Találati lista | Tudóstér

001-es BibID:	BIBFORM086696
035-os BibID:	(WoS)000553333300022 (Scopus)85088493600
Első szerző:	Fadel, Lina (gyógyszerész)
Cím:	Agonist binding directs dynamic competition among nuclear receptors for heterodimerization with retinoid X receptor / Lina Fadel, Bálint Rehó, Julianna Volkó, Dóra Bojcsuk, Zsuzsanna Kolostyák, Gergely Nagy, Gabriele Müller, Zoltán Simándi, Éva Hegedüs, Gábor Szabó, Katalin Tóth, Laszlo Nagy, György Vámosi
Dátum:	2020
ISSN:	0021-9258 1083-351X
Megjegyzések:	Retinoid X receptor (RXR) plays a pivotal role as a transcriptional regulator and serves as an obligatory heterodimerization partner for at least 20 other nuclear receptors (NRs). Given a potentially limiting/sequestered pool of RXR and simultaneous expression of several RXR partners, we hypothesized that NRs compete for binding to RXR and that this competition may be directed by specific agonist treatment. Here, we tested this hypothesis on three NRs: peroxisome proliferator-activated receptor γ (PPARγ), vitamin D receptor (VDR), and retinoic acid receptor α (RARα). Evaluation of competition relied on a nuclear-translocation assay applied in a three-color imaging model system by detecting changes in heterodimerization between RXRα and one of its partners (NR1), in the presence of another competing partner (NR2). Our results indicated dynamic competition between the NRs governed by two mechanisms. First, in the absence of agonist treatment, there is a hierarchy of affinities between RXRα and its partners in the following order: RARα>PPARγ>VDR. Second, upon agonist treatment, RXRα favors the liganded partner. We conclude that recruiting RXRα by the liganded NR not only facilitates a stimulus-specific cellular response, but might also impede other NR pathways involving RXRα.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk
Megjelenés:	Journal of Biological Chemistry. - 295 : 29 (2020), p. 10045-10061. -
További szerzők:	Rehó Bálint (1992-) Volkó Julianna (1983-) (biotechnológus) Bojcsuk Dóra (1990-) (klinikai laboratóriumi kutató) Kolostyák Zsuzsanna Nagy Gergely (1986-) (molekuláris biológus) Müller, Gabriele Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus) Tóth Katalin Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Vámosi György (1967-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	NKFIH NN129371 egyéb NKFIH KKP129909 egyéb NKFIH K124298 egyéb GINOP-2.3.2-15-2016-00050 GINOP GINOP-2.3.3-15-2016-00003 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM072900
035-os BibID:	(Cikkazonosító)12734 (WOS)000412491500006 (Scopus)85030764085
Első szerző:	Imre László (biológus)
Cím:	Nucleosome stability measured in situ by automated quantitative imaging / László Imre, Zoltán Simándi, Attila Horvath, György Fenyofalvi, Péter Nanasi Jr., Erfaneh Firouzi Niaki, Éva Hegedus, Zsolt Bacso, Urbain Weyemi, Rebekka Mauser, Juan Ausio, Albert Jeltsch, William Bonner, László Nagy, Hiroshi Kimura, Gábor Szabo
Dátum:	2017
ISSN:	2045-2322
Megjegyzések:	Current approaches have limitations in providing insight into the functional properties of particular nucleosomes in their native molecular environment. Here we describe a simple and powerful method involving elution of histones using intercalators or salt, to assess stability features dependent on DNA superhelicity and relying mainly on electrostatic interactions, respectively, and measurement of the fraction of histones remaining chromatin-bound in the individual nuclei using histone type- or posttranslational modification- (PTM-) specific antibodies and automated, quantitative imaging. The method has been validated in H3K4me3 ChIP-seq experiments, by the quantitative assessment of chromatin loop relaxation required for nucleosomal destabilization, and by comparative analyses of the intercalator and salt induced release from the nucleosomes of different histones. The accuracy of the assay allowed us to observe examples of strict association between nucleosome stability and PTMs across cell types, differentiation state and throughout the cell-cycle in close to native chromatin context, and resolve ambiguities regarding the destabilizing effect of H2A.X phosphorylation. The advantages of the in situ measuring scenario are demonstrated via the marked effect of DNA nicking on histone eviction that underscores the powerful potential of topological relaxation in the epigenetic regulation of DNA accessibility.
Tárgyszavak:	Orvostudományok Elméleti orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk Fluorescence imaging Nuclear organization Epigenetics Molekuláris Medicina
Megjelenés:	Scientific Reports. - 7 : 1 (2017), p. 1-15. -
További szerzők:	Simándi Zoltán (1984-) (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Fenyőfalvi György Nánási Péter Pál ifj. (1987-) (sejtbiológus) Firouzi Niaki, Erfaneh Hegedűs Éva (1978-) (biofizikus) Bacsó Zsolt (1963-) (biofizikus) Weyemi, Urbain Mauser, Rebekka Ausio, Juan Jeltsch, Albert Bonner, William Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus) Kimura, Hiroshi Szabó Gábor (1953-) (biofizikus)
Pályázati támogatás:	K72762 OTKA NK101337 OTKA TÁMOP-4.2.2-08/1-2008-0015 TÁMOP TÁMOP-4.2.1/B-09/1/KONV-2010-0007 TÁMOP I. ABC transzporterek; II. Magasabbrendű kromatinszerkezet TÁMOP 4.2.2.A- 11/1/KONV-2012-0023 "VÉD-ELEM TÁMOP TÁMOP 4.2.4. A/2-11-1-2012-0001 TÁMOP GINOP-2.3.2-15-2016-00044 GINOP
Internet cím:	Szerző által megadott URL DOI Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat
Borító:
Saját polcon:

001-es BibID:	BIBFORM055639
035-os BibID:	(scopus)84923228096 (wos)000349849000009
Első szerző:	Simándi Zoltán (Ph.D. hallgató, molekuláris biológus)
Cím:	PRMT1 and PRMT8 regulate retinoic acid-dependent neuronal differentiation with implications to neuropathology / Zoltan Simandi, Erik Czipa, Attila Horvath, Aron Koszeghy, Csilla Bordas, Szilárd Póliska, István Juhász, László Imre, Gábor Szabó, Balazs Dezso, Endre Barta, Sascha Sauer, Katalin Karolyi, Ilona Kovacs, Gábor Hutóczky, László Bognár, Álmos Klekner, Peter Szucs, Bálint L. Bálint, Laszlo Nagy
Dátum:	2015
ISSN:	1066-5099
Tárgyszavak:	Orvostudományok Klinikai orvostudományok idegen nyelvű folyóiratközlemény külföldi lapban folyóiratcikk stem cells neuronal differentiation retinoic acid PRMT1 PRMT8
Megjelenés:	Stem Cells. - 33 : 3 (2015), p. 726-741. -
További szerzők:	Czipa Erik (1990-) (molekuláris biológus, bioinformatikus) Horváth Attila (1988-) (programtervező informatikus) Kőszeghy Áron (1983-) (Ph.D hallgató, élettanász) Bordás Csilla Póliska Szilárd (1978-) (biológus) Juhász István (1956-) (bőrgyógyász, bőrsebész, kozmetológus, klinikai onkológus) Imre László (1979-) (biológus) Szabó Gábor (1953-) (biofizikus) Dezső Balázs (1951-) (pathológus) Barta Endre (1963-) (molekuláris biológus) Sauer, Sascha Károlyi Katalin Kovács Ilona (1965-) (patológus) Hutóczki Gábor (1983-) (Ph.D. hallgató) Bognár László (1958-) (idegsebész, gyermekidegsebész) Klekner Álmos (1970-) (idegsebész) Szűcs Péter (1974-) (kutatóorvos) Bálint Bálint László (1971-) (kutató orvos) Nagy László (1966-) (molekuláris sejtbiológus, biokémikus)
Pályázati támogatás:	K100196 OTKA TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0024 TÁMOP Molekuláris Sejt- és Immunbiológiai Doktori Iskola TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001/A2-JADJ-13 TÁMOP F68254 OTKA TÁMOP-4.2.4.A/2-11-1-2012-0001 TÁMOP
Internet cím:	Intézményi repozitóriumban (DEA) tárolt változat DOI
Borító:
Saját polcon: