the formation of heteroduplexes. Conclusions: This study suggests the use of PCR+CE in the diagnostics and the follow-up of AML patients. The data further supports the importance of proper analytical evaluation of home-made molecular biological diagnostic tests.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk electrophoresis FLT3 ITD egyetemen (Magyarországon) készült közlemény
Megjelenés:	Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. - 50 : 2 (2011), p. 301-310. -
További szerzők:	Koczok Katalin (1979-) (labororvos) Földesi Róza (1967-) (klinikai laboratóriumi kutató, PhD hallgató) Szabó Gabriella Sümegi Andrea (1969-) (biológus) Tanyi Miklós (1968-) (sebész) Szerafin László (1958-) (belgyógyászat, haematológia, klinikai onkológia szakorvos) Udvardy Miklós (1947-) (belgyógyász, haematológus) Kappelmayer János (1960-) (laboratóriumi szakorvos) Antal-Szalmás Péter (1968-) (laboratóriumi szakorvos)
Pályázati támogatás:	TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP Celluláris hematológia - immunológia
Internet cím:	DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM117653
035-os BibID:	(cikkazonosító)117747 (Scopus)85182501705
Első szerző:	Nagy Gábor (laboratóriumi szakorvos, laboratóriumi hematológus és immunológus)
Cím:	A novel way to evaluate autoantibody interference in samples with mixed antinuclear antibody patterns in the HEp-2 cell based indirect immunofluorescence assay and comparison of conventional microscopic and computer-aided pattern recognition / Gábor Nagy, Róza Földesi, István Csípő, Tünde Tarr, Gabriella Szűcs, Antónia Szántó, Tamás Bubán, Zoltán Szekanecz, Mária Papp, János Kappelmayer, Péter Antal-Szalmás
Dátum:	2024
ISSN:	0009-8981
Megjegyzések:	Background: A major challenge of the HEp-2 cell-based indirect immunofluorescence (IIF) assays is the correct identification of the individual anti-nuclear antibodies (ANAs) if more than one is present in a sample. We created artificial mixes by pooling two different samples with a single autoantibody in different titers. Comparison of the expected and observed patterns and titers clarifies the interference between the two tested ANAs. Methods: Serum samples with a single homogeneous or speckled ANA pattern were serially diluted and mixed in 16 combinations, providing end-point titers of 1:5,120 to 1:80 for both patterns. These mixes were tested by a HEp-2 IIF assay and were evaluated by conventional evaluation, the EUROPattern (EPa) system and on-screen analysis. Results: Homogeneous pattern can alter the identification of the speckled pattern much more than vice versa, but both has an interfering effect on the other. The effect of the interfering on the tested pattern was higher if the titer of the former one was higher. The pattern recognition efficacy of conventional and the on-screen evaluation was similar and superior compared to the EPa analysis. Conclusions: The application of artificial mixed samples can help the evaluation of the efficacy of manual and computer-aided ANA HEp-2 pattern recognition.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk antinukleáris antitest ANA kevert antinukleáris antitest mintázatok autoantitest indirekt immunfluoreszcencia számítógéppel segített mintázatfelismerés képelemzés mintázatfelismerő algoritmus automatizált mikroszkóp fluoreszcens mikroszkóp INDIREKT IMMUNFLUORESZCENS TESZT HEp-2
Megjelenés:	Clinica Chimica Acta. - 553 (2024), p. 1-9. -
További szerzők:	Földesi Róza (1967-) (klinikai laboratóriumi kutató, PhD hallgató) Csípő István (1953-) (vegyész) Tarr Tünde (1976-) (belgyógyász, allergológus és klinikai immunológus) Szűcs Gabriella (1963-) (belgyógyász, allergológus és klinikai immunológus, reumatológus) Szántó Antónia (1977-) (belgyógyász, allergológus és klinikai immunológus) Bubán Tamás (1967-) (belgyógyász, gasztroenterológus) Szekanecz Zoltán (1964-) (reumatológus, belgyógyász, immunológus) Papp Mária (1975-) (belgyógyász, gasztroenterológus) Kappelmayer János (1960-) (laboratóriumi szakorvos) Antal-Szalmás Péter (1968-) (laboratóriumi szakorvos)
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon: