CCL

Összesen 2 találat.
#/oldal:
Részletezés:
Rendezés:

1.

001-es BibID:BIBFORM069234
035-os BibID:(cikkazonosító)e0172189 (WOS)000395983500029 (Scopus)85014323809
Első szerző:Thangaraju, Kiruphagaran
Cím:Genomic variants reveal differential evolutionary constraints on human transglutaminases and point towards unrecognized significance of transglutaminase 2 / Thangaraju Kiruphagaran, Király Róbert, Demény Máté A., Mótyán János András, Fuxreiter Mónika, Fésüs László
Dátum:2017
ISSN:1932-6203
Megjegyzések:Transglutaminases (TGMs) catalyze Ca2+-dependent transamidation of proteins with specified roles in blood clotting (F13a) and in cornification (TGM1, TGM3). The ubiquitous TGM2 has well described enzymatic and non-enzymatic functions but in-spite of numerous studies its physiological function in humans has not been defined. We compared data on non-synonymous single nucleotide variations (nsSNVs) and loss-of-function variants on TGM1-7 and F13a from the Exome aggregation consortium dataset, and used computational and biochemical analysis to reveal the roles of damaging nsSNVs of TGM2. TGM2 and F13a display rarer damaging nsSNV sites than other TGMs and sequence of TGM2, F13a and TGM1 are evolutionary constrained. TGM2 nsSNVs are predicted to destabilize protein structure, influence Ca2+ and GTP regulation, and non-enzymatic interactions, but none coincide with conserved functional sites. We have experimentally characterized six TGM2 allelic variants detected so far in homozygous form, out of which only one, p.Arg222Gln, has decreased activities. Published exome sequencing data from various populations have not uncovered individuals with homozygous loss-of-function variants for TGM2, TGM3 and TGM7. Thus it can be concluded that human transglutaminases differ in harboring damaging variants and TGM2 is under purifying selection suggesting that it may have so far not revealed physiological functions.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
folyóiratcikk
Megjelenés:Plos One. - 12 : 3 (2017), p. 1-24. -
További szerzők:Király Róbert (1975-) (biológus) Demény Máté Ágoston (1976-) (molekuláris biológus) Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Fuxreiter Mónika (1969-) (kutató vegyész) Fésüs László (1947-) (orvos biokémikus)
Pályázati támogatás:NK-105046
OTKA
NN-106562
OTKA
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV-2012-0023
TÁMOP
MTA-LP2012-41
Egyéb
RH/885/2013
Egyéb
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:

2.

001-es BibID:BIBFORM065611
Első szerző:Thangaraju, Kiruphagaran
Cím:Computational analyses of the effect of novel amino acid clusters of human transglutaminase 2 on its structure and function / Kiruphagaran Thangaraju, Róbert Király, János András Mótyán, Viktor Attila Ambrus, Mónika Fuxreiter, László Fésüs
Dátum:2017
ISSN:0939-4451
Megjegyzések:Transglutaminase 2 (TGM2) is a unique protein of a nine member family with several enzymatic and non-enzymatic activities and interacting partners. Its physiological and pathological roles, however, are not fully understood. Comparative genomic and computational analysis reported here have revealed phylogenetic changes of TGM2 resulting in novel amino acid clusters in humans and other primates, which may impact secondary structure and increase protein stability. These clusters are located in intrinsically disordered regions and via short linear motifs influence interactions with TGM2 partners directly, or through post-translation modification (phosphorylation and N-glycosylation sites). Our data shed new light on the structural background and evolution of TGM2 multi-functionality and points to so far unrevealed biological roles of the enzyme.
Tárgyszavak:Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban
Transglutaminase 2
Short linear motifs
Protein stability
Intrinsically disordered regions
Novel amino acid clusters
Megjelenés:Amino Acids 49 :3 (2017), p. 605-614. -
További szerzők:Király Róbert (1975-) (biológus) Mótyán János András (1981-) (biokémikus, molekuláris biológus) Ambrus Viktor Attila (1989-) (biotechnológus) Fuxreiter Mónika (1969-) (kutató vegyész) Fésüs László (1947-) (orvos biokémikus)
Pályázati támogatás:NK 105046
OTKA
NN 106562
OTKA
TÁMOP-4.2.2.A-11/1/KONV2012-0023
TÁMOP
TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001
TÁMOP
Internet cím:Szerző által megadott URL
DOI
Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Rekordok letöltése1